4Z2RA

Crystal strucutre of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica
Total Genus 187
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
187
sequence length
581
structure length
566
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGYPEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 187
structure length 566
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2rA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2rA01
3NTAA 3F8DA 3NHOX 3ZYXA 5KVHA 4H2PA 2J3NA 4H2NA 1RYIA 1V59A 2PHHA 3DJJA 2APGA 5U63A 1IJHA 3KU9A 4YWOA 1E1KA 1H81A 2WETA 2X50A 3AEBA 3OC4A 2TMDA 3K7MX 4ZCCA 3VRAA 1PXCA 4B68A 3QSEA 2HQMA 4H4ZA 4H7UA 3Q6JA 2BS2A 3GWFA 1O5WA 3AYJA 2W0HA 3BI4A 3BI5A 2AAQA 3V76A 4LA1A 4H4RA 3PS9A 3UTGA 3BNMA 4BURA 4ZN0A 3VR9A 3QJ4A 2JB1A 2XVHA 3F8PA 2BA9A 4RG3A 3I6DA 2EQ8A 4BJYA 4EQRA 2ZBWA 1DJNA 4E0VA 3E1TA 5JCLA 2EQ7A 2AR8A 3DMEA 1OJDA 4YXDA 3NGCX 4U2TA 3SFDA 4CY6A 4C74A 2XCGA 1PBCA 2BXRA 1Y56A 2E5VA 2C3CA 1L9CA 3UKPA 3O0HA 1KFYA 2X8GA 1EL9A 4EIPA 3AYIA 4TM1A 2XFNA 4U8JA 4BK1A 3CGEA 3UOXA 2GAGB 1TDNA 4K5RA 3KD9A 3OZ2A 2EQ9A 4U8MA 2X8HA 2I0ZA 3ADAB 3NN6X 3DGHA 1D4CA 4H4TA 2WU5A 3II4A 4YT0A 1D5TA 2BACA 3ICRA 4K8DA 5KOWA 3QFAA 1CL0A 1KSSA 1NHRA 3B6DA 3Q9TA 2JKCA 5JCKA 2C64A 1D7YA 3ALJA 3UTHA 3NG7X 2V61A 4H4PA 1CBOA 2H89A 3IWAA 3DJEA 2BK4A 3QFBA 1GEUA 1O94A 2BK5A 1REOA 2WOIA 1JU2A 1JNRA 2YR5A 3UCLA 3KA7A 4H4WA 2B76A 2VVLA 4NTCA 1D4EA 4C5OA 4CY8A 1H7XA 1IUSA 3CPIG 1L0VA 2B9YA 4K2XA 1AOGA 2YAUA 5EOWA 3DJGX 1CJ4A 3CNSA 1GRBA 3CGBA 4EIQA 2Y6QA 1PHHA 2C75A 2YLWA 3CNJA 4BV6A 1M64A 4D03A 1RSGA 2Q0LA 3I3LA 3GYJA 4XXGA 2WDVA 1F6MA 3KPFA 3P4QA 3ATQA 4CNJA 1EL5A 4HA6A 4EM3A 2YLSA 3AD7B 4H50A 4FK1C 3VRDB 5M0ZA 4CNKA 1FECA 2GF3A 4KPRA 3UOZA 3AE1A 3GMCA 1KDGA 4WX1A 4JNQA 4TLXA 1PDHA 3VRBA 2GMJA 4NZHA 3AE8A 4C3XA 3QVRA 2WBAA 3ICTA 3ABVA 1ZOVA 4YTMA 1K0JA 2OLNA 2C66A 1PS9A 1JRXA 3URHA 1GRAA 1KF6A 1MO9A 4DGKA 1XDIA 1DOBA 1DOEA 2R9ZA 1JNZA 3LZWA 2C70A 4EMJA 3H4KA 3KKJA 4Z26A 4UDQA 1ZOYA 3EANA 3GDPA 5BUKA 2X8CA 2B9XA 1PBEA 1Z6LA 1ZDLA 2R46A 3T37A 2BC1A 1QO8A 3NN0X 5CQFA 4IV9A 4H4XA 3LB8A 2WDRA 2Q0KA 3QSMA 3LZXA 2PYXA 4B66A 1Y56B 4P9SA 4EMWA 4Z25A 1B5QA 1KNRA 3UKKA 5HY5A 1N4VA 4EM4A 1ZK7A 3AEDA 2C65A 2E1MA 3GRSA 4J56A 4PAAA 4YSYA 1GRGA 1NDAA 3GRTA 5U1OA 1NHQA 1LVLA 4X4JA 5FS6A 4YTPA 1JRYA 3C96A 1Q1RA 2GR1A 3KVEA 3DA1A 5GRTA 2YLZA 1N4UA 1GOSA 2GQFA 4I59A 4AT0A 3H8IA 1PXBA 2C73A 4JQ9A 1F8WA 3B3RA 3K7TA 1XPQA 5HHFA 1GPEA 1VG9A 3QVPA 4WCTA 1TYPA 4CCQA 2AQJA 4K7ZA 3BNUA 2JAEA 3AE6A 2ZZBA 3G5QA 1GESA 2YQUA 1PJ5A 3NIXA 4J2WA 4BJZA 1JOAA 1LQTA 4YTNA 3AE2A 5IPYA 2GQWA 2YVJA 2FJBA 4OPGA 1H86A 1FOHA 1E1MA 1K0IA 3AYLA 4ICYA 1CJCA 2DKIA 1CHUA 1PJ6A 1NPXA 2FJAA 3BHKA 3RP6A 4YKFA 2BC0A 2YLXA 3P4RA 1IUWA 4A7AA 3P9UA 3C4NA 1LPFA 4EQWA 5EBKA 2WPCA 1GETA 1S3EA 3UKQA 2ZZ0A 2WP5A 1IUXA 5J7XA 1H82A 1GT8A 3IC9A 3DJDA 4H4SA 4OPDA 1SEZA 4XWRA 1Q9IA 4B65A 1CJ2A 2QA1A 2YG7A 5JCIA 3M12A 2QCUA 1ZP0A 4H4QA 3UP4A 5BRTA 2CULA 4J57A 2OALA 3EAOA 3GDNA 1BF3A 2GB0A 3NK2X 4FDCB 2OA1A 4LU6A 4Z44A 4A65A 2WPEA 2OLOA 1H83A 1Y0PA 2RGHA 3ITJA 3NK0X 3RHAA 4OPUA 4O5UA 2ZZCA 4U2LA 3ZDNA 3ALMA 1D4DA 4B63A 5LV9A 3AXBA 4FK1A 2V60A 1PXAA 5KWFA 2YVFA 4NEWA 3DH9A 2BCPA 1NG4A 2WP9A 3SFEA 1CC6A 2O9ZA 3CN8A 3GYIA 2CDUA 3AB1A 5C2TA 1Q1WA 4REKA 1DODA 2VRMA 3CNPA 3NLCA 1NHSA 1B8SA 1HYUA 2BABA 2EQ6A 2X3NA 1H84A 2WDQA 4CRTA 4RG4A 4IVMB 4A9WA 2Q6UA 3L1RA 4J33A 4TM0A 2NPXA 1L9EA 4CCRA 2VRLA 3CNDA 3GD4A 1DJQA 3NK1X 3REDA 3UKHA 4YSXA 1NHPA 2R0CA 1ZY8A 3M13A 1S2QA 3GD3A 4YSZA 3C4AA 3GWDA 2X99A 4J34A 1EL8A 1E1LA 3UOYA 4Z2UA 4B67A 2WHDA 4Y4MA 2Z5XA 4YSHA 3AECA 3NNEA 4U8PA 3UOVA 1QJDA 3DK8A 2WS3A 2VQBA 2YG5A 3RP7A 5EB4A 1EBDA 2C72A 2YG6A 3CTYA 5U25A 4TM3A 3S61A 1OJAA 4CBQA 4K5SA 3AEAA 3M0OA 4AOXA 3FBSA 2GR3A 2V6OA 4IA6A 4FX9A 2DKHA 1ZMCA 3ICSA 1KSUA 1NG3A 4H2QA 3ATRA 2YG3A 4LIIA 4M52A 4U8LA 1OJTA 2YM1A 5KXJA 2VVLG 4JN9A 5J60A 4NEVA 4B64A 1N4WA 2B9WA 3SM8A 3UKFA 2XYOA 4AT2A 1GRFA 3LADA 1NAAA 2YVGA 2BS3A 1F3PA 4TM4A 1MXTA 4C77A 1H7WA 1PBDA 3UKLA 5BULA 4U2SA 2XLSA 4OPCA 2R45A 4A5LA 4GRTA 1GSNA 2B7RA 1MOKA 3AE5A 1B4VA 1ONFA 3VR8A 2E4GA 3NTDA 2WEUA 1CC2A 2ACZA 2XDOA 1OJCA 2WQYA 3JSKA 2XVFA 4B69A 1BWCA 3QSSA 4J36A 2VVMA 4B1BA 2YLRA 1X31B 1BGNA 1IUVA 1TDEA 2XVJA 1GNDA 2XFQA 2IVEA 4U8NA 1YQZA 2FJDA 2WOWA 4Y4LA 1QLBA 1GERA 3GSIA 1TDFA 3KLJA 1YQ4A 3EPTA 2QA2A 2WU2A 5ER0A 3UP5A 5FS7A 3NH3X 4JNAA 3AE9A 3EF6A 3D8XA 1K4QA 2Y6RA 5CKUA 1TDKA 1GTHA 1LV0A 2GR2A 5HYMA 2C76A 2A87A 3AE3A 5FMHA 1O95A 3RP8A 1LTXR 3AEFA 4USRA 3DK4A 3SQPA 3P4SA 1TDOA 4OPTA 5DBJA 3L8KA 2JBVA 3NYEA 3AEGA 4UDRA 4A6NA 4I58A 2WPFA 4GF7A 3ALLA 1L9DA 3F8RA 3G5RA 4H4YA 4J31A 5TR3A 1VQWA 2YM2A 2TPRA 3CPJG 2A8XA 3HZLA 3S5WA 4DSGA 4YKGA 5IQ1A 3AD8B 2V3BA 1VDCA 1K0LA 2C3DA 2A89A 3GMBA 2F5ZA 4XWZA 4EQXA 3AEEA 2GR0A 1XHCA 2IVDA 1E1NA 4IA5A 1FCDA 1OJ9A 4USQA 2YR6A 1JEHA 4Y4NA 1BKWA 1BZLA 4AP3A 2WOVA 5EB5A 5L46A 2WP6A 1XANA 2XLRA 1KNPA 4U8OA 2XLUA 2GAHB 4DSHA 5JCMA 2YLTA 1GXFA 5KRQA 4O5QA 1GTEA 1DNCA 1F8SA 1GALA 2C7GA 3ISHA 3NKSA 4TLZA 1N1PA 3UKAA 1PBBA 3SGLA 2XLPA 2B7SA 1P2EA 4Z2TA 2JK6A 5C3JA 4GDPA 1NEKA 3PVCA 2ARDA 3D1CA 4IVOB 1VRQB 4K22A 2XFUA 4OPIA 4EMIA 2GVCA 2Z5YA 4JDRA 1DXLA 3P1WA 2XFOA 2YR4A 4H4UA 4NTEA 3FPZA 3CNTA 1PN0A 4UDPA 4BK3A 1ZX9A 2RGOA 2BYBA 3CPHG 5IQ4A 1VG0A 4H4VA 1H6VA 1ZKQA 1LJ1A 1TRBA 1E6EA 3CGCA 1PBFA 4U8KA 4EQSA 3FMWA 2CVJA 2GH5A 4A99A 1TYTA 4JY2A 3DK9A 4H2RA 2XVEA 3AE4A 3PO7A 3AWIA 2RABA 2JB3A 4APNA 1S3BA 3NT6A 2GMHA 1E7PA 2V3AA 2WESA 3V3OA 1GRTA 1YY5A 4OVIA 4Z24A 4GCMA 4OCGA 1PJ7A 2GEWA 3NRNA 2UZZA 4UP3A 4ADWA 3FG2P 1B37A 2C67A 3LOVA 1UKVG 2CFYA 3BI2A 1JRZA 1W4XA 4X9NA 2XLTA 3LJPA 3LXDA 2R0PA 2VQ7A 2Q7VA 4RSLA 4AP1A 1CJ3A 1IUTA 1ZMDA 3R9UA 4C3YA 1NENA 2R4JA 3NYFA 5GSNA 2IIDA 2GV8A 2FJEA 2XFPA 4KX6A 4DNAA 2QAEA 3DGZA 3H8LA 3UTEA 4A6NB 3G5SA 3IHMA 4Z43A 1CF3A 1FEAA 2VOUA 4JY3A 2BK3A 1EL7A 1IUUA 1LQUA 1P2HA 2YWLA 3BHFA 4N9XA 3V3NA 4BK2A 3P4PA 5BVAA 1S2YA 2NVKX 5KVIA 1COYA 1GRHA 2V5ZA 1F8RA 3AD9B 3VQRA 5HXIA 3K7QX 4ECHA 1M6IA 2FBWA 2R4EA 3AE7A 4GDEA 2XVIA 2BCGG 5KOXA 2GRTA 5FS8A 1FL2A 1E39A 2YG4A 2OAMA 3NYCA 3IF9A 5JCNA 1BGJA 2BXSA 5FS9A 4A79A 2R0GA 2JB2A 2RGJA 2BS4A 4NTDA 4ZCDA 4MJWA 3WE0A 4X9MA 1DOCA 3CGDA 4Z2RA 2H88A 3FIMB 4GR1A 3IHGA 4GUVA 4HB9A 1FEBA 4OPLA 5M10A 1RP0A 1YQ3A 1GREA 3K30A 3COXA 3CIRA 4PABA 1D7LA 3UTFA 3RNMA 4U8IA 1ELIA 1CC4A 4D04A 1GV4A 2VZ2A 1YKJA 4AOSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KVHA 2YJ7A 3DJJA 2APGA 5U63A 1IJHA 3ZMKA 3OC4A 2PWJA 4RI7A 4ZCCA 1U88A 3QSEA 4H7UA 4H4ZA 2BS2A 3W8SA 3ZZXA 3QAGA 5FWGA 3AYJA 12GSA 5D8IA 3BI5A 2GZYA 2MMZA 2P31A 3VFIA 3GH6A 4K0NA 3PS9A 4ZN0A 1PMTA 3HCZA 1GSQA 1Q4JA 1XXUA 2JB1A 2XVHA 1JZWA 3I6DA 4RG3A 4BJYA 4FQUA 2ZBWA 1A2LA 2C1YA 2GSTA 5IM9A 2AR8A 4DSQA 4YXDA 4N10A 3SZFA 3SFDA 1R7HA 3P2AA 5G5EA 4HQZA 3DD3A 1GH2A 3O0HA 3ME7A 1KFYA 4BK1A 4TM1A 3IK7A 4V2LA 1FO5A 4GSNA 1PL2A 2X8HA 2PVOC 3GX8A 2I0ZA 4RQXA 3GN3A 2LJKA 3OR5A 3NN6X 3DGHA 2P5RA 2M46A 1D5TA 2BACA 3ICRA 4K8DA 1BYEA 2VCZA 3QFAA 3B6DA 2B1LA 4MF7A 2KLXA 4PUFC 2C64A 3SZ0A 3P90A 3VLNA 1CBOA 2H89A 2HSHA 3ERWA 1GEUA 1XG8A 2G2QA 3DVWA 1REOA 2BK5A 4KF9A 2YR5A 3UCLA 3KA7A 2OE1A 5LD0A 5IOWA 4NTCA 2A2PA 4EXJA 4O32A 4CY8A 1L0VA 1RQMA 1XVQA 3IR4A 1AOGA 3HVNA 1CQHA 5ECRB 1K0CA 1CJ4A 3LGCA 2HRNA 4EIQA 3EC3A 4AJ8A 2JSZA 3V1WA 2JZRA 3FY7A 4MP4A 5HFKA 2C75A 3I3LA 1N8JA 2WDVA 4CNJA 2P5QA 2YLSA 1V40A 3IAS2 5M0ZA 1FECA 2HE3A 3VRBA 3ICTA 1ZOVA 5CP1A 5H5RA 1PS9A 2C66A 5JCUA 1JRXA 4ECIA 5IMAA 1DOEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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