1CZM | Genus

Total Genus 74

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	74
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	260
structure length	260
Chain Sequence	ASPDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__81360255043936__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__81360255043936__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/1czm/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__81360255043936__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"81360255043936","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/1czm/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__81360255043936__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase(oxo-acid)
source organism	Homo sapiens
publication title	Drug-protein interactions. Refined structures of three sulfonamide drug complexes of human carbonic anhydrase I enzyme. pubmed doi rcsb
molecule keywords	CARBONIC ANHYDRASE I
total genus	74
structure length	260
sequence length	260
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	1993-11-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	1czmA00

5EKHA 1UGEA 5G01A 3F8EA 3S71B 3SAXA 5IPZA 1ZSBA 3CA2A 4IWZA 5CA2A 5JG5B 5DSLA 5FLPA 1UGFA 1HEDA 3RZ1B 1KOQA 1RJ5A 5FNLA 1G46A 1I8ZA 4Q6EA 3FE4A 1BN3A 4R5AA 1CAKA 4QIZA 3RLDA 2NNSA 1TEUX 3S75B 3HFPA 3KS3A 1CNGA 3S77B 4KV0A 3RYVB 1KWRA 3M5EA 3TMJA 3F7BA 4FVOA 3UYQA 4ZX1A 1DMXA 2WEGA 3S74B 5CACA 1CCTA 1G0EA 5CLUA 4Q7WA 4YX4A 3MHCA 1LGDA 1ZGFA 4QJOA 5DSRA 3RYYA 5BYIA 1TBTX 1Z97A 3S97A 1V9EA 3P55A 1RZAA 3HKTA 3KOIA 4ILXA 4Y0JA 3P4VA 3S72B 3P3JA 1G53A 1HCAA 1BNQA 3M96A 4ZWIA 3M04A 3M2NA 3OIKA 4PQ7A 3IBLA 4Q8XA 5JESB 1XQ0A 3RJ7A 1DCBA 4KNMA 3UYNA 3C7PA 3M3XA 4E49A 3DCWA 3D92A 5SZ6A 3RZ0B 3HLJA 1BNWA 4YVYA 3OILA 5DRSA 3DVBA 3P5AA 5DOHA 4JS6A 3V2MA 1CRMA 5FDCA 1UGCA 1CIMA 1CNCA 1JCZA 3EFIA 4MDMA 3L14A 2QOAA 4QSBA 1UGDA 4KNNA 1YO1A 1CINA 3D8WA 4JSWA 4HT0A 3RYJB 5JG3B 5E2RA 1CCUA 1IF9A 1LZVA 3FW3A 3KKXA 3M5TA 5FL6A 4WUPA 4QSJA 4QIYA 3P58A 1T9NA 1G45A 2GD8A 3OYSA 4FRCA 1EOUA 3ZP9A 1BNTA 3SBHA 2O4ZA 5EZTX 1FR7A 1BN4A 4Q99A 4Z1KA 4COQA 4HU1A 3T84A 5SZ5A 4CNWA 1ZFQA 3CZVA 4Z1NA 3SBIA 3GZ0A 4E5QA 3RG4A 4WW8A 4Q08A 4LP6A 1TE3X 5BRWA 5G0BA 2Q38A 3OKUA 4M2RA 4MTYA 5FNHA 1YO0A 3T5UA 5EH8A 1YDBA 3VBDA 4MLTA 3P5LA 4MO8A 4E3GA 5FLSA 4RUXA 3MYQA 4HEWA 2NWPA 4QEFA 3QYKA 1CAIA 4Q0LA 3W6HA 4ZWZA 1BCDA 1I91A 1XEGA 5DSKA 4KUVA 5L6KA 4Q07A 3NJ9A 3OIMA 1G48A 4RFCA 4YXUA 5JQTA 1Z93A 1FR4A 3RYZA 4K0SA 1CVAA 4KP8A 4X5SA 1LG5A 1ZFKA 4DZ9A 3DAZA 1G4JA 1FSQA 3MNIA 5JEPB 4QJPA 4YGJA 5FL4A 2EU2A 3DBUA 3M2YA 4ZX0A 3M2XA 1CALA 3DD0A 2WEOA 4XZ5A 3KNEA 2WD3A 2NXSA 4Q9YA 3U3AX 5JEGB 1G6VA 3D9ZA 1ZE8A 5G03A 3M5SA 4WUQA 1V9IC 3U47A 4RIUA 2ZNCA 2CABA 5EHVA 12CAA 3S73B 4PZHA 4ETQC 2OSMA 4CNRA 1H9NA 2VVAX 4HT2A 1G3ZA 2NNVA 1TEQX 1G1DA 1BNMA 3HKQA 2NNOA 3MHLA 4R5BA 1XEVA 4KUWA 4ITOA 4QSIA 1CANA 3DVDA 5LMDA 3LXEA 1CNBA 1RZEA 3MNHA 2FW4A 1TB0X 1BZMA 1MUAA 1RAYA 3N2PA 4FL7A 9CA2A 2FNKA 4Q83A 4ZAOA 2X7UA 3IBIA 1CVDA 3T82A 5CJFA 1FQMA 2CBCA 3V3HB 2CBDA 3V3IB 3TVOX 3K2FA 4FIKA 4IDRX 3HKNA 3P3HA 1I9PA 1I9MA 4BCWA 4Z1JA 3BL1A 3M1KA 4Q09A 4KNJA 1LG6A 3KIGA 3T83A 1BICA 1H4NA 3CYUA 5DSJA 3MDZA 3OY0A 3MNUA 4M2UA 3IAIA 4ZWYA 4Q49A 4E3HA 1UGGA 3NI5A 1JD0A 1HUHA 3S9TA 3MMFA 3MNAA 4HEZA 3R16A 3P44A 5SZ0A 4Q7SA 1JV0A 1HVAA 3U45X 4E4AA 4L5WA 4YWPA 4FU5A 2NXTA 3RZ8A 3RGEA 1CNIA 1CVBA 1YDDA 3S8XA 3JXHC 3JXGA 1ZSAA 4E3FA 4R59A 2OSFA 2POUA 1KEQA 1H9QA 2CA2A 1CNJA 1CVHA 4YYTA 2POWA 4KUYA 3N4BA 3M1JA 3N0NA 2WEHA 1KOPA 5G0CA 5BNLA 2FMGA 1CVCA 3M67A 1CAJA 1CZMA 2WD2A 3M40A 4MDGA 4C3TA 3ML5A 1I9OA 1ZSCA 3CAJA 2NMXA 3DC3A 1G54A 4YGLA 3F7UA 2FMZA 5JGTB 3DA2A 4PYXA 3K7KA 1OKNA 3PYKA 4QJ0A 5J8ZA 1FQRA 2NWZA 4ITPA 2Q1QA 3ML2A 4MLXA 1TG9A 5DSIA 3MHIA 4BF6A 1RZDA 4Q6DA 2VVBX 5DSNA 3S78B 4CA2A 4KP5A 2WEJA 5E2MA 5DSQA 3V3JA 3Q31A 1HCBA 3U7CA 2AW1A 3IGPA 1IF6A 3SAPA 3M98A 5FNIA 4QJXA 1IF8A 4JSZA 5E5RA 1FSRA 4CNXA 3ZNCA 3KOKA 5A6HA 5FL5A 1CVEA 1HECA 3MNKA 4WW6A 5EH7A 5EIJA 1CNKA 3RZ5A 4YGNA 1RAZA 4YGFA 2NXRA 4RUZA 4YHAA 2NWYA 2HOCA 4QJWA 4HEYA 5SZ3A 5DOGA 4UOVA 4WL4A 3DCSA 4QK2A 5JEHB 1BNVA 3RZ7A 3KLDB 1RJ6A 1THKA 1CAHA 3RG3A 3DCCA 3V3GB 1CNYA 2FNNA 2NWOA 5FLRA 1BV3A 2X7TA 2HKKA 2GEHA 3MZCA 4BF1A 4TWMA 1Y7WA 3V3FA 3W6IA 4RH2A 4Q7PA 1I9LA 1BNUA 2EZ7A 5EKJA 4YXOA 1URTA 1A42A 3PJJA 1I9NA 1KWQA 5SZ2A 3RYXB 4CACA 2FOSA 4PXXA 1CILA 1FQLA 5FNMA 1I90A 4QK1A 5AMGA 3MNJA 2QO8A 1AZMA 2IT4A 4L5VA 1CAYA 1FLJA 4K0ZA 3JXFA 3V7XA 3S76A 5A25A 2NN7A 1I9QA 2NN1A 3M1WA 5E2NA 3M14A 5E2KA 1OKLA 5AMLA 4CNVA 3HKUA 4GL1X 5JQ0A 1CNHA 5BRVA 2Q1BA 1HUGA 4YXIA 2CBAA 4RN4A 4MDLA 5FNJA 3TVNX 5DSOA 1UGBA 4FPTA 1BN1A 3V2JA 3V5GA 2AX2A 2HL4A 4DZ7A 4XIWA 7CA2A 1CAZA 1G0FA 3R17B 1ZNCA 1J9WA 1CCSA 3T5ZA 3KWAA 3MHMA 2FNMA 1YDAA 4K13A 5FLQA 4ZWXA 2ILIA 1Z9YA 4XE1A 2QP6A 3MWOA 4KNIA 2FOQA 5EHWA 3IBUA 4QSAA 3B4FA 4L5UA 1FSNA 5EKMA 1UGAA 3OKVA 5SZ1A 3T85A 4Q90A 4G0CA 4Q8YA 1IF4A 1DCAA 2POVA 6CA2A 1CAMA 4JSSA 5EHEA 5EOIA 3BETA 4Q06A 4RIVA 3M2ZA 4M2WA 3EFTA 5DSMA 3B1BA 2HNCA 3BL0A 1TG3A 5AMDA 3DV7A 4QK3A 3DC9A 4Z0QA 1CNXA 3IBNA 4RFDA 1RZBA 4E3DA 1LUGA 4Q87A 4WR7A 5EH5A 4Q78A 1AM6A 2FOVA 3IEOA 4RUYA 4Q8ZA 5E28A 4XIXA 1OQ5A 2HFWA 5FLOA 5FNGA 2ABEA 3HS4A 4Q7VA 2EU3A 1DMYA 4K0TA 3OYQA 5JGSB 1MOOA 5BRUA 2F14A 3M1QA 2H15A 2FOUA 5DSPA 8CA2A 3N3JA 4FVNA 5L3OA 3PO6A 1CRAA 4Z1EA 1F2WA 3KONA 4QTLA 3D0NA 1FQNA 2H4NA 4TWLA 4LU3A 4HBAA 2CBEA 5E2SA 4N0XB 1IF7A 4XFWA 3MHOA 5HPJA 4QJMA 2FOYA 3FFPX 1CA2A 1HEBA 4JSAA 4KAPA 2HD6A 1HEAA 4N16A 1TTMA 5FDIA 4E9OX 2W2JA 1RZCA 4LHIA 1XPZA 5E5UA 5C8IA 1OKMA 3NB5A 1YDCA 1BNNA 5FLTA 1G4OA 3F4XA 3DD8A 2NNGA 1G52A 5SZ4A 2X7SA 3DVCA 1CA3A 1TH9A 4CQ0A 1AVNA 1ZGEA 4K1QA 4Q81A 2CBBA 1ZH9A 1CAOA 4HF3A 4QY3A 5DVXA 1YO2A 1CNWA 5JDVB 4M2VA 1CVFA 4PYYA 3K34A 5FNKA 4YGKA 5SZ7A 4G7AA 3D93A 1IF5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EKH A;  1UGE A;  5G01 A;  3F8E A;  3S71 B;  3SAX A;  5IPZ A;  1ZSB A;  3CA2 A;  4IWZ A;  5CA2 A;  5JG5 B;  5DSL A;  5FLP A;  1UGF A;  1HED A;  3RZ1 B;  1KOQ A;  1RJ5 A;  5FNL A;  1G46 A;  1I8Z A;  4Q6E A;  3FE4 A;  1BN3 A;  4R5A A;  1CAK A;  4QIZ A;  3RLD A;  2NNS A;  1TEU X;  3S75 B;  3HFP A;  3KS3 A;  1CNG A;  3S77 B;  4KV0 A;  3RYV B;  1KWR A;  3M5E A;  3TMJ A;  3F7B A;  4FVO A;  3UYQ A;  4ZX1 A;  1DMX A;  2WEG A;  3S74 B;  5CAC A;  1CCT A;  1G0E A;  5CLU A;  4Q7W A;  4YX4 A;  3MHC A;  1LGD A;  1ZGF A;  4QJO A;  5DSR A;  3RYY A;  5BYI A;  1TBT X;  1Z97 A;  3S97 A;  1V9E A;  3P55 A;  1RZA A;  3HKT A;  3KOI A;  4ILX A;  4Y0J A;  3P4V A;  3S72 B;  3P3J A;  1G53 A;  1HCA A;  1BNQ A;  3M96 A;  4ZWI A;  3M04 A;  3M2N A;  3OIK A;  4PQ7 A;  3IBL A;  4Q8X A;  5JES B;  1XQ0 A;  3RJ7 A;  1DCB A;  4KNM A;  3UYN A;  3C7P A;  3M3X A;  4E49 A;  3DCW A;  3D92 A;  5SZ6 A;  3RZ0 B;  3HLJ A;  1BNW A;  4YVY A;  3OIL A;  5DRS A;  3DVB A;  3P5A A;  5DOH A;  4JS6 A;  3V2M A;  1CRM A;  5FDC A;  1UGC A;  1CIM A;  1CNC A;  1JCZ A;  3EFI A;  4MDM A;  3L14 A;  2QOA A;  4QSB A;  1UGD A;  4KNN A;  1YO1 A;  1CIN A;  3D8W A;  4JSW A;  4HT0 A;  3RYJ B;  5JG3 B;  5E2R A;  1CCU A;  1IF9 A;  1LZV A;  3FW3 A;  3KKX A;  3M5T A;  5FL6 A;  4WUP A;  4QSJ A;  4QIY A;  3P58 A;  1T9N A;  1G45 A;  2GD8 A;  3OYS A;  4FRC A;  1EOU A;  3ZP9 A;  1BNT A;  3SBH A;  2O4Z A;  5EZT X;  1FR7 A;  1BN4 A;  4Q99 A;  4Z1K A;  4COQ A;  4HU1 A;  3T84 A;  5SZ5 A;  4CNW A;  1ZFQ A;  3CZV A;  4Z1N A;  3SBI A;  3GZ0 A;  4E5Q A;  3RG4 A;  4WW8 A;  4Q08 A;  4LP6 A;  1TE3 X;  5BRW A;  5G0B A;  2Q38 A;  3OKU A;  4M2R A;  4MTY A;  5FNH A;  1YO0 A;  3T5U A;  5EH8 A;  1YDB A;  3VBD A;  4MLT A;  3P5L A;  4MO8 A;  4E3G A;  5FLS A;  4RUX A;  3MYQ A;  4HEW A;  2NWP A;  4QEF A;  3QYK A;  1CAI A;  4Q0L A;  3W6H A;  4ZWZ A;  1BCD A;  1I91 A;  1XEG A;  5DSK A;  4KUV A;  5L6K A;  4Q07 A;  3NJ9 A;  3OIM A;  1G48 A;  4RFC A;  4YXU A;  5JQT A;  1Z93 A;  1FR4 A;  3RYZ A;  4K0S A;  1CVA A;  4KP8 A;  4X5S A;  1LG5 A;  1ZFK A;  4DZ9 A;  3DAZ A;  1G4J A;  1FSQ A;  3MNI A;  5JEP B;  4QJP A;  4YGJ A;  5FL4 A;  2EU2 A;  3DBU A;  3M2Y A;  4ZX0 A;  3M2X A;  1CAL A;  3DD0 A;  2WEO A;  4XZ5 A;  3KNE A;  2WD3 A;  2NXS A;  4Q9Y A;  3U3A X;  5JEG B;  1G6V A;  3D9Z A;  1ZE8 A;  5G03 A;  3M5S A;  4WUQ A;  1V9I C;  3U47 A;  4RIU A;  2ZNC A;  2CAB A;  5EHV A;  12CA A;  3S73 B;  4PZH A;  4ETQ C;  2OSM A;  4CNR A;  1H9N A;  2VVA X;  4HT2 A;  1G3Z A;  2NNV A;  1TEQ X;  1G1D A;  1BNM A;  3HKQ A;  2NNO A;  3MHL A;  4R5B A;  1XEV A;  4KUW A;  4ITO A;  4QSI A;  1CAN A;  3DVD A;  5LMD A;  3LXE A;  1CNB A;  1RZE A;  3MNH A;  2FW4 A;  1TB0 X;  1BZM A;  1MUA A;  1RAY A;  3N2P A;  4FL7 A;  9CA2 A;  2FNK A;  4Q83 A;  4ZAO A;  2X7U A;  3IBI A;  1CVD A;  3T82 A;  5CJF A;  1FQM A;  2CBC A;  3V3H B;  2CBD A;  3V3I B;  3TVO X;  3K2F A;  4FIK A;  4IDR X;  3HKN A;  3P3H A;  1I9P A;  1I9M A;  4BCW A;  4Z1J A;  3BL1 A;  3M1K A;  4Q09 A;  4KNJ A;  1LG6 A;  3KIG A;  3T83 A;  1BIC A;  1H4N A;  3CYU A;  5DSJ A;  3MDZ A;  3OY0 A;  3MNU A;  4M2U A;  3IAI A;  4ZWY A;  4Q49 A;  4E3H A;  1UGG A;  3NI5 A;  1JD0 A;  1HUH A;  3S9T A;  3MMF A;  3MNA A;  4HEZ A;  3R16 A;  3P44 A;  5SZ0 A;  4Q7S A;  1JV0 A;  1HVA A;  3U45 X;  4E4A A;  4L5W A;  4YWP A;  4FU5 A;  2NXT A;  3RZ8 A;  3RGE A;  1CNI A;  1CVB A;  1YDD A;  3S8X A;  3JXH C;  3JXG A;  1ZSA A;  4E3F A;  4R59 A;  2OSF A;  2POU A;  1KEQ A;  1H9Q A;  2CA2 A;  1CNJ A;  1CVH A;  4YYT A;  2POW A;  4KUY A;  3N4B A;  3M1J A;  3N0N A;  2WEH A;  1KOP A;  5G0C A;  5BNL A;  2FMG A;  1CVC A;  3M67 A;  1CAJ A;  1CZM A;  2WD2 A;  3M40 A;  4MDG A;  4C3T A;  3ML5 A;  1I9O A;  1ZSC A;  3CAJ A;  2NMX A;  3DC3 A;  1G54 A;  4YGL A;  3F7U A;  2FMZ A;  5JGT B;  3DA2 A;  4PYX A;  3K7K A;  1OKN A;  3PYK A;  4QJ0 A;  5J8Z A;  1FQR A;  2NWZ A;  4ITP A;  2Q1Q A;  3ML2 A;  4MLX A;  1TG9 A;  5DSI A;  3MHI A;  4BF6 A;  1RZD A;  4Q6D A;  2VVB X;  5DSN A;  3S78 B;  4CA2 A;  4KP5 A;  2WEJ A;  5E2M A;  5DSQ A;  3V3J A;  3Q31 A;  1HCB A;  3U7C A;  2AW1 A;  3IGP A;  1IF6 A;  3SAP A;  3M98 A;  5FNI A;  4QJX A;  1IF8 A;  4JSZ A;  5E5R A;  1FSR A;  4CNX A;  3ZNC A;  3KOK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1CZMA

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