1G53A

Carbonic anhydrase ii complexed with 4-(aminosulfonyl)-n-[(2,6-difluorophenyl)methyl]-benzamide
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Contribution of Flourine to Protein-ligand Affinity in the Binding of Flouroaromatic Inhibitors to Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1g53A00
1YDBA 1IF4A 2F14A 5EHEA 5G03A 3MHMA 2NWZA 1CVBA 3RYYA 2IT4A 2CBCA 1G46A 1DMYA 4Q81A 1KOPA 4FL7A 5EH8A 1Y7WA 3P3HA 3BL0A 4XZ5A 1G48A 4KUYA 1I9OA 2VVBX 4Q08A 4KNMA 1KEQA 1ZGEA 5JEHB 4QSIA 5JGSB 3RYJB 1H4NA 5EHWA 1G0FA 4ZX0A 4DZ7A 2ZNCA 4K1QA 3S72B 5CLUA 1FSRA 5FLOA 1G4JA 3HLJA 4Q49A 3U3AX 4E3GA 1CAKA 1XQ0A 2HL4A 4QIZA 5EKMA 5FLPA 1IF7A 2HNCA 3DCSA 1I9NA 3DV7A 4QY3A 3S71B 3IBLA 4M2UA 1ZSAA 4FIKA 1LGDA 3KKXA 3RJ7A 3CZVA 5JQ0A 5CA2A 4WR7A 3F8EA 2HD6A 3SBIA 4M2VA 1HCAA 1V9EA 4KUWA 5FL4A 1TBTX 3OKVA 4Z1JA 3RZ0B 3ML5A 2FOQA 3P5AA 4Q07A 1TTMA 3MDZA 3V3JA 3OIMA 5LMDA 1CAYA 3KS3A 4MDLA 1FQNA 5G0CA 3D8WA 1CVCA 1FQMA 4GL1X 4WW8A 1CAJA 1FQLA 3CA2A 4Q09A 3U47A 4JSAA 1ZE8A 4KNJA 9CA2A 3T84A 4E3HA 2WEHA 4ZWIA 4K13A 4IWZA 1CA3A 3NB5A 3C7PA 3P58A 5L6KA 1G45A 3DVBA 3M04A 3D92A 4YWPA 3IGPA 1CNWA 4HU1A 4HT0A 4L5WA 12CAA 4Z1EA 5FNKA 1OKNA 4QSJA 4Z1KA 4E3FA 6CA2A 1AM6A 4YGLA 2NWYA 3KOKA 3S78B 1G1DA 3RYXB 8CA2A 3IBUA 4Q87A 1UGEA 4Q06A 4RIVA 2FW4A 3VBDA 1XEVA 2EU3A 2NN1A 2EZ7A 3FFPX 2FNKA 3Q31A 1URTA 2FOVA 3EFIA 1I9LA 4LHIA 2FNMA 3RG4A 3M1WA 1AVNA 4QJPA 5EKHA 4C3TA 5CACA 2CABA 5JGTB 3DC3A 1I9PA 5E2NA 1HEBA 1CA2A 4G0CA 5SZ4A 5E2RA 5EIJA 4XIXA 4E4AA 5SZ6A 1RZCA 1CIMA 4BCWA 4YXUA 3RGEA 3TVOX 2WEOA 4KNNA 4XIWA 3S97A 3IAIA 5FNJA 1CALA 4MLTA 5E2KA 5EH5A 1HEAA 1HUGA 4MTYA 4K0SA 4E5QA 5EH7A 5FDCA 5SZ2A 3PJJA 4RUYA 3N0NA 3KNEA 4ZWXA 1BICA 3B4FA 1YDAA 5A6HA 7CA2A 1FSQA 1CILA 1CZMA 4Q7SA 1YO1A 3QYKA 4COQA 3BETA 1BN3A 1TEQX 4YGFA 3D93A 5FNGA 1TE3X 4CA2A 2HFWA 5DSLA 2WEGA 3RZ7A 2CBBA 3JXGA 5E2SA 3T83A 5DSQA 1KWRA 2POUA 3V3IB 5JG3B 2NXTA 4ETQC 1G4OA 3IEOA 4YXOA 1CAHA 1HECA 2FNNA 5DSPA 5JEPB 5G0BA 4YGNA 1XEGA 4QJMA 5E2MA 3MZCA 5FLQA 4YGJA 3MYQA 2OSFA 5FDIA 3M5SA 2QOAA 3W6IA 3MHIA 1Z97A 2FOUA 1I9MA 2POVA 3HKUA 4ITOA 4Q8ZA 4E3DA 5FNLA 3S8XA 2NWOA 1TG3A 4WUPA 4Z1NA 5BYIA 1HUHA 3MNHA 3RYZA 3TMJA 5FL6A 3M1KA 5EKJA 3NJ9A 3P44A 3PYKA 5AMDA 1CNCA 1HVAA 3D9ZA 1CCUA 3EFTA 3HFPA 5AMLA 3M5EA 5DSOA 1YDCA 4Q0LA 4CQ0A 3MNUA 1CAIA 5BRWA 3V7XA 3OYSA 3CYUA 1I91A 1JCZA 1TEUX 4YX4A 1CNBA 4X5SA 4R5BA 3FE4A 4K0ZA 4M2RA 1UGDA 1G52A 1KOQA 1RAZA 3K7KA 4QJWA 1RJ6A 3P3JA 4L5VA 4YXIA 4FRCA 5DRSA 4XFWA 1IF6A 5DSMA 1H9QA 4LU3A 3DBUA 2NN7A 4CNVA 1CNGA 4RH2A 4XE1A 3PO6A 1THKA 1RZDA 3T5ZA 1OKLA 3DVDA 4Q83A 4JSZA 3M40A 3L14A 3MNIA 3KIGA 2CBDA 3DC9A 4RIUA 3DVCA 3M2ZA 4QIYA 2NXRA 1ZH9A 1AZMA 5IPZA 3V2JA 3N4BA 4PYYA 5DSNA 4KP5A 5FNMA 5SZ7A 3TVNX 4BF1A 5FLRA 4Y0JA 5BNLA 1ZSBA 2Q1QA 3DD0A 3MNAA 3U7CA 4ZAOA 2Q1BA 2NMXA 3K34A 3MMFA 4YVYA 3RLDA 4JS6A 1CNIA 1YO2A 1UGGA 2CBAA 3JXFA 3P5LA 5DSIA 1CVEA 2QO8A 5E5RA 1RJ5A 1RZAA 5JQTA 2NXSA 3ZP9A 3D0NA 1UGFA 5A25A 1YDDA 5FLTA 4PQ7A 3N3JA 5FLSA 1FLJA 1DMXA 1I8ZA 3DCWA 5SZ3A 3B1BA 5G01A 4DZ9A 4FU5A 2ABEA 4CNWA 4JSSA 4LP6A 2NNVA 2W2JA 1BZMA 1BNMA 2CBEA 2X7UA 1OKMA 5BRVA 2OSMA 3OIKA 3U45X 1H9NA 5FNIA 2NNSA 2NNOA 3V3FA 1BNVA 3OILA 4Q9YA 3JXHC 1CINA 1J9WA 3ZNCA 4RFDA 5CJFA 1BN1A 5DOHA 5JESB 1IF5A 5L3OA 4KP8A 5E28A 2CA2A 4Q6DA 4WUQA 2H4NA 2FMZA 4R59A 5JEGB 3NI5A 1XPZA 3GZ0A 3LXEA 1CNHA 2H15A 4MO8A 4Q7PA 1CVAA 3SAXA 4TWMA 4YGKA 3W6HA 2NNGA 3T85A 3ML2A 4K0TA 5SZ5A 3M1JA 3S73B 2FMGA 1LZVA 1CVDA 4MDMA 4QJ0A 2ILIA 3SAPA 4PZHA 1JV0A 4RUXA 3RYVB 4QK2A 5DVXA 1FSNA 2X7SA 3N2PA 3M67A 3FW3A 1BCDA 2X7TA 4RN4A 1TB0X 3R16A 3UYQA 4QSBA 5SZ0A 1RZBA 4PXXA 1ZFKA 1G3ZA 4JSWA 5DSRA 4CNXA 3M3XA 1FQRA 3MNJA 2GEHA 4HF3A 3KONA 2AX2A 5FL5A 2Q38A 4PYXA 1EOUA 2FOYA 4QK3A 5AMGA 4FPTA 3V5GA 3T5UA 2GD8A 1I9QA 1I90A 1MOOA 1LG6A 1UGBA 2EU2A 3F7UA 2NWPA 2POWA 5E5UA 1CNXA 5HPJA 2QP6A 4Q6EA 5EZTX 3V3HB 4WW6A 1CNKA 1ZNCA 1BNWA 3CAJA 3RZ1B 3RZ5A 1TG9A 1A42A 1BNTA 4Q90A 3HS4A 2VVAX 4QJOA 1MUAA 1FR7A 3S77B 3S75B 3R17B 4ZWZA 3T82A 3HKNA 4KV0A 1CANA 5BRUA 5DOGA 1CVHA 1OQ5A 1CNJA 4UOVA 4Z0QA 3F4XA 3BL1A 3KWAA 4QJXA 4WL4A 3V2MA 1LG5A 1JD0A 1UGAA 2O4ZA 3DD8A 4Q8XA 1G0EA 5DSKA 1CCTA 4KUVA 5JG5B 3MWOA 3MNKA 4HBAA 3M96A 5C8IA 4RFCA 3HKQA 4Q78A 3OKUA 4IDRX 4HT2A 1FR4A 1UGCA 5DSJA 4ILXA 3DA2A 3M5TA 3KLDB 4QEFA 1G53A 3IBNA 4M2WA 4FVOA 3S9TA 1BNUA 4QTLA 4MLXA 3F7BA 4RUZA 1RAYA 1IF8A 1T9NA 3DCCA 1DCAA 2AW1A 1ZSCA 3MHLA 4Q8YA 1CCSA 5EHVA 4CNRA 1G6VA 1BN4A 3M98A 3V3GB 1DCBA 1CNYA 1CRAA 3RZ8A 3IBIA 3P55A 3P4VA 4L5UA 5EOIA 3OYQA 3M1QA 4MDGA 1CAOA 3M14A 1LUGA 4TWLA 1V9IC 4FVNA 4Q99A 1ZFQA 3SBHA 3K2FA 4BF6A 4Q7VA 3S74B 1TH9A 2WD3A 2HKKA 1RZEA 5JDVB 4YYTA 2WEJA 1CAZA 4KAPA 4ZWYA 4N16A 1KWQA 1BNNA 4ITPA 3M2XA 1IF9A 4E9OX 3MHCA 3MHOA 1CVFA 3KOIA 4R5AA 4HEWA 3UYNA 1CAMA 4HEYA 5SZ1A 3DAZA 3M2YA 4KNIA 4ZX1A 4HEZA 3S76A 1F2WA 1HEDA 1BV3A 1Z9YA 3M2NA 4YHAA 1HCBA 4Q7WA 1CRMA 3HKTA 4E49A 2HOCA 2WD2A 5J8ZA 1G54A 2FOSA 3OY0A 3RG3A 1BNQA 1ZGFA 1Z93A 4N0XB 4QK1A 5FNHA 4G7AA 4QSAA 1YO0A 4CACA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YDB A;  1IF4 A;  2F14 A;  5EHE A;  5G03 A;  3MHM A;  2NWZ A;  1CVB A;  3RYY A;  2IT4 A;  2CBC A;  1G46 A;  1DMY A;  4Q81 A;  1KOP A;  4FL7 A;  5EH8 A;  1Y7W A;  3P3H A;  3BL0 A;  4XZ5 A;  1G48 A;  4KUY A;  1I9O A;  2VVB X;  4Q08 A;  4KNM A;  1KEQ A;  1ZGE A;  5JEH B;  4QSI A;  5JGS B;  3RYJ B;  1H4N A;  5EHW A;  1G0F A;  4ZX0 A;  4DZ7 A;  2ZNC A;  4K1Q A;  3S72 B;  5CLU A;  1FSR A;  5FLO A;  1G4J A;  3HLJ A;  4Q49 A;  3U3A X;  4E3G A;  1CAK A;  1XQ0 A;  2HL4 A;  4QIZ A;  5EKM A;  5FLP A;  1IF7 A;  2HNC A;  3DCS A;  1I9N A;  3DV7 A;  4QY3 A;  3S71 B;  3IBL A;  4M2U A;  1ZSA A;  4FIK A;  1LGD A;  3KKX A;  3RJ7 A;  3CZV A;  5JQ0 A;  5CA2 A;  4WR7 A;  3F8E A;  2HD6 A;  3SBI A;  4M2V A;  1HCA A;  1V9E A;  4KUW A;  5FL4 A;  1TBT X;  3OKV A;  4Z1J A;  3RZ0 B;  3ML5 A;  2FOQ A;  3P5A A;  4Q07 A;  1TTM A;  3MDZ A;  3V3J A;  3OIM A;  5LMD A;  1CAY A;  3KS3 A;  4MDL A;  1FQN A;  5G0C A;  3D8W A;  1CVC A;  1FQM A;  4GL1 X;  4WW8 A;  1CAJ A;  1FQL A;  3CA2 A;  4Q09 A;  3U47 A;  4JSA A;  1ZE8 A;  4KNJ A; 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