1G52A

Carbonic anhydrase ii complexed with 4-(aminosulfonyl)-n-[(2,3-difluorophenyl)methyl]-benzamide
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Contribution of Fluorine to Protein-Ligand Affinity in the Binding of Fluoroaromatic Inhibitors to Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1g52A00
1H4NA 2AW1A 1A42A 3IGPA 3DCWA 2VVAX 4R5AA 1DCAA 5FLSA 5E2KA 3CA2A 3S78B 4Q7PA 5CJFA 3RZ7A 3N4BA 5SZ4A 1CA2A 1EOUA 1G3ZA 1IF9A 1HEAA 1V9IC 3F7UA 2NNVA 5SZ5A 4M2WA 4MTYA 4K1QA 2CBAA 1TBTX 3PYKA 1RAYA 3M2XA 5DSKA 4MDGA 1JCZA 1AVNA 1FQNA 5FNHA 1YO2A 2HD6A 3TMJA 3C7PA 1LG6A 4Q81A 5FNKA 5CA2A 3OIKA 4LP6A 3EFTA 1ZFQA 3MNAA 4QSJA 5BRWA 2OSMA 1I9LA 3LXEA 1MUAA 2X7TA 3DD0A 3RG4A 4DZ7A 1G1DA 2POWA 3MMFA 5JESB 4XFWA 4QIYA 4YXOA 3P44A 1UGDA 4ZAOA 1FR4A 3DVDA 5C8IA 3ML2A 1CINA 4QJOA 4KUYA 2QO8A 1CIMA 3HKTA 3ZNCA 5FLPA 1G0FA 4ITPA 4Q78A 1CALA 3DVCA 3S75B 4QEFA 5DSLA 4HEYA 1FQLA 1UGCA 1DMYA 4ZX1A 5DSNA 4N0XB 3OIMA 4QJMA 4Q7WA 4PYYA 1Z93A 1ZSAA 2HL4A 5JQ0A 1RZDA 3N3JA 3UYQA 4IDRX 4WW6A 5IPZA 3K34A 5JDVB 5DOGA 1I9PA 1TG9A 3S9TA 3OYSA 4CACA 4FU5A 5CACA 3OKUA 3V3IB 2FNNA 5L6KA 1XQ0A 3NJ9A 2WD2A 3F4XA 1CAZA 1V9EA 3M98A 3KONA 4Q7VA 1KWQA 3KOKA 3B1BA 3CYUA 4R5BA 4CNRA 1CNIA 1CVCA 4Q7SA 3W6IA 3RG3A 4CQ0A 1I9OA 3S72B 3S76A 1CNYA 5SZ6A 7CA2A 1HUGA 5E5RA 4CNVA 1IF8A 4WR7A 4YYTA 1FLJA 2HOCA 3DC9A 3D0NA 3KLDB 4FPTA 4ZWIA 3DCSA 1BN1A 3V2MA 5EHWA 3RLDA 3RYYA 2FOVA 1KOPA 4E4AA 2Q38A 1MOOA 4HBAA 3P5AA 2NNOA 1BCDA 1THKA 1CILA 1RZBA 1ZFKA 4HU1A 3KS3A 4Q07A 4Q9YA 4COQA 5FNLA 3M40A 5EH5A 4RIUA 1ZGEA 3RGEA 2QOAA 1IF6A 1ZNCA 3JXGA 4KAPA 3HKNA 2NNSA 4QK1A 4M2UA 3IBUA 3D93A 4Q09A 1TG3A 1CNHA 1OQ5A 1UGAA 4M2VA 4E3GA 3ML5A 5G03A 5LMDA 3JXFA 5E5UA 1OKMA 4RUZA 1CZMA 1KOQA 3JXHC 3MNJA 1DCBA 3OILA 2NWZA 1CAOA 2NNGA 4PQ7A 5E2NA 4IWZA 3P55A 5EOIA 3T83A 2ABEA 4QIZA 4Q99A 3DA2A 4KP5A 4WUQA 3NI5A 4WUPA 4MLTA 2OSFA 3Q31A 5EHVA 1RZCA 4K0SA 5A6HA 1G46A 2NN7A 4QTLA 3M1QA 3RZ1B 1BN3A 4YGJA 5FDIA 1TEUX 3OKVA 4XE1A 5EHEA 3SBIA 3RZ5A 1FR7A 4HEZA 4X5SA 3M1JA 3M96A 5FLRA 4PZHA 3M67A 4Z1NA 1FSQA 3FFPX 3P4VA 1UGFA 2H15A 4UOVA 5JEGB 4YGFA 5FLTA 5BRVA 4Y0JA 2WEJA 3K2FA 5EKMA 1ZSBA 3U47A 4M2RA 5G0BA 2FNKA 1CAYA 4HT2A 4KUWA 3RZ8A 5DSIA 3T5ZA 1CVHA 4K0ZA 5FL6A 3T82A 3HFPA 2EU2A 3MHIA 3EFIA 1YDAA 4ITOA 5J8ZA 3SAPA 4MO8A 4HEWA 3D8WA 5AMGA 5SZ0A 4K0TA 4E3DA 1CAHA 2HKKA 2NXRA 4LHIA 1RZAA 1UGBA 5DSJA 2HFWA 4KV0A 1KWRA 3ZP9A 3RZ0B 1XEGA 5SZ1A 1AM6A 1I9QA 3HS4A 3KKXA 3M14A 1CAKA 5L3OA 1G4JA 3N2PA 3B4FA 3KOIA 1CANA 2CA2A 2CBBA 4Z1JA 3RYXB 3V5GA 3HKQA 6CA2A 4BCWA 4Q8ZA 4Q8YA 2WEGA 4TWMA 5JEHB 4YXIA 3MNHA 1CNKA 1JD0A 3U45X 3S97A 1LUGA 1TH9A 3V2JA 3KWAA 3M2YA 4RUXA 1CCTA 2Q1BA 2NMXA 3M3XA 1G0EA 4JS6A 4GL1X 4WW8A 4QJWA 5FLOA 4RN4A 5SZ7A 3BL0A 1CA3A 5EKHA 5FNJA 4R59A 3IEOA 4Q6EA 2CBDA 4CNXA 3M04A 1CVBA 1IF5A 4QY3A 4Q49A 4L5UA 3T5UA 3M2ZA 1BICA 2NWPA 4TWLA 3M5SA 2CABA 3S77B 2ZNCA 3DC3A 1CAMA 3M5EA 1CVFA 5FNIA 5SZ2A 2NWOA 1ZE8A 1CRMA 4KUVA 4BF1A 5BNLA 4N16A 5JG3B 1UGEA 1OKLA 5EKJA 1BN4A 2FNMA 4Z1EA 1G52A 4FVNA 4RH2A 2FOUA 4E3FA 1CVEA 4RFCA 5E28A 1KEQA 5G0CA 4ZWXA 2X7UA 4Q6DA 3MNKA 1CAJA 4Q06A 1UGGA 4WL4A 5DSRA 2WEOA 3RJ7A 2NXSA 1IF4A 4JSSA 4RIVA 3KIGA 4ZX0A 1I9MA 3IBLA 4QSIA 5JQTA 1YDDA 4XIXA 1T9NA 1CAIA 1HECA 2FMGA 3QYKA 2EZ7A 4QJXA 3IBNA 2CBCA 3M1WA 4YVYA 5BYIA 3DBUA 4YXUA 1G54A 3D92A 3V7XA 3TVNX 4PXXA 4QJPA 4FVOA 2FW4A 1I91A 4JSAA 5FNMA 3F7BA 5A25A 4Z1KA 4RUYA 3K7KA 1I8ZA 8CA2A 3S8XA 1HCAA 4E5QA 2FOYA 2X7SA 1H9QA 3SBHA 5AMDA 2FOQA 5JEPB 3VBDA 2Q1QA 5FL4A 5DOHA 3U7CA 5AMLA 4YX4A 3MYQA 4ZWZA 3BETA 3F8EA 3M1KA 4KNNA 4CNWA 4E9OX 2WEHA 3DVBA 2QP6A 3DAZA 2EU3A 3W6HA 3MZCA 5CLUA 5E2SA 1URTA 2WD3A 4QSBA 5DVXA 3P3JA 1HEBA 5EZTX 4YGLA 1Z97A 3OY0A 4HT0A 1BNVA 4CA2A 1TEQX 3R16A 5FL5A 1F2WA 4L5WA 1RZEA 1CNWA 3MHCA 1CNJA 3RYVB 2H4NA 1XEVA 4E49A 4KNMA 3RYZA 5DSQA 1LG5A 1AZMA 3MDZA 4FIKA 4G7AA 2NN1A 4MDLA 1YO1A 1XPZA 1CVAA 2GEHA 5G01A 3V3JA 4QJ0A 3V3GB 4HF3A 1CNGA 3M2NA 3NB5A 4YGNA 3V3FA 4Z0QA 2ILIA 3S73B 1I90A 5JGTB 3PJJA 3PO6A 1TB0X 3MNUA 4YHAA 5DSMA 2VVBX 4QK2A 4FL7A 1BV3A 3DV7A 4BF6A 1RAZA 5EIJA 3RYJB 3FE4A 3TVOX 3S74B 5SZ3A 3MHOA 1ZH9A 3MHLA 5EH7A 4XIWA 4ZWYA 2IT4A 1OKNA 4YWPA 2W2JA 4LU3A 4Q87A 3HLJA 1BNWA 1CNXA 1CCSA 3GZ0A 4MLXA 1YDBA 2F14A 2O4ZA 4ILXA 1BNUA 1H9NA 4Q8XA 5EH8A 5HPJA 1TTMA 3CAJA 1BNNA 1YO0A 3BL1A 1CCUA 3DD8A 3DCCA 3V3HB 3IBIA 3FW3A 4E3HA 4KNJA 5E2RA 3SAXA 5FDCA 2NXTA 4Q90A 3MHMA 3T84A 3UYNA 4RFDA 4XZ5A 1FSNA 4KP8A 12CAA 2POVA 5DSPA 3T85A 5BRUA 3U3AX 2NWYA 5E2MA 1ZSCA 4Q08A 5DSOA 4Q0LA 4MDMA 4Q83A 5FNGA 1G48A 1G53A 5JG5B 1YDCA 4JSWA 1RJ6A 4ETQC 3HKUA 3KNEA 2CBEA 1G6VA 3MNIA 5DRSA 1FSRA 1Y7WA 1Z9YA 2GD8A 1CNCA 1J9WA 1HEDA 1LZVA 1RJ5A 3M5TA 3MWOA 2POUA 3OYQA 9CA2A 4PYXA 3D9ZA 1CRAA 2HNCA 1HVAA 1HCBA 3P58A 1BNMA 4G0CA 1CNBA 5JGSB 4L5VA 1IF7A 3CZVA 3N0NA 4C3TA 4QSAA 4QK3A 5FLQA 1FQMA 3IAIA 1TE3X 1I9NA 2FMZA 1G4OA 1JV0A 1BZMA 2FOSA 1CVDA 3P3HA 1BNQA 1LGDA 3S71B 3P5LA 1HUHA 4JSZA 3L14A 4KNIA 4DZ9A 1FQRA 2AX2A 4YGKA 4K13A 1DMXA 1G45A 4FRCA 1ZGFA 3R17B 1BNTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1H4N A;  2AW1 A;  1A42 A;  3IGP A;  3DCW A;  2VVA X;  4R5A A;  1DCA A;  5FLS A;  5E2K A;  3CA2 A;  3S78 B;  4Q7P A;  5CJF A;  3RZ7 A;  3N4B A;  5SZ4 A;  1CA2 A;  1EOU A;  1G3Z A;  1IF9 A;  1HEA A;  1V9I C;  3F7U A;  2NNV A;  5SZ5 A;  4M2W A;  4MTY A;  4K1Q A;  2CBA A;  1TBT X;  3PYK A;  1RAY A;  3M2X A;  5DSK A;  4MDG A;  1JCZ A;  1AVN A;  1FQN A;  5FNH A;  1YO2 A;  2HD6 A;  3TMJ A;  3C7P A;  1LG6 A;  4Q81 A;  5FNK A;  5CA2 A;  3OIK A;  4LP6 A;  3EFT A;  1ZFQ A;  3MNA A;  4QSJ A;  5BRW A;  2OSM A;  1I9L A;  3LXE A;  1MUA A;  2X7T A;  3DD0 A;  3RG4 A;  4DZ7 A;  1G1D A;  2POW A;  3MMF A;  5JES B;  4XFW A;  4QIY A;  4YXO A;  3P44 A;  1UGD A;  4ZAO A;  1FR4 A;  3DVD A;  5C8I A;  3ML2 A;  1CIN A;  4QJO A;  4KUY A;  2QO8 A;  1CIM A;  3HKT A;  3ZNC A;  5FLP A;  1G0F A;  4ITP A;  4Q78 A;  1CAL A;  3DVC A;  3S75 B;  4QEF A;  5DSL A;  4HEY A;  1FQL A;  1UGC A;  1DMY A;  4ZX1 A;  5DSN A;  4N0X B;  3OIM A;  4QJM A;  4Q7W A;  4PYY A;  1Z93 A;  1ZSA A;  2HL4 A;  5JQ0 A;  1RZD A;  3N3J A;  3UYQ A;  4IDR X; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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