1CVEA

Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELDLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural consequences of redesigning a protein-zinc binding site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cveA00
4JS6A 4Q9YA 4TWMA 5EH5A 3SBHA 4G7AA 3MHMA 1YDDA 3F4XA 4GL1X 3BL0A 4HT2A 4QIYA 3S72B 3RYJB 4JSAA 3V3FA 4RUZA 1RAYA 1KOPA 3RG4A 2IT4A 3RYZA 3M1JA 4E5QA 3LXEA 1KWRA 1RJ6A 5EHEA 1CAOA 3KIGA 3RZ0B 4YGKA 4JSSA 5JGTB 1I9QA 1XEVA 3OYQA 4HEZA 1J9WA 3U3AX 3DVBA 1KOQA 1UGBA 4Q83A 2WD2A 3DV7A 2WEOA 5DVXA 3PYKA 3IEOA 5J8ZA 1I90A 3D93A 2CABA 1RZDA 4FL7A 5DSRA 4ZWYA 3M2ZA 3M67A 2NNOA 4Q7WA 5FDIA 3RLDA 3M5SA 4XZ5A 3TVNX 5EIJA 12CAA 4HBAA 3KLDB 4MDMA 4Q7SA 4BF1A 4R59A 2AW1A 4YVYA 4Y0JA 1I9NA 2EU3A 3S74B 4YGJA 4DZ9A 3CZVA 3MNHA 3MNKA 4KUYA 4N16A 4XIXA 4WL4A 4KNIA 4G0CA 2AX2A 3TVOX 5FL5A 1CNBA 4E3HA 3M14A 2FMZA 1OKNA 4Z0QA 2NN7A 4Q06A 3MHIA 3HKNA 4K0SA 1ZNCA 4K0ZA 3MZCA 1IF6A 1CNCA 4RIVA 4RN4A 3D9ZA 2CBCA 4Q78A 3IBUA 2FNNA 3T83A 1BNWA 3MYQA 2Q1BA 1G46A 5E2SA 2HL4A 5CLUA 3GZ0A 4PXXA 3U47A 4R5BA 4XE1A 5FNIA 1CZMA 5G01A 4PZHA 5E2NA 4WUPA 4Q09A 5LMDA 2Q1QA 2WEHA 5FLSA 4DZ7A 4QK1A 5FNHA 2NMXA 1CILA 3P55A 1CANA 1BNUA 4RUXA 5FNMA 2X7TA 1YO2A 1I9PA 3P5AA 3HKUA 3SBIA 5EHWA 1MOOA 2QO8A 5DSOA 4COQA 4M2RA 3CYUA 4M2WA 5FLQA 2X7SA 1CA2A 3S78B 4BCWA 5DRSA 1JV0A 1EOUA 1CRMA 5FLPA 1UGDA 3MMFA 4K13A 1CCSA 4QJPA 4XFWA 4L5VA 3V3IB 3UYQA 4E3DA 5EKHA 2NWOA 3DVDA 1CVAA 1CVFA 4QK3A 1ZSCA 3IBLA 5DSNA 4KNMA 7CA2A 1TEUX 3V3HB 1UGCA 1CA3A 3V3GB 4MO8A 3UYNA 1CNYA 5EH8A 3VBDA 1CRAA 1Z97A 4C3TA 1DCBA 4QJOA 1XEGA 4E4AA 1YDBA 4PQ7A 5FLRA 3NB5A 2CBBA 3KOKA 1CIMA 3KKXA 4ZX0A 5SZ0A 4HF3A 3NI5A 1JCZA 5DOHA 5CA2A 1URTA 1F2WA 3M2XA 5CACA 2FW4A 3TMJA 1H9NA 4KUWA 2ABEA 4ITOA 4KUVA 1IF7A 4M2UA 5DSQA 1V9EA 2OSFA 1BN3A 2CBAA 4ZWIA 2POVA 2CBEA 4E49A 4QY3A 3S71B 1IF8A 1FSNA 5BRWA 3QYKA 2FOSA 1BNNA 4HEWA 1YDCA 3W6HA 3BL1A 5CJFA 3F8EA 1LZVA 2QP6A 1CAHA 3N0NA 4ZWXA 5DSIA 4LHIA 5JG5B 1CNKA 1ZFKA 2X7UA 2NWZA 3SAPA 3DCWA 3IBNA 1CVEA 2QOAA 1RAZA 5E2KA 1BNVA 4CACA 1V9IC 3KNEA 5FNLA 5E5UA 4Z1NA 4QJWA 5EKJA 4E3FA 2FNMA 5FL4A 3K2FA 3HKTA 1UGEA 1FQLA 1RZBA 1G48A 1HVAA 3DC3A 5AMGA 9CA2A 4YGLA 1YO0A 4KAPA 1UGAA 3Q31A 4Q6DA 1CAZA 5JQ0A 3DD8A 1IF9A 3DVCA 3V5GA 5FDCA 1OKMA 4ZX1A 3OY0A 1CAYA 4Q07A 3W6IA 3M98A 3MDZA 1BNTA 1CAKA 3OYSA 4YXUA 3V7XA 2W2JA 1TB0X 2FMGA 4X5SA 4Q7VA 3K34A 2FOVA 3D0NA 3FW3A 1AVNA 3N3JA 5EHVA 3OILA 3HFPA 1ZSBA 4Q87A 4LP6A 2NNVA 4JSZA 1FSQA 1G53A 4QTLA 4QSIA 1TEQX 4YXOA 1FR4A 1CNJA 3JXFA 3M40A 4RUYA 3KWAA 5SZ2A 3DCSA 1BN4A 1UGGA 3MNAA 1XQ0A 2OSMA 1TG3A 5EOIA 4L5WA 3P3JA 3DC9A 4Q81A 2NN1A 1LG5A 4QJMA 3RG3A 5JGSB 3RZ5A 3RZ7A 3OIKA 1G3ZA 4LU3A 1HCAA 3P44A 4MTYA 5E5RA 5FNGA 1FQRA 3M96A 1HEBA 3D8WA 2POUA 4QJ0A 1CINA 1DCAA 2NXTA 2ZNCA 4L5UA 4RFDA 4QSJA 1CCUA 3M2YA 4ZAOA 3S9TA 1G52A 1THKA 1RJ5A 5BRVA 3B4FA 1H4NA 1G0EA 3D92A 3IGPA 5BRUA 5JDVB 4KP5A 2ILIA 5SZ4A 4WW6A 1G1DA 1CNXA 4Q8YA 5E2RA 5DOGA 4FPTA 1KWQA 4KP8A 1I91A 5DSLA 1BICA 5SZ6A 4ETQC 1CAMA 4QIZA 4YGNA 3M1QA 4ZWZA 1T9NA 1ZGEA 2NWPA 4QK2A 5A6HA 2WEGA 3KOIA 1XPZA 5DSMA 3MHOA 4YYTA 3V3JA 1RZAA 1JD0A 1HCBA 3ZNCA 2FOUA 2CA2A 1Z9YA 3HS4A 5JG3B 3KS3A 3NJ9A 3R16A 4FVOA 4ITPA 1Z93A 2Q38A 5E2MA 1I9LA 1HEDA 3OIMA 1CNWA 3RZ1B 4KNNA 3IBIA 3T82A 4YX4A 4R5AA 5SZ5A 4QSBA 2HOCA 5E28A 1HEAA 3L14A 3PO6A 3F7UA 3S75B 3HLJA 5SZ3A 5A25A 2H4NA 3R17B 5FL6A 5DSPA 4Z1JA 1TTMA 1ZH9A 3ML2A 1FLJA 1CVHA 1ZFQA 2NNSA 4Z1KA 2GEHA 4CNVA 4Q49A 1OKLA 4K0TA 2NXSA 2O4ZA 1I9MA 3P4VA 1LUGA 4Q99A 3M3XA 3PJJA 2EZ7A 5L6KA 3V2MA 4Q90A 4YWPA 4PYXA 2HD6A 4Q08A 3M1WA 1CCTA 2F14A 5DSJA 3S77B 1BN1A 4Q8ZA 1CNIA 3DAZA 1CVCA 1TH9A 4QEFA 1RZEA 8CA2A 5JQTA 3RYVB 1CNHA 3BETA 5AMDA 5G03A 1BCDA 4UOVA 4MDGA 3U45X 4MDLA 2POWA 1CNGA 5SZ7A 3MNUA 1TE3X 4E3GA 4XIWA 1DMYA 4Q7PA 2NNGA 3T5UA 4IDRX 3DA2A 3JXHC 4BF6A 1I9OA 5JEPB 3OKVA 5BYIA 5FNKA 3JXGA 3DCCA 3FFPX 4E9OX 2VVBX 4Q0LA 3DD0A 1IF5A 3M04A 5SZ1A 5JEGB 1ZSAA 1G0FA 4RIUA 3P58A 4N0XB 3P3HA 4M2VA 3SAXA 4FU5A 1G54A 3HKQA 4K1QA 2WD3A 4CA2A 2HNCA 2FOYA 1IF4A 3S73B 1Y7WA 3K7KA 2HKKA 2GD8A 3KONA 3T5ZA 1TBTX 1UGFA 3V2JA 4Z1EA 4KV0A 4WW8A 5JESB 3ZP9A 1HUHA 1BNMA 1FQMA 1CVBA 3N2PA 4PYYA 4CNWA 2WEJA 5HPJA 5BNLA 3S8XA 5EZTX 5FLOA 3OKUA 4MLTA 1FSRA 1OQ5A 3U7CA 1H9QA 3MNIA 2CBDA 2EU2A 5FNJA 5G0BA 1AZMA 5DSKA 1RZCA 3RYYA 3M5TA 1G45A 3B1BA 3N4BA 1CVDA 1G4JA 1LGDA 2H15A 4KNJA 4CQ0A 4MLXA 1DMXA 1HECA 3EFTA 4Q6EA 3S97A 3MHLA 3S76A 3EFIA 4QJXA 1KEQA 1G6VA 3C7PA 4QSAA 1FR7A 1I8ZA 4RH2A 1CALA 4IWZA 4JSWA 2FNKA 4CNXA 4FRCA 1YO1A 5EKMA 4ILXA 4WR7A 4CNRA 5G0CA 1A42A 3CA2A 3MWOA 4YXIA 4TWLA 3F7BA 4HEYA 5L3OA 2VVAX 1CAIA 5FLTA 1ZE8A 2HFWA 3ML5A 3RJ7A 3MHCA 4RFCA 4YHAA 2NXRA 1CAJA 1LG6A 3T84A 1MUAA 3RYXB 6CA2A 4FVNA 1ZGFA 1TG9A 4HT0A 2NWYA 1FQNA 4WUQA 3CAJA 5EH7A 5JEHB 5IPZA 3RGEA 4FIKA 1BV3A 4HU1A 5C8IA 1AM6A 3IAIA 3M5EA 3P5LA 3M2NA 1YDAA 2FOQA 3T85A 3FE4A 4Q8XA 3RZ8A 1BZMA 1HUGA 5AMLA 3DBUA 4YGFA 3MNJA 1G4OA 3M1KA 1BNQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JS6 A;  4Q9Y A;  4TWM A;  5EH5 A;  3SBH A;  4G7A A;  3MHM A;  1YDD A;  3F4X A;  4GL1 X;  3BL0 A;  4HT2 A;  4QIY A;  3S72 B;  3RYJ B;  4JSA A;  3V3F A;  4RUZ A;  1RAY A;  1KOP A;  3RG4 A;  2IT4 A;  3RYZ A;  3M1J A;  4E5Q A;  3LXE A;  1KWR A;  1RJ6 A;  5EHE A;  1CAO A;  3KIG A;  3RZ0 B;  4YGK A;  4JSS A;  5JGT B;  1I9Q A;  1XEV A;  3OYQ A;  4HEZ A;  1J9W A;  3U3A X;  3DVB A;  1KOQ A;  1UGB A;  4Q83 A;  2WD2 A;  3DV7 A;  2WEO A;  5DVX A;  3PYK A;  3IEO A;  5J8Z A;  1I90 A;  3D93 A;  2CAB A;  1RZD A;  4FL7 A;  5DSR A;  4ZWY A;  3M2Z A;  3M67 A;  2NNO A;  4Q7W A;  5FDI A;  3RLD A;  3M5S A;  4XZ5 A;  3TVN X;  5EIJ A;  12CA A;  4HBA A;  3KLD B;  4MDM A;  4Q7S A;  4BF1 A;  4R59 A;  2AW1 A;  4YVY A;  4Y0J A;  1I9N A;  2EU3 A;  3S74 B;  4YGJ A;  4DZ9 A;  3CZV A;  3MNH A;  3MNK A;  4KUY A;  4N16 A;  4XIX A;  4WL4 A;  4KNI A;  4G0C A;  2AX2 A;  3TVO X;  5FL5 A;  1CNB A;  4E3H A;  3M14 A;  2FMZ A;  1OKN A;  4Z0Q A;  2NN7 A;  4Q06 A;  3MHI A;  3HKN A;  4K0S A;  1ZNC A;  4K0Z A;  3MZC A;  1IF6 A;  1CNC A; 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