4QJWA

Crystal structure of catalytic domain of human carbonic anhydrase isozyme xii with inhibitor
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
KWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHGSEHTVSGQHFAAELHIVHYNSDLYPDASTASNKSEGLAVLAVLIEMGSFNPSYDKIFSHLQHVKYKGQEAFVPGFNIEELLPERTAEYYRYRGSLTTPPCNPTVLWTVFRNPVQISQEQLLALETALYCTHMDDPSPREMINNFRQVQKFDERLVYTSFSQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 12
publication title Functionalization of Fluorinated Benzenesulfonamides and Their Inhibitory Properties toward Carbonic Anhydrases
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qjwA00
1RZBA 4QSAA 1CCTA 3KOIA 1I9OA 3P3JA 2W2JA 5JG5B 5E2KA 3P58A 4YGNA 3W6IA 2FMGA 5DSPA 3KONA 4WW8A 1ZGFA 1HECA 3T83A 4Q49A 3D8WA 4HEZA 1LG5A 4Q0LA 4ITOA 4ZX1A 4Z1NA 3RG3A 1KOPA 2NNSA 3BETA 3DBUA 1BN4A 1I9MA 1CNGA 3IBNA 4RIUA 5EHWA 4YX4A 3OYQA 3DC9A 4LU3A 3BL1A 5E2MA 4Z1JA 4QSIA 3RYYA 4HF3A 3N0NA 4PYYA 2NWPA 1ZNCA 1CA2A 3U3AX 3HFPA 3DD8A 5SZ2A 3U45X 1IF7A 2NXTA 5FDCA 4Q8XA 3HKNA 4G0CA 5FL5A 2AX2A 1FR4A 1G46A 3C7PA 2NN1A 4QIYA 7CA2A 1Z93A 5G01A 1HEDA 1HCBA 1CANA 2HKKA 3DA2A 4DZ9A 4RIVA 5CACA 3DVBA 3NB5A 3M04A 4CACA 2QP6A 3S8XA 2NXSA 3ML2A 3P5LA 1FQLA 4YGKA 2CBDA 1TEQX 3KLDB 1TBTX 3P5AA 3DVDA 1I90A 1YO1A 2ILIA 1CNBA 5FLOA 3KOKA 2CBBA 4E3DA 4CNWA 1DCBA 2EU2A 4ZWXA 1BNQA 5J8ZA 1G4OA 3IBLA 3M1WA 4RFDA 5DVXA 4BF6A 3S72B 4HBAA 3K7KA 2FMZA 5EIJA 4K13A 5FLQA 5DSRA 1UGEA 3DV7A 5SZ1A 4WL4A 4Z1KA 1URTA 4Q8YA 4E4AA 3MNKA 1ZFQA 4KUVA 5FLTA 4PYXA 4MTYA 4QSJA 2NXRA 2CBCA 3FFPX 1LG6A 4RFCA 3S74B 4ZWIA 1CZMA 4JS6A 4K0TA 1UGBA 4ETQC 4TWLA 3L14A 1CAJA 1CNXA 3KS3A 4XIWA 1UGAA 3F8EA 3RZ8A 4Q6EA 3RGEA 1ZSCA 1ZSBA 3M2XA 5FLSA 5EZTX 3TMJA 4YYTA 4RN4A 4WUPA 5CLUA 1KEQA 4M2UA 2FOSA 1KOQA 4Q83A 3OKUA 3M5SA 3B1BA 1V9EA 1TTMA 3RJ7A 2POWA 2ABEA 1CINA 1RAZA 4KUWA 4QSBA 5FNMA 5FNKA 1G52A 1YDCA 4YWPA 5E2SA 4CNVA 1Y7WA 3HKUA 1Z9YA 4CA2A 2EU3A 3EFTA 4QK1A 1ZGEA 5FDIA 4KNMA 3M2NA 1G0FA 4PZHA 1THKA 1G45A 1H9QA 1JV0A 1BNUA 1BNMA 1HUGA 3MHOA 4FPTA 1UGDA 3PYKA 1G54A 4Q7WA 3OKVA 3PJJA 2X7SA 4Q78A 5E2NA 3PO6A 1G1DA 5FL4A 3B4FA 3OY0A 2X7TA 4QEFA 2HFWA 1KWQA 1YDDA 3V3IB 5SZ0A 1BN3A 2NN7A 3K2FA 4YXIA 5BRWA 4KP5A 3P55A 1H9NA 2QOAA 4R5AA 4YGJA 1BNNA 5EKHA 5DSQA 3RZ7A 5JEPB 1MOOA 4BF1A 5DRSA 4Q7PA 4HT2A 3IAIA 1EOUA 1HEAA 5G0CA 4Q08A 3IBUA 1I9LA 1CVBA 5FNHA 5E5RA 3T85A 4Q87A 6CA2A 4RUYA 5E28A 4TWMA 5G0BA 3M40A 1UGCA 1YDAA 1G4JA 1CNIA 4KV0A 3BL0A 3JXHC 1JCZA 3U47A 4LP6A 1BCDA 1FR7A 3S71B 1LGDA 3V3HB 3CAJA 5DOHA 1FSQA 4QJOA 3V3GB 3MNUA 1CA3A 3MNHA 5AMDA 3NI5A 5JGSB 2FOQA 4FVOA 5E5UA 3M5TA 3NJ9A 3N3JA 3DD0A 4Q99A 5FLPA 5JQTA 4FIKA 2Q1QA 4JSSA 2NMXA 5L3OA 3V5GA 4BCWA 4DZ7A 3MHIA 1CNWA 3MHLA 1XPZA 4QJMA 1CNKA 1V9IC 3DCCA 3MNJA 3RYZA 3FW3A 1CVFA 4YGLA 3T84A 3IBIA 3S75B 3V3JA 3MZCA 1XEGA 2NWOA 3RG4A 3CA2A 1IF6A 5CJFA 4K0ZA 3CYUA 2POUA 4QTLA 1CAMA 2FOYA 3DC3A 4L5VA 5FNLA 1I9PA 2NNVA 4E3FA 3M1KA 5CA2A 5DSIA 1G0EA 5AMGA 5SZ7A 4RUZA 2VVAX 1ZSAA 3RYXB 4QIZA 4R5BA 4XZ5A 3MHCA 5DSNA 1RAYA 1XEVA 3FE4A 2WEJA 5IPZA 9CA2A 3N4BA 1CRAA 1FLJA 1DMYA 1CAOA 1TH9A 2FNKA 1FSRA 1XQ0A 3DVCA 3P4VA 4R59A 4ZAOA 1RZAA 1CNHA 4Y0JA 4ILXA 8CA2A 4KUYA 5EOIA 3M96A 3OIMA 2POVA 3ML5A 5FNIA 1OKNA 4IDRX 4L5UA 1FQNA 5EH5A 1DCAA 1CVEA 1TEUX 4Q9YA 3SAXA 4HT0A 4QJPA 2HNCA 2Q1BA 4E3HA 5E2RA 5AMLA 3UYNA 4ZWYA 4YXOA 3HS4A 2O4ZA 2WEOA 3M1QA 1G3ZA 2X7UA 3F7BA 3KIGA 4KP8A 2FNNA 3UYQA 4MLXA 4FVNA 3R17B 3CZVA 4Q6DA 4G7AA 2Q38A 4MDLA 1CNCA 1RJ6A 4KNIA 4Z1EA 1BICA 1CNYA 1CVHA 1H4NA 4WW6A 1OKMA 4M2RA 5HPJA 3HKQA 4HEYA 3S77B 2H4NA 1FSNA 3MWOA 1UGGA 2GD8A 4JSAA 2FOUA 4JSWA 1HCAA 2CBEA 1BNWA 3MMFA 1RZDA 3R16A 1ZH9A 3M2ZA 3JXGA 3T5UA 4COQA 5A25A 5JQ0A 1RJ5A 3N2PA 3IGPA 5DSJA 3S78B 4E3GA 3D0NA 2FW4A 2GEHA 5BNLA 5JESB 2HOCA 5BRVA 3Q31A 4FU5A 1BV3A 2CA2A 4Q09A 3W6HA 4E5QA 3K34A 4Q90A 4JSZA 4QJXA 4E9OX 3M2YA 3RZ5A 1I9NA 4CNRA 5JEGB 1F2WA 5L6KA 3HKTA 4Q7VA 5JGTB 2HD6A 1ZE8A 4XFWA 3MDZA 3JXFA 12CAA 4PQ7A 4PXXA 2WEGA 1AVNA 2ZNCA 1CIMA 1LZVA 4FL7A 4XE1A 1I8ZA 3QYKA 1CCUA 1I91A 5EKMA 1UGFA 3M98A 5EKJA 5C8IA 1YDBA 3RYJB 1TG3A 4CNXA 1CRMA 2FOVA 1DMXA 3S76A 4QY3A 3S97A 1CVDA 1I9QA 3DCSA 4YGFA 5EHEA 3D93A 3F7UA 1YO0A 3V3FA 1BNVA 3SBHA 3V2JA 3U7CA 2IT4A 4KNJA 5JG3B 4LHIA 1Z97A 1ZFKA 4CQ0A 3S9TA 1FQRA 1TG9A 3M5EA 4UOVA 4QK3A 1G6VA 2NNOA 1T9NA 2VVBX 4FRCA 3DCWA 4KNNA 3M14A 1HEBA 4X5SA 5DOGA 1OQ5A 1JD0A 3RZ1B 4WR7A 4WUQA 1TB0X 3IEOA 4RH2A 5SZ3A 2F14A 1IF8A 2OSMA 5EHVA 2WD3A 4HU1A 3RYVB 3VBDA 3LXEA 4ITPA 4M2VA 4Q8ZA 1FQMA 1CNJA 4YXUA 4M2WA 1RZCA 2FNMA 3EFIA 3KWAA 1CAIA 4N16A 2OSFA 1G53A 3P3HA 3RZ0B 4KAPA 2WD2A 1KWRA 3TVOX 3TVNX 1CAKA 5FNJA 3MYQA 5DSOA 1IF9A 4Q7SA 5EH8A 3M67A 4MLTA 1HUHA 4MDGA 2NNGA 3P44A 3RLDA 4L5WA 5JDVB 4XIXA 4ZWZA 2WEHA 4QJ0A 1CILA 1LUGA 3M1JA 5FL6A 5LMDA 3SBIA 3SAPA 1IF5A 3MNAA 5SZ5A 4HEWA 1YO2A 5DSMA 4RUXA 3DAZA 1CAZA 1A42A 1CAHA 3F4XA 4YHAA 3S73B 5FLRA 2EZ7A 1G48A 4YVYA 3KKXA 1CAYA 1CALA 4C3TA 1BZMA 5FNGA 1CCSA 4Q81A 2CBAA 5DSLA 3D92A 2HL4A 4K1QA 1J9WA 1HVAA 3MNIA 1BN1A 3ZP9A 3T82A 3OIKA 5A6HA 2CABA 3HLJA 3OYSA 2NWZA 4K0SA 5SZ6A 3ZNCA 2NWYA 1AZMA 1AM6A 3V2MA 5JEHB 3GZ0A 1TE3X 4N0XB 1MUAA 4E49A 1RZEA 3MHMA 1CVCA 2AW1A 4QK2A 3T5ZA 3KNEA 4IWZA 1CVAA 3V7XA 4Z0QA 1IF4A 4ZX0A 3M3XA 5EH7A 3OILA 1BNTA 5BRUA 2H15A 5SZ4A 4QJWA 2QO8A 5BYIA 1OKLA 4MDMA 4MO8A 5DSKA 5G03A 4GL1X 4Q07A 4Q06A 3D9ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RZB A;  4QSA A;  1CCT A;  3KOI A;  1I9O A;  3P3J A;  2W2J A;  5JG5 B;  5E2K A;  3P58 A;  4YGN A;  3W6I A;  2FMG A;  5DSP A;  3KON A;  4WW8 A;  1ZGF A;  1HEC A;  3T83 A;  4Q49 A;  3D8W A;  4HEZ A;  1LG5 A;  4Q0L A;  4ITO A;  4ZX1 A;  4Z1N A;  3RG3 A;  1KOP A;  2NNS A;  3BET A;  3DBU A;  1BN4 A;  1I9M A;  1CNG A;  3IBN A;  4RIU A;  5EHW A;  4YX4 A;  3OYQ A;  3DC9 A;  4LU3 A;  3BL1 A;  5E2M A;  4Z1J A;  4QSI A;  3RYY A;  4HF3 A;  3N0N A;  4PYY A;  2NWP A;  1ZNC A;  1CA2 A;  3U3A X;  3HFP A;  3DD8 A;  5SZ2 A;  3U45 X;  1IF7 A;  2NXT A;  5FDC A;  4Q8X A;  3HKN A;  4G0C A;  5FL5 A;  2AX2 A;  1FR4 A;  1G46 A;  3C7P A;  2NN1 A;  4QIY A;  7CA2 A;  1Z93 A;  5G01 A;  1HED A;  1HCB A;  1CAN A;  2HKK A;  3DA2 A;  4DZ9 A;  4RIV A;  5CAC A;  3DVB A;  3NB5 A;  3M04 A;  4CAC A;  2QP6 A;  3S8X A;  2NXS A;  3ML2 A;  3P5L A;  1FQL A;  4YGK A;  2CBD A;  1TEQ X;  3KLD B;  1TBT X;  3P5A A;  3DVD A;  1I90 A;  1YO1 A;  2ILI A;  1CNB A;  5FLO A;  3KOK A;  2CBB A;  4E3D A;  4CNW A;  1DCB A;  2EU2 A;  4ZWX A;  1BNQ A; 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