1CNWA

Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase ii influence binding constants
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Secondary interactions significantly removed from the sulfonamide binding pocket of carbonic anhydrase II influence inhibitor binding constants.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase (oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 79
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1995-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cnwA00
3KS3A 3M5SA 3V3FA 1CILA 4Q78A 1Y7WA 3N4BA 4Q0LA 1G3ZA 5DSKA 4CNXA 4ZWXA 4E4AA 5SZ3A 3MHIA 2HOCA 1H4NA 1RAYA 1MUAA 3KKXA 1RZAA 3HFPA 1CAOA 4LU3A 3OYSA 4MDLA 5G03A 5FNLA 5SZ0A 4XFWA 1BNMA 4YGFA 5JESB 5FLRA 3MDZA 1I9NA 3D92A 3M2XA 2CBBA 1CVFA 3M14A 4FVOA 4QY3A 3MNJA 4QJOA 4YXIA 4QEFA 5FNGA 3RYVB 1CAJA 4Q83A 3QYKA 2NWOA 4Q6EA 1XQ0A 2NNOA 3HKQA 4QK2A 2AX2A 1CNXA 4XIXA 3HKNA 5AMLA 1JV0A 3S77B 4C3TA 4L5VA 1IF6A 4RIUA 5EZTX 5L6KA 4CACA 2QP6A 4K0SA 3DCWA 1CVBA 5JEHB 2OSMA 4Q08A 5AMDA 4KUYA 3NJ9A 3NB5A 3JXHC 4Y0JA 1CA3A 4HEWA 4RUZA 1BNUA 1ZSBA 3FFPX 3GZ0A 2X7TA 4Q07A 1CNBA 2GD8A 5FNKA 3DV7A 5EKHA 4UOVA 4KUWA 1FR4A 3MNUA 1BV3A 3IAIA 3OIKA 1HEBA 4N0XB 4JS6A 3P5AA 1IF7A 3DD8A 4XZ5A 4YGKA 4CNRA 1V9EA 1BN1A 3K34A 3RZ1B 3UYQA 5DSRA 1IF4A 5EH5A 3S75B 3S78B 3W6HA 5LMDA 4DZ7A 3M1WA 3IBLA 4Q7WA 1CIMA 5JG3B 2POWA 3OKUA 4IDRX 5DVXA 4YWPA 3DC9A 4JSAA 1CNHA 4QJWA 1THKA 3BETA 4YGLA 5FLTA 3OYQA 5FNMA 4G7AA 3M98A 3JXFA 1FSQA 4FRCA 5EH8A 2ILIA 1YDCA 4FVNA 3V2JA 4WW8A 1FLJA 3IBNA 4YHAA 1OKMA 2H15A 4ZX0A 5DSNA 1G54A 2Q38A 2FNMA 3F7BA 1ZSCA 2F14A 3K7KA 4MDGA 4E49A 3P4VA 5A6HA 5E5UA 1HUHA 1KOPA 4KNMA 1TB0X 2ZNCA 3BL1A 1Z9YA 3S72B 5CA2A 4K0TA 5G01A 4RIVA 3S74B 4L5WA 4MLTA 3MWOA 4E9OX 3OILA 4Z0QA 2NXTA 4R5AA 5JQ0A 3BL0A 1I9LA 4RUYA 3CAJA 3OKVA 1CVAA 5DOGA 3M67A 4M2WA 1BNQA 2NWPA 3MMFA 5FDCA 1I9PA 1UGAA 4JSZA 3MNHA 1RJ6A 9CA2A 2WD3A 5SZ5A 2CBEA 3MNKA 3F8EA 1CANA 2NN1A 3DD0A 2X7UA 3S97A 5BYIA 1CNCA 1CNKA 2VVBX 4FU5A 5EH7A 1BNWA 3HLJA 3PYKA 4Q87A 1F2WA 1RJ5A 4MDMA 3S9TA 1OQ5A 4G0CA 5A25A 1KOQA 1IF9A 1H9QA 3M5EA 3D0NA 3V5GA 4BCWA 4YVYA 4ITPA 5SZ2A 3CYUA 7CA2A 1CCTA 1DMXA 4Q81A 3MHCA 3T5ZA 1G0FA 4YYTA 1UGDA 4M2RA 1G4OA 3KOKA 3RYZA 5JG5B 1FQNA 2HNCA 2X7SA 4R59A 3MHLA 2NNVA 4HF3A 4Q06A 4Z1NA 3T84A 1G52A 3SBHA 4BF6A 1TE3X 4X5SA 4PXXA 3F4XA 1G6VA 2HFWA 3DA2A 4KNJA 4K0ZA 2NN7A 5JDVB 2CABA 4KV0A 5C8IA 1HVAA 3D93A 4M2VA 3SAXA 3D8WA 3M1QA 4QJPA 5E2RA 5SZ7A 2NNSA 5FL4A 2FMZA 4YGNA 2POVA 5SZ4A 4LHIA 3S76A 3M1KA 3R17B 5G0BA 2NXRA 5CLUA 3U7CA 1CALA 3N2PA 1BNVA 4KP5A 4N16A 2FOVA 1CCSA 4KP8A 2HKKA 4K1QA 3MNAA 3RZ0B 2QOAA 4QJXA 1I9OA 1UGEA 1G1DA 2FOYA 1LG6A 4JSSA 1KWQA 4TWLA 4ETQC 3DC3A 1CNWA 1OKLA 1HEAA 1Z93A 1DCBA 4ITOA 1ZGFA 4ZWYA 1CVEA 1TEUX 4Q09A 4ZWIA 5FLSA 3Q31A 3V3IB 4CQ0A 2NWZA 5AMGA 1TH9A 2FOUA 5CACA 3P5LA 5E2SA 3T5UA 1A42A 3EFIA 4KNIA 4QSBA 1ZE8A 5SZ1A 2WD2A 1RZCA 1BNTA 1H9NA 1FSRA 3LXEA 1UGFA 2WEGA 4QK1A 4QSAA 3TVNX 4ZWZA 1G53A 3R16A 3MNIA 3OY0A 5DRSA 1HUGA 4PQ7A 2EZ7A 1BN4A 1CAHA 3M40A 1DMYA 4QTLA 1FSNA 4E3HA 1LG5A 4WW6A 3P58A 3RG3A 3VBDA 4RUXA 5JGTB 1V9IC 1DCAA 1IF5A 3S8XA 1BN3A 5DOHA 4HEYA 4MTYA 4HT2A 3T83A 1UGCA 1HCAA 4PZHA 4YXOA 3V3JA 8CA2A 3K2FA 4KUVA 4YX4A 5BRWA 3IEOA 4Q6DA 5SZ6A 3DCSA 3TVOX 2FNKA 3FW3A 4RFDA 2Q1QA 3B4FA 3U45X 5L3OA 3JXGA 4WUPA 1IF8A 1CNIA 1CZMA 1T9NA 3B1BA 3ML2A 1CAMA 3ZNCA 4RN4A 3RZ5A 1RAZA 1HECA 1CAYA 2FMGA 3KIGA 4WUQA 3T82A 1AM6A 3HS4A 1UGGA 4Q8XA 3UYNA 3IBIA 1HEDA 2CBDA 4KNNA 2WEOA 4CA2A 4Q9YA 2O4ZA 4HT0A 3RGEA 1I9QA 2CBAA 5HPJA 4FIKA 4ZAOA 3M3XA 3P3JA 4RFCA 3DVBA 3KOIA 1CVHA 1BZMA 4MLXA 3V7XA 1LUGA 2OSFA 5E2KA 5DSIA 3D9ZA 4E3GA 1RZEA 3HKUA 2EU2A 5FNIA 5FL6A 3V2MA 3SBIA 4CNWA 2HL4A 5E2MA 1CVDA 4YGJA 5DSMA 12CAA 2IT4A 4Q99A 4HEZA 5EOIA 2CA2A 4YXUA 1JCZA 5DSQA 4WR7A 3RYJB 4QJMA 1CRAA 5EHWA 3IGPA 3TMJA 1G46A 3DBUA 3KONA 5G0CA 2FOSA 2NMXA 2NWYA 4QSJA 1CINA 5FDIA 3S73B 3KWAA 3NI5A 2WEHA 1G4JA 3CZVA 1ZFQA 5E28A 2AW1A 1OKNA 4Q7VA 3MHMA 4E3DA 2HD6A 1TTMA 3M1JA 1AVNA 1URTA 2NXSA 4ILXA 1YO2A 1YDBA 1YDAA 4Z1KA 3PO6A 3RYXB 1TBTX 2FOQA 3DVCA 1ZSAA 5EHVA 5BRUA 4QIZA 1BNNA 3M2YA 3RZ8A 1FQRA 1CAIA 1G48A 2GEHA 2CBCA 1ZNCA 3KNEA 5EKJA 5DSLA 4Z1EA 1CA2A 4XE1A 3ZP9A 1XEGA 2POUA 1I9MA 4CNVA 1ZH9A 3HKTA 2H4NA 4QK3A 1TG9A 3PJJA 3FE4A 5E2NA 4BF1A 3RZ7A 3DCCA 3N0NA 5FNHA 3MYQA 4HBAA 4COQA 3CA2A 3KLDB 6CA2A 3M5TA 5BNLA 3P55A 2QO8A 1BICA 1KWRA 1I8ZA 1RZBA 4JSWA 5EIJA 4LP6A 5CJFA 1HCBA 1Z97A 2NNGA 5JGSB 1XPZA 1EOUA 1G0EA 4E3FA 3M96A 1CAKA 2WEJA 1CAZA 1YO1A 5EKMA 4Q49A 3RG4A 1TG3A 3ML5A 1ZGEA 4HU1A 5JQTA 4FL7A 1KEQA 3L14A 1BCDA 1TEQX 5J8ZA 4PYXA 3IBUA 4K13A 3M2ZA 4PYYA 1FQMA 1AZMA 2EU3A 3MZCA 4Q7SA 1LGDA 3P3HA 3V3GB 3DAZA 3P44A 5FLQA 4MO8A 4M2UA 4Q8YA 4XIWA 1JD0A 5JEPB 2FNNA 3S71B 5E5RA 1YDDA 1RZDA 4RH2A 2W2JA 1LZVA 3RJ7A 3SAPA 5DSJA 3OIMA 3DVDA 1FR7A 3C7PA 4QJ0A 3RYYA 1CNJA 4KAPA 1CRMA 1J9WA 4ZX1A 3M04A 4TWMA 5JEGB 3MHOA 5EHEA 4QIYA 3V3HB 1I90A 1YO0A 4Q90A 3U3AX 5FL5A 3W6IA 3F7UA 4Q7PA 1FQLA 2FW4A 1CVCA 4QSIA 4R5BA 5DSPA 4Z1JA 5BRVA 3EFTA 3U47A 1ZFKA 5IPZA 2VVAX 5FLOA 3RLDA 1UGBA 1CNYA 4IWZA 5FLPA 1CNGA 4FPTA 4E5QA 1MOOA 5DSOA 3N3JA 3T85A 2ABEA 4Q8ZA 3M2NA 4GL1X 1CCUA 4DZ9A 1I91A 1XEVA 4WL4A 4L5UA 2Q1BA 1G45A 5FNJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KS3 A;  3M5S A;  3V3F A;  1CIL A;  4Q78 A;  1Y7W A;  3N4B A;  4Q0L A;  1G3Z A;  5DSK A;  4CNX A;  4ZWX A;  4E4A A;  5SZ3 A;  3MHI A;  2HOC A;  1H4N A;  1RAY A;  1MUA A;  3KKX A;  1RZA A;  3HFP A;  1CAO A;  4LU3 A;  3OYS A;  4MDL A;  5G03 A;  5FNL A;  5SZ0 A;  4XFW A;  1BNM A;  4YGF A;  5JES B;  5FLR A;  3MDZ A;  1I9N A;  3D92 A;  3M2X A;  2CBB A;  1CVF A;  3M14 A;  4FVO A;  4QY3 A;  3MNJ A;  4QJO A;  4YXI A;  4QEF A;  5FNG A;  3RYV B;  1CAJ A;  4Q83 A;  3QYK A;  2NWO A;  4Q6E A;  1XQ0 A;  2NNO A;  3HKQ A;  4QK2 A;  2AX2 A;  1CNX A;  4XIX A;  3HKN A;  5AML A;  1JV0 A;  3S77 B;  4C3T A;  4L5V A;  1IF6 A;  4RIU A;  5EZT X;  5L6K A;  4CAC A;  2QP6 A;  4K0S A;  3DCW A;  1CVB A;  5JEH B;  2OSM A;  4Q08 A;  5AMD A;  4KUY A;  3NJ9 A;  3NB5 A;  3JXH C;  4Y0J A;  1CA3 A;  4HEW A;  4RUZ A;  1BNU A;  1ZSB A;  3FFP X;  3GZ0 A;  2X7T A;  4Q07 A;  1CNB A;  2GD8 A;  5FNK A;  3DV7 A;  5EKH A;  4UOV A;  4KUW A;  1FR4 A;  3MNU A;  1BV3 A;  3IAI A;  3OIK A;  1HEB A;  4N0X B;  4JS6 A;  3P5A A;  1IF7 A;  3DD8 A; 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