4KNMA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 2-chloro-4-{[(4,6-dimethylpyrimidin-2-yl)sulfanyl]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
LSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
publication title Benzenesulfonamides with pyrimidine moiety as inhibitors of human carbonic anhydrases I, II, VI, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-05-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4knmA00
4QSIA 1KOPA 1I9QA 1LG5A 1YO0A 5EH5A 5DSKA 4CA2A 5SZ0A 1CNGA 5SZ2A 3V5GA 4KNNA 5AMLA 5A25A 1FQMA 2CBCA 2NWYA 2QO8A 5SZ1A 2CBEA 3SBIA 1BNWA 1HEDA 4BCWA 5FLSA 1G53A 4JSWA 4MDLA 3OIMA 4IWZA 2FOVA 3ZNCA 1ZSAA 1XEGA 2Q1QA 4KP5A 4RUYA 1I9OA 2WEHA 3KOKA 1IF4A 2F14A 4RFDA 4RN4A 3MNUA 5G01A 4ILXA 3U45X 2CBBA 3MNIA 1BNUA 1TE3X 4K0ZA 4WUPA 2POVA 1KWRA 3OYQA 4Q6DA 1RZAA 5E2MA 3S72B 5G0BA 5JQ0A 4CQ0A 1RZCA 3RGEA 4Q8ZA 4Q7WA 5FLTA 1IF5A 1CVCA 5DOGA 4ETQC 4FVNA 4JSSA 2NNOA 3M5EA 2Q1BA 3K7KA 6CA2A 3P3JA 4QSBA 3S76A 3M1KA 3SAXA 5CA2A 4MO8A 2HOCA 1I90A 3HKNA 5J8ZA 3M3XA 5BYIA 3V3IB 2WD2A 1RZEA 1CANA 5E28A 2NXTA 1TEUX 4MLTA 4Z0QA 1LGDA 4Z1EA 4E5QA 2FNNA 1TG9A 3FW3A 3T83A 4Z1KA 4G0CA 3M1QA 4HF3A 1I91A 4MDGA 4Q99A 1TB0X 1IF7A 5DSLA 1I9PA 2OSFA 3EFTA 3IGPA 4Q49A 2WEJA 4YXOA 3N2PA 2EZ7A 1CNWA 1UGCA 3DD0A 3T5ZA 2EU2A 3D9ZA 3IEOA 2OSMA 2X7UA 5FL6A 3RZ1B 1ZNCA 4Y0JA 1CAIA 1UGFA 4ITOA 1BNNA 2FOUA 4E3HA 3TVOX 3DC9A 1CAMA 3JXGA 2HL4A 3S97A 4QY3A 4Z1JA 4Q6EA 1UGBA 5JG5B 1HECA 2O4ZA 2CA2A 1BN4A 3MZCA 3DD8A 5EHVA 4HU1A 4QIYA 3KOIA 3TMJA 4KV0A 4QJXA 5FNKA 1CCTA 3V3FA 4ZAOA 1KOQA 5DSOA 1CNHA 3M14A 3MHOA 3DCWA 4Q9YA 3KWAA 3U3AX 3P5AA 3QYKA 4HEYA 3D93A 5AMGA 1ZE8A 4DZ9A 5DSNA 4IDRX 1CNKA 1JD0A 3NJ9A 1UGEA 4JSZA 3HFPA 4QJOA 1CIMA 4X5SA 3Q31A 3OILA 4K0TA 1MOOA 4YGKA 5DSMA 4QJ0A 3PYKA 5A6HA 4QJPA 4N0XB 1ZGEA 5DRSA 5SZ7A 1ZH9A 5E5UA 5G0CA 1DCAA 1Z97A 5FLOA 3RZ5A 1HCAA 1V9EA 4FVOA 1G4JA 2NNSA 3MNHA 5BRWA 3B1BA 1CNJA 1J9WA 4XE1A 1I9LA 3DVCA 3V3HB 2W2JA 5JESB 2IT4A 4KUVA 5HPJA 5JGTB 1THKA 3D0NA 4RIVA 4K1QA 5L6KA 3RZ7A 3S78B 1A42A 4ZWZA 1TEQX 4ZWIA 4YHAA 4N16A 2NMXA 4K0SA 4RFCA 4QJWA 1FQLA 1HUHA 2AW1A 1YDAA 3DV7A 3T82A 2HKKA 2ILIA 1KWQA 5JDVB 3OKUA 1FSRA 1HUGA 1URTA 4JSAA 1AM6A 3B4FA 4YX4A 3ZP9A 3JXHC 3BL1A 4HT2A 4KNJA 3VBDA 1EOUA 3IBLA 1OKMA 2VVAX 3SBHA 3P58A 2QOAA 1I9MA 1CNYA 1CINA 1HEAA 4PYXA 4Q7VA 5E2SA 2NXRA 5EH7A 1CAZA 4QSAA 3RZ8A 5FL4A 2FW4A 3T5UA 4Q83A 4QEFA 3V2MA 3CYUA 3NI5A 3KNEA 2WD3A 1UGGA 2WEOA 3UYNA 4RH2A 5FL5A 4HBAA 1OKNA 3SAPA 1IF9A 3R17B 3FFPX 2ZNCA 3MHCA 1TH9A 1HEBA 1T9NA 4YGJA 3P55A 3EFIA 2NWOA 1CNBA 1LUGA 4BF1A 1BN1A 3DVDA 4QK1A 2H4NA 1BNTA 5EIJA 4R5AA 4L5VA 3S8XA 2Q38A 2GD8A 1RAZA 1BV3A 5FDCA 4M2RA 1H9QA 3IBIA 3KKXA 5EOIA 3P5LA 3RG4A 3S73B 4YGNA 1F2WA 3MYQA 4L5WA 1CVAA 3HKTA 1BNMA 3OY0A 4Q07A 5FNJA 4LHIA 1CAKA 3CA2A 3N4BA 3P4VA 1G45A 5FDIA 3MHLA 5EH8A 3RYXB 2CBDA 5C8IA 1CCUA 4WR7A 4KUWA 4Q7PA 8CA2A 4CNXA 1OQ5A 1ZSCA 4WW8A 1AZMA 4KUYA 4Z1NA 5JGSB 1CA2A 3NB5A 4TWMA 4KP8A 4Q78A 1ZFKA 2FMZA 1CNCA 2FNMA 4R5BA 4Q8YA 3M96A 1Z9YA 1RJ5A 1CNIA 5BNLA 2FNKA 4QTLA 1UGDA 5FNIA 5E2KA 1FSNA 3W6IA 3S77B 5DSJA 4PXXA 4Q90A 5IPZA 1DMYA 4PQ7A 3KONA 3DCCA 1FQRA 2HD6A 2VVBX 4LP6A 5DSQA 3L14A 2NN7A 4E4AA 5E5RA 1G3ZA 2HNCA 1BZMA 2NN1A 1CA3A 5CJFA 3K2FA 3BETA 1CAHA 3DA2A 1CCSA 1IF6A 4QK3A 2CBAA 4Q06A 1LG6A 1MUAA 5DSPA 3HKQA 1ZFQA 4M2VA 3IAIA 3HLJA 3DVBA 1BN3A 4WUQA 5FLPA 3V3GB 2X7TA 1AVNA 5DOHA 4LU3A 3M1WA 1I8ZA 5DVXA 4BF6A 4Q81A 1FSQA 4PYYA 4YYTA 4HEZA 4TWLA 4QIZA 5JEPB 5FNLA 4K13A 1I9NA 4XIXA 3RLDA 3UYQA 4C3TA 2H15A 3JXFA 1CNXA 3MHMA 3M2XA 3P44A 3FE4A 1BCDA 3U47A 3RYJB 1ZGFA 4Q09A 3PJJA 1ZSBA 4YXUA 1HCBA 5FLRA 3MHIA 3RZ0B 3S9TA 1JV0A 3DC3A 1TBTX 4YGLA 3MWOA 3D8WA 3N0NA 5CACA 1CVHA 3F7UA 5EZTX 4RUZA 3MNAA 3HS4A 2QP6A 1FR4A 3MNKA 3GZ0A 3BL0A 4FRCA 2NNGA 1CVFA 4YGFA 5EHEA 2NWPA 3MMFA 3N3JA 1FR7A 4ZWXA 2NXSA 1YO1A 3RYVB 3PO6A 2FMGA 5SZ3A 1XPZA 2EU3A 5SZ4A 3T85A 2FOYA 3S75B 3M1JA 3ML2A 5JG3B 1V9IC 1G4OA 2ABEA 9CA2A 3M2YA 3S71B 5JEHB 12CAA 1RJ6A 5DSRA 1G0EA 1CRMA 4E3FA 3OYSA 4MTYA 5SZ5A 5FNMA 3W6HA 3T84A 1G48A 2WEGA 2POWA 3P3HA 1YDCA 4DZ7A 5LMDA 3V3JA 4RIUA 4ITPA 4CNVA 2GEHA 5EHWA 1BNVA 4RUXA 2NNVA 4FIKA 4G7AA 4Q0LA 3F8EA 3M40A 4XZ5A 2AX2A 4R59A 4YWPA 3DBUA 3HKUA 1G6VA 5FLQA 3M67A 1XQ0A 1G1DA 5DSIA 1CILA 1RAYA 5EKJA 5BRUA 3CAJA 1BICA 5G03A 4YXIA 3DAZA 3D92A 4WW6A 3M2ZA 3IBNA 4CACA 1RZDA 4CNWA 4KNMA 3IBUA 3RJ7A 1CAYA 4KNIA 4QK2A 1CVBA 2FOQA 3OKVA 4XFWA 4L5UA 1YDBA 4PZHA 4CNRA 3CZVA 3M5SA 1G0FA 3U7CA 1CZMA 4HEWA 1UGAA 1CALA 5CLUA 3M04A 5E2RA 3RYZA 2POUA 1CVDA 4FU5A 4MLXA 2HFWA 1JCZA 5EKMA 3KS3A 1OKLA 5FNGA 5JEGB 3R16A 4WL4A 2X7SA 4JS6A 1Y7WA 4GL1X 5SZ6A 3M98A 1G52A 1TG3A 3LXEA 3F7BA 4Q08A 3ML5A 5BRVA 4QJMA 3RYYA 1G46A 1YDDA 1DCBA 4UOVA 2NWZA 1H9NA 3M5TA 5E2NA 4ZX1A 1FQNA 3KLDB 3TVNX 3K34A 3V2JA 4MDMA 3DCSA 4Q8XA 4ZWYA 1FLJA 1CAOA 1BNQA 4XIWA 4ZX0A 5JQTA 3MNJA 4E3GA 5L3OA 1XEVA 1TTMA 4YVYA 4Q87A 3OIKA 1YO2A 1DMXA 4KAPA 2FOSA 5FNHA 4FL7A 3M2NA 1CRAA 3RG3A 4E49A 4HT0A 1HVAA 3KIGA 4M2WA 4M2UA 4COQA 4QSJA 3F4XA 1G54A 3C7PA 1IF8A 1Z93A 1LZVA 4E9OX 1CVEA 4Q7SA 1RZBA 3V7XA 7CA2A 5AMDA 5EKHA 1CAJA 1KEQA 3S74B 3MDZA 1H4NA 4FPTA 2CABA 4E3DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4QSI A;  1KOP A;  1I9Q A;  1LG5 A;  1YO0 A;  5EH5 A;  5DSK A;  4CA2 A;  5SZ0 A;  1CNG A;  5SZ2 A;  3V5G A;  4KNN A;  5AML A;  5A25 A;  1FQM A;  2CBC A;  2NWY A;  2QO8 A;  5SZ1 A;  2CBE A;  3SBI A;  1BNW A;  1HED A;  4BCW A;  5FLS A;  1G53 A;  4JSW A;  4MDL A;  3OIM A;  4IWZ A;  2FOV A;  3ZNC A;  1ZSA A;  1XEG A;  2Q1Q A;  4KP5 A;  4RUY A;  1I9O A;  2WEH A;  3KOK A;  1IF4 A;  2F14 A;  4RFD A;  4RN4 A;  3MNU A;  5G01 A;  4ILX A;  3U45 X;  2CBB A;  3MNI A;  1BNU A;  1TE3 X;  4K0Z A;  4WUP A;  2POV A;  1KWR A;  3OYQ A;  4Q6D A;  1RZA A;  5E2M A;  3S72 B;  5G0B A;  5JQ0 A;  4CQ0 A;  1RZC A;  3RGE A;  4Q8Z A;  4Q7W A;  5FLT A;  1IF5 A;  1CVC A;  5DOG A;  4ETQ C;  4FVN A;  4JSS A;  2NNO A;  3M5E A;  2Q1B A;  3K7K A;  6CA2 A;  3P3J A;  4QSB A;  3S76 A;  3M1K A;  3SAX A;  5CA2 A;  4MO8 A;  2HOC A;  1I90 A;  3HKN A;  5J8Z A;  3M3X A;  5BYI A;  3V3I B;  2WD2 A;  1RZE A;  1CAN A;  5E28 A;  2NXT A;  1TEU X;  4MLT A;  4Z0Q A;  1LGD A;  4Z1E A;  4E5Q A;  2FNN A;  1TG9 A;  3FW3 A;  3T83 A;  4Z1K A;  4G0C A; 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