3DD8A

Carbonic anhydrase inhibitors. interaction of the antitumor sulfamate emd-486019 with twelve mammalian isoforms: kinetic and x-ray crystallographic studies
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Carbonic anhydrase inhibitors. Interaction of the antitumor sulfamate EMD 486019 with twelve mammalian carbonic anhydrase isoforms: Kinetic and X-ray crystallographic studies
pubmed doi rcsb
total genus 77
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dd8A00
4Q7WA 2NNOA 2POUA 1OKMA 1CNBA 5JQ0A 9CA2A 3MNHA 1KWQA 5E2NA 3C7PA 2GEHA 5E5UA 1AZMA 2FMGA 5SZ6A 8CA2A 1CNYA 1G45A 5E2KA 5SZ0A 3S78B 1BN3A 3RZ8A 2NWPA 1J9WA 4LU3A 4Q7VA 3IGPA 3P44A 4M2VA 4Q87A 5FLOA 4YGNA 1CCUA 3M5TA 3MDZA 4E4AA 3U45X 3P3HA 3M40A 4HT0A 4QSJA 4FVOA 5DSNA 4IWZA 4Q8XA 3BL0A 1G46A 2W2JA 4K1QA 4WW8A 2POWA 4QJPA 3KOIA 1A42A 3HS4A 4FRCA 1G4JA 1I9MA 1CVFA 4ITPA 1RZBA 2NWYA 1BN4A 5JEPB 4PYXA 5DOHA 1ZSAA 2EU3A 2NXRA 2NXTA 1KOPA 5DSQA 3M04A 1CNJA 4YGFA 3NJ9A 5DSOA 2NN1A 1RJ5A 4Y0JA 4RIUA 2FNNA 3DVCA 4Q6EA 4YGJA 3CZVA 1TEQX 3D93A 3MZCA 1RZCA 1BNWA 5E2MA 1CZMA 1RJ6A 3T85A 1UGCA 4N0XB 4CNRA 5HPJA 1OQ5A 3RZ7A 4HBAA 5EHEA 5FNGA 5CA2A 5FLRA 2NMXA 3RJ7A 3SAXA 2HNCA 4PXXA 4RFDA 1TG9A 1CAJA 3IAIA 5FNJA 1BV3A 4Q6DA 1CCTA 3U7CA 4E3HA 1CNHA 3M1JA 4Q8ZA 1G52A 5IPZA 3MHCA 4Q07A 1BNVA 1OKNA 2HL4A 3KONA 3OKVA 1RAYA 3CYUA 4L5UA 3RYZA 4Q7SA 4ZX0A 5LMDA 1CCSA 1IF4A 1I9NA 5JG3B 3V2MA 3MHIA 3MNAA 5EH8A 3VBDA 1XPZA 2FOYA 2ILIA 1H4NA 1AM6A 2CBCA 4M2UA 4FPTA 5FNLA 4E3GA 3BETA 1CILA 4PQ7A 1THKA 4RFCA 1FR7A 3KS3A 4E3FA 5FNHA 3M2NA 3N3JA 1KEQA 1H9NA 2FOSA 5EOIA 1CVCA 5CACA 4CACA 5AMDA 3F7UA 1BN1A 1CNGA 4XZ5A 3IBUA 1CVHA 3KIGA 4RN4A 1CALA 3DBUA 2FOVA 1CAZA 3OILA 3TVNX 1TBTX 2X7SA 1MUAA 1RZDA 4PYYA 1CVEA 4Z1NA 3ML5A 3K34A 3ML2A 4ITOA 1BZMA 3M2ZA 2FW4A 5JGTB 4FVNA 2CBDA 1G6VA 3MNKA 4JSZA 1FR4A 4XE1A 3RYYA 4KNNA 1UGFA 4YXOA 1IF9A 4HF3A 1TE3X 4E9OX 2OSMA 2WEGA 3T5ZA 3JXFA 1DMXA 1CNXA 1V9IC 4QK3A 3MYQA 5FDIA 1CRMA 5G03A 3S77B 4R5BA 4Q99A 4JSAA 5AMGA 3V3HB 3RLDA 3HFPA 5J8ZA 1CVDA 3GZ0A 4CNVA 4L5VA 4ZAOA 4HEYA 4COQA 4Q78A 1AVNA 3EFIA 5BNLA 1I9LA 2VVBX 3SAPA 1XQ0A 4KUWA 3S74B 2CABA 1I91A 3M5SA 4KNMA 5A25A 4ZWZA 3PYKA 1HECA 2H15A 3D0NA 1I9QA 3V7XA 4YGKA 4K13A 3B1BA 3KWAA 1G54A 1TB0X 1IF8A 3M67A 1CIMA 4XFWA 3D92A 4MLTA 1YDDA 2FMZA 5DOGA 1CNCA 2NXSA 1I8ZA 5DVXA 5EIJA 1HEDA 1BICA 3F8EA 6CA2A 5EKMA 2F14A 5FL5A 1YO1A 1FSQA 1LG6A 1G0FA 4HEWA 4ZWXA 1G48A 1ZSCA 4X5SA 4Z1JA 1Z93A 1ZFQA 3T5UA 2WD2A 5EH7A 3N2PA 1ZGFA 3DCWA 3MHMA 3RGEA 5JG5B 4TWLA 4FU5A 3RYXB 3S72B 3V5GA 4YWPA 5DSJA 3S8XA 3OYQA 1TH9A 4E3DA 3DD8A 3HKQA 3L14A 4G0CA 5E2RA 1LUGA 1TTMA 2QO8A 1UGAA 4HT2A 1CNWA 3HKTA 2ZNCA 3TVOX 4FIKA 2OSFA 3V3GB 4BF1A 3MMFA 1BNTA 2VVAX 4CNWA 4DZ9A 4QJ0A 4MDGA 2HKKA 4WUPA 4E5QA 2AW1A 4HEZA 3S9TA 1UGGA 1T9NA 3FFPX 5FNMA 4QJMA 4RIVA 3HLJA 5G01A 1HCAA 5SZ7A 1ZGEA 4KNIA 3M14A 1HEBA 1CNKA 3MWOA 4BCWA 4KV0A 2FNKA 3FW3A 3M1WA 5FL4A 3CA2A 4M2WA 2FOUA 3RZ5A 1G0EA 4QJOA 4K0TA 1V9EA 4Q9YA 3M98A 3M2XA 5FNIA 1ZFKA 1XEGA 1Y7WA 3M1QA 3U47A 4QSIA 3OIKA 1FQNA 2X7UA 3M1KA 3R17B 3JXHC 3KOKA 3DD0A 4QSAA 1CAKA 4RUYA 1IF5A 3PO6A 4M2RA 4YX4A 4YXUA 1I9PA 3MNJA 4JSWA 2CBEA 1CA3A 4ILXA 2POVA 4Q49A 4YVYA 5JGSB 2HOCA 4PZHA 1HVAA 3BL1A 4QJWA 4FL7A 5JEGB 2O4ZA 3Q31A 4MLXA 5SZ1A 2NWZA 4ZWYA 3SBIA 2HD6A 1DCBA 1FSRA 3NI5A 1CNIA 1HUGA 4QK2A 5CLUA 2H4NA 1Z97A 4C3TA 3F7BA 5G0CA 1CAYA 3DCCA 5C8IA 5DSIA 2FOQA 3K2FA 5SZ3A 4KP8A 1CINA 1UGBA 2IT4A 5JDVB 3S97A 3OY0A 3KLDB 2NNGA 3UYQA 2Q1QA 4UOVA 4Q0LA 3M96A 3LXEA 1FLJA 3M3XA 4KUVA 3P3JA 4KAPA 3D8WA 4JS6A 5BRUA 3IBLA 3K7KA 3S73B 4RUZA 1FQLA 1G3ZA 1FQMA 2NNVA 3P4VA 3DC9A 2CBAA 3HKUA 1YDAA 1ZNCA 4Q8YA 2CA2A 1IF7A 5FNKA 4Z1KA 3V2JA 1HCBA 1YO0A 3W6HA 5FL6A 5L6KA 3W6IA 1DCAA 1TEUX 4K0ZA 5FLTA 2WEOA 3IBIA 4WUQA 4KUYA 1G53A 3V3FA 1CRAA 4MDMA 1CAHA 1BNQA 5FDCA 4CA2A 2NWOA 3MNUA 4Q08A 3B4FA 4XIWA 4L5WA 3U3AX 4CQ0A 4MDLA 4MTYA 4JSSA 3DAZA 4CNXA 1JCZA 3IBNA 4TWMA 4YHAA 5FLQA 3T82A 1IF6A 4Q90A 1OKLA 1H9QA 3P5AA 2X7TA 5DSRA 7CA2A 4XIXA 1XEVA 4WR7A 2FNMA 5JESB 3RG3A 4E49A 3P5LA 1I90A 3DVBA 4QTLA 4GL1X 4RH2A 5BRVA 3DC3A 5SZ2A 1JV0A 1ZSBA 5SZ5A 4G7AA 3P58A 4Z1EA 5FLPA 1CAMA 5G0BA 2EU2A 1ZH9A 2QP6A 4MO8A 1LZVA 4N16A 3N4BA 3ZNCA 5E5RA 1BNUA 3JXGA 4YYTA 1ZE8A 4ETQC 4KNJA 12CAA 4QSBA 1CAOA 1YDCA 3DA2A 4BF6A 1KOQA 3HKNA 4K0SA 1RAZA 3RYVB 5EKHA 4R59A 4R5AA 1I9OA 3TMJA 5A6HA 2NNSA 4Q81A 4QEFA 3PJJA 5E28A 5JEHB 4ZWIA 3MNIA 5EHWA 3KKXA 1UGDA 1Z9YA 3EFTA 1LG5A 4WL4A 4QIZA 3DV7A 2CBBA 1RZAA 5DSMA 4YXIA 5BRWA 3N0NA 4Q7PA 2NN7A 5EHVA 4WW6A 5EKJA 1CVBA 1FSNA 4Q83A 3CAJA 3DVDA 1BCDA 1G1DA 2EZ7A 3MHOA 5CJFA 4RUXA 1RZEA 1YDBA 1KWRA 4ZX1A 3NB5A 3OYSA 4QK1A 5L3OA 1CVAA 3RZ1B 1EOUA 4Q06A 3F4XA 4IDRX 3T84A 3RG4A 5FLSA 5DSPA 1MOOA 3D9ZA 1G4OA 5DRSA 4KP5A 1DMYA 5DSLA 3V3JA 5DSKA 2GD8A 4Q09A 3QYKA 3OKUA 4Z0QA 4LHIA 3UYNA 4QIYA 4DZ7A 3S76A 3ZP9A 1BNNA 3IEOA 1CAIA 5BYIA 1HEAA 5SZ4A 2QOAA 4QY3A 1UGEA 3FE4A 1YO2A 3MHLA 2AX2A 3DCSA 3S75B 3R16A 1BNMA 3M5EA 2WEHA 2WD3A 1JD0A 2HFWA 5EZTX 4YGLA 3OIMA 1FQRA 5E2SA 4LP6A 3V3IB 1CA2A 1F2WA 1TG3A 3RZ0B 5AMLA 3T83A 4QJXA 1HUHA 2WEJA 5JQTA 1LGDA 3M2YA 5EH5A 3P55A 2Q38A 4HU1A 1CANA 1URTA 2ABEA 2Q1BA 3S71B 3SBHA 3KNEA 3RYJB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q7W A;  2NNO A;  2POU A;  1OKM A;  1CNB A;  5JQ0 A;  9CA2 A;  3MNH A;  1KWQ A;  5E2N A;  3C7P A;  2GEH A;  5E5U A;  1AZM A;  2FMG A;  5SZ6 A;  8CA2 A;  1CNY A;  1G45 A;  5E2K A;  5SZ0 A;  3S78 B;  1BN3 A;  3RZ8 A;  2NWP A;  1J9W A;  4LU3 A;  4Q7V A;  3IGP A;  3P44 A;  4M2V A;  4Q87 A;  5FLO A;  4YGN A;  1CCU A;  3M5T A;  3MDZ A;  4E4A A;  3U45 X;  3P3H A;  3M40 A;  4HT0 A;  4QSJ A;  4FVO A;  5DSN A;  4IWZ A;  4Q8X A;  3BL0 A;  1G46 A;  2W2J A;  4K1Q A;  4WW8 A;  2POW A;  4QJP A;  3KOI A;  1A42 A;  3HS4 A;  4FRC A;  1G4J A;  1I9M A;  1CVF A;  4ITP A;  1RZB A;  2NWY A;  1BN4 A;  5JEP B;  4PYX A;  5DOH A;  1ZSA A;  2EU3 A;  2NXR A;  2NXT A;  1KOP A;  5DSQ A;  3M04 A;  1CNJ A;  4YGF A;  3NJ9 A;  5DSO A;  2NN1 A;  1RJ5 A;  4Y0J A;  4RIU A;  2FNN A;  3DVC A;  4Q6E A;  4YGJ A;  3CZV A;  1TEQ X;  3D93 A;  3MZC A;  1RZC A;  1BNW A;  5E2M A;  1CZM A;  1RJ6 A;  3T85 A;  1UGC A;  4N0X B;  4CNR A;  5HPJ A;  1OQ5 A;  3RZ7 A;  4HBA A;  5EHE A;  5FNG A;  5CA2 A;  5FLR A;  2NMX A;  3RJ7 A;  3SAX A;  2HNC A; 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