1CAYA

Wild-type and e106q mutant carbonic anhydrase complexed with acetate
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Wild-type and E106Q mutant carbonic anhydrase complexed with acetate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cayA00
1RAYA 1RZCA 3F7UA 5FNJA 2CBEA 2FNMA 3M1JA 2QP6A 3SBIA 3P55A 2NN1A 2POVA 2NNGA 2NXRA 3IBNA 4Q81A 5EZTX 4COQA 1TE3X 5SZ4A 2WEHA 1J9WA 1CAYA 1ZGFA 1LGDA 4XFWA 3MNHA 5SZ3A 3T85A 4CNXA 3M14A 1G45A 4FVNA 1YDBA 3M5EA 3W6IA 5EKMA 3IBUA 5AMDA 5FL4A 3RYJB 3IBLA 5FNKA 4Q87A 4QSIA 1XEVA 4RUXA 5BRVA 3BETA 1CNWA 4YGNA 3D9ZA 5CLUA 3RG4A 3PYKA 5IPZA 3OILA 5BRWA 3S8XA 4R5AA 1YDDA 4RUZA 2QOAA 4M2VA 1TBTX 4ZAOA 5FL5A 2FNKA 1T9NA 4BF6A 3L14A 2IT4A 5L6KA 5FNGA 3K34A 4Q08A 1G48A 4KNIA 4FIKA 1BV3A 4ZX1A 1AM6A 3M5TA 3OYSA 3RYYA 5EHEA 1CAHA 5JGSB 1CNIA 5FLOA 2NMXA 5AMGA 5SZ6A 4K0TA 1G53A 1TEUX 3KKXA 2POUA 1FR4A 1IF4A 1RZEA 1IF8A 2NXTA 2Q38A 1KEQA 1CINA 1AVNA 5HPJA 2CBAA 5JEGB 5JG5B 3CZVA 1CAJA 3MHMA 2X7TA 3M04A 3OKUA 3N4BA 1OKLA 4YYTA 3RZ1B 4JSAA 4L5UA 4MO8A 2F14A 4QIYA 4MDMA 4XE1A 3S71B 3M96A 4QK3A 3OY0A 5DVXA 4MLXA 4E4AA 4Z1EA 3P3HA 1UGGA 3DC3A 1BCDA 4RFDA 5FLQA 5E2MA 5E2KA 1G6VA 4K0SA 3T84A 1UGCA 3DCSA 1CAOA 4KNNA 1BN3A 4Q6EA 3K2FA 5BNLA 4E9OX 5A6HA 3S72B 2EU3A 5E5RA 3HS4A 3PO6A 3V2JA 3Q31A 2HOCA 3MHIA 3FW3A 3MMFA 2QO8A 3M2ZA 2FNNA 4ZX0A 5DSQA 1UGDA 4ILXA 1THKA 2FMZA 2ZNCA 3M67A 4LHIA 3MZCA 4L5VA 4YVYA 4KNJA 3S77B 1XEGA 1RZDA 1HEDA 1AZMA 2HL4A 4K0ZA 2ILIA 3T5ZA 1Z97A 4QJOA 1KWQA 2NNVA 4K1QA 4MTYA 2NWPA 4Z0QA 5SZ0A 1CVHA 2FOQA 3N3JA 3V5GA 3BL1A 3S97A 1DCAA 2ABEA 3P58A 1CVAA 3T5UA 5DRSA 5FLTA 3TVOX 4TWMA 4CACA 3ML5A 4QSBA 3ML2A 5JG3B 1BN1A 1JCZA 4QK2A 4PYYA 3V3IB 2WD2A 2HNCA 4JSSA 2NWYA 3CA2A 1I8ZA 1BICA 1IF9A 3V3FA 3P44A 1ZSBA 4Q06A 1G54A 5DSIA 4FRCA 4QJXA 4RUYA 2HFWA 4HT2A 1YO1A 5EKJA 4JS6A 1LG5A 4RFCA 1BZMA 1Z93A 4G7AA 1UGBA 4Q07A 3P4VA 1UGEA 3MYQA 2EU2A 4K13A 1BNTA 5SZ7A 2HD6A 3PJJA 4M2UA 1G46A 1YDAA 3KONA 4ITPA 4Q78A 4CA2A 4PXXA 5C8IA 2X7SA 2NWOA 2NWZA 2VVBX 1LZVA 4YGKA 1H9QA 3DBUA 3M1QA 1CNCA 1CAZA 2AW1A 4QY3A 3N0NA 3D93A 1HUHA 4CNRA 3S9TA 3V2MA 4DZ9A 3KOKA 5EKHA 3U45X 5CJFA 4FPTA 5DSKA 2OSFA 4YGLA 3M2YA 4R59A 3F8EA 5CA2A 1I9NA 2FOSA 4N16A 1Z9YA 3LXEA 1HUGA 1XQ0A 1BNVA 3M2XA 3MNAA 5EH5A 3S74B 5FLPA 4KV0A 1H9NA 1G1DA 5DSPA 1CRMA 2EZ7A 5FLSA 3HFPA 5E2RA 1CVCA 3RZ5A 3RG3A 3UYNA 4YWPA 5A25A 4G0CA 4JSWA 3V7XA 5DSRA 5E2SA 2CBDA 3RZ7A 1ZFQA 4ZWYA 3F7BA 3C7PA 3F4XA 4Q7PA 1EOUA 4PYXA 2NNOA 4WUPA 5DOGA 5SZ5A 6CA2A 4FL7A 1RJ5A 4QJPA 1CIMA 1BNQA 3HKQA 1CA2A 4BF1A 1BNUA 4N0XB 3S78B 3MNKA 4Q7WA 3JXGA 1CAMA 3B4FA 5EIJA 3DVDA 4XIXA 4Z1JA 1CILA 3TMJA 3RGEA 3MHLA 4HEWA 3RJ7A 4ZWZA 1G52A 4KUVA 4Q49A 1OKNA 2CBCA 3B1BA 4Q83A 5L3OA 3RZ8A 3UYQA 1G4OA 5AMLA 1MOOA 1CNJA 1DCBA 4CNWA 3DC9A 5FDIA 1BNWA 1G0FA 1A42A 1I9QA 5JEPB 4CNVA 4M2RA 3RYVB 4RN4A 3MNIA 5EHVA 3OIMA 2AX2A 1CA3A 3M5SA 3KIGA 5E28A 2O4ZA 2Q1BA 5FNMA 1RZBA 1CVBA 1RJ6A 3R16A 2X7UA 5FLRA 1IF5A 3D8WA 1FSRA 4QK1A 2WEJA 1CCSA 5JESB 1FQRA 1I91A 3DCWA 1DMXA 1YO2A 2GD8A 1FR7A 3M1WA 1TH9A 1CAIA 4PZHA 1G3ZA 4Q8ZA 4WUQA 1ZNCA 4E3FA 5FNLA 4QJMA 5DSJA 3S73B 5FDCA 3OIKA 4GL1X 3MDZA 4E3GA 4QJ0A 1I90A 1HCAA 2POWA 1ZSAA 1CZMA 1CNYA 5FL6A 1URTA 1XPZA 3DV7A 1H4NA 3HKTA 1CNHA 5EH7A 5DSMA 3GZ0A 1JD0A 2W2JA 5FNHA 1LG6A 3HKUA 5JQTA 3NI5A 3DD8A 12CAA 1CANA 4Q6DA 5E2NA 3M2NA 1HCBA 5EHWA 1DMYA 4HEZA 1CAKA 1CVEA 3MNJA 4HT0A 3TVNX 4HEYA 1IF6A 4TWLA 1IF7A 3ZP9A 2NN7A 3ZNCA 3MNUA 1TEQX 4QTLA 1CNKA 2WEOA 3VBDA 1HEBA 1RAZA 4Q8XA 3M98A 1TG3A 4Z1NA 5JDVB 4FU5A 3KLDB 3OYQA 4Z1KA 3DAZA 3M1KA 1OKMA 2HKKA 4QIZA 4QSAA 5SZ1A 4M2WA 1F2WA 3MHOA 4IDRX 5FNIA 4L5WA 3SAXA 4Q0LA 2VVAX 4JSZA 4E49A 4DZ7A 1HEAA 3D92A 3KNEA 5SZ2A 3T82A 1FQMA 4ITOA 1V9IC 3U47A 4LU3A 4Q90A 1I9OA 5JEHB 3HKNA 4KNMA 2WEGA 4R5BA 4Q7SA 4CQ0A 3MHCA 4Q7VA 3QYKA 4IWZA 2OSMA 2CA2A 1ZE8A 5G0CA 4HBAA 3W6HA 5J8ZA 3OKVA 4Q9YA 2WD3A 2NNSA 5E5UA 5G0BA 3EFIA 4KP5A 3U7CA 3IGPA 3T83A 3M3XA 2Q1QA 3JXFA 1OQ5A 3R17B 4YGJA 1CRAA 1UGFA 1CCUA 3HLJA 1MUAA 2CABA 4FVOA 4MDGA 1ZH9A 1I9LA 4E3HA 1KWRA 3CAJA 3V3JA 3KOIA 1ZSCA 4ZWIA 1FSQA 1FSNA 3FFPX 4UOVA 4C3TA 3CYUA 4Y0JA 4RIVA 5G01A 3MWOA 3N2PA 5DSLA 3KWAA 4ZWXA 2GEHA 1CCTA 5CACA 1CVDA 1JV0A 4HF3A 2FOUA 3DA2A 4YXOA 4X5SA 3RZ0B 1RZAA 1ZFKA 1YDCA 5LMDA 4BCWA 2NXSA 3JXHC 3DCCA 4WR7A 4LP6A 4YXUA 3U3AX 2FW4A 4QJWA 1Y7WA 4YXIA 8CA2A 1CVFA 3K7KA 7CA2A 4MLTA 9CA2A 1V9EA 2H4NA 4PQ7A 5JQ0A 2FOYA 3V3GB 1I9MA 5DSNA 1HECA 1CALA 4RH2A 2H15A 4YGFA 4WW8A 4HU1A 3DVCA 4XZ5A 4YHAA 3NJ9A 3KS3A 3NB5A 2FOVA 4KUWA 1CNBA 5BYIA 1CNGA 4KP8A 4KAPA 1UGAA 1TTMA 4RIUA 3RLDA 3P5AA 2CBBA 3SBHA 5BRUA 1KOQA 1HVAA 4YX4A 1G0EA 4E3DA 3IAIA 5EH8A 5G03A 4Q8YA 1YO0A 1I9PA 4QSJA 3SAPA 3P5LA 4WW6A 1KOPA 5DOHA 3RYZA 2FMGA 1G4JA 3IEOA 3V3HB 4Q09A 4XIWA 1BN4A 3S76A 1FLJA 3DD0A 4WL4A 3M40A 4QEFA 3EFTA 1LUGA 3FE4A 1FQLA 3IBIA 3D0NA 1TB0X 1TG9A 1ZGEA 3DVBA 3BL0A 3S75B 5DSOA 5EOIA 1BNMA 4ETQC 1BNNA 3P3JA 4MDLA 1CNXA 1FQNA 4KUYA 5JGTB 4Q99A 3RYXB 4E5QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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