1FR7A

X-ray crystal structure of zinc-bound f93s/f95l/w97m carbonic anhydrase (caii) variant
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQSHLHMGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural influence of hydrophobic core residues on metal binding and specificity in carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1fr7A00
4K13A 4XIWA 1TEUX 1ZSAA 3OKVA 5EKHA 5DRSA 4Z1KA 3MWOA 5SZ7A 1UGDA 3D92A 4QSJA 5JQ0A 3D9ZA 4Z1NA 4G7AA 2W2JA 3NB5A 4KNMA 4Q7VA 1RZBA 2EU3A 3RJ7A 1CRAA 3Q31A 5FL4A 5LMDA 3B1BA 1IF5A 3S76A 1RJ6A 5DVXA 4FL7A 3M04A 4Q7SA 5DSNA 5SZ0A 4QIYA 1CVHA 3M40A 3P3JA 2NNSA 5BNLA 1JD0A 3M2YA 3M98A 4ILXA 3IAIA 3S97A 4LHIA 4QSAA 3IBLA 3N4BA 1FQRA 2QO8A 3K34A 5FNLA 4CNRA 3DVCA 3BL1A 1CAKA 4Q81A 3RZ5A 4KNJA 4HF3A 1HEDA 1RZAA 3F7UA 3FFPX 2NXRA 4E3FA 2ABEA 1G54A 3MHLA 1IF9A 4DZ9A 3SBIA 1CVDA 3DCWA 3V5GA 3P55A 1LG6A 1MUAA 4Y0JA 5CJFA 4K1QA 3R16A 4RN4A 1I91A 1G4JA 1UGCA 1CINA 5L6KA 3MHIA 5E2SA 2CBCA 3MNIA 4E3DA 4IWZA 2NNOA 4Q8ZA 4YGNA 1I9QA 5J8ZA 1CVAA 5E2NA 3V7XA 1CRMA 3BETA 3HKNA 4FU5A 1I9PA 4Q7WA 3S75B 2H4NA 2WEOA 1IF4A 4HEYA 3UYNA 5DSIA 3V2JA 3RZ8A 3JXFA 5EHWA 1CAJA 2AX2A 4TWLA 3MNAA 5FLQA 2WEHA 3T85A 3F8EA 3L14A 4K0ZA 3DBUA 5E2KA 3P5LA 2NMXA 3K7KA 5SZ1A 5G0BA 3M2NA 1CNXA 1ZH9A 1F2WA 3DA2A 3DCCA 2CA2A 4HT2A 4RFDA 5E2MA 3LXEA 3M1WA 4Q99A 4QY3A 4E3HA 4HBAA 1BN3A 3RYJB 1G4OA 2FNNA 3RG4A 8CA2A 5FDIA 3M96A 1BZMA 4QSBA 1CAIA 3SAXA 3UYQA 1HCAA 5AMGA 5JQTA 3P5AA 4TWMA 1CA2A 4JSAA 5E5UA 1BICA 4E5QA 3KONA 1HECA 4MDLA 3OIMA 4LU3A 1I9NA 4YXOA 2NWZA 5DSQA 5SZ2A 1RJ5A 5FL5A 1CIMA 3P3HA 4M2RA 4C3TA 5JGSB 1KWRA 3T84A 3M2ZA 3FW3A 4QK1A 3RYYA 4CA2A 4MLTA 3V3HB 3S73B 5BRVA 3B4FA 1UGGA 5DSLA 3PYKA 2HL4A 3GZ0A 1BV3A 1G3ZA 3DD0A 4KAPA 5A25A 5FNKA 3MDZA 2CBEA 4G0CA 5JDVB 1BCDA 1CANA 1YO1A 1CNKA 1RZDA 4QJPA 3TVNX 1FQLA 1TG9A 3M14A 3HKTA 5EH8A 1IF8A 3EFTA 5FNHA 1Z9YA 1BNQA 1UGEA 4FRCA 5BYIA 1Y7WA 1FQMA 1YO2A 2NN1A 1G53A 6CA2A 1THKA 2NN7A 4M2UA 3HFPA 5E2RA 2GEHA 3S72B 4K0SA 1AZMA 2Q38A 5JEHB 5DSRA 1IF6A 3OILA 1CVFA 5EKMA 3SBHA 3TMJA 5A6HA 3T5ZA 5SZ6A 1H4NA 3MHMA 3SAPA 3RLDA 4CACA 1BNNA 3C7PA 2QP6A 5EHVA 3N0NA 1UGBA 5DSMA 3QYKA 3MYQA 4E9OX 3DC3A 4RUXA 2HFWA 4QJXA 1BNMA 5FLTA 4M2VA 2FW4A 1BN1A 3U7CA 1BNTA 5IPZA 4MLXA 4DZ7A 4PXXA 2AW1A 4MO8A 4YGFA 4ZWYA 3P58A 2POUA 1ZSBA 2F14A 4L5WA 1TBTX 3KOKA 1G1DA 7CA2A 1G45A 5C8IA 5L3OA 3RYVB 3DV7A 3W6IA 4CNXA 4Q6DA 4YHAA 3D93A 3HKQA 4HU1A 3CYUA 1CA3A 3DAZA 1DMYA 5CLUA 1KOQA 1FSNA 3KKXA 3D0NA 3DVDA 4XIXA 1YDAA 4ITOA 1KEQA 5AMDA 5BRUA 4Q09A 3M2XA 4BF6A 3RZ1B 1BNWA 1G46A 1XEGA 3M1QA 1TH9A 1XEVA 1MOOA 1ZNCA 4BCWA 1LUGA 2Q1BA 3K2FA 4KUVA 1OKLA 3U47A 4KNIA 4QJOA 3V3IB 4UOVA 5SZ5A 3IBIA 1CNYA 5FLPA 2GD8A 2IT4A 2NNVA 2X7SA 1FR4A 1JCZA 4HEZA 4QEFA 1CAZA 1OKNA 4ZAOA 4Z1JA 5E28A 4YGKA 2POVA 1I90A 4Q87A 4PYXA 4Q06A 1RZEA 5FDCA 3N3JA 3M67A 4Q0LA 4KUYA 4RH2A 4XZ5A 4PYYA 3PJJA 4RUZA 5EH7A 4ZWZA 3CA2A 5EH5A 3N2PA 4E49A 2NWOA 1TTMA 4CNVA 1CVEA 5FNJA 3MNJA 3MZCA 5DSOA 1H9NA 5JEPB 1CCUA 4HEWA 1AVNA 3M5SA 4BF1A 4X5SA 3RGEA 1RZCA 1YDCA 1G6VA 4CNWA 3V3FA 1ZGFA 3HLJA 4QTLA 1H9QA 1J9WA 4Q49A 1UGFA 1V9EA 5HPJA 3NJ9A 3R17B 4XE1A 1KWQA 2HD6A 4E3GA 1YDDA 4L5UA 4FPTA 4ZX1A 1ZFQA 2QOAA 4FVNA 3RYXB 3ZP9A 4KP8A 2FNMA 2FNKA 3KWAA 4RFCA 1TEQX 3NI5A 3TVOX 3M5EA 1Z93A 3S74B 2HOCA 4QJMA 5DOGA 1I8ZA 1G0EA 2NWPA 2FOSA 1FLJA 4YVYA 4Z0QA 4E4AA 3W6HA 5DSJA 1LZVA 3T82A 4Q83A 1CNHA 2WEGA 1A42A 1AM6A 3KLDB 3RG3A 3KIGA 5EZTX 2NNGA 5JEGB 3PO6A 3IBUA 3OKUA 3BL0A 1HUHA 4K0TA 4PZHA 4WW8A 3ZNCA 3DD8A 2FOUA 1HVAA 3KNEA 3S8XA 3U3AX 1CCSA 1CAOA 5JG5B 1CNWA 2HKKA 1CZMA 5DOHA 4KUWA 3EFIA 4FVOA 2WD2A 4ZWIA 3RZ0B 3F4XA 3KOIA 4RUYA 3RYZA 9CA2A 1I9OA 3DCSA 1OQ5A 3IBNA 4FIKA 5EKJA 4ITPA 3OIKA 1V9IC 1CVBA 1OKMA 1CALA 5E5RA 1CNGA 2O4ZA 3M1JA 5FL6A 2VVBX 4R5BA 2CABA 1EOUA 2NWYA 3U45X 4M2WA 1HEAA 1G52A 1BNUA 1IF7A 4JSSA 4KNNA 5DSKA 2X7UA 1FR7A 1HEBA 3V2MA 3D8WA 2FOVA 2FMZA 4Q78A 3KS3A 1LG5A 3S71B 4YXIA 1I9MA 1HCBA 5DSPA 3MHOA 3ML2A 2FOYA 2EU2A 3MNHA 2Q1QA 1I9LA 5BRWA 4QIZA 5JG3B 1RAZA 1FSRA 3V3JA 4N16A 1FQNA 4XFWA 12CAA 4WL4A 3MMFA 4MDGA 2POWA 3DC9A 3T83A 1XPZA 3FE4A 3JXHC 4WUPA 5G03A 2CBAA 4QSIA 3MHCA 3OYSA 2FMGA 4R59A 2CBDA 3MNKA 4COQA 4JSWA 4ETQC 2ILIA 3IGPA 1UGAA 2NXSA 2X7TA 4PQ7A 1G0FA 3M3XA 2WD3A 1CAMA 1TB0X 5EHEA 5FLSA 4QK2A 4WW6A 4Q9YA 4R5AA 5FLOA 1CNCA 2HNCA 4RIVA 1G48A 1XQ0A 1CVCA 4N0XB 4CQ0A 4ZWXA 1LGDA 4QK3A 5SZ4A 3M5TA 1BNVA 5SZ3A 4IDRX 3CZVA 3S77B 4Q08A 3IEOA 3JXGA 4ZX0A 3V3GB 1DCBA 1JV0A 4YWPA 3T5UA 3S78B 4Q7PA 2CBBA 3ML5A 1TE3X 5EOIA 5JGTB 3OY0A 1CCTA 3CAJA 4Q8XA 4Z1EA 2H15A 3DVBA 4HT0A 4YYTA 4YGLA 5CACA 1Z97A 2VVAX 1TG3A 4WUQA 1CNJA 2EZ7A 1CILA 3VBDA 1KOPA 5G01A 3M1KA 4RIUA 4Q8YA 1CAHA 3F7BA 4YGJA 4JS6A 5JESB 1BN4A 4MDMA 5FLRA 5EIJA 4QJWA 5FNIA 3P4VA 4KV0A 4L5VA 4KP5A 3HKUA 1CNBA 1CNIA 1FSQA 1ZSCA 2ZNCA 5G0CA 1HUGA 2NXTA 2WEJA 4YX4A 5AMLA 4JSZA 5FNMA 1T9NA 2OSMA 5CA2A 1ZGEA 2OSFA 1ZFKA 4LP6A 4YXUA 1DCAA 1YO0A 4QJ0A 3P44A 1RAYA 1CAYA 1URTA 3S9TA 4Q90A 1DMXA 1ZE8A 2FOQA 4MTYA 3HS4A 3MNUA 5FNGA 4GL1X 3OYQA 3RZ7A 4Q6EA 4WR7A 1YDBA 4Q07A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4K13 A;  4XIW A;  1TEU X;  1ZSA A;  3OKV A;  5EKH A;  5DRS A;  4Z1K A;  3MWO A;  5SZ7 A;  1UGD A;  3D92 A;  4QSJ A;  5JQ0 A;  3D9Z A;  4Z1N A;  4G7A A;  2W2J A;  3NB5 A;  4KNM A;  4Q7V A;  1RZB A;  2EU3 A;  3RJ7 A;  1CRA A;  3Q31 A;  5FL4 A;  5LMD A;  3B1B A;  1IF5 A;  3S76 A;  1RJ6 A;  5DVX A;  4FL7 A;  3M04 A;  4Q7S A;  5DSN A;  5SZ0 A;  4QIY A;  1CVH A;  3M40 A;  3P3J A;  2NNS A;  5BNL A;  1JD0 A;  3M2Y A;  3M98 A;  4ILX A;  3IAI A;  3S97 A;  4LHI A;  4QSA A;  3IBL A;  3N4B A;  1FQR A;  2QO8 A;  3K34 A;  5FNL A;  4CNR A;  3DVC A;  3BL1 A;  1CAK A;  4Q81 A;  3RZ5 A;  4KNJ A;  4HF3 A;  1HED A;  1RZA A;  3F7U A;  3FFP X;  2NXR A;  4E3F A;  2ABE A;  1G54 A;  3MHL A;  1IF9 A;  4DZ9 A;  3SBI A;  1CVD A;  3DCW A;  3V5G A;  3P55 A;  1LG6 A;  1MUA A;  4Y0J A;  5CJF A;  4K1Q A;  3R16 A;  4RN4 A;  1I91 A;  1G4J A;  1UGC A;  1CIN A;  5L6K A;  3MHI A;  5E2S A;  2CBC A;  3MNI A;  4E3D A;  4IWZ A;  2NNO A;  4Q8Z A;  4YGN A;  1I9Q A;  5J8Z A;  1CVA A;  5E2N A;  3V7X A;  1CRM A;  3BET A;  3HKN A;  4FU5 A; 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