4Z2TA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase w225y from pseudomonas azelaica
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
581
structure length
559
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYYMFVAALRMIRPWNKWICVWGEITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 190
structure length 559
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2tA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2tA01
2JB2A 3ATQA 1S3EA 3G5RA 3KKJA 3S5WA 3GYJA 1DJQA 3BNMA 2JK6A 2YLSA 3AD8B 3QSEA 1NDAA 3K30A 2VZ2A 3S61A 2BACA 4FDCB 4J56A 1B8SA 4I59A 2WPFA 2YM1A 1NAAA 2BK3A 2C75A 1JEHA 1NG3A 2VQBA 2XCGA 3CGDA 2YAUA 4Z44A 3WE0A 1DODA 1NENA 3NTDA 3URHA 1QJDA 2B9XA 2X8HA 5IPYA 2BC1A 4AOSA 2Y6RA 4UDQA 4Z24A 3NIXA 4PAAA 1BZLA 2VRLA 1L9DA 2AQJA 2WP5A 2IVEA 3ALMA 2FJBA 3R9UA 5HXIA 3AYLA 3DK4A 4GUVA 4BV6A 4BK3A 2WU2A 2QCUA 4P9SA 2X99A 1JU2A 3NTAA 1M64A 4A79A 2YM2A 3DA1A 3IHMA 4H4SA 4NTEA 4EQXA 2R0GA 4H4VA 1PXAA 4Z2RA 4AT0A 3DJJA 1Y56A 2WHDA 2XVHA 3FG2P 2GAGB 2X3NA 1CC2A 1GRBA 1ZOVA 4N9XA 4Z2TA 1JOAA 4H4QA 5KVHA 3SM8A 1GRGA 2FBWA 3NT6A 4J36A 4XXGA 1XHCA 4U2SA 3ITJA 3EPTA 3LOVA 5C3JA 3AE5A 3KA7A 3QSMA 1MO9A 1NG4A 3OZ2A 2GF3A 2PHHA 1KNRA 3BNUA 4ZCDA 2ACZA 3UTGA 4Z25A 1RSGA 1O95A 4X4JA 4YSZA 2R9ZA 1KNPA 3DK8A 2R0PA 1TDFA 1ZKQA 4H4XA 2EQ8A 2R4JA 1P2HA 4H2QA 2BS2A 2WU5A 3UTFA 1K0IA 2Q6UA 4FK1C 3ALLA 3HZLA 1OJAA 3C96A 3NYEA 1N4UA 3BHFA 1EL5A 2XVEA 1JRZA 2W0HA 2OAMA 4A7AA 5KOWA 3C4NA 3CNTA 4B65A 4BK1A 1CJ4A 2C65A 2WS3A 2XLPA 3UOYA 3GMBA 4IV9A 3KU9A 3H8LA 2B7SA 4ADWA 1GTHA 3P4RA 4BURA 5L46A 2ZZCA 1GNDA 4D03A 1FOHA 4C74A 4GF7A 4ECHA 4BK2A 2GQWA 3ATRA 5EOWA 3ICTA 4O5QA 1YKJA 2CULA 4H2RA 3NLCA 3GRTA 2OLNA 2YVGA 1LVLA 3F8DA 3COXA 1OJDA 3Q6JA 1BKWA 3BI5A 3VR8A 4K5RA 3DJDA 4C77A 2V6OA 2R0CA 1MOKA 2GRTA 2OLOA 1QO8A 1S2YA 4CBQA 3SFEA 4B64A 4XWZA 3GDPA 1ZMCA 3GD3A 1X31B 1F8WA 2AR8A 4A6NB 3QJ4A 4YXDA 2E5VA 4J31A 2BABA 3NK1X 3GWFA 3QSSA 3UP5A 2C66A 3AE8A 3PS9A 4DSGA 1ZMDA 3AEEA 3CPJG 2R45A 1Z6LA 5GSNA 2YWLA 4UDPA 3NYCA 2X8CA 3O0HA 1D7LA 4J57A 4NTCA 5EB4A 3SGLA 1L9CA 2J3NA 5HHFA 1CJ3A 1SEZA 1PBCA 2A89A 3UTEA 4OPTA 1LJ1A 4JNQA 2RABA 1H6VA 2WQYA 2YR4A 3M12A 2JBVA 2B76A 4EM4A 1CC6A 1DOEA 4TM3A 1VG0A 4EIPA 3IHGA 1VDCA 2XLSA 4YSXA 4H7UA 5KXJA 3CPIG 1PN0A 3P4PA 3RP8A 2R4EA 4H4UA 5KRQA 4MJWA 4OPLA 3AE7A 5M0ZA 2BC0A 1Q1RA 3CIRA 3RP6A 5IQ1A 1OJ9A 2H88A 1CBOA 1IJHA 2WDQA 1F3PA 4CNJA 2XVJA 2JKCA 3F8PA 3NKSA 1OJTA 1E6EA 2C72A 4E0VA 3NN0X 2BK4A 3B6DA 2VVLG 3BHKA 1PDHA 1YQ4A 3DGZA 2B9WA 1TRBA 3UP4A 1ZX9A 2A87A 1MXTA 2Y6QA 3CPHG 4EM3A 1FECA 1Y56B 2YLTA 3K7MX 2WPEA 3P4QA 1PHHA 1IUXA 1PJ6A 1OJCA 3VR9A 1NPXA 4EIQA 3H8IA 3RHAA 4U8OA 3AEBA 1GT8A 3NK0X 4X9MA 1E1LA 4KPRA 4B63A 2FJDA 2APGA 4USQA 4YSHA 5ER0A 1IUVA 1REOA 1YY5A 4OPGA 4Y4LA 4Y4MA 4A99A 2YR6A 2WDRA 2V60A 2XDOA 3B3RA 3P1WA 3EF6A 1PBBA 1W4XA 3K7QX 3NG7X 2GV8A 2OA1A 3I6DA 1XDIA 4OPCA 2YR5A 2CDUA 1H7WA 3NK2X 4A65A 3KLJA 2GR2A 1L9EA 1CC4A 3ICRA 3BI4A 1HYUA 4EMIA 3GD4A 3CNPA 4JQ9A 2NPXA 4AT2A 4FK1A 1BWCA 5C2TA 5EBKA 3AECA 2E1MA 1GPEA 4CRTA 5KWFA 3EAOA 1D4EA 2V3BA 3CGBA 2CFYA 3GWDA 4C5OA 2YVFA 3M0OA 3AD7B 2TMDA 4TM1A 1PBDA 4U2TA 3FIMB 3H4KA 1RP0A 3VRDB 5JCMA 1ZK7A 3SQPA 3UKFA 5JCNA 2YG5A 3CGCA 3QFAA 3K7TA 4A5LA 1DJNA 4U8JA 3UKKA 1TYPA 3ALJA 3II4A 2WP6A 1VRQB 4H2PA 4NEWA 2VOUA 2Q0KA 3E1TA 4YTNA 2QA2A 1CF3A 4FX9A 1GTEA 1GV4A 2GR0A 2B9YA 2R46A 5IQ4A 4A9WA 2F5ZA 3JSKA 1DXLA 4H4WA 3V76A 2C70A 3AD9B 1GRHA 4Z2UA 1PS9A 1GOSA 1RYIA 1GERA 2WETA 1IUWA 1H81A 2ZZ0A 4YKGA 5KOXA 2O9ZA 4M52A 2VQ7A 4I58A 4IA5A 3GSIA 2BS4A 1UKVG 3ABVA 1IUTA 3LZXA 1ZDLA 1H86A 3KVEA 4ZN0A 1LQUA 3V3NA 2TPRA 2Z5XA 4GDPA 1GXFA 2GR1A 1O5WA 1ELIA 1S2QA 4EQRA 2Q0LA 3AE9A 4B67A 3CGEA 4GR1A 3KD9A 2NVKX 1PXBA 5FS8A 3UTHA 4YKFA 3RP7A 4IA6A 1ZP0A 3IF9A 5GRTA 4J2WA 4JY2A 4OPDA 4O5UA 3DH9A 1AOGA 1CJCA 1BGNA 1FCDA 3LZWA 1YQZA 2GR3A 2GMJA 2E4GA 4REKA 4B1BA 3LB8A 2VVMA 1EL8A 1GESA 3UOVA 4B69A 4PABA 1TDOA 4XWRA 4JNAA 3SFDA 1S3BA 3UCLA 3QVPA 4DSHA 2XVIA 1M6IA 3PO7A 4IVMB 1EL9A 5JCIA 4K7ZA 5KVIA 1PJ5A 1GRTA 2BS3A 3NH3X 4CCQA 4YTMA 4YSYA 5U1OA 3AEAA 1KFYA 1Q1WA 3OC4A 2YLXA 2WP9A 3VRBA 2AAQA 2H89A 3PVCA 4K8DA 3V3OA 4Z26A 2WBAA 4DNAA 1H7XA 3CN8A 3D8XA 4U8MA 2V61A 3DJGX 4JDRA 3CNSA 2YLRA 2IVDA 4ZCCA 1NHSA 3QVRA 1H84A 3VQRA 5LV9A 1PBFA 2V5ZA 2GH5A 3IWAA 4BJZA 3REDA 1TYTA 2OALA 4HA6A 5HYMA 2BYBA 4YTPA 5M10A 3VRAA 1P2EA 4YWOA 1TDNA 3AYJA 3DMEA 3KPFA 3AE4A 2GEWA 2JB1A 3M13A 5U63A 2C67A 2C7GA 3G5SA 1DOBA 1N4WA 4YT0A 1TDKA 3LJPA 2QA1A 4H50A 2JAEA 1B4VA 2A8XA 1XANA 3AYIA 4H4YA 1LTXR 2YVJA 4U8NA 1L0VA 4UDRA 4CCRA 1JRYA 2WOVA 5U25A 1KSSA 1NHPA 4J34A 4X9NA 4C3YA 4NEVA 2JB3A 4TLZA 3UOZA 2YG7A 1NEKA 1TDEA 4B66A 4JY3A 3UOXA 3NRNA 2WDVA 1E7PA 2DKHA 3AEDA 3LADA 1FL2A 4BJYA 2XFUA 4U8KA 3NYFA 3EANA 1K0LA 2WEUA 3FBSA 4RSLA 4EMJA 1FEAA 4TLXA 2WOWA 5HY5A 4WCTA 4D04A 2ARDA 2RGHA 1O94A 1K4QA 2QAEA 2YLZA 3AB1A 3AE6A 3F8RA 2XFPA 2WOIA 4H4PA 4HB9A 4TM0A 4WX1A 1CHUA 1D4CA 2VRMA 1JNZA 1KSUA 3BI2A 1E1KA 2X50A 3FPZA 3NNEA 3NN6X 4H2NA 5FS7A 3QFBA 4NZHA 1D7YA 4K2XA 4AP1A 2V3AA 4U2LA 5TR3A 5J60A 2DKIA 4K5SA 3G5QA 3UKAA 1COYA 1Q9IA 2UZZA 2IIDA 1F8SA 2X8GA 2XFOA 2YG4A 1CJ2A 1GREA 2YQUA 4U8LA 4Y4NA 1PXCA 4GCMA 2B7RA 1D4DA 2YG6A 1IUSA 1B5QA 4Z43A 3FMWA 1FEBA 2BXRA 4EQSA 3ADAB 1Y0PA 1LPFA 3IC9A 4NTDA 1F6MA 4U8PA 3CNJA 5CQFA 1BGJA 4GDEA 5BRTA 1PBEA 2XLRA 1E1NA 4AP3A 3AWIA 1E39A 3T37A 2BCGG 2BCPA 4JN9A 5BULA 2XLTA 2Z5YA 3L8KA 1CL0A 2XVFA 2YG3A 2GQFA 1GRFA 3GDNA 2BK5A 2BXSA 1JRXA 2FJEA 4H4RA 3I3LA 1ZOYA 1GALA 4OPIA 4EQWA 3AEGA 2HQMA 3UKPA 2XYOA 1VG9A 2XFNA 2GMHA 1GRAA 3GMCA 1NHRA 2EQ6A 3DGHA 1VQWA 2I0ZA 3ICSA 2FJAA 1V59A 1ZY8A 3CNDA 5J7XA 1NHQA 3AE1A 1N4VA 4U8IA 2PYXA 2WPCA 4USRA 3GYIA 4GRTA 1B37A 1K0JA 1ONFA 3GRSA 2C64A 2RGJA 2YLWA 2EQ7A 1KDGA 1DNCA 1PJ7A 1H83A 1QLBA 2Q7VA 2ZBWA 5DBJA 4CY8A 4RG4A 3AE3A 3ZYXA 3CTYA 1F8RA 5BVAA 4H4TA 3ZDNA 1XPQA 1KF6A 4KX6A 3NGCX 3P4SA 2EQ9A 4H4ZA 4TM4A 5FS6A 5CKUA 3L1RA 1LV0A 3AXBA 2C73A 4K22A 2CVJA 3C4AA 5EB5A 3AEFA 4AOXA 1IUUA 2XFQA 4OPUA 3D1CA 1YQ3A 1H82A 1BF3A 1GEUA 1LQTA 1EL7A 2ZZBA 3UKQA 4LA1A 4LIIA 1EBDA 2GAHB 2C76A 5FS9A 4C3XA 5BUKA 2GVCA 4LU6A 4CNKA 1JNRA 3UKHA 4DGKA 3LXDA 2GB0A 4ICYA 4OCGA 3UKLA 4APNA 1GSNA 3AE2A 4J33A 4OVIA 4A6NA 5FMHA 3DJEA 3Q9TA 4CY6A 1E1MA 4UP3A 3DK9A 2XLUA 2RGOA 3P9UA 3RNMA 3NHOX 3ISHA 2VVLA 1D5TA 1N1PA 2BA9A 1DOCA 2C3DA 4IVOB 5JCLA 1GETA 2C3CA 4RG3A 4EMWA 4B68A 5JCKA 2WESA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2JB2A 3ATQA 1S3EA 2ZNMA 3PR8A 4CW9A 4MPFA 3EURA 1AC1A 3K30A 1JZRA 3S61A 3CRUA 2BACA 5G1LA 2H74A 2OBIA 2WPFA 1OYJA 4AF2A 3FR3A 1JEHA 4XHMA 3NTDA 1USBA 5F07A 2X8HA 1WE0A 13GSA 1XXUA 4HZ2A 4I2UA 4PAAA 3T2ZA 4II3A 3R9UA 5HXIA 3EINA 3NTAA 4A79A 5IMAA 3Q74A 4TR0A 4XS6A 1TRSA 2OE1A 3DJJA 5D8IA 5L71A 1N8JA 3HA9A 3MNGA 4N9XA 3HCZA 4Z2TA 18GSA 17GSA 3GL3A 4H4QA 5KVHA 11GSA 2K8VA 4EO3A 3NIVA 3NT6A 4U2SA 5B6MA 2OE0A 3LOVA 2L6DA 4O5RA 1ZMAA 2PUKC 1NG4A 3OZ2A 4BWQA 3D6IA 3GX8A 3J7Yk 2X4AA 3I43A 4PTSA 4AJ6A 1KNRA 1RSGA 3BCKA 5ECSA 3BNUA 5H5RA 2R9ZA 4LMVA 2ES7A 4PX1A 5J3RA 4GTUA 1G7EA 2REMA 3LGCA 2BS2A 4GAPA 6GSYA 2Q6UA 2RM5A 3HZLA 3QPMA 2B3SA 3ZLPA 3GV1A 5F06A 4L5LA 3KP9A 4I97A 2XVEA 4A7AA 1JRZA 1O8XA 3C4NA 3CNTA 2YWIA 3F4RA 1CJ4A 2WGRA 3UOYA 3FYGA 4Q5QA 4GSSA 5IM9A 4YQUA 14GSA 4ADWA 2H6YA 4BURA 1PA3A 4GF7A 3CTGA 3HD5A 4ECHA 2FWHA 2CULA 2VCZA 3NLCA 2VCQA 3SYIA 3F8DA 4WBRD 3VR8A 1M2DA 1KBNA 3ZVJA 2OLOA 5CYYA 1VF1A 3CRTA 4B64A 3GDPA 1ZMCA 2GSQA 2NTOA 2OADA 4X43A 3QJ4A 2CQ9A 2BABA 1H75A 1U3IA 3AE8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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