1G53A

Carbonic anhydrase ii complexed with 4-(aminosulfonyl)-n-[(2,6-difluorophenyl)methyl]-benzamide
Total Genus 75

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
3H1 (13-18)EMPTY3H2 (21-24)TIV9 (241-244)AH1 (131-135)TIV3 (25-28)TIV10 (251-254)S1 (32-33)S8 (108-109)TI2 (34-37)S2 (39-40)TI4 (41-44)S6 (78-82)S3 (46-50)TVIII1 (75-78)TI5 (51-54)S9 (116-124)S5 (66-70)TIV5 (72-75)S11 (172-175)S4 (56-61)3H5 (164-166)AH3 (220-227)TIV4 (62-65)S7 (88-97)TVIII2 (98-101)TI6 (100-103)TIV6 (105-108)TI'1 (109-112)S12 (191-196)TIV7 (108-111)3H3 (125-128)O1 (128-130)TVIa1 (200-203)TIV8 (137-140)S13 (207-212)AH2 (158-163)TII1 (169-172)3H6 (181-184)S14 (216-218)TIV2 (18-21)S10 (141-150)3H4 (155-157)TII2 (233-236)TI1 (8-11)Updating...
connected with : NaN
publication title Contribution of Flourine to Protein-ligand Affinity in the Binding of Flouroaromatic Inhibitors to Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2000-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1g53A00
2QO8A 3P44A 1LZVA 2NWYA 4ZAOA 1CANA 4YGNA 1V9IC 4N16A 1IF8A 4XFWA 4KUVA 4WUQA 4KNNA 3S73B 1CRAA 5BRVA 4QJWA 5FL6A 1CVHA 1CAKA 3K2FA 1CILA 2WD3A 3NI5A 4CQ0A 4KAPA 4XE1A 5JQTA 5AMGA 3D93A 1HEBA 1H9QA 3M2YA 1I8ZA 3TVNX 4BCWA 5FLPA 2FOQA 4K0TA 1YO2A 3KS3A 5FL5A 2H15A 2CBCA 2FNKA 7CA2A 3IBLA 1KWRA 4QTLA 2OSMA 1Z9YA 3OY0A 4UOVA 1THKA 3IBNA 5G01A 4KP8A 3DBUA 3N4BA 1KOPA 4QIYA 4RFDA 3S74B 1YO1A 2FNNA 4L5VA 1DMXA 5EZTX 5AMLA 3PJJA 3MHCA 4WUPA 4ITOA 3S77B 1G0FA 4G7AA 1T9NA 4ZWYA 5EHWA 6CA2A 2CBDA 4Q06A 4E3GA 3KOKA 1BCDA 2WEHA 3MNAA 3W6HA 4YX4A 5SZ5A 1BNMA 4MO8A 1OKLA 4XZ5A 5G0BA 3F4XA 1DMYA 5DSMA 3DVCA 2X7SA 3OKVA 2FW4A 3HKUA 5JGSB 4KUYA 4ZWXA 3DVBA 3S97A 2IT4A 2FMGA 3U47A 1TE3X 5EKHA 4HBAA 4Q7SA 5FNKA 4MDGA 5FNLA 3VBDA 3KIGA 1ZH9A 1UGFA 3JXFA 1LG6A 4RUYA 4LP6A 3SBHA 2CBAA 5JEHB 4Z1JA 2OSFA 4Q87A 1JV0A 3OIMA 3KLDB 5SZ6A 1JCZA 3BL1A 4ZX0A 2CABA 3DCCA 5FLRA 4E3DA 5E2NA 1CNYA 4L5UA 1XPZA 3OKUA 3V2JA 3NJ9A 4PYYA 2HNCA 4ITPA 4RFCA 3W6IA 1BNTA 4Q83A 4FL7A 1ZGFA 2FOSA 5LMDA 3MDZA 4Q6DA 3FE4A 5DSQA 1HCBA 2POVA 5DSKA 1FSNA 4QIZA 4FRCA 4JSZA 2Q38A 3MNHA 1TH9A 5JDVB 1CAMA 1FR4A 3JXHC 3M40A 5E28A 3KKXA 3IEOA 5DSNA 4Q07A 4QK2A 5E2SA 4M2UA 4JSWA 4Q08A 4KP5A 5E2MA 2CA2A 5AMDA 4MDLA 4E9OX 4QJOA 3RZ7A 1FSRA 3RZ8A 4N0XB 1CNJA 1UGBA 4QEFA 4RH2A 1I9NA 1G48A 1LGDA 4ETQC 2FOUA 3MNJA 4QJMA 2ILIA 3D0NA 1CVFA 4JSSA 3T5ZA 1I9QA 3RYVB 5DRSA 4GL1X 2NNGA 3SBIA 3P3HA 4MLTA 3MHIA 3U7CA 1RJ6A 3M98A 1CAYA 3M1QA 1CZMA 1XQ0A 3M67A 3HFPA 5FNHA 1V9EA 1BNUA 1CVEA 1I9MA 1XEVA 2ZNCA 5DSRA 4IWZA 2NNSA 3DV7A 4TWMA 2WEOA 4FPTA 1HEAA 3RJ7A 4DZ7A 5FLOA 3M5EA 1ZSCA 3DCSA 5G03A 1G1DA 1CNGA 4K0ZA 4Q8XA 3MNKA 4ILXA 4Q8YA 5FL4A 4YXIA 1CRMA 3C7PA 1RAYA 1YO0A 3R17B 1OKMA 4X5SA 8CA2A 1TTMA 3MYQA 3RG4A 3DC9A 4FU5A 1HECA 2FNMA 4YYTA 5SZ1A 1FLJA 3M1KA 3RYZA 5E5UA 1IF4A 5FLQA 3KNEA 3RG3A 3MHLA 3MHOA 4K1QA 5CLUA 1CAIA 1HVAA 5DOHA 3MNIA 4Q7VA 4COQA 3IBIA 4CNWA 4KNMA 1JD0A 3RZ0B 1RZAA 2NXTA 4KUWA 4G0CA 1YDBA 4RIUA 3P4VA 3M1WA 3V2MA 5C8IA 1CAZA 5JQ0A 1FR7A 1BNNA 5FNIA 1G52A 1CVBA 2GEHA 3HLJA 1CIMA 5DOGA 4YVYA 5DSPA 1RJ5A 1TEUX 4Z0QA 3S9TA 2WEGA 5G0CA 3ZP9A 4IDRX 3B1BA 3B4FA 4YGLA 1MUAA 4XIWA 3UYNA 3IGPA 1KWQA 1I9OA 1CNHA 3IAIA 1BICA 5EHVA 5JEPB 1FSQA 1IF9A 1ZGEA 4E5QA 1RAZA 5FLSA 2NMXA 2FOVA 3ML2A 5EKJA 3UYQA 4CNRA 5DSOA 5A25A 1RZBA 3CAJA 4MLXA 2POUA 4PYXA 2CBEA 3D8WA 4Q8ZA 2AX2A 3M3XA 5JG5B 2NN7A 3HKQA 4Q49A 4RUXA 4YGFA 1G53A 1TEQX 1URTA 3M2ZA 9CA2A 4HT0A 4Q78A 5FLTA 3V3GB 4K13A 4YWPA 1FQNA 1HUGA 3GZ0A 5L3OA 1OKNA 5JGTB 1CNBA 3IBUA 4MDMA 4M2RA 4XIXA 5FDIA 1AM6A 3S75B 2HOCA 1BV3A 1CVCA 4Q0LA 2X7TA 4LHIA 5L6KA 3MZCA 4QK3A 1G4OA 4WL4A 4QK1A 3T5UA 12CAA 5EH7A 4Q9YA 1BNQA 4MTYA 3U45X 3V5GA 1HEDA 1A42A 4HT2A 3ML5A 3F8EA 3DA2A 3Q31A 4R5AA 4TWLA 1Z97A 3DVDA 3M96A 3P55A 4WR7A 5DSLA 1RZEA 5SZ3A 3RZ1B 5SZ0A 4CACA 1I9LA 5EHEA 3PO6A 4HEZA 3T82A 5CJFA 3P3JA 4HF3A 3V3IB 3EFTA 1YDDA 4K0SA 5EOIA 4JSAA 3DD0A 1TG9A 1YDCA 3M5SA 2WD2A 3SAPA 3K7KA 3RYJB 5E5RA 1BN1A 1BNVA 1CAOA 3L14A 2QP6A 4BF6A 3S71B 4KNJA 1AVNA 2HL4A 3RLDA 4KV0A 4ZWIA 1H9NA 3M2NA 5JG3B 1UGGA 3TVOX 4Z1NA 5CACA 1CNCA 2FOYA 3OYQA 4JS6A 4R59A 5J8ZA 3S76A 1ZSBA 3N3JA 3P5AA 1RZDA 3JXGA 1CA2A 1TBTX 2NNVA 2AW1A 4BF1A 4YHAA 1CNKA 3R16A 1IF7A 3FW3A 3BL0A 1CVDA 1G0EA 4RN4A 1G3ZA 4HU1A 1G46A 3FFPX 4M2WA 4C3TA 5IPZA 3M14A 4QY3A 1G6VA 1UGCA 4YXUA 2NXSA 4R5BA 1I90A 1CALA 1TB0X 1G54A 5SZ2A 4E3HA 5BYIA 5EH8A 1LUGA 2GD8A 3RYYA 3PYKA 1DCAA 3OIKA 4YGKA 5SZ7A 1IF6A 1ZFQA 1HCAA 1BN3A 1IF5A 2H4NA 1CAJA 2NWZA 3QYKA 1ZNCA 3S72B 1H4NA 3MNUA 2FMZA 1Z93A 2F14A 1XEGA 4Y0JA 2Q1BA 2NWOA 1TG3A 2NN1A 2VVBX 1CCSA 3M5TA 5DVXA 3DD8A 4QJXA 4PZHA 2WEJA 3T84A 3NB5A 5FNMA 1CNXA 1RZCA 5FNJA 3V7XA 3F7UA 3LXEA 5HPJA 3P58A 1I91A 3CA2A 3OILA 3D9ZA 1CCUA 3S8XA 2EU3A 3V3JA 3HKTA 3M2XA 1KOQA 1FQRA 3ZNCA 3DCWA 3MHMA 5DSJA 1BNWA 1UGAA 5EH5A 3V3FA 1CCTA 4LU3A 4Q99A 3M04A 4CNXA 4QSJA 5JEGB 3CYUA 2Q1QA 1J9WA 3N2PA 1BZMA 4WW8A 4YGJA 5FDCA 4Z1KA 5BRUA 3T85A 1ZFKA 3BETA 3OYSA 4YXOA 1ZSAA 4QJPA 4QSBA 2NNOA 1OQ5A 5CA2A 4FVOA 1AZMA 4QSAA 5E2RA 1EOUA 4L5WA 4E49A 5A6HA 2HD6A 3D92A 5SZ4A 3CZVA 3V3HB 4Q7WA 3HS4A 4CNVA 3SAXA 4RIVA 1MOOA 4Z1EA 4ZX1A 4FVNA 3RYXB 3S78B 5BRWA 2CBBA 1ZE8A 1FQMA 5EKMA 2HFWA 3KOIA 1UGEA 1CVAA 5JESB 3M1JA 1CAHA 1CNWA 1F2WA 1BN4A 4Q09A 4Q81A 2NXRA 2POWA 4FIKA 3DAZA 3MMFA 3RZ5A 4RUZA 3N0NA 1G45A 4Q7PA 1KEQA 3DC3A 4HEWA 2ABEA 2EZ7A 4DZ9A 4CA2A 2VVAX 1CA3A 4PXXA 1UGDA 3TMJA 1CINA 4Q6EA 1Y7WA 4WW6A 1YDAA 1I9PA 1LG5A 3EFIA 3KONA 5EIJA 3HKNA 3RGEA 2NWPA 4M2VA 3KWAA 2HKKA 2O4ZA 4KNIA 1CNIA 1HUHA 1FQLA 3T83A 1G4JA 4ZWZA 5BNLA 5DSIA 3F7BA 4HEYA 4QSIA 3K34A 2QOAA 4E3FA 5E2KA 3MWOA 2W2JA 1DCBA 4Q90A 5FNGA 3P5LA 2EU2A 4QJ0A 4E4AA 4PQ7A 3U3AX 2X7UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QO8 A;  3P44 A;  1LZV A;  2NWY A;  4ZAO A;  1CAN A;  4YGN A;  1V9I C;  4N16 A;  1IF8 A;  4XFW A;  4KUV A;  4WUQ A;  4KNN A;  3S73 B;  1CRA A;  5BRV A;  4QJW A;  5FL6 A;  1CVH A;  1CAK A;  3K2F A;  1CIL A;  2WD3 A;  3NI5 A;  4CQ0 A;  4KAP A;  4XE1 A;  5JQT A;  5AMG A;  3D93 A;  1HEB A;  1H9Q A;  3M2Y A;  1I8Z A;  3TVN X;  4BCW A;  5FLP A;  2FOQ A;  4K0T A;  1YO2 A;  3KS3 A;  5FL5 A;  2H15 A;  2CBC A;  2FNK A;  7CA2 A;  3IBL A;  1KWR A;  4QTL A;  2OSM A;  1Z9Y A;  3OY0 A;  4UOV A;  1THK A;  3IBN A;  5G01 A;  4KP8 A;  3DBU A;  3N4B A;  1KOP A;  4QIY A;  4RFD A;  3S74 B;  1YO1 A;  2FNN A;  4L5V A;  1DMX A;  5EZT X;  5AML A;  3PJJ A;  3MHC A;  4WUP A;  4ITO A;  3S77 B;  1G0F A;  4G7A A;  1T9N A;  4ZWY A;  5EHW A;  6CA2 A;  2CBD A;  4Q06 A;  4E3G A;  3KOK A;  1BCD A;  2WEH A;  3MNA A;  3W6H A;  4YX4 A;  5SZ5 A;  1BNM A;  4MO8 A;  1OKL A;  4XZ5 A;  5G0B A;  3F4X A;  1DMY A;  5DSM A;  3DVC A;  2X7S A;  3OKV A;  2FW4 A;  3HKU A;  5JGS B;  4KUY A;  4ZWX A;  3DVB A;  3S97 A;  2IT4 A;  2FMG A;  3U47 A; 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