1RAYA

The structure of human carbonic anhydrase ii in complex with bromide and azide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title The structure of human carbonic anhydrase II in complex with bromide and azide.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1rayA00
3IEOA 5E2KA 4M2RA 1F2WA 1FQRA 1I9OA 2NMXA 1KWRA 1CVHA 5JEGB 3MZCA 2NN7A 3MNUA 5G0CA 4HBAA 5G01A 5E2MA 4L5WA 1FQNA 3ZNCA 1CVCA 1HEDA 1BNTA 1ZFKA 1TBTX 3T82A 2FNKA 5EKMA 2WD2A 5SZ4A 3DA2A 1HEBA 1V9EA 3S97A 2NWYA 1ZNCA 4Q90A 5DOGA 2FMGA 3DCSA 4QTLA 4BCWA 1MOOA 1TEQX 1RJ6A 3HKQA 5DSRA 3M3XA 3ML2A 3FE4A 3KNEA 4JSZA 4GL1X 1CA2A 2GD8A 1CVAA 2CBCA 1IF4A 2CABA 4HU1A 2H4NA 2EU3A 4ILXA 5JEPB 4YYTA 3IAIA 1CAYA 4Q99A 3B4FA 4K13A 3F8EA 5FNHA 1UGGA 3S74B 1CNCA 3MMFA 3F4XA 3RZ5A 3V2MA 4FVOA 5FLSA 1HCBA 4KNIA 3M1KA 1G48A 4Z0QA 4K0ZA 5FNKA 2NNGA 4YGJA 3KWAA 1CZMA 1DCAA 1BV3A 4KUWA 1OQ5A 3JXHC 4M2VA 5FNJA 2WEHA 3P5AA 3P3HA 1BZMA 3TVOX 3OYSA 3IBUA 4Z1NA 4YGKA 4CNXA 3M1WA 1OKLA 4XFWA 2NWPA 4FU5A 5FLTA 4YXIA 4KNMA 2NWZA 1CAZA 1BN1A 2Q1BA 2CA2A 5J8ZA 1YO0A 1DMXA 3OIMA 5EHEA 4YX4A 3S73B 4TWLA 4BF6A 1CILA 1LGDA 1RZEA 3RJ7A 3V3FA 1CCUA 1J9WA 4R5BA 3M1QA 3RYJB 4QEFA 1ZSBA 4Q8YA 5G03A 3P3JA 1I90A 1BNVA 1OKNA 3DVCA 5JESB 1G46A 5FLOA 1RAZA 2ZNCA 4QIZA 3MNHA 3OY0A 1YO1A 2X7UA 4FVNA 5SZ2A 4E4AA 4Q9YA 5FLQA 4RUYA 1UGDA 3KLDB 3FFPX 1H9QA 2NNOA 3HKUA 3SAPA 2FW4A 4Q07A 1H4NA 3CYUA 3PJJA 1CINA 3DAZA 5JDVB 4CNVA 1YDBA 1ZGEA 3OKUA 3P55A 2FNMA 2HOCA 5JEHB 2OSFA 2POUA 5DVXA 2QOAA 1CNKA 3Q31A 3D8WA 3M5EA 3P58A 3NI5A 4LHIA 4Y0JA 5FL6A 3DBUA 2O4ZA 3CZVA 4CACA 4Q49A 4IDRX 3IGPA 4E3DA 5FLRA 1Y7WA 3HS4A 1CCSA 2FOQA 4E3HA 4RFDA 1BCDA 1CANA 1ZGFA 1BNWA 1RZCA 3M2ZA 3OYQA 4L5VA 4LU3A 5DSKA 4C3TA 1G52A 1HUGA 3NB5A 1CAKA 1G0FA 4K0SA 1TG9A 2FNNA 4K0TA 5FL5A 3EFTA 3T83A 4WL4A 4YXOA 3M5SA 1TH9A 3RLDA 4KAPA 4ZWZA 5EKHA 1HECA 3RZ1B 3F7UA 6CA2A 3UYNA 5EH8A 5FLPA 2EZ7A 5JG5B 3IBIA 1I9QA 1BNQA 1CNWA 1XQ0A 1ZH9A 5E2RA 4Q7VA 1BNNA 3KIGA 3VBDA 4JS6A 1OKMA 1FSNA 5FNLA 1CAJA 1AZMA 1JCZA 2CBDA 3U45X 2AW1A 1T9NA 3ZP9A 1TB0X 5DSOA 5L6KA 1KEQA 4YXUA 3T5UA 3M2NA 3HKNA 1BNMA 1LUGA 4ITPA 5E5UA 2HL4A 5IPZA 3TVNX 4FPTA 4XIWA 3KOIA 1RZBA 2CBEA 4ETQC 4HT2A 1CVFA 1IF5A 1I9PA 3ML5A 5SZ3A 1DMYA 2W2JA 2WEOA 4YGFA 3S78B 5CACA 3DD0A 4PZHA 5EHVA 1FQMA 4QJOA 4Q78A 2POWA 4Q8XA 4Q83A 4BF1A 1BN3A 2X7SA 4HF3A 2IT4A 1LZVA 1LG5A 5L3OA 4RUZA 3M96A 3NJ9A 4MTYA 4RIVA 12CAA 2FMZA 5DSLA 1A42A 1KOPA 5DOHA 3M04A 4WW6A 1BNUA 3KS3A 3L14A 4ZWIA 5A25A 4KUVA 4ZX1A 3T85A 3QYKA 1EOUA 3MHCA 4QJMA 3V5GA 2FOVA 1RZAA 3T84A 4QJWA 1KOQA 3RYYA 4QIYA 4KUYA 1HCAA 1IF8A 1JD0A 2NXRA 4Q06A 2POVA 4E3GA 2QP6A 1URTA 1I9LA 3EFIA 5E28A 2ILIA 1I9NA 1UGFA 1CAHA 1XPZA 3M5TA 4RUXA 3N0NA 3KONA 5C8IA 1CAMA 5FNIA 1CCTA 1UGBA 1ZE8A 4PYXA 3JXGA 3MHLA 4FIKA 5EOIA 3IBNA 4KV0A 5AMDA 4E5QA 1G4JA 3N4BA 2WEJA 1CNJA 4RIUA 2GEHA 2NWOA 3M2YA 5SZ0A 4HEZA 1CNYA 5EIJA 5EH5A 3HKTA 4Q0LA 1CRMA 4ZX0A 2F14A 1LG6A 1TTMA 3C7PA 3DVBA 4QK1A 4N0XB 3P44A 1YO2A 3RZ7A 1BN4A 3OKVA 1TG3A 4MDMA 2H15A 3SBIA 3HFPA 5JQ0A 1I9MA 2VVAX 3S9TA 4YVYA 5A6HA 2NXSA 5FDIA 3PO6A 2CBAA 4MLTA 4YWPA 3D9ZA 2FOUA 5AMGA 2HFWA 1G53A 3P5LA 3S71B 1FLJA 3IBLA 4ZAOA 4YGLA 2NN1A 3M40A 3KOKA 5LMDA 5G0BA 4QSJA 4M2UA 3S72B 3V3HB 4Q6DA 3P4VA 5BRUA 3HLJA 5EHWA 1FR4A 4G0CA 3RYVB 3BL1A 4PQ7A 1XEGA 1CRAA 1UGAA 1H9NA 3DC9A 3MNKA 4JSAA 3V3IB 2NXTA 1HEAA 1FR7A 4XE1A 5SZ7A 4HEYA 2X7TA 5E2NA 1DCBA 3K34A 4ZWYA 5JGTB 3RZ8A 3D92A 3RG3A 3MNJA 1TE3X 3OILA 3S8XA 1CNBA 7CA2A 4Q87A 4N16A 4E49A 1YDDA 1G45A 4QJPA 1AVNA 3BETA 1RAYA 5EKJA 1I91A 4JSWA 3RGEA 5FNMA 3SAXA 1CNXA 2Q38A 3W6IA 5SZ5A 3V7XA 4FRCA 1Z9YA 3T5ZA 5JG3B 5SZ1A 1G1DA 4L5UA 1Z97A 3V3JA 4QJ0A 4QSBA 1JV0A 4ZWXA 1CA3A 3CA2A 2QO8A 4Q7PA 5BRVA 3DCCA 4COQA 1I8ZA 5FDCA 4XZ5A 1FSRA 3V3GB 2HNCA 2WD3A 1CAIA 4PYYA 4X5SA 3LXEA 4MDGA 1CNHA 1IF9A 3D0NA 4RH2A 1ZFQA 3MNAA 3CAJA 4YGNA 4ITOA 1CVEA 5BNLA 5BYIA 5HPJA 3RYZA 4Q7WA 5DSIA 4CA2A 5DSQA 4DZ7A 4E3FA 2ABEA 1RZDA 3DC3A 4QSIA 3RG4A 4E9OX 3M1JA 3MWOA 4Q08A 4YHAA 3N2PA 1IF6A 1TEUX 5AMLA 5CLUA 4KP5A 1CNGA 4JSSA 4QSAA 3SBHA 1CAOA 8CA2A 4Z1JA 3M14A 3DVDA 3MHIA 1ZSAA 3U7CA 4MDLA 5CA2A 4Q8ZA 1ZSCA 3U3AX 5DSNA 1CNIA 3BL0A 3MHMA 4FL7A 1THKA 3DCWA 4R59A 3RZ0B 3N3JA 5FL4A 2NNVA 1XEVA 3M98A 5BRWA 3B1BA 5EZTX 3S77B 5JQTA 4Z1EA 1CVDA 2HD6A 4QK2A 3S76A 1G6VA 1KWQA 1G3ZA 4QK3A 3UYQA 5EH7A 2WEGA 2HKKA 4MO8A 1CIMA 1V9IC 1HUHA 3FW3A 1UGEA 1MUAA 4XIXA 5E2SA 4IWZA 3M2XA 5E5RA 4K1QA 1Z93A 1BICA 1G4OA 1YDAA 4WUPA 4WUQA 5FNGA 2OSMA 3S75B 3RYXB 3R16A 4TWMA 4QJXA 1FSQA 1CALA 3OIKA 4CNRA 4Q7SA 1CVBA 3PYKA 4HEWA 5SZ6A 2Q1QA 2VVBX 3K2FA 3K7KA 3D93A 1G54A 4LP6A 1YDCA 3DD8A 3M67A 4CQ0A 4Q81A 4Z1KA 4RN4A 4Q09A 4R5AA 3DV7A 5DRSA 2AX2A 4Q6EA 1RJ5A 3MNIA 4MLXA 1AM6A 4KNJA 3W6HA 4CNWA 4PXXA 5DSMA 1UGCA 5JGSB 4G7AA 4WW8A 3KKXA 5CJFA 1HVAA 4DZ9A 4RFCA 2CBBA 3MHOA 4QY3A 4UOVA 9CA2A 3JXFA 4WR7A 2EU2A 1IF7A 4M2WA 4HT0A 4KNNA 4KP8A 2FOYA 3MYQA 3TMJA 3F7BA 1FQLA 1G0EA 5DSPA 5DSJA 2FOSA 3MDZA 3U47A 2NNSA 3V2JA 3GZ0A 3R17B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IEO A;  5E2K A;  4M2R A;  1F2W A;  1FQR A;  1I9O A;  2NMX A;  1KWR A;  1CVH A;  5JEG B;  3MZC A;  2NN7 A;  3MNU A;  5G0C A;  4HBA A;  5G01 A;  5E2M A;  4L5W A;  1FQN A;  3ZNC A;  1CVC A;  1HED A;  1BNT A;  1ZFK A;  1TBT X;  3T82 A;  2FNK A;  5EKM A;  2WD2 A;  5SZ4 A;  3DA2 A;  1HEB A;  1V9E A;  3S97 A;  2NWY A;  1ZNC A;  4Q90 A;  5DOG A;  2FMG A;  3DCS A;  4QTL A;  4BCW A;  1MOO A;  1TEQ X;  1RJ6 A;  3HKQ A;  5DSR A;  3M3X A;  3ML2 A;  3FE4 A;  3KNE A;  4JSZ A;  4GL1 X;  1CA2 A;  2GD8 A;  1CVA A;  2CBC A;  1IF4 A;  2CAB A;  4HU1 A;  2H4N A;  2EU3 A;  4ILX A;  5JEP B;  4YYT A;  3IAI A;  1CAY A;  4Q99 A;  3B4F A;  4K13 A;  3F8E A;  5FNH A;  1UGG A;  3S74 B;  1CNC A;  3MMF A;  3F4X A;  3RZ5 A;  3V2M A;  4FVO A;  5FLS A;  1HCB A;  4KNI A;  3M1K A;  1G48 A;  4Z0Q A;  4K0Z A;  5FNK A;  2NNG A;  4YGJ A;  3KWA A;  1CZM A;  1DCA A;  1BV3 A;  4KUW A;  1OQ5 A;  3JXH C;  4M2V A;  5FNJ A;  2WEH A;  3P5A A;  3P3H A;  1BZM A;  3TVO X;  3OYS A;  3IBU A;  4Z1N A;  4YGK A;  4CNX A;  3M1W A;  1OKL A;  4XFW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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