1CCSA

Structure-assisted redesign of a protein-zinc binding site with femtomolar affinity
Total Genus 74

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLDTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV1 (9-12)TI1 (8-11)TI2 (12-15)3H1 (16-18)3H2 (21-24)TIV10 (241-244)TIV2 (18-21)AH1 (131-135)S12 (191-196)TIV3 (25-28)TIV7 (105-108)TI4 (34-37)TI6 (41-44)S6 (78-82)TVIII1 (75-78)S3 (46-50)TIV5 (72-75)S9 (116-124)S5 (66-70)TI7 (51-54)S11 (172-175)TII1 (169-172)S4 (56-61)TIV4 (62-65)AH2 (158-163)3H5 (164-166)AH3 (220-227)S7 (88-97)TII'1 (81-84)TII2 (233-236)TIV6 (98-101)TI8 (100-103)TIV8 (108-111)S8 (108-109)S10 (141-150)TI'1 (109-112)3H3 (125-128)O1 (128-130)TI9 (137-140)TVIa1 (200-203)S13 (207-212)S14 (216-218)TIV9 (176-179)S1 (32-33)S2 (39-40)3H4 (155-157)3H6 (181-184)TIV11 (251-254)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase (oxo-acid)
source organism Homo sapiens
publication title Structure-assisted redesign of a protein-zinc-binding site with femtomolar affinity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 74
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ccsA00
2FNKA 3K34A 4Q07A 4Q90A 1OQ5A 3KONA 4CA2A 3T5UA 5DSRA 3S75B 5EH8A 4XIWA 1BNTA 3D9ZA 1UGAA 1RJ6A 2POUA 4MDMA 3RYZA 4YGNA 5JGTB 3MNJA 2FOYA 5LMDA 3JXFA 1CAOA 4MTYA 4Q6EA 4XE1A 3V3GB 3RZ7A 3M5EA 1KEQA 5DSKA 4HEYA 4Q08A 2FOSA 4QSIA 4QK3A 5E2KA 4YGJA 1UGDA 3SAXA 3F8EA 1CCUA 3RYJB 1CALA 1FQNA 2X7SA 3RYYA 1BNWA 1ZSAA 5AMGA 1BN1A 1CAHA 3MNIA 4Q8YA 5FNGA 1TG9A 3U3AX 4KP5A 9CA2A 1CNIA 1H9NA 3LXEA 4Z1NA 5JGSB 2WD3A 1IF4A 4HT2A 4HT0A 2NNSA 5BRVA 1RZCA 4ITPA 2AW1A 3B1BA 3P3JA 5EKHA 5SZ1A 3UYQA 1CNGA 2NWZA 3S74B 2X7UA 5J8ZA 1HUHA 3KOIA 5EZTX 5FLOA 1CRAA 2H15A 4ZX0A 1Z97A 1RZDA 3T83A 3HFPA 5CJFA 4MDLA 5JQTA 2GD8A 5FL5A 4LHIA 5EOIA 1ZFKA 5FNIA 4MO8A 4KNMA 3MZCA 3D8WA 3DCWA 2HL4A 4KUVA 3V5GA 4N16A 4E3HA 3KWAA 4FRCA 5SZ7A 4C3TA 1IF7A 3M40A 1FQRA 1T9NA 3K7KA 2NNGA 3M2YA 3MMFA 3S97A 2H4NA 3M5SA 5CA2A 1BNQA 2EU2A 4KNIA 2X7TA 3PYKA 1UGFA 2FW4A 4RIUA 4TWLA 3F7BA 3RGEA 5A25A 5FDIA 1CVAA 1RZAA 4YYTA 2GEHA 1FSNA 3M3XA 5E5RA 1I91A 3KIGA 3MDZA 3RG4A 3P5AA 1OKMA 3RZ8A 1BV3A 1LZVA 4Q99A 1FSRA 3IBIA 1FQMA 4CNRA 3OILA 3M1WA 1H4NA 4QJ0A 3D0NA 4WW8A 4CQ0A 3KKXA 1G4OA 3V2MA 1CINA 4K0TA 5BYIA 4MDGA 1CVDA 4Q8XA 1UGCA 4HU1A 3V3FA 5G03A 3OKUA 4M2VA 1HEBA 2VVBX 1CAIA 1ZGEA 1BCDA 2CBEA 3TVNX 3P4VA 5BNLA 1HEDA 4YXUA 3MHLA 5DSQA 1CA3A 3M98A 3RYVB 1RZEA 3P55A 4QJPA 1KOPA 1URTA 1MUAA 3JXGA 5G0BA 5JEPB 3DVBA 5FNLA 1F2WA 1HCAA 3IBLA 4Q83A 2NXSA 4N0XB 1G0FA 5IPZA 1CVHA 4HEWA 5FLQA 4GL1X 5FLPA 1CNYA 3P58A 5AMLA 4QK1A 4RIVA 4CACA 1TTMA 5FNHA 1UGGA 1I9OA 3IAIA 2EZ7A 4YGKA 3M1QA 3DD0A 3OYSA 1RAZA 1EOUA 3F7UA 1BNVA 1CVCA 2HOCA 5FLTA 4YVYA 4QEFA 2W2JA 3C7PA 5CLUA 1DMYA 5SZ6A 1CNKA 4RUXA 4FIKA 4Q09A 5JG5B 3OKVA 3PJJA 4QIYA 2NMXA 1TBTX 2HNCA 1AZMA 1DMXA 3B4FA 7CA2A 3PO6A 1Z93A 3M2NA 5JEHB 2CABA 3S8XA 3DBUA 1RJ5A 5BRWA 1I90A 1CNHA 4ILXA 4QSAA 4RUZA 5EHWA 5DSIA 1HECA 3HLJA 5SZ5A 1CCTA 1DCAA 5DSOA 3MYQA 2HKKA 5E2SA 1G0EA 3IBNA 4HEZA 4QIZA 4E49A 3HKNA 4E9OX 5JEGB 3BETA 3TMJA 4K1QA 1CAYA 3DCSA 2NXTA 4KAPA 5FNKA 2WEOA 4BCWA 1CVFA 3N3JA 1TEUX 4RH2A 1FQLA 1G54A 4M2WA 4R59A 3MWOA 2EU3A 5JG3B 3S77B 3M2XA 1I9QA 3CZVA 1ZSBA 3P5LA 4JS6A 3V2JA 4YGLA 2FNMA 1CAKA 5FNMA 4RN4A 1HEAA 4Q7PA 5JQ0A 3P44A 3RLDA 3W6IA 1TH9A 4XZ5A 3R16A 4ZAOA 3RZ5A 1IF9A 3MNAA 5E2MA 1TEQX 2VVAX 1ZH9A 2WEJA 5FL6A 4KV0A 3MNUA 1OKNA 5AMDA 3KS3A 3S71B 4CNVA 5EH7A 1G46A 3MNHA 4XFWA 4Q7WA 1G52A 5DSMA 5C8IA 1BN3A 4L5WA 1FSQA 5CACA 3T85A 4FVOA 3ZNCA 3CYUA 4CNXA 1G48A 3M14A 5EHVA 2HFWA 3U47A 1ZSCA 8CA2A 1IF6A 1THKA 2HD6A 1HVAA 4E3FA 1CVBA 3CA2A 1MOOA 1YDBA 2OSMA 4FU5A 4Q78A 1CRMA 1CAZA 4Q87A 3RZ1B 1G6VA 4Q7VA 3F4XA 5FDCA 3IEOA 3W6HA 5DVXA 3V7XA 4HF3A 1TB0X 2ABEA 3MHMA 4KUYA 4K0ZA 2CBBA 4E3GA 12CAA 5L6KA 4Q8ZA 1ZGFA 4HBAA 3DC9A 1H9QA 2CBCA 4QJOA 2Q38A 4WUQA 4JSZA 2ILIA 3MHIA 2FOVA 6CA2A 4DZ7A 4ITOA 3S72B 4BF1A 4YXOA 4QJXA 5DOHA 5G01A 1XQ0A 3T5ZA 1LG6A 3IBUA 1BICA 4JSSA 4RUYA 4MLTA 4WL4A 3HKQA 3OY0A 4M2UA 4PYYA 2POWA 4BF6A 1CA2A 1JCZA 3RG3A 3RYXB 2NWPA 3TVOX 1TG3A 3S78B 5SZ2A 1LGDA 3T84A 1XEVA 1LG5A 4TWMA 1JD0A 1I9NA 3S76A 3KLDB 2CBAA 1BZMA 1ZFQA 5E28A 4YHAA 5EKMA 3QYKA 5L3OA 1JV0A 2AX2A 4Q0LA 1YDDA 1ZE8A 4PYXA 1J9WA 3OYQA 4E5QA 3SBHA 3HKUA 1CNCA 4QJMA 2WEHA 3SAPA 1I9PA 3P3HA 1FLJA 3S9TA 1UGEA 3M1JA 5EIJA 3HS4A 1RZBA 2FMGA 2NN1A 1ZNCA 2NNOA 3T82A 3V3JA 1G3ZA 1I8ZA 3M96A 5SZ3A 1BNNA 1DCBA 3FE4A 5E2RA 1HCBA 1CAMA 1AM6A 1YDCA 1XPZA 3DD8A 3RJ7A 5JDVB 5HPJA 1V9IC 3L14A 3ML2A 3N0NA 4KNNA 4Y0JA 4QY3A 4FVNA 4E3DA 3NJ9A 4FL7A 3EFIA 4QK2A 1CANA 4KNJA 4ZWZA 3VBDA 4Q7SA 5DSNA 5A6HA 4Q81A 5DOGA 5EKJA 2OSFA 3Q31A 4ZWIA 3DAZA 3SBIA 3KNEA 3N2PA 4QJWA 2Q1BA 2QO8A 1FR7A 1KOQA 4L5UA 5E5UA 3M1KA 1UGBA 3U7CA 3NI5A 5BRUA 2WD2A 3IGPA 3BL0A 1BNUA 1CNBA 3M67A 2QP6A 4QSBA 3EFTA 5DSJA 4UOVA 4WR7A 2CA2A 2NWYA 4LP6A 4Q49A 4PQ7A 4RFCA 4Z1JA 2Q1QA 4MLXA 1XEGA 1AVNA 3MNKA 4ZWXA 2NXRA 1YO0A 1TE3X 4FPTA 4ZWYA 4IWZA 5E2NA 2NWOA 1G53A 1RAYA 5EH5A 4R5BA 1IF8A 1CCSA 1YO1A 4JSAA 4CNWA 2CBDA 1CNWA 1G45A 4G7AA 5DRSA 3BL1A 4Z0QA 2NNVA 2FMZA 4Z1KA 3V3IB 5FLSA 1BNMA 4KP8A 3DVDA 3OIKA 2WEGA 1HUGA 3KOKA 3FW3A 3FFPX 2IT4A 2F14A 4LU3A 4KUWA 3ZP9A 2FNNA 5G0CA 3MHCA 1I9LA 2FOUA 3K2FA 2FOQA 3M04A 5JESB 3ML5A 2QOAA 3V3HB 1BN4A 1CAJA 3CAJA 4YWPA 1KWQA 4Z1EA 3JXHC 3RZ0B 4QSJA 5SZ4A 5FLRA 3NB5A 3DV7A 1CZMA 1I9MA 4WUPA 1CNJA 1YO2A 1CNXA 1V9EA 4G0CA 1OKLA 5EHEA 4XIXA 4K0SA 5FNJA 4YGFA 1KWRA 4L5VA 5SZ0A 3DCCA 3GZ0A 3N4BA 3S73B 1LUGA 2POVA 1CILA 2O4ZA 4WW6A 3D92A 5FL4A 4JSWA 1G1DA 4IDRX 3HKTA 4M2RA 3DVCA 1CIMA 4RFDA 3UYNA 1CVEA 5DSLA 4Q9YA 4X5SA 1FR4A 4PZHA 5DSPA 3M2ZA 4PXXA 4K13A 4ETQC 1YDAA 4QTLA 3R17B 4Q06A 4R5AA 3MHOA 3U45X 3M5TA 4E4AA 1G4JA 3DA2A 1Y7WA 2ZNCA 4DZ9A 3DC3A 3D93A 2NN7A 3OIMA 1A42A 4Q6DA 4YX4A 4ZX1A 4YXIA 4COQA 1IF5A 1Z9YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FNK A;  3K34 A;  4Q07 A;  4Q90 A;  1OQ5 A;  3KON A;  4CA2 A;  3T5U A;  5DSR A;  3S75 B;  5EH8 A;  4XIW A;  1BNT A;  3D9Z A;  1UGA A;  1RJ6 A;  2POU A;  4MDM A;  3RYZ A;  4YGN A;  5JGT B;  3MNJ A;  2FOY A;  5LMD A;  3JXF A;  1CAO A;  4MTY A;  4Q6E A;  4XE1 A;  3V3G B;  3RZ7 A;  3M5E A;  1KEQ A;  5DSK A;  4HEY A;  4Q08 A;  2FOS A;  4QSI A;  4QK3 A;  5E2K A;  4YGJ A;  1UGD A;  3SAX A;  3F8E A;  1CCU A;  3RYJ B;  1CAL A;  1FQN A;  2X7S A;  3RYY A;  1BNW A;  1ZSA A;  5AMG A;  1BN1 A;  1CAH A;  3MNI A;  4Q8Y A;  5FNG A;  1TG9 A;  3U3A X;  4KP5 A;  9CA2 A;  1CNI A;  1H9N A;  3LXE A;  4Z1N A;  5JGS B;  2WD3 A;  1IF4 A;  4HT2 A;  4HT0 A;  2NNS A;  5BRV A;  1RZC A;  4ITP A;  2AW1 A;  3B1B A;  3P3J A;  5EKH A;  5SZ1 A;  3UYQ A;  1CNG A;  2NWZ A;  3S74 B;  2X7U A;  5J8Z A;  1HUH A;  3KOI A;  5EZT X;  5FLO A;  1CRA A;  2H15 A;  4ZX0 A;  1Z97 A;  1RZD A;  3T83 A;  3HFP A;  5CJF A;  4MDL A;  5JQT A;  2GD8 A;  5FL5 A;  4LHI A;  5EOI A;  1ZFK A;  5FNI A;  4MO8 A;  4KNM A;  3MZC A;  3D8W A;  3DCW A;  2HL4 A; 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