1CVEA

Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELDLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cveA00
1RJ5A 2EU2A 1MOOA 1OKNA 5JESB 3M5TA 3RG3A 3QYKA 5JGSB 1XPZA 3V3GB 4BF1A 4Q87A 3D8WA 3MZCA 4XE1A 1T9NA 2NWOA 2NWPA 4QK3A 3HKQA 2Q1BA 4HBAA 3U3AX 4M2VA 3S75B 3K2FA 2NXRA 4MDMA 1G0FA 4QJWA 5DSLA 3MNHA 4Q6DA 3HFPA 3DCCA 3DVCA 3M98A 4LHIA 1UGAA 1G0EA 1KWQA 4L5WA 3MDZA 5J8ZA 1CAKA 3RJ7A 1FLJA 2POUA 3V5GA 1CNYA 1RZEA 4WR7A 3F7UA 5EHWA 3V3FA 3ZNCA 2W2JA 4XIWA 4E49A 4ZWXA 1CA3A 3NB5A 5CLUA 4WW8A 2POVA 5AMGA 3MWOA 4GL1X 1JV0A 1HUGA 2QOAA 3DBUA 3S73B 3RZ1B 3OILA 2ABEA 4RH2A 3RYZA 2NNOA 4FVNA 3F7BA 2FOVA 2CBBA 4HEZA 4ZX0A 2WEGA 4RIVA 3HKUA 3KOKA 5JEHB 1CCTA 3S8XA 3MNUA 1ZH9A 5BRVA 1BNNA 4QIYA 5FNIA 4BCWA 4ZX1A 5AMDA 3S74B 1ZGEA 1CNXA 3T5UA 2WEOA 4YXIA 3B1BA 3P58A 1G4OA 5EHVA 3DCWA 3VBDA 3P5AA 4QJ0A 4YVYA 4HU1A 3DAZA 4MTYA 1G3ZA 2X7SA 5DSQA 4PXXA 4RN4A 3HKNA 5FL4A 4Z0QA 3CZVA 1YDDA 2QP6A 2IT4A 1IF4A 4K1QA 4Q07A 4UOVA 5A25A 3BL0A 1ZFKA 3F8EA 1CAZA 5FNLA 1Z97A 1CRMA 1CAHA 1G48A 4PYYA 3ML2A 3BETA 4COQA 2FMZA 1TEUX 5DSJA 5JEPB 4CNXA 5JGTB 1BV3A 3U7CA 1BNTA 4XZ5A 1TG3A 1G45A 1LZVA 1XEVA 2NN1A 4RUXA 1G1DA 1YO1A 4Y0JA 5FNHA 3T5ZA 3MMFA 1BN1A 3D9ZA 4QSJA 3S77B 9CA2A 1CAYA 1A42A 1V9EA 4QTLA 1I90A 1UGGA 1CZMA 3DV7A 3RG4A 1DCBA 1CVHA 2AX2A 1ZSAA 4Q8XA 3IBUA 5JQ0A 3V2MA 1CVEA 4WUPA 1FSQA 2CBDA 1Y7WA 2X7UA 1HEDA 1I9MA 3D93A 3FFPX 3M1JA 1F2WA 1CAMA 1MUAA 4Z1KA 3DCSA 4Q83A 3S78B 4YGJA 3NI5A 1UGDA 1TE3X 1JD0A 4Q0LA 1CNHA 5C8IA 3BL1A 2FNMA 1RJ6A 3MNIA 3RZ7A 2FOQA 1CNJA 4G7AA 5FL6A 3M2ZA 3T84A 3MHLA 1IF5A 1BNQA 5EZTX 1H9NA 5DSMA 1IF6A 3OIKA 5FLSA 3S72B 3FW3A 3HS4A 1ZSBA 5FLTA 4YXOA 1UGEA 1CALA 1KOQA 4QK1A 4YYTA 2NN7A 4WW6A 3CA2A 4FVOA 4N0XB 3KOIA 3JXGA 1BNWA 4K13A 4KP8A 1HCAA 4XIXA 3OKUA 1EOUA 4QIZA 4QSIA 3KIGA 4CQ0A 5FDCA 1RZBA 2WD3A 3PO6A 3IEOA 5JQTA 2Q1QA 1I91A 5IPZA 3V3JA 1FQMA 3V2JA 4HT0A 4RUYA 3S97A 2OSFA 3IAIA 1TG9A 3W6IA 3V3HB 1BCDA 4JSZA 2FNKA 4M2UA 5JEGB 3KLDB 4Q06A 1Z93A 3M1QA 5EKHA 3RGEA 5BNLA 3SBHA 2EU3A 1YDBA 1XQ0A 2HOCA 1BNMA 3KONA 3GZ0A 3EFIA 2NNGA 2EZ7A 1CVAA 5DSKA 3M67A 3M5EA 5EIJA 5EH5A 4XFWA 3V3IB 5CACA 5JG3B 1FR4A 1KOPA 1FQNA 4FIKA 1ZNCA 2NNSA 4Q7PA 7CA2A 4FL7A 4YXUA 1YO2A 3MYQA 3R17B 3IBIA 3M2YA 1LG6A 5G0CA 12CAA 5E28A 4ZWIA 4KUVA 3P44A 3U45X 5DSIA 3TMJA 3N3JA 5FNGA 4E3GA 5BRUA 3MNJA 3W6HA 5E2MA 1I9NA 5EKMA 5DSRA 3DC9A 4ILXA 4MDLA 1FQRA 1CCSA 1BICA 3N0NA 5E5UA 1CANA 5DSNA 4ZWZA 2FMGA 3V7XA 3M2NA 3IBNA 1UGCA 1CVCA 1TH9A 4CA2A 1DCAA 2VVBX 1THKA 1HECA 4QEFA 1CAIA 1I9LA 4Q90A 4RIUA 5JG5B 1G6VA 1BN3A 1FR7A 3OYQA 1CVDA 1CA2A 4Q81A 2HKKA 5SZ7A 4E4AA 4Z1JA 4MLTA 5FLOA 3RYYA 4ZWYA 1DMXA 4FU5A 1OQ5A 4N16A 5L6KA 1ZE8A 4KP5A 4CACA 4Q09A 4E3HA 4L5VA 4QJXA 5SZ6A 3UYQA 4QSAA 3PYKA 4CNVA 2CBCA 1CNWA 4ITPA 4MDGA 4YGLA 5FNJA 3PJJA 3D0NA 4K0TA 1YDCA 3P4VA 3S71B 5AMLA 1ZSCA 4Q7WA 1HUHA 4LP6A 5FNMA 1IF9A 2FOYA 4YWPA 1J9WA 3DVDA 2FOUA 3M1WA 5BYIA 1I9QA 2NWZA 3ZP9A 3S76A 1G53A 4KUYA 1V9IC 2POWA 1LUGA 1CILA 5L3OA 3JXHC 3KNEA 3HLJA 4R5AA 4M2WA 2ZNCA 3P55A 4YHAA 5E2KA 2CABA 1CNIA 5BRWA 3RZ5A 4X5SA 3EFTA 1I9PA 1TBTX 5DOGA 4Q7SA 1YO0A 4KNMA 4YGKA 3P3HA 3M3XA 1UGBA 3RYJB 4KV0A 5HPJA 4HEYA 2HD6A 3LXEA 3T85A 1CNCA 5E2SA 4KUWA 4Q49A 3D92A 5SZ2A 3RLDA 4G0CA 2H4NA 4TWLA 3K7KA 4IDRX 4Q7VA 2NXSA 2NMXA 5FL5A 4E3FA 3MNKA 4ZAOA 5E5RA 1BN4A 1KEQA 5G01A 5DSOA 1LGDA 3T82A 2HL4A 1LG5A 3RZ8A 3N4BA 1AM6A 4Q9YA 1BZMA 4KNNA 1UGFA 2HFWA 4FPTA 2WD2A 1AVNA 1CINA 1ZFQA 1TEQX 3MHMA 1IF8A 4FRCA 4R5BA 4KNJA 4Q6EA 3IGPA 3KS3A 3T83A 3C7PA 3K34A 1HVAA 1G46A 1FSRA 5FLRA 4JSWA 2NNVA 5DVXA 4E9OX 4KAPA 5E2NA 1CNBA 2GD8A 3OKVA 4RFDA 4LU3A 5DSPA 1CCUA 3M40A 4Z1EA 1RAYA 1DMYA 1CNGA 5SZ1A 1CVBA 5EKJA 1G4JA 3Q31A 4DZ9A 4Q78A 4PQ7A 1RAZA 3KWAA 5LMDA 3U47A 1JCZA 5EOIA 4Q8YA 1CNKA 4RUZA 4YGFA 2VVAX 4QK2A 1BNVA 2GEHA 4MO8A 5JDVB 4CNWA 3P3JA 3RYXB 5SZ4A 5EHEA 3FE4A 4QJOA 1FSNA 1CAJA 5G0BA 4C3TA 5FLQA 4MLXA 3P5LA 5SZ3A 3S9TA 5G03A 5FDIA 3DD8A 5DRSA 1CAOA 3M96A 4K0ZA 3ML5A 3SAXA 6CA2A 5SZ0A 4HF3A 4QJMA 4Q08A 4YGNA 1CRAA 5EH7A 5A6HA 2FNNA 3DVBA 2WEJA 3CYUA 1KWRA 2FOSA 3B4FA 4HEWA 4R59A 1I8ZA 2Q38A 4JSAA 4PZHA 4Q8ZA 4QSBA 5CJFA 3M5SA 4IWZA 3M1KA 1RZAA 3SAPA 2F14A 4DZ7A 1HCBA 1G54A 3R16A 4ETQC 1OKMA 4HT2A 3DC3A 2AW1A 3OYSA 2NWYA 4ITOA 3HKTA 3N2PA 4JSSA 1RZDA 1TB0X 1RZCA 1I9OA 4TWMA 8CA2A 3KKXA 4Z1NA 1HEAA 3TVNX 2OSMA 3NJ9A 4M2RA 2ILIA 4QY3A 2HNCA 3MHCA 2CBEA 3MNAA 4PYXA 1BNUA 1CIMA 3F4XA 3CAJA 2NXTA 1URTA 5E2RA 3TVOX 4CNRA 1H4NA 4BF6A 3DA2A 3M04A 1YDAA 1H9QA 1AZMA 1CVFA 3SBIA 2O4ZA 2WEHA 1XEGA 4WUQA 4Q99A 1TTMA 2CA2A 4RFCA 1FQLA 4WL4A 4K0SA 4JS6A 2H15A 4E5QA 1G52A 3OIMA 2QO8A 4QJPA 1ZGFA 3OY0A 3DD0A 5DOHA 1OKLA 5CA2A 4L5UA 3MHOA 5FNKA 3IBLA 5EH8A 2CBAA 5FLPA 3MHIA 3M14A 2X7TA 4E3DA 3RYVB 1IF7A 4YX4A 3RZ0B 1HEBA 3M2XA 3UYNA 3JXFA 5SZ5A 1Z9YA 2FW4A 3L14A 4KNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RJ5 A;  2EU2 A;  1MOO A;  1OKN A;  5JES B;  3M5T A;  3RG3 A;  3QYK A;  5JGS B;  1XPZ A;  3V3G B;  4BF1 A;  4Q87 A;  3D8W A;  3MZC A;  4XE1 A;  1T9N A;  2NWO A;  2NWP A;  4QK3 A;  3HKQ A;  2Q1B A;  4HBA A;  3U3A X;  4M2V A;  3S75 B;  3K2F A;  2NXR A;  4MDM A;  1G0F A;  4QJW A;  5DSL A;  3MNH A;  4Q6D A;  3HFP A;  3DCC A;  3DVC A;  3M98 A;  4LHI A;  1UGA A;  1G0E A;  1KWQ A;  4L5W A;  3MDZ A;  5J8Z A;  1CAK A;  3RJ7 A;  1FLJ A;  2POU A;  3V5G A;  1CNY A;  1RZE A;  4WR7 A;  3F7U A;  5EHW A;  3V3F A;  3ZNC A;  2W2J A;  4XIW A;  4E49 A;  4ZWX A;  1CA3 A;  3NB5 A;  5CLU A;  4WW8 A;  2POV A;  5AMG A;  3MWO A;  4GL1 X;  1JV0 A;  1HUG A;  2QOA A;  3DBU A;  3S73 B;  3RZ1 B;  3OIL A;  2ABE A;  4RH2 A;  3RYZ A;  2NNO A;  4FVN A;  3F7B A;  2FOV A;  2CBB A;  4HEZ A;  4ZX0 A;  2WEG A;  4RIV A;  3HKU A;  3KOK A;  5JEH B;  1CCT A;  3S8X A;  3MNU A;  1ZH9 A;  5BRV A;  1BNN A;  4QIY A;  5FNI A;  4BCW A;  4ZX1 A;  5AMD A;  3S74 B;  1ZGE A;  1CNX A;  3T5U A;  2WEO A;  4YXI A;  3B1B A;  3P58 A;  1G4O A;  5EHV A; 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