4QSJA

Crystal structure of human carbonic anhydrase isozyme xiii with 2-chloro-4-{[(4-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-2-yl)thio]acetyl}benzenesulfonamide
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
RLSWGYREHNGPIHWKEFFPIADGDQQSPIEIKTKEVKYDSSLRPLSIKYDPSSAKIISNSGHSFNVDFDDTENKSVLRGGPLTGSYRLRQVHLHWGSADDHGSEHIVDGVSYAAELHVVHWNSDKYPSFVEAAHEPDGLAVLGVFLQIGEPNSQLQKITDTLDSIKEKGKQTRFTNFDLLSLLPPSWDYWTYPGSLTVPPLLESVTWIVLKQPINISSQQLAKFRSLLCTAEGEAAAFLVSNHRPPQPLKGRKVRASFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 13
publication title Intrinsic Thermodynamics and Structure Correlation of Benzenesulfonamides with a Pyrimidine Moiety Binding to Carbonic Anhydrases I, II, VII, XII, and XIII
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2014-07-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4qsjA00
1BNWA 3S78B 3M3XA 3OIMA 2NNSA 4WUQA 4YGJA 3MMFA 3T5UA 5JQ0A 1H4NA 3MNIA 1CANA 3DC3A 1H9NA 2NWPA 3W6HA 1HEAA 4RIUA 3MYQA 3RYZA 3M1JA 1LZVA 4JSAA 8CA2A 5JEPB 4BCWA 5FNHA 4QJMA 3N0NA 1LUGA 1G1DA 3P44A 4QSAA 2HFWA 4R59A 2Q1BA 4BF1A 5DOGA 5HPJA 1XPZA 5FLPA 4RUXA 3V3IB 3TMJA 5AMLA 1RZCA 1RZAA 4RUYA 5E2RA 3U47A 1EOUA 4IDRX 5BRUA 3OIKA 4HT2A 1BN3A 3DCSA 4JSZA 5G0CA 1FQRA 5G03A 1BNTA 3KLDB 1CNIA 5J8ZA 5BRWA 3V7XA 1FR4A 4MDGA 1LG5A 3EFTA 3QYKA 4RN4A 1CAYA 3M40A 2FNKA 1FQMA 5E2KA 3GZ0A 1ZSBA 4L5WA 1RJ5A 2FMZA 4KNIA 4X5SA 4FRCA 1CAKA 1YO0A 2NNOA 4R5AA 4XZ5A 5SZ7A 1CNHA 3V3JA 5FNMA 1UGCA 4TWMA 3MWOA 3D8WA 4Q87A 4YGKA 4QEFA 1BNUA 5C8IA 1CNCA 4K0TA 5EHWA 1IF7A 3KS3A 5CA2A 3S74B 1CNKA 3RYJB 2H4NA 3ZP9A 1BV3A 1TTMA 3PYKA 2ILIA 1I9MA 3DD0A 2EU2A 1FR7A 3V2MA 3D0NA 1FSRA 4L5UA 5FLQA 5CLUA 1CCUA 5JQTA 1BNMA 4YX4A 4Q49A 3OKUA 4BF6A 4Z1NA 2GD8A 4XIWA 1YDDA 4QJ0A 1HEBA 4RH2A 5DSPA 3KONA 3RGEA 1FQNA 4QIYA 4DZ9A 3T85A 4E3HA 1CAHA 1HCAA 1ZNCA 4E3DA 3DC9A 3RZ8A 1G48A 4XIXA 4LHIA 4QK1A 4ZWZA 3F7BA 1TG9A 1CVHA 4QIZA 3ZNCA 3HKQA 3FE4A 1HVAA 5AMGA 1CNJA 2NNGA 3K34A 3U7CA 1F2WA 4MLTA 3P3JA 3DAZA 1CAJA 5EKHA 3MHOA 5DSKA 3M1QA 1OKMA 1OQ5A 5L3OA 1CIMA 4Q8YA 5A6HA 3DCWA 2CBCA 3DVBA 1ZE8A 2X7UA 1IF9A 4QJXA 1TEQX 4XE1A 1KOQA 1URTA 1YDCA 5FNKA 5DSQA 3DVDA 4QJPA 3NJ9A 4Z0QA 3P5AA 4Q78A 1BN4A 1DMXA 3MHCA 3TVOX 3SAXA 4PYYA 2QOAA 4FIKA 1HCBA 4UOVA 2FW4A 4CA2A 3ML2A 3RZ5A 3DD8A 5EIJA 5FL6A 4ZX0A 4C3TA 4PXXA 3V2JA 5DSLA 4WR7A 4DZ7A 4HU1A 4CNXA 4CQ0A 4KUYA 1G53A 4LU3A 3P58A 3S9TA 4K0SA 3VBDA 4HEYA 4RFDA 4Q99A 3N4BA 3T84A 4JSWA 3S75B 4CNRA 1CNYA 2GEHA 1AZMA 1CNGA 5EOIA 1RAZA 1RZBA 2OSFA 3JXFA 4FVNA 2HNCA 3BL1A 1I91A 1DCAA 1ZFKA 2NWOA 4L5VA 3HKTA 2O4ZA 3M14A 3HLJA 5EZTX 3SAPA 3Q31A 4CNWA 1DMYA 1LG6A 2ABEA 1RZEA 3HS4A 5BYIA 4KUVA 5IPZA 3HKNA 2NXTA 4MDLA 4ZX1A 1UGEA 4R5BA 4MO8A 3W6IA 4QSBA 5E2MA 4COQA 3MDZA 3P5LA 2H15A 3OYSA 5SZ3A 2ZNCA 3SBHA 4KP8A 1G4JA 4QK2A 4ETQC 3T82A 3MNJA 4N0XB 3OY0A 4YGLA 2FOVA 4KAPA 1CVDA 4QK3A 2FOQA 3KWAA 4QTLA 7CA2A 3IBNA 4KUWA 1RZDA 1I9LA 4Q07A 1THKA 4E3GA 4HEWA 1CAMA 3IAIA 4MLXA 5EH7A 1CNWA 3P55A 3DV7A 3D9ZA 5DSJA 4Z1JA 1AM6A 1CVCA 4KNNA 5JEGB 1FSNA 1CINA 2X7TA 1I8ZA 1G6VA 1G0EA 3RZ7A 4M2VA 5FL4A 2CA2A 1G52A 3R17B 1CNBA 3P4VA 5EH5A 5JDVB 1KWQA 4RFCA 1BZMA 1H9QA 5FDCA 5FNIA 3R16A 4YXUA 1G0FA 5DSNA 4E9OX 2WEHA 1I9PA 1IF8A 4ITOA 5EH8A 1KEQA 4MDMA 5JGTB 3D92A 4Q9YA 3M96A 3JXGA 3CYUA 3MNAA 4YHAA 4E3FA 4GL1X 2WEGA 5G01A 4ZWIA 3RG4A 4Z1EA 1BNQA 4Q81A 2HD6A 1Z97A 5FNGA 3CZVA 1CILA 4YWPA 5SZ6A 1XQ0A 3M1KA 4QJOA 4ZAOA 4ITPA 2POVA 2CBAA 1ZGEA 3MNKA 4Q7SA 5EHEA 3HKUA 1HECA 3JXHC 4Q7WA 2NMXA 4XFWA 5JGSB 1FQLA 1UGFA 1I9NA 3PJJA 3RYVB 3K2FA 12CAA 3PO6A 2FOSA 1Y7WA 1FSQA 3S97A 1CZMA 2POUA 1UGGA 2AW1A 1YO2A 5JESB 4WW8A 2NN7A 1CALA 3IBIA 2OSMA 5FNJA 4Z1KA 3MHMA 4PQ7A 3M1WA 3S73B 2EU3A 1UGBA 3CAJA 5DSMA 5FDIA 1TBTX 5E2NA 1LGDA 4ILXA 4YVYA 3OYQA 4Q7VA 3MHIA 4Q0LA 2W2JA 1YO1A 1YDBA 4HF3A 4QJWA 6CA2A 5SZ2A 1G4OA 4QSIA 1HEDA 1DCBA 2FOUA 3D93A 4Q83A 1MOOA 4KV0A 4ZWXA 1AVNA 3V3HB 5DOHA 1IF5A 1G46A 3V3GB 4WW6A 1TB0X 3M98A 1CCSA 1HUHA 4JSSA 3KKXA 1BN1A 2CBEA 2HKKA 4FPTA 5DVXA 1IF4A 2NXSA 1CCTA 4G0CA 5A25A 5DSIA 3C7PA 1TEUX 4Q06A 2CABA 4Q90A 3RLDA 5LMDA 1CA2A 3U45X 3M2XA 5CACA 5FLSA 1ZSAA 4QY3A 3IGPA 2FMGA 4K0ZA 1I90A 3P3HA 1CAOA 1CNXA 5SZ5A 3OKVA 2CBBA 1ZH9A 2NXRA 3M5EA 3DA2A 3UYNA 4CACA 3S77B 2F14A 4M2RA 4Q09A 1T9NA 5DSOA 4YGFA 4LP6A 3B4FA 1XEGA 1JD0A 1JV0A 1J9WA 1KWRA 5DSRA 3RYYA 3UYQA 4Q08A 3MNHA 3IBLA 1IF6A 5G0BA 3CA2A 5CJFA 2Q38A 2X7SA 3DBUA 1CVEA 1JCZA 1I9OA 1Z9YA 4HT0A 1UGAA 1V9EA 5FLOA 3RYXB 5SZ4A 2WEOA 5FLRA 3T5ZA 1BNNA 4Q6DA 1CRAA 1CVAA 5EKJA 5JG5B 2WD3A 4FL7A 4N16A 1XEVA 4FU5A 3F7UA 1ZSCA 1BICA 3M2NA 1BNVA 4RIVA 4WUPA 3NI5A 3LXEA 4RUZA 5E28A 4Q8XA 3MZCA 1G54A 1HUGA 2FNMA 1FLJA 3F4XA 3M67A 3N2PA 2VVBX 4FVOA 4YGNA 4Q6EA 3V3FA 2CBDA 4PZHA 5EHVA 5DRSA 1OKLA 3S72B 3S8XA 4E4AA 4YYTA 3HFPA 2QP6A 1ZFQA 2AX2A 3KIGA 3KOIA 1TE3X 4K13A 2VVAX 3SBIA 2FNNA 1CVFA 1UGDA 4E5QA 3RG3A 4MTYA 1KOPA 3KNEA 2EZ7A 4YXIA 3EFIA 2NNVA 5E2SA 5EKMA 4CNVA 3M2ZA 4JS6A 5FL5A 3N3JA 2POWA 3NB5A 2HL4A 5BNLA 1BCDA 1OKNA 1RAYA 4Q8ZA 4QSJA 1YDAA 5JG3B 1I9QA 2FOYA 4Q7PA 1TH9A 4K1QA 3OILA 4Y0JA 1ZGFA 4YXOA 3ML5A 5FNLA 3V5GA 3RZ1B 2QO8A 5E5UA 5L6KA 1A42A 2HOCA 3L14A 4KP5A 3M5TA 4KNMA 2Q1QA 3BL0A 4TWLA 1CVBA 4HEZA 2NN1A 2IT4A 3BETA 3K7KA 3T83A 4WL4A 1CA3A 3IBUA 3S71B 4G7AA 3TVNX 3F8EA 3RZ0B 4E49A 2NWYA 5SZ0A 1MUAA 3B1BA 5SZ1A 2WD2A 4M2UA 3FW3A 4M2WA 1G45A 3MNUA 4HBAA 4PYXA 1V9IC 3DVCA 3IEOA 5BRVA 2NWZA 3M5SA 1RJ6A 5FLTA 2WEJA 1TG3A 5AMDA 4ZWYA 1CAIA 3MHLA 1CAZA 5JEHB 3M04A 4KNJA 1CRMA 3RJ7A 4IWZA 9CA2A 1G3ZA 3S76A 3DCCA 1Z93A 3U3AX 3M2YA 5E5RA 3FFPX 3KOKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BNW A;  3S78 B;  3M3X A;  3OIM A;  2NNS A;  4WUQ A;  4YGJ A;  3MMF A;  3T5U A;  5JQ0 A;  1H4N A;  3MNI A;  1CAN A;  3DC3 A;  1H9N A;  2NWP A;  3W6H A;  1HEA A;  4RIU A;  3MYQ A;  3RYZ A;  3M1J A;  1LZV A;  4JSA A;  8CA2 A;  5JEP B;  4BCW A;  5FNH A;  4QJM A;  3N0N A;  1LUG A;  1G1D A;  3P44 A;  4QSA A;  2HFW A;  4R59 A;  2Q1B A;  4BF1 A;  5DOG A;  5HPJ A;  1XPZ A;  5FLP A;  4RUX A;  3V3I B;  3TMJ A;  5AML A;  1RZC A;  1RZA A;  4RUY A;  5E2R A;  3U47 A;  1EOU A;  4IDR X;  5BRU A;  3OIK A;  4HT2 A;  1BN3 A;  3DCS A;  4JSZ A;  5G0C A;  1FQR A;  5G03 A;  1BNT A;  3KLD B;  1CNI A;  5J8Z A;  5BRW A;  3V7X A;  1FR4 A;  4MDG A;  1LG5 A;  3EFT A;  3QYK A;  4RN4 A;  1CAY A;  3M40 A;  2FNK A;  1FQM A;  5E2K A;  3GZ0 A;  1ZSB A;  4L5W A;  1RJ5 A;  2FMZ A;  4KNI A;  4X5S A;  4FRC A;  1CAK A;  1YO0 A;  2NNO A;  4R5A A;  4XZ5 A;  5SZ7 A;  1CNH A;  3V3J A;  5FNM A;  1UGC A;  4TWM A;  3MWO A;  3D8W A;  4Q87 A;  4YGK A;  4QEF A;  1BNU A;  5C8I A;  1CNC A;  4K0T A;  5EHW A;  1IF7 A;  3KS3 A;  5CA2 A;  3S74 B; 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