3M98A

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme ii with 5-(1h-benzimidazol-1-ylacetyl)-2-chlorobenzenesulfonamide
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme II with 5-(1H-benzimidazol-1-ylacetyl)-2-chlorobenzenesulfonamide
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3m98A00
3M5EA 4XZ5A 5FLSA 5JESB 2QO8A 4K0SA 4L5WA 2WEGA 1G3ZA 2HFWA 4QSJA 1KWQA 3P58A 1G46A 1CAZA 1CVAA 3FE4A 1I91A 5FDCA 1JV0A 4TWLA 3V5GA 5JG3B 3OIMA 1CNHA 1RZAA 3ML2A 5EHVA 2NNGA 4FL7A 4RUXA 5SZ2A 2FNKA 3P44A 3PO6A 5FLQA 1RZEA 4M2UA 5BRUA 1J9WA 3U7CA 4HT2A 2QOAA 1TEUX 1ZFKA 3BL1A 2QP6A 4YX4A 5DSRA 4YYTA 3MNJA 2FOUA 3T5UA 1ZNCA 4FVOA 1TG3A 4YHAA 4E3HA 1FQNA 1ZGEA 2WD3A 1ZFQA 3M1JA 2X7SA 2CBDA 3DC3A 1CNIA 1AZMA 1FQMA 4YGJA 1IF7A 3U3AX 3B4FA 4L5VA 3V3GB 3NJ9A 4CACA 4E5QA 5SZ6A 4FU5A 1I9PA 1CNKA 1CAMA 4KNNA 3IBUA 4YVYA 3OYQA 4ETQC 1CNGA 1IF8A 3NI5A 1Z97A 1CNBA 1CAOA 3DCWA 3V3IB 3RYJB 4ZWIA 2F14A 5AMGA 1HEBA 3RGEA 1JD0A 3M5TA 4KNIA 4QK2A 1BNUA 5E2NA 1BZMA 4MDGA 1TE3X 5EHEA 2FNMA 5JEGB 4FVNA 1H4NA 4XFWA 3S97A 12CAA 4KP5A 3M40A 3R16A 3JXFA 3MMFA 1BNMA 1URTA 5EH7A 1CINA 3W6IA 3MHOA 2H15A 4IWZA 1DMYA 2X7TA 4Q6EA 2CBBA 1I9MA 2Q1QA 4Z1NA 1G4OA 4Y0JA 4N16A 3VBDA 4WW8A 3KNEA 2POUA 3MYQA 5E5UA 1RJ5A 2NXSA 4L5UA 1Z9YA 5J8ZA 5L3OA 5DSIA 1CNXA 3RG4A 2VVAX 3SAXA 5FLPA 4YWPA 3PYKA 3KKXA 5DVXA 4WUQA 5DSJA 4ITOA 3MHMA 2OSMA 4YGKA 5EKMA 4BCWA 4Q7SA 1LZVA 5HPJA 1BN4A 4QJOA 1H9NA 3K7KA 1YO2A 4Q81A 4QSIA 4JSAA 4HEYA 1XPZA 3MDZA 1A42A 4HEWA 4Z1EA 3D92A 3FFPX 1CRAA 3RYVB 2FOQA 4Q06A 2HKKA 1ZE8A 1MOOA 5E2RA 1HECA 3S72B 7CA2A 4E4AA 3HFPA 4PQ7A 5G03A 1UGCA 3RYXB 4JSZA 1YDAA 5FNLA 2Q1BA 3IEOA 1OKLA 2NNSA 4XIXA 5DSOA 1TB0X 3M2XA 1CA2A 3RYYA 1G48A 2CABA 1YO0A 4HEZA 1RAYA 2O4ZA 3BETA 1I9OA 4LP6A 3P3JA 4TWMA 1RZBA 3M1KA 1HVAA 4QTLA 3EFIA 4QSAA 3D0NA 3S8XA 4Q7PA 3DC9A 4HU1A 2IT4A 1CCUA 5FNGA 3S71B 5JEHB 1LG6A 3HKTA 1OKMA 4K1QA 4MTYA 5FL6A 5DSKA 2NN7A 4ZWYA 4QEFA 2HD6A 2POWA 2GEHA 3RZ7A 5E2MA 4Q78A 4Q07A 1BNTA 1CVDA 5A25A 3JXHC 4FIKA 4WW6A 2NN1A 4KAPA 5BRWA 2AX2A 3TVNX 1ZGFA 4MO8A 3T84A 3GZ0A 4KV0A 4PYYA 3DCCA 5G01A 4COQA 4LHIA 3SBIA 1FQRA 4QJMA 4BF6A 3M04A 1T9NA 3L14A 1CAHA 3JXGA 4HBAA 4RUYA 5FNMA 3MZCA 4CNVA 2Q38A 3HKUA 3M14A 5EH5A 3DVBA 3DAZA 4M2VA 4R5BA 1HCAA 4YGLA 1G52A 4YXOA 5CACA 3S78B 1CAJA 1DCAA 2CBAA 4ZWZA 1BICA 1AM6A 3DV7A 4WR7A 1UGBA 1IF6A 4ITPA 4JSWA 4PZHA 2FOYA 4XE1A 4MDLA 4E3DA 4ILXA 2NXTA 5EIJA 1CVFA 4Q87A 3P55A 5DSNA 4Q7WA 3KWAA 3R17B 3V3HB 3U45X 5FNIA 1YDCA 1UGGA 3OILA 3F4XA 4CNXA 4KNJA 3RJ7A 3UYNA 5LMDA 4YXUA 5CJFA 2FOSA 1CALA 4QY3A 1UGAA 1LUGA 2NWPA 1TBTX 5FNJA 1G45A 1CA3A 4UOVA 4N0XB 1KWRA 1LG5A 4Q8XA 4FPTA 4RIUA 1TH9A 4QJWA 3SBHA 5JGSB 1CNWA 4QK3A 4Q6DA 5CA2A 3MHLA 1CVCA 3HKQA 1ZSAA 4X5SA 4RH2A 3MNKA 1IF9A 2FNNA 2HOCA 3DD8A 2WD2A 3OKUA 3IGPA 3RZ0B 3V3FA 1DMXA 5AMLA 3P3HA 3MHCA 1RZDA 3S74B 4KP8A 3M1QA 3SAPA 3ML5A 1RAZA 3CZVA 3N0NA 4K0TA 5DRSA 3TVOX 4Z1KA 1CVBA 2NNVA 4Q9YA 5JDVB 4M2WA 3NB5A 2FMGA 4CA2A 4MLTA 1H9QA 4RFCA 4CQ0A 4Q0LA 4MDMA 5FLRA 3MWOA 4RUZA 5E2SA 4QK1A 1CAKA 1F2WA 2HNCA 5E5RA 1G53A 4QSBA 1BNQA 3RZ5A 4IDRX 4KNMA 3W6HA 4RN4A 3ZP9A 2GD8A 4QIYA 4Q7VA 4G0CA 5CLUA 4CNWA 2EZ7A 1BNNA 1YO1A 1YDDA 3V2JA 2NNOA 3C7PA 5EOIA 3M2NA 5JQTA 3KONA 4XIWA 3HLJA 3K34A 2POVA 3P5LA 1BNVA 4E49A 1BN3A 1HEAA 1V9EA 5SZ4A 3LXEA 1ZSCA 3P4VA 3M98A 3T83A 5FLOA 3KLDB 4RIVA 4ZAOA 4DZ9A 4KUVA 1KOQA 1CRMA 5DOGA 1HUGA 1HUHA 1ZSBA 3M96A 5FNHA 3KS3A 2FMZA 3RLDA 1MUAA 2OSFA 1AVNA 1XEGA 5EH8A 3TMJA 8CA2A 4BF1A 1CCSA 4YGFA 5BRVA 2WEJA 5SZ3A 3V2MA 1FR7A 3ZNCA 1LGDA 3U47A 4Q99A 3F7BA 1JCZA 3CAJA 3MNIA 4PXXA 2WEHA 4ZWXA 3T85A 3DA2A 3IBIA 2ILIA 1G1DA 5EHWA 1FQLA 3DCSA 1IF5A 3MNUA 5JGTB 1I90A 4GL1X 1I9QA 4QJXA 4YGNA 3RZ1B 4Z0QA 3D8WA 1BCDA 1RJ6A 3D9ZA 3MNHA 4QIZA 5E2KA 5AMDA 3P5AA 3N4BA 3EFTA 5FNKA 4JSSA 1V9IC 4Q49A 3S9TA 4R59A 4C3TA 2CA2A 3IBLA 3CA2A 4WUPA 4RFDA 4Q83A 3M2ZA 4JS6A 3MHIA 3V3JA 1G0EA 1CVHA 1UGEA 1FLJA 2NWOA 5E28A 5SZ0A 2CBCA 2H4NA 4E9OX 1ZH9A 3UYQA 1FR4A 5JEPB 1CNYA 3Q31A 5DOHA 5JG5B 4R5AA 3HS4A 1TG9A 1G54A 3KIGA 1CCTA 4K0ZA 2ZNCA 1FSRA 3HKNA 5IPZA 3M67A 2W2JA 2CBEA 3BL0A 3F7UA 4ZX0A 4E3FA 1TEQX 3N3JA 2NXRA 3M3XA 1CAIA 1CNJA 1THKA 3DVCA 3DVDA 4K13A 3KOKA 4Q8YA 4Q09A 4PYXA 1DCBA 4QJ0A 4M2RA 4Q08A 4WL4A 5C8IA 5DSMA 3CYUA 3M5SA 2NWYA 4G7AA 4LU3A 3S76A 3T5ZA 1I9NA 3M1WA 3OY0A 1G6VA 1G4JA 2EU3A 1UGDA 4QJPA 1OKNA 3PJJA 3K2FA 4Z1JA 1CVEA 1TTMA 5SZ7A 3RYZA 1XQ0A 2FW4A 1G0FA 1FSNA 1HCBA 2X7UA 3B1BA 3IBNA 5FL5A 1CAYA 5EKJA 3S73B 5DSLA 2VVBX 4E3GA 1Z93A 5A6HA 3DBUA 1KOPA 3DD0A 6CA2A 5EKHA 3KOIA 1Y7WA 5DSPA 3M2YA 4Q90A 4KUYA 3OYSA 1CNCA 2NMXA 1BV3A 3OKVA 4CNRA 1YDBA 1I8ZA 2NWZA 3S75B 2AW1A 3N2PA 5DSQA 1UGFA 1I9LA 3FW3A 3F8EA 1IF4A 1CIMA 2EU2A 5G0CA 3T82A 5L6KA 3S77B 2FOVA 4Q8ZA 4ZX1A 1CZMA 5SZ1A 4FRCA 4DZ7A 3RZ8A 1BN1A 3D93A 3V7XA 9CA2A 1HEDA 1BNWA 1KEQA 4YXIA 2WEOA 3IAIA 1OQ5A 2HL4A 3QYKA 5BYIA 1CILA 4KUWA 4HT0A 3MNAA 4HF3A 5G0BA 3OIKA 5FL4A 1RZCA 5JQ0A 1EOUA 1FSQA 1XEVA 1CANA 3RG3A 5EZTX 5FLTA 5FDIA 5SZ5A 5BNLA 2ABEA 4MLXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3M5E A;  4XZ5 A;  5FLS A;  5JES B;  2QO8 A;  4K0S A;  4L5W A;  2WEG A;  1G3Z A;  2HFW A;  4QSJ A;  1KWQ A;  3P58 A;  1G46 A;  1CAZ A;  1CVA A;  3FE4 A;  1I91 A;  5FDC A;  1JV0 A;  4TWL A;  3V5G A;  5JG3 B;  3OIM A;  1CNH A;  1RZA A;  3ML2 A;  5EHV A;  2NNG A;  4FL7 A;  4RUX A;  5SZ2 A;  2FNK A;  3P44 A;  3PO6 A;  5FLQ A;  1RZE A;  4M2U A;  5BRU A;  1J9W A;  3U7C A;  4HT2 A;  2QOA A;  1TEU X;  1ZFK A;  3BL1 A;  2QP6 A;  4YX4 A;  5DSR A;  4YYT A;  3MNJ A;  2FOU A;  3T5U A;  1ZNC A;  4FVO A;  1TG3 A;  4YHA A;  4E3H A;  1FQN A;  1ZGE A;  2WD3 A;  1ZFQ A;  3M1J A;  2X7S A;  2CBD A;  3DC3 A;  1CNI A;  1AZM A;  1FQM A;  4YGJ A;  1IF7 A;  3U3A X;  3B4F A;  4L5V A;  3V3G B;  3NJ9 A;  4CAC A;  4E5Q A;  5SZ6 A;  4FU5 A;  1I9P A;  1CNK A;  1CAM A;  4KNN A;  3IBU A;  4YVY A;  3OYQ A;  4ETQ C;  1CNG A;  1IF8 A;  3NI5 A;  1Z97 A;  1CNB A;  1CAO A;  3DCW A;  3V3I B;  3RYJ B;  4ZWI A;  2F14 A;  5AMG A;  1HEB A;  3RGE A;  1JD0 A;  3M5T A;  4KNI A;  4QK2 A;  1BNU A;  5E2N A;  1BZM A;  4MDG A;  1TE3 X;  5EHE A; 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