4Z2UA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase r242q from pseudomonas azelaica
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
581
structure length
563
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGQMGIGDSGSINIEFSADLSSLCEHRKGDMYWMFVAALQMIRPWNKWICVWGYITKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
total genus 191
structure length 563
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2015-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4z2uA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4z2uA01
2X3NA 2YLXA 1GSNA 4JNAA 2XYOA 5KXJA 3UTEA 2JAEA 4Y4LA 4OPDA 4B63A 3AEEA 1BWCA 4JQ9A 1H83A 4A99A 2YG7A 3PS9A 3SFDA 2R0PA 2BS4A 1NHQA 2WPFA 4GR1A 3UOXA 4USRA 1Y56A 1DOBA 1FEBA 1EL8A 3RNMA 4D03A 4USQA 3VR9A 1F8WA 1IUUA 1JNZA 2YG3A 3WE0A 2RGHA 4X9MA 4IVMB 3LZXA 4X4JA 3AXBA 1B5QA 1PS9A 4U8OA 4ZN0A 2QA1A 4DSHA 4OPUA 1CJ4A 3ADAB 4TM4A 4TM3A 1GNDA 3L8KA 2BCGG 2B7RA 5M0ZA 1B37A 1NEKA 3BI4A 1L0VA 4YTMA 4AP3A 3QVPA 3FG2P 2YG6A 2Q0LA 2JB2A 3AD9B 2Z5XA 4U8IA 3CGDA 3ICRA 2A8XA 1D7YA 1EL5A 3DJDA 4U2TA 4EIQA 1K4QA 3CPJG 1M64A 1N4UA 2GH5A 1VQWA 3UTFA 4AOSA 2GQFA 2HQMA 1Y56B 2YLSA 3RP7A 1H81A 1NPXA 2WP9A 4UDPA 4GF7A 2GR0A 2OLNA 4H2RA 2QCUA 4KX6A 5KVHA 4H2PA 1JRXA 4PABA 3EAOA 3LJPA 2VQBA 2FJBA 5DBJA 2WEUA 2JB3A 4ECHA 1CL0A 3AE8A 1D4EA 1TYTA 2RGJA 4YSYA 1NHPA 1TDFA 3CPIG 3M12A 5JCLA 2WU2A 3OC4A 3QFAA 3LB8A 4Z25A 5U25A 3AE1A 2JBVA 1H7WA 2XLPA 2YAUA 4H4WA 4ZCCA 3DGZA 4U2SA 1IUWA 2YLRA 4YTPA 2Q7VA 4Y4MA 2R9ZA 1CC4A 2XLTA 2Z5YA 3V3OA 4K2XA 1REOA 1CJ3A 2V3BA 2XCGA 1KDGA 4EQSA 2YG4A 3UTHA 1XANA 5GSNA 2E5VA 1TDOA 5JCMA 1VG0A 1ZX9A 4UDQA 3AEGA 1E1LA 2YQUA 4CY8A 3LXDA 1S3EA 2CDUA 3K30A 1GALA 2C3DA 3UKKA 3UKPA 4NTEA 2E4GA 3ITJA 1DOEA 1Z6LA 3G5QA 3F8RA 3I6DA 4GRTA 1ZMDA 2GEWA 5ER0A 3DK8A 1Q1WA 2APGA 2NVKX 2X8CA 3NTDA 1JEHA 1H86A 1CC2A 1PBDA 2GQWA 2BCPA 4U8KA 3DJJA 4M52A 5J7XA 2XFOA 3CNJA 4EMIA 1AOGA 2IVDA 2WPEA 4CRTA 2B7SA 1LQTA 3NT6A 1L9CA 1NG3A 2XFNA 3B6DA 2NPXA 1BGJA 3DGHA 2VRMA 3Q6JA 4GDPA 4A5LA 3CIRA 2YLZA 1TYPA 1F8SA 2FJAA 3BI2A 3EANA 2BS3A 2ACZA 2ZBWA 2EQ6A 2V60A 3AE7A 5L46A 1GREA 2BK4A 1RP0A 2C70A 1FL2A 3FMWA 3V76A 3E1TA 4B67A 3CNSA 1E1NA 4K8DA 2VOUA 3CNTA 4FDCB 3AE2A 5EB5A 2C72A 3NYEA 3KLJA 2V3AA 4JDRA 1ZOVA 1DJQA 2AAQA 3K7TA 4CCQA 2AR8A 2C75A 1CHUA 2WPCA 4H4YA 2X8GA 2YR6A 1JU2A 3CGEA 4GCMA 2I0ZA 4U8PA 4U2LA 1PDHA 2YM2A 1Q1RA 2GRTA 4H4PA 4A7AA 2XVJA 4WX1A 4DNAA 4NEWA 2GMHA 1GTEA 2GF3A 4H2NA 3DJGX 4YSXA 3LADA 2XVIA 3B3RA 3NYFA 4CY6A 1D4CA 3IHMA 2JB1A 4NTDA 1XDIA 1ONFA 3UKAA 4BV6A 4C3XA 1NG4A 4H4UA 2GR1A 4J31A 3GMCA 2B9XA 5EB4A 1ZMCA 2X99A 3KA7A 3CGBA 3BHKA 1TDEA 2GB0A 1DNCA 4A6NA 1PBBA 4BK3A 1W4XA 4Z2UA 1N4VA 2C66A 4OPGA 2WOWA 4Z2RA 1E39A 3AE6A 1NDAA 1LTXR 4BURA 4OVIA 1E1MA 1YY5A 3ZYXA 4B65A 1KSUA 2V6OA 4A9WA 4K5RA 1PBFA 3AD7B 1LVLA 2WOVA 1MXTA 1GRFA 3NH3X 4XWRA 2X50A 4I58A 1H6VA 2VVLA 3ALJA 2BS2A 3IC9A 2GMJA 4LA1A 1PXAA 2WU5A 3ATQA 3GDPA 4H4QA 2WBAA 4Y4NA 3SQPA 4B69A 3ISHA 4U8LA 2BK5A 3S5WA 1CJ2A 1VG9A 1OJ9A 1TDKA 1P2EA 2IVEA 3UP4A 2E1MA 3AE9A 3NTAA 4A6NB 2VQ7A 5TR3A 4REKA 4O5QA 3RHAA 2GV8A 2WDVA 2BA9A 3FBSA 3ATRA 3NK1X 4H4ZA 4YXDA 3AE5A 3R9UA 3GDNA 4CNJA 3C4NA 3AEAA 4U8JA 1S2QA 3QSMA 4HA6A 1PBCA 3LZWA 5J60A 3BHFA 2B76A 1GEUA 1CF3A 3UOZA 1YQZA 3C4AA 3URHA 1F8RA 4EQRA 5HHFA 5CQFA 1XPQA 3DH9A 3KKJA 2GVCA 2BC0A 1RYIA 4Z44A 2BK3A 2B9WA 4JN9A 2WOIA 2UZZA 3M0OA 3NIXA 4IV9A 1EL7A 2YG5A 3S61A 3Q9TA 3GYJA 1MO9A 3ICSA 4Z24A 3UP5A 3RP8A 1YKJA 2OAMA 2WP5A 4J34A 2TPRA 4EM4A 2C7GA 2XVFA 2XLSA 2YVFA 1VRQB 4TM0A 4LIIA 1Y0PA 3QSSA 3AYIA 3T37A 1L9EA 2GR3A 5KOWA 3F8PA 1JOAA 2VVLG 5BULA 3KU9A 4AOXA 3GD4A 2WHDA 4BJYA 1PJ7A 1PHHA 2PYXA 2VZ2A 3K7QX 4O5UA 3SGLA 4K7ZA 5FMHA 3IWAA 3VQRA 4EQXA 1HYUA 1V59A 4ICYA 1LQUA 2XDOA 2R0CA 2ZZBA 3QJ4A 5FS8A 4NEVA 1GRGA 1F6MA 3PO7A 1NENA 2OA1A 5EBKA 4CCRA 4EMWA 3AD8B 2IIDA 1GTHA 4IVOB 3GSIA 4HB9A 1FECA 4I59A 5C2TA 5JCNA 3H8IA 2GAGB 3NRNA 3G5SA 5HXIA 2O9ZA 4J2WA 2CFYA 5JCKA 2CULA 5KWFA 2C3CA 3CTYA 4TM1A 3P4RA 1EBDA 2R4EA 4IA6A 1ELIA 3UKFA 1GRBA 5C3JA 1FCDA 1GT8A 3D8XA 4FK1A 1P2HA 2GR2A 1D5TA 2C76A 4GDEA 3SFEA 4DSGA 2ZZCA 3P1WA 1S3BA 2Y6QA 3NKSA 2XFUA 4TLZA 4NZHA 3LOVA 5KVIA 1LPFA 1K0IA 1KNRA 2V5ZA 4YTNA 4MJWA 5BVAA 3AEBA 3AEFA 3NN6X 4RSLA 3FPZA 4H7UA 3QSEA 1EL9A 3GYIA 1LV0A 1PXBA 3EPTA 2H88A 2Q0KA 3AWIA 2DKHA 5FS6A 1PJ6A 4LU6A 1OJCA 2C67A 1D7LA 3NK2X 4N9XA 2CVJA 2A89A 3II4A 2FJDA 1ZK7A 3KPFA 4YT0A 3BI5A 1DXLA 1NAAA 3VR8A 2QAEA 1H84A 4OPIA 4YSZA 2RGOA 3ICTA 3QVRA 4B64A 5BUKA 1GERA 1ZP0A 1B4VA 2YLTA 4NTCA 4H2QA 4B66A 2X8HA 1SEZA 1F3PA 4YKFA 3FIMB 3AYJA 4P9SA 2R46A 2BABA 1DOCA 2OLOA 4J33A 1MOKA 4AP1A 1Q9IA 5CKUA 5HYMA 4K5SA 1JNRA 1S2YA 2B9YA 4C74A 4YKGA 1YQ4A 4A79A 2GAHB 4RG3A 1KF6A 1BGNA 4BK1A 5HY5A 1IJHA 1K0JA 3C96A 4OPCA 1KSSA 5IPYA 1GV4A 3BNUA 1OJDA 3M13A 3NGCX 1TRBA 2A87A 4CBQA 1GXFA 2VVMA 3K7MX 1B8SA 1H82A 3NK0X 2YR4A 4APNA 1GESA 1LJ1A 3P4SA 1CC6A 2PHHA 3AE3A 3BNMA 3D1CA 3G5RA 4PAAA 5U63A 5IQ4A 1K0LA 4B68A 3GWFA 2BACA 2OALA 3O0HA 4FK1C 3CNDA 3SM8A 3NYCA 3REDA 2BXRA 4WCTA 2BYBA 1XHCA 2XFPA 3QFBA 4U8MA 5IQ1A 4BJZA 2W0HA 3ALMA 4JNQA 2F5ZA 2FBWA 2XLRA 2YVJA 1OJAA 2JK6A 3UOYA 2WQYA 4AT2A 3UKHA 4ZCDA 4H4XA 3VRBA 5EOWA 5LV9A 1IUSA 1GRTA 4EIPA 2V61A 3GRSA 4UP3A 2Q6UA 3F8DA 1L9DA 3DA1A 4OCGA 2AQJA 4U8NA 4EMJA 1UKVG 5U1OA 4YWOA 1H7XA 4J56A 1FEAA 3AB1A 2Y6RA 1QJDA 4OPLA 3RP6A 1PN0A 1YQ3A 1COYA 3GMBA 4JY2A 4TLXA 2R4JA 3NN0X 3JSKA 4OPTA 4RG4A 1NHSA 4XWZA 2DKIA 3IF9A 2YLWA 2YM1A 3UCLA 3PVCA 1X31B 5KRQA 1NHRA 1IUVA 2XVEA 2JKCA 3VRAA 3KVEA 2XFQA 2YWLA 3CNPA 4H4RA 3DK4A 3V3NA 1GETA 2C73A 1ZKQA 1ZY8A 2YR5A 3HZLA 1D4DA 1KNPA 4FX9A 2RABA 1PXCA 4H4VA 3UKLA 2EQ8A 5JCIA 2VRLA 3OZ2A 2BXSA 5BRTA 4GUVA 1GRAA 2H89A 1KFYA 1N4WA 2FJEA 3AEDA 2R0GA 4AT0A 2WDQA 1PJ5A 1BKWA 3UTGA 5GRTA 3ZDNA 3DJEA 1FOHA 1O5WA 1BZLA 2EQ7A 3NHOX 1VDCA 2QA2A 4UDRA 4XXGA 3ABVA 1PBEA 5FS9A 2BC1A 1E1KA 3EF6A 3GRTA 1M6IA 1ZDLA 5KOXA 2XLUA 4H4TA 1BF3A 3NG7X 3I3LA 1E7PA 3P4PA 1GRHA 3H4KA 4D04A 1ZOYA 5FS7A 2ZZ0A 3P4QA 1IUXA 1DODA 4YSHA 1DJNA 4B1BA 2EQ9A 2C64A 3AE4A 3CGCA 1E6EA 3GD3A 2WP6A 3DK9A 1CJCA 2ARDA 4C3YA 4E0VA 4IA5A 1TDNA 3NNEA 3AECA 3CPHG 1N1PA 2J3NA 4A65A 2WDRA 4Z2TA 1JRZA 2TMDA 4C5OA 3H8LA 4J36A 4ADWA 1O94A 4Z43A 4H4SA 3IHGA 2WS3A 3NLCA 1CBOA 2R45A 3ALLA 1RSGA 3P9UA 3AYLA 4C77A 2WESA 3UKQA 5M10A 3KD9A 3GWDA 2C65A 4H50A 1IUTA 4EM3A 3COXA 2YVGA 3VRDB 3DMEA 1GOSA 3L1RA 4K22A 2WETA 1GPEA 1QO8A 4JY3A 3UOVA 1O95A 1QLBA 3CN8A 4X9NA 4BK2A 4J57A 4CNKA 4Z26A 1OJTA 4EQWA 4DGKA 2XVHA 4KPRA 1JRYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YLXA 4BA7A 3UTEA 1O7UA 4BWQA 3HZ8A 3OR5A 3WT1A 1SKSB 1G6WA 1BWCA 3SFDA 2LS5A 1A0RP 2WB9A 3UOXA 4USRA 2IN3A 3RNMA 1QMVA 3VR9A 1CQHA 2L6DA 4GF0A 3GTUB 1JNZA 2BMXA 4G6GA 2FD3A 3P7XA 1X9MB 2RGHA 3ERGA 3TKSA 3AXBA 1B5QA 1WIKA 5COHA 3LYKA 4DSHA 3ADAB 5JCUA 3L8KA 2BCGG 2B7RA 1B37A 4P3YB 1EGRA 3KM6A 4AP3A 3QVPA 1ERUA 3FG2P 3CMMA 2JB2A 5C00A 3LXZA 4XRDA 3LORA 5ECIB 4U8IA 1EEMA 1KTEA 3CGDA 2A8XA 1EL5A 3G7JA 4U2TA 1OKDA 2HZEA 1N4UA 2GH5A 3KTBA 4PQHA 2GQFA 3PPUA 1H81A 1DBYA 4I97A 2OLNA 4H2RA 3MSZA 5KVHA 5A4VA 4H2PA 2P5QA 2LJAA 2WEUA 4ECHA 1D4EA 1TYTA 1K3LA 3HKRA 1TK0B 1TDFA 3M12A 1TOFA 2WU2A 4Z25A 2MBSA 3F6FA 5CNWA 3AE1A 1H7WA 2YAUA 4WEYA 3RHCA 4U2SA 1J0FA 1PGTA 4PUFC 1CC4A 1GSSA 2Z5YA 4IP1A 1KDGA 1OKTA 4HU9A 1ZX9A 1E1LA 19GSA 2H73A 2YQUA 3TOTA 3UKKA 2E4GA 1Z6LA 2B1LA 5D8IA 2DMLA 2IMKA 3I6DA 4GRTA 1XPVA 3DWVA 1FW1A 1H86A 1U6TA 4WF5A 1CC2A 1PBDA 4TXOB 1K0CA 2BCPA 2GTUA 4TR4A 4LMVA 1J9BA 2BJXA 1OAZA 5ECLB 1AOGA 2B5EA 1FB6A 2WPEA 4MLYA 2HRFA 4CRTA 3NT6A 2HSMA 5D9XA 5JCGA 3L9VA 3QAWA 5LCZA 1TRSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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