4K0TA

Structure of hcaix mimic (hcaii with 5 mutations in active site) in complex with chlorzolamide
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHSFQVTFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDLGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTEGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Designing isoform specific inhibitors against hCAIX using CAIX mimic
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2013-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4k0tA00
5A6HA 3B4FA 4Q8YA 4E3FA 1TG9A 3RYVB 2X7UA 5CA2A 1CNBA 4MLXA 1G4JA 4KP8A 5G0CA 4WR7A 1CVFA 3S76A 3RYJB 1KOQA 1BNWA 4Q83A 1ZFKA 1UGFA 2FOYA 3B1BA 1RZBA 4PYYA 5E2KA 1CA3A 1CAJA 1ZFQA 3RG4A 3TMJA 1J9WA 3IBIA 5HPJA 1HEDA 1FR4A 4XZ5A 3NJ9A 3KKXA 5FLQA 4M2RA 3OY0A 4LP6A 4KAPA 3V3FA 4ETQC 3PO6A 1HCAA 4HEWA 4RFDA 3RGEA 4K0ZA 3RZ7A 3IBLA 1UGDA 3S72B 3OILA 4BF6A 3OIKA 4Q49A 4HT0A 3M96A 3F7BA 1Z97A 4L5UA 2OSFA 1RJ6A 5CACA 3D93A 4G7AA 4Q8ZA 2WEJA 1CNYA 5J8ZA 3MHIA 4N0XB 5DOHA 1DMXA 5JQTA 3KOIA 3ZNCA 2QOAA 1KEQA 5SZ0A 5JQ0A 4QK1A 1YDAA 1IF4A 1TE3X 4Q7WA 3T5UA 2NNOA 1V9EA 3NI5A 1I9MA 2AX2A 4MTYA 3RLDA 1BCDA 1RJ5A 1TBTX 5SZ6A 3RYZA 4CA2A 4ILXA 3DVBA 1TH9A 1KWQA 4ZWIA 3MNAA 2GD8A 3K34A 2ZNCA 1CIMA 3KNEA 4Z1KA 2F14A 5BRVA 2CBCA 4JSWA 3UYNA 3RJ7A 4E49A 1RZDA 3PJJA 4COQA 4TWLA 4XIWA 2HD6A 4Z0QA 1XQ0A 3DC3A 5DOGA 4E3DA 3FE4A 1OKMA 3TVOX 3DV7A 4YVYA 1CAKA 3C7PA 4KUYA 5E2SA 5C8IA 2X7TA 2FNNA 3DVDA 1EOUA 4UOVA 5A25A 1JD0A 4KP5A 3M2NA 1KWRA 2QO8A 4QJMA 1AM6A 3DD0A 3IEOA 3MYQA 1URTA 5JGSB 3W6IA 1XEVA 3DA2A 1CANA 6CA2A 3S71B 1KOPA 1Z93A 2FOSA 4JSAA 1ZNCA 1G0FA 2AW1A 5E5UA 3F8EA 4RIUA 1HEAA 1RZEA 2NXTA 3MDZA 4Q7VA 3P58A 3EFTA 4R59A 4LHIA 1G48A 5FLPA 4RFCA 1UGAA 1HCBA 3DCSA 4E4AA 2FMZA 1H9NA 2H4NA 2CBEA 3S77B 5FNLA 5JGTB 4N16A 3HFPA 5FLRA 3DD8A 2HNCA 3ML5A 5DSNA 1HVAA 3W6HA 4YXIA 3R16A 2Q38A 4BCWA 4ITPA 3NB5A 3ML2A 3T84A 3V3IB 3JXHC 3V3JA 1ZGFA 3IBUA 5EKHA 1RAZA 2WEGA 1V9IC 5SZ2A 2CABA 1CVDA 4XFWA 4CQ0A 3HKNA 3M5EA 2CBAA 2EZ7A 4Q09A 4QJOA 4ITOA 1CINA 1XPZA 1CAMA 1HUHA 4ZX1A 4QJWA 1BN4A 3BETA 1OQ5A 1G53A 3PYKA 4KUWA 5EH7A 4YGKA 1IF5A 4Y0JA 3T83A 1LGDA 1AVNA 3M67A 3T5ZA 9CA2A 4KNIA 2WEHA 4IDRX 1BZMA 1FQMA 1H9QA 1BNMA 1Z9YA 5BRWA 2HKKA 4YGLA 5FL4A 2FOUA 3JXFA 4PQ7A 3M98A 1I8ZA 1FR7A 5FNJA 1TEUX 1I9QA 1CNWA 2CBDA 4FIKA 3RYXB 7CA2A 3P3JA 4QK2A 3FFPX 4QSIA 1RZAA 4QJ0A 3OYSA 1ZE8A 3P3HA 3FW3A 3MNHA 4Q78A 5EH5A 5FNKA 4QSAA 3S75B 1ZSAA 5SZ4A 2POVA 5DVXA 5FDIA 4L5WA 5FLOA 4M2UA 4BF1A 4CNWA 1YDDA 3CA2A 1CA2A 1YO1A 1DCAA 1ZSBA 4PZHA 1CAIA 1HECA 4CACA 4JSSA 5AMDA 1FQRA 2NWYA 3CYUA 4Q0LA 2OSMA 1CAZA 3KIGA 1BICA 1UGGA 3MHCA 1CALA 4FRCA 1BNUA 2O4ZA 4PYXA 1LZVA 4K13A 3V2MA 5FNGA 1BN3A 4K1QA 4Q81A 1I9OA 3M1QA 1CNXA 3M5TA 3KONA 2NN7A 1OKLA 5E5RA 3RG3A 3MMFA 1BNTA 2H15A 1CNKA 1G6VA 3P55A 4KNNA 3EFIA 3JXGA 4FVNA 1HEBA 3S78B 2HFWA 1I9PA 1RAYA 4KV0A 3MHMA 3N2PA 3CAJA 4MDMA 2QP6A 1CVCA 2NXSA 4Q99A 8CA2A 3L14A 2Q1BA 2FOVA 3M2ZA 5FNHA 4QIYA 5E28A 3P5LA 1CCTA 4RUZA 3U7CA 5SZ3A 3MNKA 1DMYA 2FOQA 5EZTX 5FNMA 4K0SA 1CAHA 4Q08A 5BYIA 4IWZA 1G1DA 4HBAA 5JEHB 1I91A 1UGEA 4JS6A 4YXUA 1CVEA 3T85A 3HKTA 4Z1JA 3S73B 5AMGA 1G46A 1UGBA 1T9NA 4ZWXA 1CAYA 4R5BA 1I9LA 1THKA 1TG3A 4FVOA 4L5VA 5FL5A 4E9OX 4M2VA 1YO2A 3QYKA 4RUXA 1ZSCA 3RZ5A 4YXOA 4ZWZA 5EIJA 2VVAX 4RIVA 3DCCA 4YGNA 4ZWYA 3KOKA 5SZ1A 1CZMA 4QIZA 4M2WA 4ZAOA 5LMDA 3RZ8A 5DSQA 4Q7SA 3MWOA 3V5GA 1FLJA 5JDVB 4E5QA 3OKVA 1TB0X 1HUGA 1YDBA 2ABEA 4HEYA 5EHVA 1IF6A 1CILA 2IT4A 3T82A 1G45A 4CNRA 2HOCA 4HEZA 1A42A 3M2YA 3RZ0B 4DZ9A 3MHOA 4HT2A 1BNQA 3F7UA 2FNMA 5L3OA 1Y7WA 1FQNA 4Q6DA 4Q7PA 3HLJA 1CNGA 5DSOA 5JESB 3MNIA 4HF3A 3U45X 5DSIA 1G3ZA 4Q9YA 3D9ZA 3KWAA 4RUYA 3DVCA 3DAZA 4G0CA 5EKMA 4QJPA 1JV0A 1F2WA 2CA2A 4MDGA 4WL4A 2W2JA 3U47A 3D8WA 1BNNA 4RN4A 5CJFA 3K2FA 2Q1QA 3P44A 5EHEA 1IF8A 3HKUA 4HU1A 4KNJA 1CNCA 4WW8A 3M1KA 4FL7A 3LXEA 2WD3A 2NWPA 4YX4A 1DCBA 1LG5A 4Q90A 1FSNA 2EU2A 4LU3A 3V7XA 4FU5A 1JCZA 1CVBA 3N3JA 4R5AA 4WUQA 4QTLA 5JEGB 4CNXA 1IF9A 3S8XA 4QEFA 3U3AX 4KNMA 1CNJA 3TVNX 1ZH9A 2WEOA 5DSRA 5BRUA 1G52A 3D92A 5SZ7A 4KUVA 4XE1A 3DCWA 3OYQA 1IF7A 1FQLA 1CRMA 2FW4A 4YHAA 5FDCA 3RZ1B 3SBIA 3M04A 5G03A 2POUA 3P4VA 1CNHA 3S97A 3ZP9A 1I9NA 3MZCA 5FL6A 4WW6A 3HKQA 3S74B 5EOIA 4YYTA 4YGFA 2NNVA 5EHWA 5G01A 4RH2A 5E2RA 4FPTA 1G0EA 3IGPA 2FMGA 3SBHA 2POWA 4GL1X 5DSKA 1CVAA 4QJXA 3SAXA 5JEPB 4QSJA 4WUPA 4E3GA 5AMLA 3GZ0A 2CBBA 3MNJA 1G54A 3N0NA 4QSBA 4E3HA 3MNUA 4QK3A 2EU3A 3M40A 3V3HB 5JG5B 4XIXA 4Q8XA 1ZGEA 2NMXA 5JG3B 3VBDA 5DSLA 2NNGA 3OIMA 3R17B 1CAOA 3RYYA 2GEHA 3BL1A 1FSQA 3V3GB 3KLDB 1G4OA 3IBNA 4Q06A 4YGJA 4Z1NA 1AZMA 1H4NA 5E2MA 1CCUA 2X7SA 1CNIA 5E2NA 1YDCA 4CNVA 1MUAA 3BL0A 4MDLA 4YWPA 3IAIA 4QY3A 5FLTA 5EKJA 1BNVA 3M14A 3DBUA 3M5SA 5FLSA 5FNIA 4ZX0A 4X5SA 1CRAA 4DZ7A 1OKNA 4Q6EA 4C3TA 1RZCA 1TTMA 2WD2A 4TWMA 3DC9A 3N4BA 12CAA 4MO8A 2HL4A 5IPZA 3M2XA 3M1JA 1XEGA 4Q07A 3SAPA 3D0NA 3V2JA 1MOOA 2NWOA 2VVBX 5BNLA 5DSJA 3K7KA 3F4XA 2NXRA 3HS4A 4Q87A 3MHLA 3CZVA 4PXXA 1CCSA 1I90A 1FSRA 1BV3A 5DSMA 2FNKA 3P5AA 1UGCA 1LG6A 1BN1A 4MLTA 4JSZA 3KS3A 1TEQX 5DRSA 5G0BA 2ILIA 4K0TA 1YO0A 5CLUA 5L6KA 2NNSA 2NN1A 3M3XA 1CVHA 3OKUA 3M1WA 5DSPA 3UYQA 5SZ5A 1LUGA 4Z1EA 3S9TA 5EH8A 2NWZA 3Q31A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5A6H A;  3B4F A;  4Q8Y A;  4E3F A;  1TG9 A;  3RYV B;  2X7U A;  5CA2 A;  1CNB A;  4MLX A;  1G4J A;  4KP8 A;  5G0C A;  4WR7 A;  1CVF A;  3S76 A;  3RYJ B;  1KOQ A;  1BNW A;  4Q83 A;  1ZFK A;  1UGF A;  2FOY A;  3B1B A;  1RZB A;  4PYY A;  5E2K A;  1CA3 A;  1CAJ A;  1ZFQ A;  3RG4 A;  3TMJ A;  1J9W A;  3IBI A;  5HPJ A;  1HED A;  1FR4 A;  4XZ5 A;  3NJ9 A;  3KKX A;  5FLQ A;  4M2R A;  3OY0 A;  4LP6 A;  4KAP A;  3V3F A;  4ETQ C;  3PO6 A;  1HCA A;  4HEW A;  4RFD A;  3RGE A;  4K0Z A;  3RZ7 A;  3IBL A;  1UGD A;  3S72 B;  3OIL A;  4BF6 A;  3OIK A;  4Q49 A;  4HT0 A;  3M96 A;  3F7B A;  1Z97 A;  4L5U A;  2OSF A;  1RJ6 A;  5CAC A;  3D93 A;  4G7A A;  4Q8Z A;  2WEJ A;  1CNY A;  5J8Z A;  3MHI A;  4N0X B;  5DOH A;  1DMX A;  5JQT A;  3KOI A;  3ZNC A;  2QOA A;  1KEQ A;  5SZ0 A;  5JQ0 A;  4QK1 A;  1YDA A;  1IF4 A;  1TE3 X;  4Q7W A;  3T5U A;  2NNO A;  1V9E A;  3NI5 A;  1I9M A;  2AX2 A;  4MTY A;  3RLD A;  1BCD A;  1RJ5 A;  1TBT X;  5SZ6 A;  3RYZ A;  4CA2 A;  4ILX A;  3DVB A;  1TH9 A;  1KWQ A;  4ZWI A;  3MNA A;  2GD8 A; 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