1DCAA

Structure of an engineered metal binding site in human carbonic anhydrase ii reveals the architecture of a regulatory cysteine switch
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLCTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of an engineered His3Cys zinc binding site in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 76
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1dcaA00
3HLJA 4WW8A 4RUZA 1ZFQA 1TE3X 1UGFA 4KAPA 1HVAA 3CYUA 1FQMA 3FFPX 4N0XB 1JD0A 2GEHA 5SZ2A 2FOQA 1CAJA 4YYTA 1CCSA 1CILA 2CBCA 4YXIA 4YHAA 5CA2A 4LHIA 3V3GB 2WEJA 5SZ3A 7CA2A 5CACA 5JGTB 4IWZA 1CNKA 5E2NA 4QJPA 2HD6A 2HKKA 3B4FA 1ZFKA 1HEBA 3BETA 1RZCA 1CA3A 3U7CA 3K34A 1EOUA 2HL4A 5CLUA 5DSMA 1CVEA 5A25A 3P5LA 1IF6A 1BNMA 3MHLA 3D93A 3DD8A 3IBUA 3P55A 3M1WA 4YX4A 3MHIA 3HS4A 5EHVA 2WEOA 3RYJB 4IDRX 5EKHA 5SZ7A 6CA2A 3IBNA 3S73B 3T82A 4YXOA 3IBIA 4CNXA 3EFTA 5E5RA 1UGDA 1BNVA 3RJ7A 4QSBA 5JQ0A 1CCUA 4R5BA 1G6VA 3TVNX 1CAKA 3KOKA 4QSIA 4BF6A 5FL6A 1CAMA 2NXTA 5FL5A 3S8XA 1CANA 4PYYA 2CABA 3P4VA 4FU5A 3P3HA 3NB5A 3RZ7A 1RZDA 4UOVA 1I8ZA 3HFPA 3D0NA 3DD0A 3FE4A 4JSWA 3P3JA 1CIMA 4KNIA 5FLRA 4QIYA 3VBDA 4E3FA 5J8ZA 1OKMA 4ETQC 2FOVA 1G52A 2WEGA 4RN4A 3ZNCA 2X7SA 1H9QA 2EU2A 3N0NA 2H4NA 5EKJA 3D9ZA 1CAIA 3M3XA 1HEAA 1FSRA 3MYQA 1KEQA 4WL4A 1CNCA 1TTMA 4KUVA 5FLSA 4FVOA 3U47A 1G1DA 1G4OA 2FMGA 2IT4A 1AZMA 4CNVA 4Z1JA 3DVBA 4YGFA 5AMLA 3V3FA 3TMJA 3DV7A 3OYQA 3LXEA 1CRAA 1TH9A 1IF5A 2FW4A 4KNMA 4Q90A 5JG3B 1JCZA 1Z93A 3RZ8A 4Q8YA 1CNWA 2EZ7A 3N2PA 5E2MA 1CNHA 5BYIA 1I90A 5DSKA 3D8WA 2FNKA 3T83A 4Q0LA 4ZWZA 1Z97A 3S9TA 4MLXA 3HKUA 1RJ6A 4Q6EA 5DRSA 3MHMA 3RYYA 1I9NA 1I9QA 5FNKA 2OSMA 5IPZA 1LUGA 2NWOA 2CBDA 3MNAA 3M2XA 3OIMA 1ZSCA 3JXHC 4ITPA 1XEGA 3U45X 3MNJA 5BRUA 4G0CA 3S77B 1TEUX 4K0SA 3SAPA 5JEHB 4KNJA 4LU3A 1RZAA 5FLQA 2AX2A 4HEZA 4DZ7A 1JV0A 3MNIA 4ILXA 4XE1A 1A42A 3V2JA 1LGDA 5JGSB 3RYVB 1BNQA 4ZAOA 1HECA 5FL4A 4QSJA 1UGGA 3KNEA 5FNIA 3NJ9A 3S97A 1IF8A 1G0FA 3S75B 4FVNA 4XZ5A 1XQ0A 3RG4A 2GD8A 5FNMA 2QO8A 3M67A 1HEDA 1UGCA 2Q1QA 3DVCA 4Q7PA 3BL1A 4WW6A 2Q38A 4LP6A 4RUYA 4Z1KA 2FNMA 4RIUA 4CACA 1G3ZA 3F7UA 4JSSA 3MDZA 4HEWA 4L5UA 4E3DA 1KOQA 4Q8ZA 1BNTA 3DC3A 4ZWXA 4Q8XA 4Q87A 2POWA 4M2WA 2NXSA 5DVXA 4E3GA 4ZWIA 3T85A 3KLDB 3MMFA 1G53A 4QK2A 4MDGA 5DSNA 3KKXA 1FQLA 3V7XA 4HT0A 1UGAA 3PJJA 3R16A 1CVDA 3M1JA 1LZVA 3OY0A 4KP5A 4QJWA 2NNOA 3W6HA 1BNUA 4E9OX 3S71B 1HCAA 5SZ5A 3M5SA 2NWYA 3S78B 1G48A 4QK3A 2NNGA 3DVDA 2NN7A 1CNGA 1ZH9A 5E2KA 5EIJA 1Y7WA 1CNIA 3N4BA 4QY3A 5FLTA 4Q08A 3S76A 3KONA 4XIWA 1CINA 1G46A 5HPJA 4FL7A 4FPTA 1DCBA 5FNLA 4M2UA 4N16A 1YO0A 1BN4A 2NMXA 4QJMA 4Q78A 3F4XA 4BF1A 4Q07A 1TEQX 1G54A 3MHCA 2POUA 3ML5A 2WEHA 3OYSA 3OIKA 4WR7A 1ZNCA 1G4JA 3M04A 4E3HA 3RLDA 4Q7WA 3DAZA 1IF4A 1MOOA 1CVFA 5G0BA 1H9NA 1YDDA 5EH7A 4HEYA 4Q06A 1FR7A 3P5AA 4Q09A 1HCBA 12CAA 5EH8A 1V9EA 5DSRA 4ZX1A 4DZ9A 4WUPA 4Q81A 2WD3A 3JXFA 5BRWA 4C3TA 3RYZA 4CNWA 2VVBX 2VVAX 1G0EA 5DSIA 5LMDA 4ZWYA 4Y0JA 3S72B 4KUYA 1RAYA 3UYQA 3KOIA 3IGPA 3JXGA 4XIXA 4CQ0A 5E5UA 1TB0X 1CNXA 3R17B 3N3JA 1TG9A 3MZCA 1CVHA 4R5AA 3HKQA 4YXUA 1CNBA 2HNCA 4L5WA 2O4ZA 4Q99A 3S74B 4QJOA 1DMYA 4Q7VA 8CA2A 4WUQA 5E2RA 5E28A 3P44A 1KOPA 3T5UA 4MTYA 5JG5B 3ML2A 1YDBA 3CA2A 1G45A 2ILIA 4K0ZA 4K1QA 2OSFA 1ZE8A 3L14A 4KUWA 5DSQA 4QEFA 4Z1NA 1FSQA 4FIKA 3DBUA 4RUXA 1CNJA 4RFDA 3M2YA 5C8IA 1DMXA 2HFWA 4TWLA 5G01A 4MDLA 3T5ZA 2Q1BA 4CNRA 1J9WA 1KWRA 3CZVA 4PQ7A 1FSNA 3RZ1B 4PZHA 3HKTA 3DCCA 3TVOX 4GL1X 4MLTA 3RG3A 4YGJA 1RAZA 1YO1A 4TWMA 4Q49A 2NXRA 4QJ0A 4Q6DA 1XPZA 1FQNA 3V3IB 4QIZA 3V3HB 1BV3A 4PYXA 3M40A 4G7AA 3IEOA 4X5SA 4YGKA 4E49A 4RIVA 2H15A 3DCWA 3P58A 1RZBA 5FDIA 5SZ6A 1MUAA 1XEVA 4ITOA 4CA2A 3OILA 2FNNA 1CVAA 5SZ4A 4Z1EA 1ZSAA 1FQRA 1CCTA 4JSZA 3FW3A 3D92A 5DSPA 3M5EA 4RH2A 1ZGEA 1ZSBA 3M96A 1URTA 3RGEA 3V5GA 4YGLA 4MO8A 1CVBA 1BICA 1THKA 3K7KA 5CJFA 1BCDA 1CAOA 3M14A 3MNKA 5EHWA 5JEPB 5G03A 2EU3A 2ABEA 3DCSA 2NNSA 2ZNCA 4HF3A 2CBEA 1YO2A 2QOAA 1H4NA 3UYNA 1BZMA 3W6IA 1IF7A 3MHOA 1Z9YA 2CBBA 3M5TA 5DOGA 4Z0QA 3IBLA 5E2SA 3OKVA 4M2VA 5DOHA 1HUGA 2CA2A 1CVCA 1OKNA 4MDMA 5EHEA 3KWAA 5EZTX 5FLOA 5AMDA 5DSOA 4YVYA 3NI5A 4COQA 1BNWA 5JESB 1CZMA 5FNJA 3V3JA 2F14A 1HUHA 1AM6A 1I9MA 5SZ0A 1LG6A 1YDCA 3K2FA 4KP8A 1BN3A 1BNNA 1RZEA 4KV0A 3T84A 5A6HA 1UGBA 5EOIA 5JQTA 1I91A 3C7PA 1V9IC 1ZGFA 3EFIA 2NWPA 1TG3A 4E5QA 2POVA 2FOUA 1IF9A 1FR4A 3DA2A 3RZ5A 2NN1A 1YDAA 4K0TA 2X7TA 4ZX0A 3M1QA 3SBIA 3F8EA 4K13A 4R59A 3U3AX 9CA2A 4L5VA 5G0CA 2NNVA 4YWPA 3SBHA 4E4AA 3PYKA 1RJ5A 5DSJA 5SZ1A 4QSAA 1AVNA 2FOSA 3CAJA 5FLPA 1I9PA 3BL0A 3M98A 1CAHA 2CBAA 3DC9A 3PO6A 4BCWA 5EH5A 5FDCA 1TBTX 3M1KA 4YGNA 2HOCA 5JEGB 1F2WA 3MWOA 5BNLA 4Q83A 5EKMA 1CALA 5L6KA 3IAIA 5L3OA 4Q9YA 4FRCA 1CRMA 3HKNA 4Q7SA 5AMGA 1I9LA 5BRVA 3M2ZA 1DCAA 4M2RA 2WD2A 3RZ0B 4XFWA 2FOYA 1LG5A 1CAYA 3GZ0A 1KWQA 4HBAA 1FLJA 5FNHA 3Q31A 5FNGA 3RYXB 4JSAA 1T9NA 1CAZA 4KNNA 3MNHA 2NWZA 5JDVB 5DSLA 4QK1A 3SAXA 3ZP9A 1UGEA 2W2JA 4RFCA 1BN1A 1CA2A 1OKLA 3V2MA 2X7UA 4HU1A 4PXXA 3F7BA 4QTLA 3QYKA 3OKUA 1OQ5A 3M2NA 2QP6A 3KS3A 4JS6A 2AW1A 3KIGA 3B1BA 4QJXA 4HT2A 1CNYA 2FMZA 1I9OA 3MNUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HLJ A;  4WW8 A;  4RUZ A;  1ZFQ A;  1TE3 X;  1UGF A;  4KAP A;  1HVA A;  3CYU A;  1FQM A;  3FFP X;  4N0X B;  1JD0 A;  2GEH A;  5SZ2 A;  2FOQ A;  1CAJ A;  4YYT A;  1CCS A;  1CIL A;  2CBC A;  4YXI A;  4YHA A;  5CA2 A;  4LHI A;  3V3G B;  2WEJ A;  5SZ3 A;  7CA2 A;  5CAC A;  5JGT B;  4IWZ A;  1CNK A;  5E2N A;  4QJP A;  2HD6 A;  2HKK A;  3B4F A;  1ZFK A;  1HEB A;  3BET A;  1RZC A;  1CA3 A;  3U7C A;  3K34 A;  1EOU A;  2HL4 A;  5CLU A;  5DSM A;  1CVE A;  5A25 A;  3P5L A;  1IF6 A;  1BNM A;  3MHL A;  3D93 A;  3DD8 A;  3IBU A;  3P55 A;  3M1W A;  4YX4 A;  3MHI A;  3HS4 A;  5EHV A;  2WEO A;  3RYJ B;  4IDR X;  5EKH A;  5SZ7 A;  6CA2 A;  3IBN A;  3S73 B;  3T82 A;  4YXO A;  3IBI A;  4CNX A;  3EFT A;  5E5R A;  1UGD A;  1BNV A;  3RJ7 A;  4QSB A;  5JQ0 A;  1CCU A;  4R5B A;  1G6V A;  3TVN X;  1CAK A;  3KOK A;  4QSI A;  4BF6 A;  5FL6 A;  1CAM A;  2NXT A;  5FL5 A;  3S8X A;  1CAN A;  4PYY A;  2CAB A;  3P4V A;  4FU5 A;  3P3H A;  3NB5 A;  3RZ7 A;  1RZD A;  4UOV A;  1I8Z A;  3HFP A;  3D0N A;  3DD0 A;  3FE4 A;  4JSW A; 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