3KOKA

Crystal structure of cobalt (ii) human carbonic anhydrase ii at ph 8.5
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Comparison of solution and crystal properties of Co(II)-substituted human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-11-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3kokA00
4Z1NA 5JESB 1KOPA 2ZNCA 2H4NA 1KWRA 2X7UA 2FNNA 3KONA 3DCCA 1Z97A 4Q99A 2AW1A 1CAJA 3F4XA 4Q7WA 3RYYA 5SZ3A 5C8IA 1THKA 1RAYA 2QO8A 3M40A 2Q38A 3M5EA 5CACA 3M04A 1TG9A 3D93A 3KOKA 1G4OA 3S72B 1KEQA 4N16A 4ZWZA 3IAIA 3R16A 4KUWA 4BF1A 5G0BA 4CACA 3V5GA 5L3OA 5EZTX 1KWQA 3P44A 1RJ6A 2F14A 1IF5A 5DSIA 4YGJA 1OKMA 4Z1JA 1RJ5A 4JSAA 4LU3A 4YGFA 1BNNA 4BF6A 3M2XA 2POWA 5FNIA 4ZWIA 4M2RA 4XIXA 4KNJA 4KP8A 4HT0A 5L6KA 1RZAA 3UYNA 3ML5A 5E2KA 4Z1KA 1LG6A 3M1QA 1TG3A 4ZX1A 1UGAA 4DZ9A 3M3XA 4RFCA 5DOGA 4QSJA 1H9NA 3DD8A 3D0NA 4Q90A 1TEUX 5JG3B 3MNHA 3D92A 2EU3A 1MOOA 1ZH9A 5SZ0A 3DCSA 3MHLA 2POVA 3N0NA 4E5QA 1CA2A 1CVEA 4Q07A 5E2SA 1RZBA 4CQ0A 3EFTA 3MNAA 3PJJA 4XIWA 3KS3A 5EH7A 1FQRA 1CNHA 3DA2A 4ETQC 5DVXA 3T82A 5BRUA 4K13A 3HFPA 1G53A 3T83A 4R5BA 3RYXB 5HPJA 1G46A 4Q8YA 3DVDA 5G0CA 3V3GB 1CAIA 4RIUA 5SZ1A 1V9IC 4K0TA 2NMXA 1CVDA 1EOUA 1BN4A 5FLOA 3UYQA 1TTMA 3PO6A 2CBEA 4QIZA 5FDCA 1XPZA 1HVAA 1ZSCA 2CBCA 3Q31A 5EH8A 4E4AA 4YX4A 4HEZA 4MLTA 4Q08A 3FFPX 4R5AA 1ZNCA 5DSLA 1CNCA 4G0CA 3HKTA 4WUQA 3MYQA 5BRWA 1I9NA 4JSWA 3P4VA 3P3JA 5FL4A 1G54A 1BN1A 1YO2A 5DSKA 3V2JA 4KP5A 5DSQA 2H15A 2HOCA 1CAKA 3DD0A 3MWOA 1RAZA 3ZP9A 4QJWA 5J8ZA 1BZMA 2FOSA 4PZHA 3GZ0A 5SZ4A 1IF6A 1I9OA 1CCUA 2WEJA 5AMLA 1ZFQA 1ZFKA 3B1BA 4ZX0A 3VBDA 4MDGA 1CAMA 1HECA 2AX2A 1BNWA 4QK1A 1CVBA 4Q83A 4G7AA 3RYZA 3S9TA 1Z93A 3JXFA 1FQMA 3K34A 4Q06A 4CNRA 1G48A 4M2WA 1IF4A 5E5RA 3SBHA 1Y7WA 3MMFA 1CAHA 3T5UA 1HEDA 3RZ0B 4RH2A 1BN3A 1TB0X 3S77B 4RFDA 5A25A 1BICA 1FR4A 4Q81A 2OSMA 1G1DA 1HEAA 5EHWA 1T9NA 4PXXA 3L14A 3M1JA 1ZSAA 1CNIA 1XEGA 3NJ9A 1HUGA 3HLJA 5FLPA 4CNXA 4PQ7A 1J9WA 5EHEA 4QSIA 4HEWA 3N4BA 4QTLA 3RG4A 4CA2A 4XFWA 2X7SA 5JQTA 3V3FA 2HKKA 2HFWA 3KKXA 5BYIA 2QP6A 5JQ0A 4MTYA 3ZNCA 1HCBA 2FOQA 1YDBA 4FPTA 2EU2A 5DSRA 1IF9A 1G4JA 5FLTA 2FMZA 2WD3A 1CVFA 3S78B 4XZ5A 3S74B 1TEQX 4YYTA 3U47A 2FOYA 2NWOA 3HS4A 1YDAA 2NWZA 1IF7A 1CNYA 1FSNA 1HUHA 2NXTA 3HKQA 4JSSA 4Q7VA 3P5AA 1BNVA 4K0ZA 4UOVA 3V3JA 1G45A 1AZMA 4WL4A 4L5VA 5SZ7A 4QK2A 4YXOA 3MNKA 3IGPA 5BNLA 3MNJA 3M1KA 4Q7SA 4HT2A 2NNVA 3C7PA 3S97A 3OIKA 2X7TA 4QJMA 1CRMA 3N3JA 1UGBA 1CALA 5EKMA 3S73B 1G6VA 5JEPB 2WEHA 2IT4A 5CLUA 4WR7A 5DRSA 5CJFA 1XQ0A 1MUAA 5JDVB 1I9LA 5E2MA 3TVNX 2NXSA 3KLDB 4E3DA 4Q6EA 2FMGA 1FR7A 3M96A 3P5LA 5FLQA 4KNIA 4WW8A 3V3HB 3BETA 3RZ1B 1CA3A 1CAOA 1CILA 1G0EA 3MHOA 3OILA 4M2UA 4M2VA 4QY3A 4Q7PA 4PYXA 2NNGA 3R17B 4R59A 3OYSA 3TMJA 4YGLA 1OKLA 1F2WA 4QSAA 5BRVA 3DC3A 5JEHB 4HEYA 3P3HA 3IEOA 3K2FA 4KNNA 5AMGA 2NXRA 2ILIA 3D8WA 5EIJA 5LMDA 3DV7A 4QEFA 1IF8A 5DOHA 3MHMA 4Q8XA 4MO8A 4YGNA 4YXIA 4Q87A 3T5ZA 1RZCA 5EOIA 3DCWA 3RJ7A 1G0FA 2NWYA 4K1QA 3U7CA 4QJXA 1BNTA 1RZDA 3B4FA 4QJ0A 3BL1A 4YWPA 4Q09A 3SBIA 1Z9YA 5FLSA 1CAZA 5SZ5A 4TWMA 1I9PA 3W6IA 4MLXA 1CNJA 8CA2A 2WEGA 3KOIA 2FOUA 4Y0JA 4E3HA 4E49A 5FDIA 3FW3A 1UGEA 3KWAA 4QIYA 4E3GA 1G3ZA 4FU5A 4RUYA 4FL7A 4YVYA 3CA2A 1CRAA 3OIMA 4Q9YA 1JCZA 4YXUA 4WUPA 3T85A 3RGEA 5G01A 4JS6A 1FLJA 3OKUA 4N0XB 1I91A 4MDMA 1FQLA 3U45X 9CA2A 3DVCA 1UGCA 1FSQA 5FLRA 4FIKA 5A6HA 1CVHA 3MNIA 4C3TA 5DSNA 5FNMA 3S8XA 4QJPA 2VVBX 4CNVA 2FNMA 3BL0A 1CZMA 4L5WA 3MDZA 1BNQA 2HD6A 5FL5A 4HU1A 5EKJA 2CBBA 3IBIA 3JXHC 1I8ZA 3DBUA 4RUZA 1CIMA 3JXGA 3M67A 4FVOA 3V3IB 2GD8A 1DMXA 1H9QA 1RZEA 3HKUA 3M14A 3M2NA 2O4ZA 3DAZA 3DC9A 1DMYA 2NNOA 2NWPA 12CAA 2EZ7A 1UGFA 2ABEA 3P55A 1CNGA 1BCDA 3IBNA 5FNLA 1G52A 4Q0LA 5JEGB 4LHIA 4QSBA 1XEVA 3EFIA 3S71B 3DVBA 3KNEA 5CA2A 4DZ7A 4CNWA 4Q49A 4Q6DA 4Q78A 5DSPA 4ZAOA 1CINA 1KOQA 1TE3X 3IBLA 3N2PA 4RUXA 3LXEA 4X5SA 5DSOA 2HL4A 5FNJA 1AVNA 1CANA 3M98A 3M2ZA 3S75B 5EH5A 3W6HA 3ML2A 4Z0QA 1AM6A 1YDDA 4ITOA 4JSZA 1I9QA 2FNKA 2WD2A 4L5UA 1BV3A 5SZ6A 5E28A 3MHCA 1CCTA 3CAJA 4KUYA 3IBUA 5FNGA 4WW6A 3M1WA 4ZWYA 2FW4A 4YGKA 5E2RA 1I90A 3P58A 3HKNA 1LZVA 3RYJB 3V2MA 4ZWXA 1HCAA 1OKNA 1OQ5A 1ZSBA 3K7KA 5E5UA 2Q1BA 3M2YA 3RYVB 5FNHA 5FNKA 2Q1QA 5JGTB 4HBAA 5EKHA 1JD0A 5JGSB 1TBTX 2CBAA 2QOAA 1H4NA 3T84A 3CZVA 1CVAA 2GEHA 3SAXA 2W2JA 3NI5A 1BNMA 4IDRX 1TH9A 3V7XA 1ZGFA 5JG5B 2HNCA 3OYQA 1YO1A 2NNSA 3F8EA 3RLDA 3MHIA 4QK3A 1DCBA 3RZ5A 2VVAX 4Q8ZA 4XE1A 1CAYA 3RG3A 3MZCA 4GL1X 1JV0A 3PYKA 3SAPA 3OY0A 3M5SA 3TVOX 1URTA 3FE4A 3S76A 3F7BA 1HEBA 3QYKA 5G03A 4FRCA 1FQNA 3RZ7A 2POUA 4ILXA 3F7UA 5E2NA 1FSRA 4TWLA 4E9OX 2CA2A 4HF3A 2FOVA 1LGDA 1LG5A 5AMDA 1CCSA 4KNMA 2CABA 1V9EA 1ZGEA 3U3AX 1LUGA 4KUVA 4PYYA 4QJOA 3OKVA 3MNUA 4K0SA 5FL6A 1CNWA 1DCAA 1I9MA 4E3FA 2CBDA 2NN1A 3KIGA 2OSFA 3M5TA 4RN4A 1CNKA 5DSMA 4COQA 3NB5A 4YHAA 1ZE8A 4Z1EA 1A42A 1CNXA 1UGDA 7CA2A 1CVCA 3RZ8A 4KAPA 1YO0A 4IWZA 5SZ2A 1BNUA 5IPZA 3CYUA 4LP6A 5EHVA 4ITPA 4MDLA 1UGGA 4BCWA 5DSJA 4RIVA 1CNBA 1YDCA 2NN7A 4KV0A 2WEOA 3D9ZA 4FVNA 6CA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Z1N A;  5JES B;  1KOP A;  2ZNC A;  2H4N A;  1KWR A;  2X7U A;  2FNN A;  3KON A;  3DCC A;  1Z97 A;  4Q99 A;  2AW1 A;  1CAJ A;  3F4X A;  4Q7W A;  3RYY A;  5SZ3 A;  5C8I A;  1THK A;  1RAY A;  2QO8 A;  3M40 A;  2Q38 A;  3M5E A;  5CAC A;  3M04 A;  1TG9 A;  3D93 A;  3KOK A;  1G4O A;  3S72 B;  1KEQ A;  4N16 A;  4ZWZ A;  3IAI A;  3R16 A;  4KUW A;  4BF1 A;  5G0B A;  4CAC A;  3V5G A;  5L3O A;  5EZT X;  1KWQ A;  3P44 A;  1RJ6 A;  2F14 A;  1IF5 A;  5DSI A;  4YGJ A;  1OKM A;  4Z1J A;  1RJ5 A;  4JSA A;  4LU3 A;  4YGF A;  1BNN A;  4BF6 A;  3M2X A;  2POW A;  5FNI A;  4ZWI A;  4M2R A;  4XIX A;  4KNJ A;  4KP8 A;  4HT0 A;  5L6K A;  1RZA A;  3UYN A;  3ML5 A;  5E2K A;  4Z1K A;  1LG6 A;  3M1Q A;  1TG3 A;  4ZX1 A;  1UGA A;  4DZ9 A;  3M3X A;  4RFC A;  5DOG A;  4QSJ A;  1H9N A;  3DD8 A;  3D0N A;  4Q90 A;  1TEU X;  5JG3 B;  3MNH A;  3D92 A;  2EU3 A;  1MOO A;  1ZH9 A;  5SZ0 A;  3DCS A;  3MHL A;  2POV A;  3N0N A;  4E5Q A;  1CA2 A;  1CVE A;  4Q07 A;  5E2S A;  1RZB A;  4CQ0 A;  3EFT A;  3MNA A;  3PJJ A;  4XIW A;  3KS3 A; 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