1CAIA

Structural analysis of the zinc hydroxide-thr 199-glu 106 hydrogen bonding network in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSAHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural analysis of the zinc hydroxide-Thr-199-Glu-106 hydrogen-bond network in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1caiA00
4PYYA 4HEZA 1FR7A 2X7UA 3T84A 1G45A 4RUZA 4E3HA 4K0ZA 3DCSA 4R59A 4X5SA 3S71B 4Q8ZA 4QIZA 1TTMA 1BV3A 3P4VA 3MHIA 2NWZA 3Q31A 5JDVB 3IBIA 5SZ5A 3F7UA 1G48A 5FNHA 2GD8A 3OIKA 5SZ0A 5SZ3A 1TBTX 4Q87A 4YGFA 5SZ7A 4HEYA 1YDDA 4ETQC 3W6IA 5CLUA 3RYZA 4RFDA 4K0TA 3HFPA 1G0FA 4RN4A 4ITPA 3P55A 4Q7SA 1CNYA 1FQMA 1UGGA 2ILIA 4KNMA 4Q9YA 5BRVA 1HEDA 4Q07A 2Q1BA 4BCWA 3T82A 5DVXA 1CA3A 2EU2A 5FNGA 4E9OX 3S8XA 5EHWA 4QEFA 1CCSA 2AW1A 4TWMA 5FNJA 1IF5A 1G3ZA 1CAJA 4Q90A 1UGFA 4YXUA 5FLOA 5G01A 4JS6A 3HKQA 5FNLA 1H4NA 4IWZA 3K34A 2NWOA 5SZ2A 3FW3A 3MHLA 5A25A 3CAJA 2X7TA 3MMFA 1CNWA 2CABA 4WR7A 4FVOA 1FQRA 4K13A 1OQ5A 3BETA 3M04A 4Z1EA 1MOOA 4YGLA 3P58A 4Q0LA 2NMXA 5FL4A 1AZMA 2X7SA 2NN1A 4CQ0A 3M96A 5DSPA 1LG5A 2POVA 2CBAA 3ZP9A 4Q06A 2CBEA 8CA2A 3P5LA 4RUXA 4KP8A 3RJ7A 4Z1NA 1KOQA 1XEGA 3W6HA 3RG4A 2O4ZA 5FL6A 4M2UA 1CNCA 3FFPX 4ITOA 2W2JA 3ML5A 4MTYA 1ZGFA 4E5QA 3K7KA 1RJ5A 5AMGA 3SAPA 5DRSA 4LHIA 3HKUA 3D8WA 3KKXA 4E3GA 5FNKA 1V9EA 4YXIA 3ZNCA 1FQLA 3HKTA 1I9MA 4JSAA 1BNQA 3D93A 3D92A 1HEAA 3RZ7A 1FLJA 4QSJA 5EH5A 3IEOA 4QTLA 5DSRA 4IDRX 1CILA 3M1QA 3C7PA 1G4OA 1BNMA 5HPJA 1H9QA 5E2KA 4Q7PA 3P3HA 1CNJA 3RZ8A 4CNXA 3NJ9A 4Q6EA 1HUGA 3HS4A 1RZEA 2NWYA 5JESB 3MNAA 1HECA 1DCBA 4QJOA 3M2ZA 5EIJA 5DSJA 1I9QA 4KAPA 4KNNA 3N4BA 5JGSB 1G46A 1TG3A 3M14A 5FDIA 5SZ1A 3EFIA 4COQA 1FSQA 3KOIA 4MDLA 1LGDA 4Q8XA 5FLSA 4Q78A 4Z0QA 4CA2A 3M1JA 4HU1A 3OY0A 1FSRA 4TWLA 4YX4A 1CNBA 5BYIA 4JSZA 1ZSBA 3IBUA 2NXTA 3R17B 1V9IC 5EHVA 5CJFA 5JQ0A 4YWPA 5BRWA 1G0EA 1ZFQA 4MDMA 4KUVA 1CVEA 1KWQA 3S78B 1J9WA 1T9NA 4E3FA 3HKNA 3DC9A 5LMDA 3OKUA 3U7CA 3PJJA 4QJXA 4LU3A 1CVAA 2FMZA 5JQTA 3U47A 4N16A 3T85A 5E5RA 1DCAA 3JXGA 4CNRA 3PYKA 4KUWA 3S75B 3N0NA 3OIMA 4YXOA 5DSQA 3M1KA 4ZX1A 4C3TA 3S74B 2HNCA 5L6KA 1CALA 3N2PA 2VVBX 2FOVA 2OSFA 4G7AA 3RLDA 3F4XA 3IBLA 4FL7A 3V3IB 3DVCA 3KONA 5E2RA 1I9OA 4RFCA 4E3DA 1BNWA 3L14A 3OYQA 5AMLA 3MZCA 3RG3A 3DVDA 1DMYA 4RIVA 5JGTB 3MDZA 1G1DA 1Z93A 2EU3A 3MNIA 2FOYA 1CVCA 4CACA 1G54A 1LG6A 2POWA 3M1WA 4HBAA 4PYXA 3MHMA 1XQ0A 4QIYA 2NWPA 4WL4A 1I9LA 3V3FA 1FR4A 1RAZA 4M2WA 1CAYA 3F8EA 3SBHA 4QSIA 1G53A 7CA2A 1BCDA 2Q38A 3N3JA 1CVBA 3PO6A 4FIKA 1XEVA 5DSIA 5JG5B 1TE3X 5E5UA 5SZ6A 3S76A 1G4JA 4QK3A 1ZE8A 4XE1A 9CA2A 4KNIA 1CAHA 1CNXA 1I91A 1THKA 4HT0A 3TVNX 3UYQA 4Q81A 5DSKA 2ZNCA 2CBDA 1YO0A 5DOGA 1CANA 2H15A 3CYUA 1YDBA 2CBBA 1HUHA 3M2XA 2NN7A 4Q09A 1IF9A 4PXXA 4ZWYA 3SBIA 1DMXA 5FNMA 2F14A 3M40A 1BNVA 4PQ7A 3S72B 1JV0A 3ML2A 4ZWIA 1BNUA 3V7XA 1AVNA 3R16A 5E2MA 4BF1A 3P3JA 1I8ZA 3V2MA 4ZWXA 3RZ1B 2WEGA 5FNIA 1UGCA 1RZAA 2FNNA 2NNOA 3KS3A 1CINA 1OKMA 4R5AA 4Q7WA 3U3AX 5A6HA 3KNEA 4HT2A 3B4FA 3F7BA 3DBUA 4FRCA 1CVHA 4YVYA 3V3JA 3MHOA 1CNIA 3DD8A 1OKLA 3OILA 3BL1A 1RZCA 5DOHA 2NNSA 1ZGEA 4BF6A 3DCCA 1BN3A 1KWRA 4YGNA 4L5VA 2FNMA 1MUAA 1BICA 2CBCA 4MO8A 2ABEA 4QJPA 1ZH9A 3M5EA 2FOUA 1CVDA 3DCWA 4GL1X 3DD0A 1CNHA 1BNTA 1BN4A 4KV0A 1XPZA 2QO8A 3MNJA 3OKVA 4HF3A 4Q49A 1TB0X 3NI5A 5IPZA 4Y0JA 4JSSA 3JXFA 1TEUX 3T83A 4E4AA 4MDGA 5JEPB 4FU5A 3B1BA 5EZTX 3IBNA 1I9NA 1FQNA 1IF6A 2FOQA 1CAIA 4YGKA 3RZ5A 5FLQA 5L3OA 1LUGA 1FSNA 3V3HB 1G6VA 1CRAA 3S77B 2NNGA 3V5GA 4WW6A 3V2JA 3DA2A 3P5AA 2WEOA 2Q1QA 2WEJA 3S9TA 1H9NA 3KLDB 4QK1A 4CNVA 1G52A 1BZMA 4QSAA 1RJ6A 3MNKA 3S97A 3JXHC 3IAIA 3FE4A 5G03A 1UGEA 1CA2A 2NXRA 1EOUA 1I9PA 1CZMA 5EH8A 4MLXA 4M2RA 1CAMA 1CCUA 2HL4A 1BNNA 2NXSA 4E49A 4KUYA 4XIXA 12CAA 3MNHA 5FDCA 5FL5A 4KP5A 3T5UA 1F2WA 4Z1KA 4L5UA 1UGAA 1TEQX 4G0CA 5DSLA 3DC3A 1Z97A 1HCAA 1IF4A 3TVOX 4ILXA 4K0SA 4KNJA 3RYXB 3TMJA 1TH9A 4WUQA 3V3GB 5JEHB 4ZX0A 3LXEA 1RZBA 1ZNCA 2IT4A 4Q6DA 2WEHA 2POUA 3M5SA 5EHEA 1RZDA 4QY3A 4Q99A 1YO1A 5SZ4A 2FNKA 4RH2A 1CIMA 1YDCA 1JCZA 3RYJB 3OYSA 3D9ZA 1Z9YA 3M3XA 4UOVA 4PZHA 2GEHA 2HD6A 2WD3A 1CVFA 3NB5A 4Q08A 4R5BA 1CAOA 3DVBA 1LZVA 2NNVA 1UGBA 4QJMA 2EZ7A 3U45X 4QJ0A 1URTA 3P44A 4QJWA 3S73B 3M2NA 3HLJA 4MLTA 5CA2A 2H4NA 3MWOA 5EKHA 5JEGB 4JSWA 3IGPA 3MYQA 5G0BA 4XIWA 3QYKA 5J8ZA 2OSMA 3KIGA 3RYYA 1KEQA 6CA2A 1CNGA 3M5TA 1OKNA 4RIUA 5E2SA 4FPTA 3MNUA 1HVAA 2FW4A 5DSMA 4FVNA 1RAYA 2HFWA 1HCBA 1A42A 2QOAA 4XZ5A 1BN1A 5DSNA 3D0NA 4Q7VA 1HEBA 3CZVA 4CNWA 5FLTA 1I90A 4ZAOA 3K2FA 3CA2A 4HEWA 1UGDA 4Q8YA 3EFTA 5EKMA 4ZWZA 3M2YA 5FLRA 1KOPA 5EKJA 3T5ZA 4YYTA 1CNKA 5E28A 1TG9A 4XFWA 1ZSCA 1ZSAA 4QSBA 4LP6A 4WUPA 3M67A 4K1QA 4N0XB 2HOCA 4WW8A 1IF7A 2FMGA 5E2NA 1Y7WA 4Q83A 3RZ0B 3VBDA 4DZ9A 5BNLA 4YGJA 3RGEA 1AM6A 2VVAX 4DZ7A 1ZFKA 2CA2A 3KOKA 1JD0A 5JG3B 4RUYA 5C8IA 4YHAA 1IF8A 3SAXA 5G0CA 3GZ0A 5EOIA 5EH7A 2AX2A 5FLPA 3MHCA 1CAZA 1YDAA 2QP6A 1CRMA 3BL0A 1CAKA 1CCTA 3DV7A 3RYVB 5BRUA 3M98A 3KWAA 4Z1JA 4M2VA 2FOSA 5CACA 3UYNA 2HKKA 5DSOA 4QK2A 1YO2A 4L5WA 2WD2A 3DAZA 5AMDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4PYY A;  4HEZ A;  1FR7 A;  2X7U A;  3T84 A;  1G45 A;  4RUZ A;  4E3H A;  4K0Z A;  3DCS A;  4R59 A;  4X5S A;  3S71 B;  4Q8Z A;  4QIZ A;  1TTM A;  1BV3 A;  3P4V A;  3MHI A;  2NWZ A;  3Q31 A;  5JDV B;  3IBI A;  5SZ5 A;  3F7U A;  1G48 A;  5FNH A;  2GD8 A;  3OIK A;  5SZ0 A;  5SZ3 A;  1TBT X;  4Q87 A;  4YGF A;  5SZ7 A;  4HEY A;  1YDD A;  4ETQ C;  3W6I A;  5CLU A;  3RYZ A;  4RFD A;  4K0T A;  3HFP A;  1G0F A;  4RN4 A;  4ITP A;  3P55 A;  4Q7S A;  1CNY A;  1FQM A;  1UGG A;  2ILI A;  4KNM A;  4Q9Y A;  5BRV A;  1HED A;  4Q07 A;  2Q1B A;  4BCW A;  3T82 A;  5DVX A;  1CA3 A;  2EU2 A;  5FNG A;  4E9O X;  3S8X A;  5EHW A;  4QEF A;  1CCS A;  2AW1 A;  4TWM A;  5FNJ A;  1IF5 A;  1G3Z A;  1CAJ A;  4Q90 A;  1UGF A;  4YXU A;  5FLO A;  5G01 A;  4JS6 A;  3HKQ A;  5FNL A;  1H4N A;  4IWZ A;  3K34 A;  2NWO A;  5SZ2 A;  3FW3 A;  3MHL A;  5A25 A;  3CAJ A;  2X7T A;  3MMF A;  1CNW A;  2CAB A;  4WR7 A;  4FVO A;  1FQR A;  4K13 A;  1OQ5 A;  3BET A;  3M04 A;  4Z1E A;  1MOO A;  4YGL A;  3P58 A;  4Q0L A;  2NMX A;  5FL4 A;  1AZM A; 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