1CIMA

The positions of his-64 and a bound water in human carbonic anhydrase ii upon binding three structurally related inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Positions of His-64 and a bound water in human carbonic anhydrase II upon binding three structurally related inhibitors.
pubmed rcsb
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cimA00
2WEHA 4JSAA 5BNLA 1CAYA 3P58A 3S73B 4K0TA 3U7CA 4YHAA 3KOKA 1HVAA 1LGDA 3P44A 1BN1A 1H9NA 5SZ2A 4Q9YA 3MMFA 5BRWA 3U3AX 1G0FA 5DSKA 1CCTA 2FMZA 1BICA 4M2VA 4RUYA 1BZMA 1CRMA 3V2JA 3SBHA 4FVOA 3DA2A 1CAJA 1BNUA 4L5UA 4UOVA 1FQRA 2X7UA 3ML2A 3MYQA 4HT0A 4ZX1A 4LHIA 2WEJA 4PYXA 5E28A 5FL5A 1CVBA 3IGPA 4N16A 3HKQA 4RFCA 3RZ0B 1F2WA 4Q7WA 1RAYA 3K2FA 2HL4A 3P5LA 3VBDA 5BRUA 5FNKA 1FSNA 1HEDA 3K7KA 3MZCA 2QP6A 3U45X 4L5WA 1OQ5A 3FFPX 4PXXA 2O4ZA 3DVCA 1RZAA 5JGSB 4L5VA 1G4JA 4Q7SA 3P4VA 1IF9A 5L3OA 3PJJA 4PQ7A 3M1KA 4DZ7A 3ZP9A 1YO1A 3M1QA 2CBBA 1HECA 1CVFA 4Z1KA 1BNTA 1CA2A 1ZH9A 4Q8ZA 4E3GA 4KV0A 3M5EA 1G6VA 2NWYA 1I9NA 1ZSBA 3HS4A 2FOSA 4QEFA 5J8ZA 4Q81A 2X7SA 5JQ0A 1YDBA 1G54A 4KNJA 6CA2A 5FNHA 3KNEA 3P55A 1CAOA 1CRAA 4IDRX 1DCAA 1I8ZA 2WEOA 1DMXA 3V3FA 2Q1QA 4Z1EA 2NXRA 1FQMA 1IF8A 3GZ0A 2WD3A 4KUWA 3OIKA 1RJ5A 4R5BA 5FLSA 4Q08A 2WEGA 3TVOX 5DSIA 3S76A 1IF6A 4QSJA 3M2NA 2NWZA 3T82A 3S97A 5FLPA 1YO0A 4BCWA 1Z97A 3CAJA 1XEVA 2H15A 1ZGEA 4ITPA 4XE1A 2FOUA 3D9ZA 4ZWXA 2FNMA 3ML5A 3NJ9A 2NNSA 3V3JA 5L6KA 2ZNCA 3DD0A 1JV0A 1CA3A 1CILA 4QSAA 1G4OA 4YGFA 1CAZA 1ZNCA 3MHMA 5E2RA 3S75B 3F7UA 2FNNA 5SZ7A 3OKVA 1CNBA 4QJPA 2ILIA 5DOHA 4Q0LA 1XPZA 1RAZA 5DOGA 4Q99A 1G3ZA 3RZ8A 1CNWA 3W6HA 5DSJA 3M5SA 1TTMA 3P3HA 1RZDA 1CIMA 4LP6A 3RZ1B 1ZFKA 4RUXA 1AZMA 1OKLA 5FLQA 4HEZA 4FPTA 5JGTB 2FOVA 3KLDB 4XIXA 3S9TA 4KUVA 3RZ5A 4E3FA 3P5AA 5FNMA 1CVDA 1CNHA 1FR7A 4FRCA 4YGJA 2NMXA 1I9OA 3N0NA 4KNMA 4K0ZA 4E3DA 4QIZA 5DSPA 1I9MA 3MWOA 3M67A 5DSQA 1HCAA 3F7BA 5A25A 4Q7PA 4Q7VA 1TEUX 1Y7WA 1YDDA 3M1JA 2WD2A 5EKMA 5EKJA 3U47A 4YX4A 2POWA 4YGNA 3OIMA 1TBTX 2HNCA 3EFTA 3RLDA 5SZ5A 3KS3A 3RYVB 3DVBA 5JEGB 1V9EA 3DCWA 2OSFA 1T9NA 2QOAA 3RG4A 1UGFA 5EZTX 1MOOA 5FL6A 1G0EA 4Q06A 1FSQA 1TH9A 5AMLA 5C8IA 3PYKA 4HU1A 3M2XA 4R59A 1CVEA 5IPZA 4Y0JA 5G0CA 2IT4A 1CANA 1LG6A 1UGAA 4K1QA 1EOUA 3MNIA 2NNVA 5E5UA 1FR4A 4KP5A 1CNJA 1XQ0A 1CVCA 3S71B 1YDCA 1HCBA 5EHWA 1CAHA 1KOQA 4CNVA 2HOCA 4E5QA 5FDIA 4JSZA 1Z9YA 4K0SA 5FNGA 3S8XA 3IBLA 1BNNA 5HPJA 4HEWA 3RYZA 3M1WA 4QJOA 2ABEA 2GEHA 3T83A 4QJ0A 3T84A 4PYYA 4Q90A 3V3HB 1YDAA 1UGGA 1LUGA 3N3JA 2AX2A 4Q49A 3RZ7A 4TWMA 3EFIA 7CA2A 4PZHA 4KNNA 2HKKA 1THKA 1KWRA 3B1BA 4YGLA 5BYIA 4E49A 5E2MA 1JD0A 3M2YA 3IAIA 4FU5A 1KWQA 1RZCA 1V9IC 3D0NA 4COQA 5CLUA 5DSNA 3F4XA 3T85A 2NN1A 4ETQC 2H4NA 1BNQA 3IBIA 5FLOA 1FLJA 5CJFA 4QIYA 3HLJA 1CCUA 1DCBA 1XEGA 4N0XB 3HKUA 3TMJA 4HF3A 5G03A 3OYQA 3HKNA 2F14A 3RG3A 4BF1A 1LG5A 4LU3A 5EOIA 2NWOA 4RIUA 3MHOA 3V7XA 2NN7A 3KWAA 4DZ9A 3D8WA 3OKUA 5FL4A 3SAPA 3DC9A 4TWLA 3B4FA 3OY0A 5JQTA 3M98A 3MHLA 3MNJA 2FNKA 4M2WA 3S72B 3MNKA 3R16A 1TEQX 1BCDA 5A6HA 3DBUA 4QK3A 1J9WA 4ZWYA 2NNOA 2CBAA 5E2KA 4GL1X 1IF5A 4HBAA 4WR7A 1BN3A 3P3JA 1G52A 3MNAA 4CACA 3FE4A 1LZVA 5DSMA 1I9QA 4Q83A 3L14A 3M04A 4Z0QA 4Q8XA 3UYNA 4QJMA 4YYTA 1CZMA 5DSLA 4E4AA 2CBDA 4CNRA 4MO8A 3V3IB 5SZ4A 3F8EA 3V5GA 4ZWZA 1IF7A 3DV7A 5FNJA 5FLRA 2EZ7A 5DVXA 3M2ZA 1HUHA 2VVAX 1BNWA 2HFWA 3IBUA 3TVNX 3JXHC 3W6IA 1FQLA 4YWPA 4ZWIA 4Z1NA 4YXUA 3IEOA 4QJXA 1CAMA 1Z93A 4G7AA 4ZAOA 3ZNCA 3N2PA 4QK1A 1ZSAA 5EHEA 2NXTA 1OKNA 4K13A 5JDVB 3D93A 2QO8A 3KONA 1CNXA 3RGEA 1CNYA 3OYSA 5EH7A 12CAA 5JEPB 9CA2A 3MHIA 5JG5B 2X7TA 4ZX0A 2NWPA 4KAPA 3UYQA 1AM6A 1TE3X 1CVAA 1OKMA 2CA2A 4CNWA 8CA2A 1UGBA 4M2RA 2POVA 2GD8A 2Q1BA 4HT2A 2FOQA 4Q07A 3CA2A 3SBIA 3NI5A 5BRVA 4BF6A 1TG3A 5EKHA 1I9LA 1H4NA 2AW1A 4QTLA 4JS6A 4CQ0A 1TG9A 3DAZA 5SZ1A 1H9QA 4Q6DA 3KIGA 4X5SA 1CNIA 5CACA 3M96A 1RZEA 3QYKA 2POUA 4CNXA 3V3GB 5FNLA 1BNMA 1I90A 4JSSA 2NXSA 4WW8A 4FL7A 4KP8A 4G0CA 1G45A 3OILA 5LMDA 4MDMA 1HEBA 1KOPA 4RFDA 3DVDA 1IF4A 4ILXA 3Q31A 1HEAA 2Q38A 1RJ6A 4RH2A 4XZ5A 1ZSCA 1CAIA 5E2NA 3T5UA 4R5AA 5SZ3A 4QSBA 2VVBX 1URTA 4E3HA 1YO2A 3M3XA 4RUZA 5AMGA 4C3TA 4WUQA 5G0BA 1MUAA 3D92A 1FQNA 1ZFQA 3FW3A 3RYXB 3RYJB 5CA2A 3M40A 4ITOA 5FDCA 5E5RA 5JG3B 4CA2A 3IBNA 3BETA 3NB5A 3RYYA 1HUGA 2W2JA 3LXEA 4KUYA 1BNVA 4Z1JA 2FW4A 4WUPA 1KEQA 1ZGFA 4MDLA 3S74B 4KNIA 4FIKA 4MTYA 5SZ6A 3DD8A 3K34A 1CVHA 1I91A 1UGCA 3HKTA 4Q8YA 4IWZA 4WL4A 5FLTA 1ZE8A 3MNHA 1CNGA 3M14A 5DSRA 3V2MA 3DC3A 1TB0X 1G53A 5E2SA 5EHVA 3M5TA 3T5ZA 5JEHB 2EU3A 3MHCA 3JXFA 3BL1A 5DRSA 1CNCA 3N4BA 3KKXA 4YGKA 5DSOA 3S77B 3MDZA 1G46A 1I9PA 1JCZA 1G48A 4YXOA 4Q6EA 4Q09A 2CABA 3JXGA 1BN4A 4MLXA 3CZVA 1A42A 2HD6A 5EH5A 5EH8A 4MLTA 1CAKA 1FSRA 4QSIA 4YVYA 4MDGA 3DCSA 4M2UA 4Q78A 4RIVA 3SAXA 5G01A 3CYUA 3R17B 4QK2A 5JESB 4QY3A 1UGDA 2OSMA 3C7PA 4RN4A 1CINA 2EU2A 3BL0A 5SZ0A 3MNUA 4QJWA 1RZBA 2NNGA 1CCSA 2CBEA 1CNKA 1DMYA 4Q87A 4E9OX 3KOIA 1CALA 3PO6A 4XFWA 4YXIA 4XIWA 3HFPA 4FVNA 5FNIA 3S78B 4HEYA 5EIJA 1G1DA 1AVNA 2FMGA 5AMDA 1BV3A 1UGEA 2FOYA 4WW6A 2CBCA 3DCCA 4JSWA 3RJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WEH A;  4JSA A;  5BNL A;  1CAY A;  3P58 A;  3S73 B;  4K0T A;  3U7C A;  4YHA A;  3KOK A;  1HVA A;  1LGD A;  3P44 A;  1BN1 A;  1H9N A;  5SZ2 A;  4Q9Y A;  3MMF A;  5BRW A;  3U3A X;  1G0F A;  5DSK A;  1CCT A;  2FMZ A;  1BIC A;  4M2V A;  4RUY A;  1BZM A;  1CRM A;  3V2J A;  3SBH A;  4FVO A;  3DA2 A;  1CAJ A;  1BNU A;  4L5U A;  4UOV A;  1FQR A;  2X7U A;  3ML2 A;  3MYQ A;  4HT0 A;  4ZX1 A;  4LHI A;  2WEJ A;  4PYX A;  5E28 A;  5FL5 A;  1CVB A;  3IGP A;  4N16 A;  3HKQ A;  4RFC A;  3RZ0 B;  1F2W A;  4Q7W A;  1RAY A;  3K2F A;  2HL4 A;  3P5L A;  3VBD A;  5BRU A;  5FNK A;  1FSN A;  1HED A;  3K7K A;  3MZC A;  2QP6 A;  3U45 X;  4L5W A;  1OQ5 A;  3FFP X;  4PXX A;  2O4Z A;  3DVC A;  1RZA A;  5JGS B;  4L5V A;  1G4J A;  4Q7S A;  3P4V A;  1IF9 A;  5L3O A;  3PJJ A;  4PQ7 A;  3M1K A;  4DZ7 A;  3ZP9 A;  1YO1 A;  3M1Q A;  2CBB A;  1HEC A;  1CVF A;  4Z1K A;  1BNT A;  1CA2 A;  1ZH9 A;  4Q8Z A;  4E3G A;  4KV0 A;  3M5E A;  1G6V A;  2NWY A;  1I9N A;  1ZSB A;  3HS4 A;  2FOS A;  4QEF A;  5J8Z A;  4Q81 A;  2X7S A;  5JQ0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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