5DOHA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 2-[(1s)-2,3-dihydro-1h-inden-1-ylamino]-3,5,6-trifluoro-4-[(2-hydroxyethyl)thio]benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Intrinsic Thermodynamics and Structures of 2,4- and 3,4-Substituted Fluorinated Benzenesulfonamides Binding to Carbonic Anhydrases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dohA00
1ZGFA 5L3OA 1TB0X 2AW1A 3MDZA 4HU1A 4PYYA 1V9IC 4WUQA 4Z1KA 1G53A 5JEGB 3OYSA 1XQ0A 1I90A 5LMDA 1HEBA 3RYYA 3KS3A 4E49A 4KP5A 4BCWA 3HLJA 3S8XA 3RZ1B 1DCBA 5E5RA 1I9LA 4RH2A 3KWAA 4QK1A 4YX4A 1ZSCA 3M5SA 1Z9YA 3F4XA 5EH8A 1CNXA 3NJ9A 2CA2A 3RLDA 2CBBA 5FNGA 3TVNX 3V3GB 4Q78A 4RFCA 2H15A 1I9NA 3IBLA 3MNUA 3S77B 3D0NA 5EOIA 3VBDA 3ZNCA 3W6IA 5AMDA 1BN1A 1ZNCA 3KONA 4Q09A 1I9MA 5EHVA 9CA2A 4QIZA 5JGTB 4FIKA 5J8ZA 1Z97A 1FQRA 1G48A 2NNVA 4Q8XA 4CNRA 2VVAX 4IDRX 1RZBA 1ZGEA 3P3HA 2ABEA 5SZ5A 5DSMA 2NNGA 3N2PA 3N0NA 4MTYA 2WD2A 5SZ3A 4XIWA 5FNJA 5DSNA 3ML2A 2HD6A 2GEHA 5DSRA 4R5BA 4LP6A 5JGSB 1CA2A 3V3FA 5DOGA 3K2FA 1THKA 3ZP9A 5DSJA 5JESB 1XEGA 4QEFA 5JEPB 5JDVB 1G4JA 1LZVA 1LUGA 4RFDA 5JQ0A 4TWLA 3HKNA 4PZHA 4QSAA 1G0EA 7CA2A 4CACA 3M14A 3M98A 3P5AA 5A6HA 1CIMA 1CVBA 2ZNCA 4RIUA 5JEHB 3D93A 2X7SA 3M2NA 3OYQA 1AVNA 1RZEA 4KUYA 5EZTX 4Q7WA 3KIGA 3T5ZA 4M2UA 1RJ5A 4ITPA 4Q08A 3S76A 8CA2A 2QOAA 5DOHA 1CVFA 5EH7A 1AZMA 4Q7SA 3HKQA 1T9NA 2HFWA 1HECA 1G45A 3S78B 5DSIA 3PO6A 2FOUA 3EFTA 4Q49A 4HT0A 4FL7A 3N3JA 4QJXA 1CANA 1CNBA 3U45X 3V2MA 1CNKA 2X7UA 1CZMA 5JQTA 5FDCA 3B4FA 4UOVA 4HEZA 5AMLA 3V5GA 3D9ZA 4QJOA 3TMJA 3P58A 4MLTA 1LG6A 1CVAA 1A42A 5FDIA 3DCWA 3B1BA 3S72B 2POVA 3V3HB 3W6HA 4Z1NA 3PYKA 3IEOA 4FRCA 5C8IA 1AM6A 3JXFA 4GL1X 5E2NA 5SZ1A 3MNJA 4Q99A 4KUVA 3M40A 4LU3A 1TTMA 5DVXA 4R5AA 2NNOA 3M5EA 1I9PA 1YDCA 3DCCA 5SZ7A 1HEAA 3DBUA 1BZMA 2POWA 4K0ZA 3MHIA 4YWPA 3RZ0B 4YGKA 1ZE8A 3OILA 4QSJA 1IF8A 1BICA 3RZ7A 1KEQA 5CJFA 3S9TA 2NWYA 3M1JA 2POUA 2CABA 1JCZA 1I91A 5IPZA 3MHOA 3RYVB 1CAYA 3M1WA 3U7CA 5DSQA 3DVCA 1RAZA 1CINA 1G54A 4CNXA 4QK3A 1CALA 3M2XA 1CILA 4YXUA 1UGDA 4K13A 4G0CA 4YGNA 1FSRA 1CRMA 1UGCA 1BNWA 3U47A 3D8WA 3MNAA 3OIMA 3RG4A 4Q7VA 1CVCA 5FLRA 3S73B 3EFIA 3NB5A 4Q87A 3MWOA 4KUWA 1CVDA 3CAJA 3RGEA 1G6VA 1YO1A 1G3ZA 2WD3A 1ZSAA 3SBIA 3MHLA 5CACA 1CNHA 3DC3A 2ILIA 5FNKA 1H4NA 1TE3X 4WW6A 3ML5A 4RUZA 1KOPA 2EU3A 3RG3A 1OKMA 4E3HA 4Q8ZA 1ZFKA 2WEHA 3DCSA 4L5UA 5SZ0A 2F14A 1FQNA 4ZWZA 3R17B 1UGAA 1CVEA 3HKTA 3IBIA 4Z1JA 3GZ0A 5FLSA 5G0BA 5FLOA 4ILXA 4M2RA 1TBTX 1EOUA 2FNNA 4Q6EA 2Q1QA 4Q6DA 5EKHA 4C3TA 4DZ9A 2NWZA 3FFPX 3QYKA 4CQ0A 3K7KA 4HEWA 1I8ZA 1OKNA 2CBDA 4Q81A 2HNCA 3R16A 4XIXA 1TEUX 5FNHA 1YDBA 1CCTA 5DSKA 2WEJA 1G1DA 4ZWIA 3MNIA 2QP6A 4COQA 1BNNA 5DSOA 5FLQA 3DVBA 5DRSA 3KOIA 4JSWA 3RJ7A 4QSBA 3UYNA 4PQ7A 1CAOA 4KNNA 4E5QA 1CNYA 5BYIA 1J9WA 1FSQA 1LGDA 1KOQA 1DCAA 3KOKA 5E28A 6CA2A 4ZWYA 4FVOA 3CYUA 1RZDA 5FL4A 1OQ5A 1BNVA 4QJ0A 5SZ2A 1CVHA 3DD0A 4ETQC 1HEDA 2X7TA 1UGEA 4K0SA 3DC9A 4Q06A 1FQLA 3P3JA 4Q07A 3OY0A 5BNLA 3MHCA 2FOVA 4N0XB 2NWOA 3BL0A 3JXHC 3V7XA 3M96A 5FL5A 1BCDA 1CAKA 4Q8YA 1TG9A 3RYXB 1F2WA 5L6KA 3KNEA 1ZH9A 4Q9YA 3M04A 3C7PA 2WEGA 1KWQA 4RUYA 4YXOA 1YDAA 1UGGA 2NN1A 5G01A 4ZX0A 2QO8A 3JXGA 3T82A 3DV7A 5EHWA 4Y0JA 1ZSBA 3T85A 2EU2A 3M1QA 3BL1A 2NN7A 1TEQX 2IT4A 5E2MA 4YGLA 4YXIA 12CAA 4HBAA 5EKJA 4FPTA 5BRVA 4YVYA 4CNVA 4ZAOA 1YO0A 3TVOX 4PYXA 1URTA 5AMGA 1I9OA 3NI5A 1CNCA 1CNWA 3Q31A 3DA2A 4IWZA 4MO8A 2FOSA 4Q83A 4QJMA 4R59A 3S74B 4CA2A 3OKUA 1YDDA 1BNMA 5FNIA 1UGFA 5DSPA 4E3DA 3M3XA 3FW3A 4Z0QA 1G46A 3M5TA 5HPJA 1RZCA 4Q7PA 3OIKA 5BRUA 1HCBA 2EZ7A 1CCUA 4MDGA 4L5WA 3RYZA 1CRAA 4E9OX 1FQMA 1MOOA 3RZ5A 1CA3A 4WL4A 4FU5A 4QK2A 2FOQA 1RJ6A 1IF5A 3V2JA 1BN3A 5FLTA 1IF6A 1TG3A 1DMXA 1JV0A 2GD8A 3CA2A 2CBEA 4L5VA 2OSMA 2FNMA 3MZCA 2FW4A 2FOYA 4MLXA 4YGFA 3SBHA 4WW8A 4YYTA 5E5UA 4KP8A 4YGJA 1Y7WA 2VVBX 3LXEA 3V3IB 3SAXA 2CBAA 3DVDA 2NNSA 1CNIA 5DSLA 5G03A 1MUAA 4E3GA 1IF7A 3M1KA 3KLDB 2AX2A 1HUHA 3K34A 2WEOA 4QSIA 1LG5A 1OKLA 2Q38A 3S97A 1XEVA 3OKVA 3IAIA 1FR4A 5FLPA 2OSFA 4HF3A 4K0TA 3P44A 1CAHA 1BNUA 4KNMA 3S71B 1JD0A 3KKXA 4LHIA 4ZX1A 4BF6A 2NWPA 4E4AA 3M2YA 3F7UA 3MMFA 3RZ8A 4JS6A 2H4NA 4JSAA 1CAIA 4KNJA 3MNHA 1FSNA 4RUXA 3FE4A 4G7AA 4HT2A 4M2VA 4WUPA 2O4ZA 4BF1A 5CA2A 4KNIA 1BNQA 1CAMA 2NXRA 1HCAA 4RIVA 1BV3A 3SAPA 1TH9A 4M2WA 4JSZA 3T84A 4XFWA 4K1QA 4QTLA 1I9QA 2NMXA 1CAZA 1UGBA 1YO2A 3CZVA 5E2RA 2HOCA 3L14A 1XPZA 2CBCA 4MDLA 4N16A 3V3JA 1CNGA 4PXXA 3HS4A 3S75B 5E2KA 3MHMA 5G0CA 4DZ7A 2FMZA 2NXTA 4MDMA 3P55A 3P4VA 4WR7A 5EIJA 4Q90A 5JG3B 4QIYA 3BETA 1HVAA 1RAYA 3PJJA 5BRWA 1CAJA 2FNKA 3M67A 1KWRA 5FNLA 1G52A 5EKMA 2W2JA 1RZAA 1H9NA 1G0FA 1IF9A 2HL4A 3D92A 1DMYA 4ZWXA 1FLJA 1H9QA 3UYQA 3DD8A 3MYQA 1CNJA 4Q0LA 3U3AX 3T83A 4TWMA 1G4OA 5CLUA 4Z1EA 5A25A 2Q1BA 5SZ6A 4QJWA 5EH5A 1HUGA 4ITOA 4YHAA 2HKKA 3HFPA 3F7BA 4KAPA 3HKUA 5JG5B 4QY3A 4HEYA 1BNTA 4CNWA 5EHEA 1V9EA 1Z93A 4JSSA 1CCSA 2NXSA 3DAZA 5FL6A 1ZFQA 3T5UA 5SZ4A 4E3FA 3P5LA 3F8EA 4RN4A 3N4BA 4FVNA 1BN4A 4KV0A 3IBNA 3M2ZA 4XE1A 5FNMA 4QJPA 4XZ5A 1FR7A 2FMGA 3IBUA 4X5SA 1IF4A 3IGPA 3RYJB 3MNKA 5E2SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZGF A;  5L3O A;  1TB0 X;  2AW1 A;  3MDZ A;  4HU1 A;  4PYY A;  1V9I C;  4WUQ A;  4Z1K A;  1G53 A;  5JEG B;  3OYS A;  1XQ0 A;  1I90 A;  5LMD A;  1HEB A;  3RYY A;  3KS3 A;  4E49 A;  4KP5 A;  4BCW A;  3HLJ A;  3S8X A;  3RZ1 B;  1DCB A;  5E5R A;  1I9L A;  4RH2 A;  3KWA A;  4QK1 A;  4YX4 A;  1ZSC A;  3M5S A;  1Z9Y A;  3F4X A;  5EH8 A;  1CNX A;  3NJ9 A;  2CA2 A;  3RLD A;  2CBB A;  5FNG A;  3TVN X;  3V3G B;  4Q78 A;  4RFC A;  2H15 A;  1I9N A;  3IBL A;  3MNU A;  3S77 B;  3D0N A;  5EOI A;  3VBD A;  3ZNC A;  3W6I A;  5AMD A;  1BN1 A;  1ZNC A;  3KON A;  4Q09 A;  1I9M A;  5EHV A;  9CA2 A;  4QIZ A;  5JGT B;  4FIK A;  5J8Z A;  1Z97 A;  1FQR A;  1G48 A;  2NNV A;  4Q8X A;  4CNR A;  2VVA X;  4IDR X;  1RZB A;  1ZGE A;  3P3H A;  2ABE A;  5SZ5 A;  5DSM A;  2NNG A;  3N2P A;  3N0N A;  4MTY A;  2WD2 A;  5SZ3 A;  4XIW A;  5FNJ A;  5DSN A;  3ML2 A;  2HD6 A;  2GEH A;  5DSR A;  4R5B A;  4LP6 A;  5JGS B;  1CA2 A;  3V3F A;  5DOG A;  3K2F A;  1THK A;  3ZP9 A;  5DSJ A;  5JES B;  1XEG A;  4QEF A;  5JEP B;  5JDV B;  1G4J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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