2OSMA

Inhibition of carbonic anhydrase ii by thioxolone: a mechanistic and structural study
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Inhibition of Carbonic Anhydrase II by Thioxolone: A Mechanistic and Structural Study.
pubmed doi rcsb
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2007-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2osmA00
1OQ5A 4BF6A 1CNWA 3MHLA 4QJOA 1BCDA 4PYXA 4MDMA 5SZ4A 3M67A 4Q09A 5A6HA 3ZP9A 4YHAA 3DCWA 4YGJA 3RYYA 3U47A 3S97A 4R5AA 4K0TA 5LMDA 5FLPA 5E2MA 1ZSAA 4LP6A 5DOHA 5AMGA 5E5RA 1F2WA 5EHWA 2HL4A 4FVOA 5G01A 3SBHA 5IPZA 4KNNA 1CNYA 3MNHA 3P3JA 2WEOA 4Z1JA 1BICA 3NB5A 4YXOA 1AM6A 3HKQA 4JSWA 4RUXA 3S72B 3LXEA 2QOAA 4Q7PA 5JG3B 3HFPA 1CAKA 5CJFA 1I91A 1CVAA 3T84A 4GL1X 3M40A 3MNKA 4ZWYA 2FOVA 4Q6EA 5FNMA 1KOPA 4E5QA 4LU3A 1BNWA 1CALA 4PZHA 1UGGA 1CVCA 2NNOA 4HF3A 4Q7SA 3MHIA 4R5BA 1HEAA 5FLOA 1Z93A 4M2UA 4WR7A 2NXRA 1CRMA 3CA2A 1V9IC 1KWQA 1YDDA 4RN4A 4Q81A 5EH5A 3OIKA 1FQMA 4MO8A 3S76A 3DBUA 1CCSA 3OIMA 1ZH9A 5DSRA 4Z1KA 1FR4A 3DD0A 3MNIA 5SZ7A 1IF9A 4KUYA 4WUPA 4M2RA 5FNLA 3MDZA 2W2JA 1KOQA 3DD8A 3N3JA 3MNJA 3PYKA 1I9NA 1CAOA 1CVEA 1IF8A 3RJ7A 3OYSA 4K0ZA 4FIKA 4QSAA 5SZ3A 4CNRA 3M2ZA 5EKMA 2FW4A 4YWPA 3VBDA 3M2XA 3CAJA 3KNEA 4TWLA 5JDVB 3V3FA 5DSPA 2NMXA 5CLUA 3M1QA 2HKKA 2ZNCA 4LHIA 4DZ9A 4Q08A 3MHCA 5L3OA 3FFPX 5FNHA 5DSLA 1HECA 1HEBA 4G0CA 1CAMA 3MYQA 1DMYA 5FNJA 4HU1A 4XE1A 3RGEA 4YXUA 4YX4A 1CA2A 5E2RA 4MDGA 3DA2A 5JG5B 3N4BA 3MWOA 4ETQC 5FNKA 3W6IA 5DSKA 2X7SA 2NN7A 5J8ZA 1TBTX 3DV7A 3OKVA 1I9LA 3S73B 4L5WA 3S78B 1G6VA 4Y0JA 1YDBA 4QEFA 1YDAA 5AMDA 3D93A 5EKHA 5FLSA 5DSIA 3RZ5A 4ZWIA 1UGBA 4XIWA 3TVNX 1BNVA 1DCBA 3MZCA 4KP8A 3S75B 3OILA 3ZNCA 1YDCA 4HEWA 4ITPA 1RZBA 4CNXA 3DCCA 1XEVA 3KIGA 4E3DA 4KUVA 1ZFKA 1CNBA 3BL1A 4KNIA 5BRVA 3OKUA 5E2KA 1BNQA 4DZ7A 4QSJA 4QJPA 4MDLA 4XIXA 3PO6A 5CA2A 1G48A 3N2PA 1AVNA 2CBCA 3RYJB 5CACA 4ILXA 12CAA 4HT0A 3IBLA 1TB0X 4E9OX 4E3HA 3M5TA 2NNSA 3M96A 5JGSB 3FW3A 1G53A 2NWPA 3S77B 4Z0QA 4YGFA 4CA2A 4QJMA 1G4OA 4E49A 4QK3A 1TE3X 1TG3A 1V9EA 1AZMA 3HKUA 5DSJA 1UGCA 1I8ZA 1BNNA 1G0EA 1BN3A 1XQ0A 1CNIA 1HUGA 5E2NA 2NXTA 3U3AX 5FL5A 3B1BA 4FPTA 4HEYA 4C3TA 2WEHA 3MHMA 4KNJA 3W6HA 5A25A 1DCAA 4L5VA 3D0NA 4M2VA 3IBIA 4QTLA 3V2JA 5BRWA 2CBBA 3OY0A 3EFIA 4QSBA 4Q06A 4QY3A 3DVBA 4N16A 1LGDA 5C8IA 3T5ZA 3UYNA 3F8EA 2EU2A 3NI5A 2CBEA 4PQ7A 1G3ZA 4JSZA 3M2NA 4RUZA 5EHEA 3DCSA 2EZ7A 2NN1A 3GZ0A 2HOCA 4Q83A 5SZ2A 1CAJA 2FOSA 5DVXA 3KONA 1BN4A 4ITOA 1CRAA 1HCBA 3U45X 4HBAA 3ML5A 4COQA 2ILIA 4Q8YA 5SZ0A 1CCTA 3TVOX 4G7AA 2WEJA 3R17B 5FL6A 5JQ0A 1LG5A 5EH7A 3M1JA 4IWZA 4CQ0A 2VVAX 3Q31A 3D8WA 3F7BA 3R16A 3S9TA 1ZGFA 1CVHA 5EKJA 1FLJA 3HS4A 4Q9YA 1BV3A 3K7KA 3RYZA 2EU3A 1TH9A 4IDRX 3T83A 1J9WA 3IAIA 4Q7WA 3HLJA 3KLDB 4KV0A 1LUGA 1OKLA 4RFDA 4RFCA 1ZGEA 3S71B 1JCZA 1CAZA 1IF4A 3KOKA 3TMJA 5DSOA 3SAPA 1G45A 1FSRA 3K2FA 5HPJA 1YO1A 2NXSA 3DVCA 3M04A 5FL4A 3B4FA 3RZ7A 4JSSA 1TTMA 4CACA 4Q0LA 4R59A 2HNCA 3P5LA 4Q90A 1CA3A 5FDIA 3U7CA 1IF7A 5JEHB 4MLTA 5SZ6A 1FQLA 5DRSA 1CILA 1RAYA 4UOVA 3RYVB 3RZ1B 1FQRA 4QIYA 3S74B 4Q49A 4FU5A 1YO2A 4Q99A 3JXFA 1CCUA 1ZSCA 3P44A 5DSNA 4QJXA 1CNJA 5EZTX 5FLRA 2FNNA 5E2SA 3SBIA 3SAXA 1H4NA 4QIZA 4MLXA 3D9ZA 3KS3A 3NJ9A 1CAYA 1G52A 5JEGB 3IBNA 9CA2A 4CNVA 1IF6A 5E5UA 4PXXA 4YYTA 1G0FA 3M2YA 4JSAA 3MMFA 4MTYA 2QO8A 4XFWA 1H9NA 4FRCA 1CAIA 4Q7VA 2Q38A 3C7PA 1JV0A 4E4AA 4ZX0A 5FLTA 3HKNA 1BZMA 3RG4A 2NWZA 1FSQA 1CANA 1BNMA 4K13A 2Q1BA 2FNMA 3T85A 3MNAA 7CA2A 4KAPA 4Q8ZA 4FVNA 3K34A 3L14A 2WEGA 1T9NA 5JEPB 4YGLA 3HKTA 1IF5A 3P4VA 4BF1A 3BETA 4ZWXA 1ZSBA 3EFTA 3F4XA 3IBUA 1UGEA 4Q6DA 3M1WA 1I9QA 5BRUA 3DC9A 2X7TA 4HT2A 3V3HB 2Q1QA 3DAZA 4KNMA 3T82A 2H4NA 1G1DA 2IT4A 4PYYA 2HD6A 3D92A 1I9OA 4RIUA 4ZX1A 1FR7A 4K1QA 5L6KA 3V3IB 1CNHA 1BNUA 4CNWA 1I9PA 1RZCA 4TWMA 1KEQA 1TEQX 2H15A 1HUHA 4YXIA 4YGKA 1H9QA 5EH8A 3M14A 4BCWA 4N0XB 5SZ5A 1CAHA 5EHVA 3S8XA 5FNGA 5BYIA 5EOIA 5JQTA 3KKXA 4FL7A 1CVFA 1A42A 3M1KA 2FNKA 1UGAA 2POUA 5JGTB 2FMGA 1ZFQA 2WD2A 1LG6A 3BL0A 1THKA 4K0SA 1RZAA 2CABA 2CBDA 1CZMA 4QSIA 3OYQA 2CBAA 1OKMA 3M98A 1ZNCA 1UGDA 4XZ5A 1CNKA 4QJ0A 2NNVA 4RUYA 4WUQA 4Q8XA 1CNCA 2GD8A 3QYKA 1YO0A 3CYUA 1RJ6A 1G46A 2NWOA 4HEZA 1RZDA 5G0BA 1RAZA 4WL4A 1CVDA 2NNGA 4X5SA 3JXHC 1G54A 3P58A 2AW1A 3MHOA 1FQNA 2POWA 5EIJA 2GEHA 5G03A 5G0CA 8CA2A 1XEGA 1HVAA 1OKNA 2FOQA 4JS6A 4YVYA 3V5GA 4YGNA 3FE4A 3RLDA 1Z9YA 1HCAA 5JESB 2CA2A 1ZE8A 3JXGA 3DVDA 3M5SA 1LZVA 5FNIA 3M5EA 1XPZA 3DC3A 3F7UA 3P5AA 4M2WA 1BNTA 1CVBA 3IGPA 2WD3A 1TG9A 4Q07A 1CIMA 1I9MA 3P55A 3RZ8A 1MOOA 3MNUA 3RZ0B 3PJJA 2HFWA 2F14A 2FMZA 3V3JA 2POVA 3P3HA 3UYQA 1TEUX 3V3GB 1CNXA 3N0NA 5E28A 3RG3A 4QK1A 4WW6A 1EOUA 1Y7WA 4L5UA 6CA2A 4KP5A 3ML2A 3KOIA 2NWYA 1MUAA 3V7XA 4E3GA 1BN1A 2FOYA 2O4ZA 4QK2A 4RH2A 3M3XA 4ZWZA 4E3FA 5DSQA 2ABEA 4QJWA 5DOGA 2X7UA 1UGFA 5DSMA 1DMXA 4Q87A 1CINA 1G4JA 3IEOA 4ZAOA 1RZEA 5SZ1A 1KWRA 5AMLA 5FDCA 1I90A 5BNLA 4Z1EA 4Z1NA 2AX2A 3CZVA 4RIVA 4KUWA 1HEDA 2OSMA 3RYXB 2FOUA 1Z97A 3KWAA 4WW8A 5FLQA 3V2MA 1FSNA 2VVBX 4Q78A 1JD0A 2OSFA 1RJ5A 1URTA 2QP6A 3T5UA 1CNGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OQ5 A;  4BF6 A;  1CNW A;  3MHL A;  4QJO A;  1BCD A;  4PYX A;  4MDM A;  5SZ4 A;  3M67 A;  4Q09 A;  5A6H A;  3ZP9 A;  4YHA A;  3DCW A;  4YGJ A;  3RYY A;  3U47 A;  3S97 A;  4R5A A;  4K0T A;  5LMD A;  5FLP A;  5E2M A;  1ZSA A;  4LP6 A;  5DOH A;  5AMG A;  5E5R A;  1F2W A;  5EHW A;  2HL4 A;  4FVO A;  5G01 A;  3SBH A;  5IPZ A;  4KNN A;  1CNY A;  3MNH A;  3P3J A;  2WEO A;  4Z1J A;  1BIC A;  3NB5 A;  4YXO A;  1AM6 A;  3HKQ A;  4JSW A;  4RUX A;  3S72 B;  3LXE A;  2QOA A;  4Q7P A;  5JG3 B;  3HFP A;  1CAK A;  5CJF A;  1I91 A;  1CVA A;  3T84 A;  4GL1 X;  3M40 A;  3MNK A;  4ZWY A;  2FOV A;  4Q6E A;  5FNM A;  1KOP A;  4E5Q A;  4LU3 A;  1BNW A;  1CAL A;  4PZH A;  1UGG A;  1CVC A;  2NNO A;  4HF3 A;  4Q7S A;  3MHI A;  4R5B A;  1HEA A;  5FLO A;  1Z93 A;  4M2U A;  4WR7 A;  2NXR A;  1CRM A;  3CA2 A;  1V9I C;  1KWQ A;  1YDD A;  4RN4 A;  4Q81 A;  5EH5 A;  3OIK A;  1FQM A;  4MO8 A;  3S76 A;  3DBU A;  1CCS A;  3OIM A;  1ZH9 A;  5DSR A;  4Z1K A;  1FR4 A;  3DD0 A;  3MNI A;  5SZ7 A;  1IF9 A;  4KUY A;  4WUP A;  4M2R A; 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