1G4OA

Carbonic anhydrase ii (f131v) complexed with 4-(aminosulfonyl)-n-phenylmethylbenzamide
Total Genus 74

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDVGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (13-18)3H2 (21-24)AH1 (131-135)TIV3 (25-28)TIV9 (251-254)S1 (32-33)S8 (108-109)TI2 (34-37)EMPTYS2 (39-40)TI4 (41-44)S6 (78-82)S3 (46-50)TVIII1 (75-78)S9 (116-124)TI5 (51-54)S5 (66-70)TIV5 (72-75)S11 (172-175)S4 (56-61)3H5 (164-166)AH3 (220-227)TIV4 (62-65)S7 (88-97)TVIII2 (98-101)TI6 (100-103)TIV6 (105-108)TI'1 (109-112)S12 (191-196)TIV7 (108-111)TVIa1 (200-203)TIV8 (137-140)S13 (207-212)AH2 (158-163)3H4 (155-157)TII1 (169-172)3H6 (181-184)S14 (216-218)TII2 (233-236)TIV2 (18-21)S10 (141-150)3H3 (125-128)TI1 (8-11)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Contribution of Flourine to Protein-ligand Affinity in the Binding of Flouroaromatic Inhibitors to Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1g4oA00
5EH5A 1DCBA 1XEVA 3UYQA 5FNJA 1I9PA 3B4FA 4RFCA 3N2PA 1RZDA 4QSBA 5EOIA 4HU1A 1G46A 4MLTA 1G4JA 3V3FA 3IBUA 2IT4A 3S78B 1TTMA 4FIKA 1FQNA 4FL7A 4Q6EA 4M2WA 4Z0QA 4XIWA 1RZAA 1BICA 5G0CA 5FL6A 2FNKA 2Q38A 1YDBA 3S75B 3NI5A 4YYTA 1BZMA 4YGJA 2NWPA 5SZ1A 5FNMA 3D9ZA 5BNLA 2Q1BA 4BF6A 2VVAX 3SBHA 2X7UA 3KS3A 5E5RA 1DMYA 1H9QA 5DSKA 4QSJA 3K2FA 3R17B 4E5QA 3KOIA 1G0EA 1HEBA 1CANA 4COQA 4JSSA 3P3HA 4K0ZA 1THKA 4K0SA 4E3DA 4CNVA 1CNHA 3D0NA 3MMFA 1FLJA 2NWOA 5EZTX 5EIJA 4FPTA 4JSAA 1TBTX 4ZWXA 1FSNA 3MHLA 3M5SA 2FMGA 4KUVA 5AMGA 1ZH9A 4Z1NA 4QK3A 1BNTA 1TEUX 3FE4A 2GEHA 4Y0JA 3D93A 4HBAA 4XFWA 4Q09A 1YDDA 4QK1A 1G45A 5DVXA 2X7SA 2H15A 1YDCA 1UGGA 2FOVA 1AVNA 4Q0LA 3P3JA 4WUPA 1ZSBA 3T83A 3P5AA 3M1WA 4ZWIA 1CRAA 1CVBA 2VVBX 1RJ5A 4Z1JA 5JGSB 4Q81A 3TVNX 2CBAA 1AM6A 4HEZA 3FFPX 5JEPB 3KIGA 3TVOX 4KNIA 1IF5A 3DV7A 5DSRA 3KLDB 3M98A 4JSZA 4IDRX 1Z93A 4QEFA 1UGFA 3F7UA 2CA2A 3M67A 4LP6A 3BL0A 3S8XA 4E3FA 3P5LA 3C7PA 1CNYA 4JS6A 4BF1A 2EU2A 2CBEA 3MDZA 3U7CA 5JDVB 1CAKA 3DD0A 4ITPA 3N3JA 2HD6A 4MDMA 1BNNA 1FSQA 1UGDA 3PJJA 5DSOA 4XZ5A 4KP5A 1URTA 4ZX1A 3EFTA 5DSJA 4QJPA 1CA2A 4YGFA 5FLQA 3P58A 3TMJA 2HOCA 3OKVA 3JXHC 4E49A 1CNCA 3M1QA 1F2WA 1I9NA 4Q7WA 1CZMA 1OQ5A 5FLOA 3P4VA 1KWQA 4Q06A 1XPZA 3Q31A 2FW4A 1ZFQA 5BRVA 4KNJA 3RYVB 3DCWA 3SAXA 4R59A 4HEYA 1CINA 3DC3A 4YXUA 4YWPA 1UGCA 4YX4A 2WEHA 5G0BA 1G3ZA 4Q8XA 2NWYA 4HEWA 3RZ1B 1BNVA 1EOUA 2NWZA 4G0CA 4UOVA 5CACA 4YGKA 1RZEA 3V3IB 1CNBA 1OKMA 1UGEA 5FL4A 3MNJA 3ZP9A 4GL1X 3CYUA 1CNWA 4Q7PA 4ZX0A 1CVEA 3OYQA 4LHIA 3ML2A 2NXRA 5EHVA 4E9OX 3SAPA 3MYQA 1TEQX 3DCCA 2O4ZA 4Q7VA 1CAIA 1I8ZA 3IAIA 5HPJA 3RZ7A 2EU3A 1CRMA 2QO8A 5JEHB 3KKXA 4CNXA 4CNWA 1CVDA 5E2MA 3DBUA 3RYJB 5JG3B 3BETA 4M2VA 4Q99A 4WUQA 5DSNA 3OYSA 3S72B 4Z1EA 1BNWA 4XE1A 4CA2A 5SZ2A 2QOAA 4K0TA 3DVDA 1CNIA 3T85A 5LMDA 4X5SA 2CBCA 4MLXA 3RZ0B 3S74B 5A6HA 3M40A 2WD3A 2NN1A 1ZSAA 3P44A 3DD8A 1FR7A 1I9QA 2HNCA 2NXTA 4QSIA 2OSMA 3M2XA 3V7XA 1G6VA 1Z97A 1BN3A 3KONA 5BRWA 4KP8A 1AZMA 1G48A 4RUYA 5DSMA 1KOPA 3NJ9A 3M2NA 4ILXA 4QIYA 3V2MA 4YGLA 3V3GB 5CJFA 4PQ7A 2W2JA 3R16A 1HUGA 1IF4A 3M2YA 1V9EA 1JD0A 4HF3A 1I9MA 4QTLA 1MUAA 1KEQA 3B1BA 3CZVA 5CA2A 3DC9A 3MZCA 2FOSA 3D92A 5E28A 3S77B 3RGEA 3HKTA 4Q90A 5E2RA 1CAYA 3M5TA 4QIZA 3K7KA 3OILA 5E2NA 3U3AX 1CALA 1LGDA 3JXFA 4HT0A 1DCAA 3T82A 1G52A 4E3HA 1OKNA 1FQMA 2POVA 1FQLA 5DRSA 3FW3A 2POUA 1ZGFA 4MDLA 4N0XB 1ZE8A 1RZCA 3HKQA 4FVOA 5A25A 2Q1QA 4KNNA 4Q83A 1OKLA 5BYIA 2ZNCA 4RUXA 2FNMA 1A42A 4QJWA 4WR7A 5FLPA 1BCDA 3RYXB 2HL4A 1H4NA 2WEGA 4WW6A 1FSRA 5AMLA 4RIUA 5FNLA 3M14A 1BV3A 2QP6A 3DA2A 4ITOA 4IWZA 4KV0A 4Q8ZA 1CVFA 1CIMA 4FRCA 5E2SA 2WD2A 3PYKA 1ZFKA 4Q6DA 5JQTA 3S97A 3RG3A 3HKNA 4ZWYA 2ABEA 3S73B 4JSWA 4ETQC 1H9NA 3M5EA 2X7TA 3MNKA 1G4OA 5G03A 4PYYA 1Y7WA 3HS4A 3D8WA 1CAOA 1HEAA 5J8ZA 9CA2A 1TB0X 1CCSA 3M1JA 5E2KA 3W6HA 3CA2A 3M2ZA 5SZ7A 1FQRA 4YXOA 1KWRA 3LXEA 3DVBA 3T84A 4Q9YA 12CAA 2NNSA 7CA2A 1DMXA 5EKMA 1IF7A 3MHOA 4RN4A 5SZ0A 1ZNCA 5JEGB 3F4XA 3KWAA 3N4BA 1CAJA 1LG6A 4FU5A 3F8EA 1CAHA 4QJOA 4FVNA 2AW1A 5FL5A 2F14A 5DSQA 4QK2A 3CAJA 3V2JA 2HFWA 1CVCA 5DSIA 4E3GA 4YGNA 3OIKA 3W6IA 1TG3A 1XEGA 5C8IA 4M2UA 1HECA 1BNMA 4CNRA 2ILIA 3MNIA 2H4NA 5FDCA 3DCSA 4LU3A 4CQ0A 4RH2A 1IF8A 4RFDA 5EHWA 1CNXA 1FR4A 1YO0A 4K13A 5EH7A 2NXSA 3KOKA 4L5VA 3OY0A 1TE3X 3OIMA 4PXXA 3S71B 4TWLA 2EZ7A 2WEOA 1J9WA 4CACA 3IEOA 5L3OA 2OSFA 4Q49A 3V5GA 5FLRA 4MTYA 3GZ0A 1CA3A 1G0FA 4PZHA 1V9IC 2NN7A 3S76A 4K1QA 1JCZA 3DVCA 4L5UA 3M04A 5BRUA 5EHEA 4MDGA 3P55A 4QJMA 2NMXA 3RYYA 4L5WA 5FDIA 1I9LA 1G54A 1HUHA 3K34A 4BCWA 5CLUA 3RZ5A 4Q08A 2NNGA 3V3HB 2FOUA 1CILA 5DSPA 2FOYA 1CNKA 3OKUA 2CABA 3RZ8A 2CBDA 4DZ9A 5EKHA 1T9NA 5FNGA 3L14A 3KNEA 4YXIA 5EH8A 5FNHA 1I91A 1ZGEA 3NB5A 3PO6A 4RUZA 1UGAA 3MNHA 4HT2A 1HCAA 1HEDA 4KUYA 1CAZA 5JQ0A 3M96A 4E4AA 1IF6A 5FLSA 5E5UA 3VBDA 5SZ4A 4N16A 4RIVA 8CA2A 1G53A 3RLDA 1JV0A 2NNOA 5SZ5A 1G1DA 1HVAA 5DSLA 3HFPA 1IF9A 4R5AA 4Z1KA 4M2RA 1UGBA 2WEJA 4Q07A 1YO1A 4TWMA 3MHCA 3QYKA 3ZNCA 3N0NA 4MO8A 4R5BA 2HKKA 5DOGA 3F7BA 4WW8A 3IGPA 6CA2A 3M1KA 1RAYA 4Q8YA 2POWA 1YDAA 2GD8A 3MHMA 4KNMA 3T5ZA 1CCTA 3ML5A 3RYZA 4G7AA 1BN4A 1CAMA 2NNVA 4WL4A 2CBBA 3MHIA 1RAZA 5FNIA 5AMDA 5JG5B 4C3TA 4PYXA 2FOQA 5FLTA 3EFIA 3MNUA 3U45X 3M3XA 4QJ0A 5IPZA 3IBIA 3RJ7A 1XQ0A 4Q87A 1TG9A 1CVAA 4Q7SA 5SZ6A 4Q78A 4KAPA 5EKJA 3JXGA 1RZBA 4YHAA 1YO2A 3V3JA 1MOOA 1CNJA 4ZWZA 4QSAA 5G01A 4DZ7A 3UYNA 1BNUA 3MNAA 3HLJA 1CNGA 4QY3A 3BL1A 1BN1A 4XIXA 1RJ6A 1Z9YA 1KOQA 3MWOA 1ZSCA 2FMZA 3SBIA 1CVHA 4ZAOA 3U47A 3S9TA 4KUWA 2AX2A 1LUGA 4YVYA 1I9OA 3IBNA 3T5UA 1BNQA 2FNNA 5L6KA 1HCBA 4QJXA 3RG4A 5JGTB 1CCUA 1I90A 5FNKA 1LG5A 5SZ3A 1TH9A 1LZVA 5JESB 3IBLA 5DOHA 3HKUA 3DAZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5EH5 A;  1DCB A;  1XEV A;  3UYQ A;  5FNJ A;  1I9P A;  3B4F A;  4RFC A;  3N2P A;  1RZD A;  4QSB A;  5EOI A;  4HU1 A;  1G46 A;  4MLT A;  1G4J A;  3V3F A;  3IBU A;  2IT4 A;  3S78 B;  1TTM A;  4FIK A;  1FQN A;  4FL7 A;  4Q6E A;  4M2W A;  4Z0Q A;  4XIW A;  1RZA A;  1BIC A;  5G0C A;  5FL6 A;  2FNK A;  2Q38 A;  1YDB A;  3S75 B;  3NI5 A;  4YYT A;  1BZM A;  4YGJ A;  2NWP A;  5SZ1 A;  5FNM A;  3D9Z A;  5BNL A;  2Q1B A;  4BF6 A;  2VVA X;  3SBH A;  2X7U A;  3KS3 A;  5E5R A;  1DMY A;  1H9Q A;  5DSK A;  4QSJ A;  3K2F A;  3R17 B;  4E5Q A;  3KOI A;  1G0E A;  1HEB A;  1CAN A;  4COQ A;  4JSS A;  3P3H A;  4K0Z A;  1THK A;  4K0S A;  4E3D A;  4CNV A;  1CNH A;  3D0N A;  3MMF A;  1FLJ A;  2NWO A;  5EZT X;  5EIJ A;  4FPT A;  4JSA A;  1TBT X;  4ZWX A;  1FSN A;  3MHL A;  3M5S A;  2FMG A;  4KUV A;  5AMG A;  1ZH9 A;  4Z1N A;  4QK3 A;  1BNT A;  1TEU X;  3FE4 A;  2GEH A;  4Y0J A;  3D93 A;  4HBA A;  4XFW A;  4Q09 A;  1YDD A;  4QK1 A;  1G45 A;  5DVX A;  2X7S A;  2H15 A;  1YDC A;  1UGG A;  2FOV A;  1AVN A;  4Q0L A;  3P3J A; 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