1BICA

Crystallographic analysis of thr-200-> his human carbonic anhydrase ii and its complex with the substrate, hco3-
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTHPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Crystallographic analysis of Thr-200-->His human carbonic anhydrase II and its complex with the substrate, HCO3-.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bicA00
4Q7PA 5SZ0A 1UGGA 4Y0JA 2CBDA 4Q7SA 5LMDA 3EFIA 1CALA 4MDLA 5E2NA 2POVA 4QSAA 1TEUX 1FR7A 5BRWA 2GEHA 3BL1A 4Q99A 4KUVA 4MLXA 3RLDA 4WW6A 1HUHA 5FNKA 5FLSA 1CA3A 1YO0A 5EZTX 3RGEA 1I9QA 1KEQA 1BNMA 3M04A 3NI5A 4TWMA 5DVXA 1YDCA 3SBIA 4BF1A 5AMDA 4QK1A 12CAA 1Z9YA 2CA2A 2X7SA 3P44A 1IF5A 2Q38A 4GL1X 5DSQA 4QSBA 1EOUA 1CVDA 1IF8A 3M98A 3M1QA 4DZ7A 3MYQA 1BN1A 3W6IA 1CNIA 1THKA 3BETA 1CVCA 3BL0A 5BRVA 1BNVA 5FNGA 4QSIA 4Q06A 5G0CA 5IPZA 5JGSB 4E5QA 3M5SA 4YYTA 3OKVA 4JSSA 4MLTA 4KAPA 3T85A 3P5AA 3C7PA 4QK3A 3M2NA 3MHOA 2IT4A 3UYQA 4WUPA 4YXUA 4HU1A 2FOVA 4LHIA 3RYYA 2HNCA 4RIVA 4WW8A 4KV0A 1TB0X 3SAXA 3V3GB 1UGFA 1OKMA 5E5UA 1TG3A 4QY3A 3JXFA 2NMXA 3D8WA 1MUAA 3T5UA 1OKNA 5E2SA 2CBBA 5JEGB 2CBAA 4FL7A 4M2RA 1CAKA 5JGTB 3W6HA 4FU5A 4QEFA 3B4FA 3S71B 1CNYA 3N0NA 5DSIA 3ML2A 2CBCA 4WR7A 4IDRX 3RJ7A 1MOOA 3P4VA 3HFPA 3R16A 4KNIA 2EU2A 1ZSCA 4HEYA 4QSJA 1BN3A 3CAJA 4FPTA 3OIMA 3MNKA 4L5WA 1H9QA 1TEQX 3Q31A 1RJ6A 3GZ0A 5EH8A 4YXIA 1HECA 4XFWA 1XPZA 1CAZA 3KLDB 1BNUA 1CNGA 3NB5A 4QJ0A 2QOAA 1G0FA 1CNXA 3QYKA 5JEHB 5DSRA 1BN4A 3D9ZA 1G52A 1HCAA 3V3HB 5FL6A 1CCSA 3K2FA 3RYXB 2HOCA 3KNEA 4C3TA 3U45X 4QJMA 3HKUA 3ZNCA 3IBNA 4Q90A 3KOIA 3MHIA 1RAZA 4ITPA 4R59A 5DRSA 3V3FA 1G46A 1FSRA 2WEOA 4CA2A 5FLQA 5FLTA 3V3IB 4HBAA 1ZNCA 3M5TA 4FIKA 2FNKA 4FVOA 3S74B 5JDVB 1KWRA 4Q6DA 3M2YA 4PXXA 5EIJA 4K1QA 2EU3A 3S75B 3TVNX 4JS6A 3M14A 4Q8ZA 3VBDA 4Z1KA 1HVAA 4PYXA 4YX4A 1FQNA 2FOUA 4WUQA 4ZWXA 4M2VA 1JCZA 5BNLA 1G0EA 1Z93A 3DCCA 5FLPA 3B1BA 3U47A 3FE4A 4Q8YA 4RFCA 4HT0A 3DD0A 5FNIA 4ZWYA 4QJPA 3M5EA 4KP8A 3M1KA 4E3GA 4QIYA 2QO8A 4FRCA 2VVBX 3V3JA 3RZ1B 3DC9A 1CAIA 1G4JA 5C8IA 1RJ5A 5E5RA 1YDDA 1FLJA 2HL4A 4MDMA 5SZ2A 3D92A 2FW4A 5SZ3A 5FDIA 1CAHA 1J9WA 1ZH9A 5DSLA 1CAMA 1BNQA 4M2WA 1CVEA 3RYVB 4LU3A 3TMJA 3PO6A 5BYIA 5SZ5A 4QJOA 3L14A 3M2XA 4HT2A 4ILXA 5CJFA 1ZGEA 1CAOA 1IF9A 3MMFA 3S8XA 5EOIA 4Z1JA 5JEPB 3MHLA 2X7UA 2O4ZA 1HEBA 4Q08A 2NWZA 1Y7WA 2POUA 4RH2A 4CNXA 1CVAA 1YDAA 3JXHC 3N2PA 1I9LA 4XIXA 2CABA 1CAJA 2FMGA 2OSMA 3DD8A 4KUWA 3SAPA 3RZ7A 1FQLA 7CA2A 2FMZA 2W2JA 3OILA 3RG4A 1CVBA 4DZ9A 1RAYA 4WL4A 2WD3A 3IAIA 5FNJA 3P3HA 1ZFKA 3D0NA 3P55A 5G01A 4L5UA 3IBLA 1LG6A 3M67A 5CACA 3HKQA 3MNIA 1XEVA 1HUGA 3OY0A 2WEJA 1CNJA 5E2RA 4CNWA 5EKMA 5E2KA 3EFTA 1DMYA 1TBTX 1TE3X 4MTYA 1I90A 4TWLA 3MNHA 2ABEA 4K0SA 2NNOA 1CNKA 2POWA 4Q83A 1RZCA 4RN4A 3DVCA 3V5GA 4KP5A 5CA2A 3MDZA 9CA2A 1HCBA 1IF4A 4KNJA 4MO8A 5EKHA 2Q1QA 5EKJA 5L3OA 4ZWZA 1DCAA 5G03A 3RG3A 5FL5A 3HS4A 1FR4A 3KS3A 3S9TA 4RFDA 3OKUA 3S77B 3V2JA 3DC3A 4CNRA 4Q0LA 1BCDA 3IBUA 4LP6A 3HKTA 4PQ7A 3HLJA 4ZX1A 3MZCA 1A42A 4UOVA 4Q07A 1BICA 1CRAA 3K34A 4ZX0A 3S72B 1I9OA 4KNNA 1TTMA 4M2UA 4E3DA 2FOYA 4Z1NA 1H9NA 4E49A 5FNMA 3MHCA 1ZE8A 5FDCA 3K7KA 1I9MA 4IWZA 4KUYA 1YO1A 1BZMA 4RUXA 5FNLA 1JV0A 1RZEA 3PJJA 5E28A 2FNMA 2FOSA 4YWPA 4Q6EA 5JQ0A 4YHAA 1XQ0A 3OYQA 5JG3B 4RIUA 3U7CA 1Z97A 2OSFA 3IBIA 5FLOA 4Q8XA 1T9NA 5A25A 3DCWA 5SZ4A 1OQ5A 3V7XA 4CQ0A 3DV7A 4ITOA 5DSOA 3LXEA 1I9PA 1UGAA 4ZAOA 2HKKA 5L6KA 1UGDA 5BRUA 1KOPA 1G3ZA 3P5LA 5FL4A 1I8ZA 2HD6A 3OIKA 3U3AX 4Q78A 1FSNA 5FNHA 3CA2A 1RZAA 3DVBA 3R17B 1CNHA 4ZWIA 4E4AA 3V2MA 1CZMA 3S97A 1BNTA 4YGLA 1LGDA 5J8ZA 3DAZA 1I91A 3F8EA 2FOQA 4JSWA 3JXGA 2AX2A 3FFPX 1IF7A 4CACA 5EHVA 1LZVA 1BNWA 1CIMA 4QJWA 3OYSA 1G1DA 3T82A 4YGNA 1CRMA 2NWYA 2ZNCA 3FW3A 2HFWA 1KOQA 2NN7A 4RUZA 2WD2A 4Q81A 3HKNA 3SBHA 4K13A 4Q87A 4X5SA 2NNGA 4JSZA 2NNVA 4Z1EA 4XE1A 1ZGFA 2WEHA 4E3HA 4RUYA 4YVYA 1BV3A 2X7TA 3S76A 1HEDA 1CCTA 1UGCA 4YXOA 1AVNA 4L5VA 1G48A 1G4OA 4K0TA 1FSQA 3M1JA 5DSKA 3MHMA 2NXRA 1XEGA 4E3FA 2NN1A 1G45A 1TG9A 3KIGA 4MDGA 1CCUA 4KNMA 3F7BA 1CA2A 3F4XA 1RZDA 3IGPA 3T83A 1YDBA 3TVOX 1DMXA 1UGBA 3KOKA 4XIWA 3M96A 4YGKA 3DA2A 3M40A 2EZ7A 3S73B 4QIZA 4Q49A 3IEOA 3M1WA 4XZ5A 2F14A 1CANA 4BCWA 1AZMA 3T84A 1JD0A 4Q09A 3MNJA 1CILA 4CNVA 3ML5A 3M3XA 4G7AA 5DSJA 4HEZA 2H15A 3CYUA 1UGEA 5DSNA 4PYYA 6CA2A 1BNNA 1LUGA 1V9IC 3S78B 1V9EA 2NNSA 3DCSA 1LG5A 5E2MA 3RZ8A 4Q7WA 1DCBA 5JESB 1FQRA 1CINA 1CNCA 3MNAA 4K0ZA 3P58A 4N16A 5SZ7A 5EHEA 1ZSBA 1G6VA 3KWAA 3M2ZA 4BF6A 4E9OX 4HF3A 5DSMA 1CNWA 3RZ0B 1F2WA 1CNBA 3N3JA 3PYKA 4YGJA 8CA2A 5SZ6A 4ETQC 1OKLA 4Z0QA 4COQA 5JG5B 2WEGA 3F7UA 1ZFQA 3NJ9A 4QTLA 5DOHA 3T5ZA 2NWOA 4HEWA 1URTA 1KWQA 5HPJA 3DBUA 2GD8A 5EH7A 1H4NA 4JSAA 5DOGA 2FNNA 1RZBA 3RZ5A 4QK2A 2NXTA 1G54A 1YO2A 5FLRA 3N4BA 3RYZA 5EH5A 5G0BA 4Q7VA 2H4NA 3RYJB 2VVAX 4FVNA 4QJXA 5AMGA 1TH9A 1G53A 1HEAA 4R5AA 4YGFA 5SZ1A 3MWOA 3DVDA 3KKXA 3CZVA 1CVFA 1I9NA 4Q9YA 5AMLA 4N0XB 2QP6A 2NWPA 5CLUA 4G0CA 3UYNA 3D93A 2ILIA 1IF6A 1CVHA 1ZSAA 5A6HA 3MNUA 3KONA 5JQTA 1CAYA 3P3JA 1AM6A 5EHWA 1FQMA 3ZP9A 2AW1A 2CBEA 4PZHA 2NXSA 5DSPA 2Q1BA 4R5BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q7P A;  5SZ0 A;  1UGG A;  4Y0J A;  2CBD A;  4Q7S A;  5LMD A;  3EFI A;  1CAL A;  4MDL A;  5E2N A;  2POV A;  4QSA A;  1TEU X;  1FR7 A;  5BRW A;  2GEH A;  3BL1 A;  4Q99 A;  4KUV A;  4MLX A;  3RLD A;  4WW6 A;  1HUH A;  5FNK A;  5FLS A;  1CA3 A;  1YO0 A;  5EZT X;  3RGE A;  1I9Q A;  1KEQ A;  1BNM A;  3M04 A;  3NI5 A;  4TWM A;  5DVX A;  1YDC A;  3SBI A;  4BF1 A;  5AMD A;  4QK1 A;  12CA A;  1Z9Y A;  2CA2 A;  2X7S A;  3P44 A;  1IF5 A;  2Q38 A;  4GL1 X;  5DSQ A;  4QSB A;  1EOU A;  1CVD A;  1IF8 A;  3M98 A;  3M1Q A;  4DZ7 A;  3MYQ A;  1BN1 A;  3W6I A;  1CNI A;  1THK A;  3BET A;  1CVC A;  3BL0 A;  5BRV A;  1BNV A;  5FNG A;  4QSI A;  4Q06 A;  5G0C A;  5IPZ A;  5JGS B;  4E5Q A;  3M5S A;  4YYT A;  3OKV A;  4JSS A;  4MLT A;  4KAP A;  3T85 A;  3P5A A;  3C7P A;  4QK3 A;  3M2N A;  3MHO A;  2IT4 A;  3UYQ A;  4WUP A;  4YXU A;  4HU1 A;  2FOV A;  4LHI A;  3RYY A;  2HNC A;  4RIV A;  4WW8 A;  4KV0 A;  1TB0 X;  3SAX A;  3V3G B;  1UGF A;  1OKM A;  5E5U A;  1TG3 A;  4QY3 A;  3JXF A;  2NMX A;  3D8W A;  1MUA A;  3T5U A; 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