The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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Knots found |
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sequence length |
256
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structure length |
256
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Chain Sequence |
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Antigen specificity and high affinity binding provided by one single loop of a camel single-domain antibody.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
CARBONIC ANHYDRASE
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| molecule tags |
Lyase/immune system
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| source organism |
Camelus dromedarius
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| total genus |
67
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| structure length |
256
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| sequence length |
256
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| other databases |
 KnotProt 2.0: S +31
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| ec nomenclature |
ec
4.2.1.1: Carbonic anhydrase. |
| pdb deposition date | 2000-11-08 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Carbonic Anhydrase II | Alpha carbonic anhydrase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3RZ7 A; 2NN1 A; 1CIL A; 2ZNC A; 5JGS B; 1CVD A; 3N2P A; 3PYK A; 5EKJ A; 3UYN A; 2POW A; 4MDL A; 1KWR A; 4FIK A; 3KWA A; 1CA3 A; 4JS6 A; 5SZ2 A; 4YHA A; 5DOH A; 3LXE A; 4CA2 A; 1BNV A; 4Z0Q A; 4KUY A; 5DSP A; 5FLQ A; 3EFI A; 5EH8 A; 1JCZ A; 3SBH A; 5DSM A; 1BNM A; 1I9Q A; 2Q38 A; 4Y0J A; 4YXI A; 2CBD A; 4K0T A; 2EU3 A; 4IWZ A; 1Z93 A; 3P4V A; 4CQ0 A; 4Q06 A; 2X7T A; 5SZ6 A; 3S9T A; 8CA2 A; 3CA2 A; 3TVO X; 4BF6 A; 4QSA A; 4E3G A; 2QOA A; 4FL7 A; 4E49 A; 3S73 B; 3DVD A; 1HEA A; 5EIJ A; 1CAI A; 4YYT A; 1TG9 A; 2CAB A; 4UOV A; 4FU5 A; 5JG3 B; 1I9O A; 1IF9 A; 1CVH A; 3IBU A; 4QTL A; 3V2J A; 4YX4 A; 3IGP A; 5DSQ A; 3HKU A; 2ILI A; 5SZ7 A; 2Q1B A; 1OKL A; 4M2U A; 4E4A A; 3M2X A; 4Q8Y A; 4PQ7 A; 3OKU A; 1DMY A; 1KWQ A; 5JEH B; 3EFT A; 1G6V A; 4TWL A; 1ZSC A; 3DC9 A; 4WW8 A; 1ZGF A; 2CBE A; 4PZH A; 5E5R A; 5DSO A; 5HPJ A; 4KAP A; 3DD0 A; 1CNJ A; 2NXR A; 2F14 A; 3RGE A; 3T84 A; 5AMD A; 5DRS A; 3B1B A; 1I9N A; 3MNJ A; 4HBA A; 3SAX A; 1CNH A; 3P58 A; 1LZV A; 4COQ A; 2NNO A; 2VVA X; 1DMX A; 5G0B A; 5DOG A; 1IF5 A; 2NXS A; 3KOI A; 1G45 A; 4E3H A; 3P5A A; 1YDB A; 3CAJ A; 3K2F A; 1CNG A; 1I9P A; 3C7P A; 3RYV B; 3D8W A; 1YO2 A; 4KV0 A; 2FOV A; 1ZFQ A; 4LU3 A; 4N0X B; 3RYX B; 3JXF A; 1H9Q A; 3P44 A; 1CA2 A; 2NMX A; 4JSZ A; 1G1D A; 3U7C A; 2WEJ A; 3MHL A; 5FLT A; 5E28 A; 1LGD A; 4KUW A; 2WEO A; 3NI5 A; 1CAN A; 5E2R A; 3ZNC A; 3VBD A; 5CAC A; 3T5U A; 1YDA A; 4CAC A; 1HCA A; 1IF4 A; 3JXG A; 3S77 B; 1LG6 A; 3S75 B; 4QK3 A; 4PYX A; 5FNG A; 2H15 A; 1JV0 A; 3MWO A; 4RH2 A; 4RN4 A; 3DBU A; 3MZC A; 3NJ9 A; 3S72 B; 4Q99 A; 4HT0 A; 4L5U A; 2CBA A; 5EHW A; 2NNS A; 4YGJ A; 2NWZ A; 1TTM A; 1FSR A; 1CAL A; 4Q90 A; 5FL4 A; 2EZ7 A; 2FNK A; 2FOS A; 2GD8 A; 4GL1 X; 2FMG A; 1FR7 A; 1XQ0 A; 1RAZ A; 3RZ5 A; 5JES B; 2CBB A; 1F2W A; 1G53 A; 5JEG B; 1RAY A; 3P3J A; 4KUV A; 3PO6 A; 3CZV A; 1ZNC A; 2FNM A; 3KIG A; 4QJX A; 1TEU X; 4E3D A; 4ETQ C; 3M67 A; 5FLS A; 5LMD A; 1G48 A; 1BN1 A; 1OQ5 A; 4LHI A; 2HNC A; 2AX2 A; 3OIL A; 2FOU A; 1IF8 A; 3M5T A; 3F4X A; 1OKM A; 2HKK A; 1URT A; 3S78 B; 1G46 A; 1Y7W A; 1BV3 A; 3PJJ A; 1UGE A; 3V7X A; 4R5A A; 3DCS A; 2FNN A; 5FDC A; 1HED A; 3HLJ A; 5AML A; 5G01 A; 3N3J A; 4FRC A; 2WEG A; 4YXO A; 5DSJ A; 1H9N A; 1CAJ A; 3MNU A; 1YDC A; 4ITP A; 4QSJ A; 7CA2 A; 5JQ0 A; 3M40 A; 4E5Q A; 4M2V A; 1G54 A; 1UGG A; 4MDG A; 3T85 A; 5CA2 A; 2POV A; 5JEP B; 4MO8 A; 5SZ0 A; 2NNG A; 4Q7P A; 4KNN A; 3F7B A; 3NB5 A; 1BN4 A; 1FQL A; 5E2K A; 4L5V A; 12CA A; 2QO8 A; 1CVB A; 5FDI A; 3RLD A; 4JSS A; 1TBT X; 3DAZ A; 4RFC A; 3RG3 A; 1TEQ X; 3MMF A; 4QJ0 A; 4ILX A; 1EOU A; 3KOK A; 5JDV B; 3M5S A; 4ZX1 A; 4HT2 A; 5SZ5 A; 4QK2 A; 3N4B A; 3IEO A; 5G0C A; 5JG5 B; 3V3F A; 3M2N A; 3DCW A; 1RZB A; 1TB0 X; 3SBI A; 1IF7 A; 4Q09 A; 1ZSA A; 4Q07 A; 3U47 A; 3V3J A; 4R59 A; 1ZH9 A; 3HKN A; 4K13 A; 5FNM A; 4QK1 A; 4WW6 A; 1HUG A; 1CNC A; 1BZM A; 2WEH A; 4C3T A; 5A25 A; 2NWY A; 3IAI A; 4ZWI A; 1FSN A; 3S97 A; 5CLU A; 3M1J A; 3M3X A; 3D92 A; 3N0N A; 4QJM A; 1KEQ A; 2H4N A; 1I91 A; 4JSA A; 1YO1 A; 4RIU A; 3Q31 A; 2QP6 A; 2W2J A; 3HFP A; 1RZE A; 3V3H B; 3L14 A; 4Q8X A; 1CNY A; 3M1W A; 4RUX A; 1I9M A; 4CNW A; 2Q1Q A; 1AVN A; 3V2M A; 4ZAO A; 3DD8 A; 3MHC A; 3CYU A; 4M2W A; 5FNI A; 1XEG A; 4DZ9 A; 2EU2 A; 1HUH A; 4K0Z A; 1HEC A; 3DCC A; 3BL0 A; 1CIN A; 4Q81 A; 1RZC A; 5EZT X; 1RJ5 A; 4CNV A; 1UGA A; 3MHM A; 3RYJ B; 1THK A; 3TMJ A; 4WR7 A; 3RJ7 A; 3P3H A; 1G0F A; 4XZ5 A; 3M5E A; 2O4Z A; 5EKH A; 1CVF A; 1CNX A; 3M2Y A; 3K7K A; 2FOY A; 4RFD A; 5L6K A; 3QYK A; 3S71 B; 3SAP A; 4E9O X; 1UGC A; 4QJP A; 5DSK A; 1HCB A; 6CA2 A; 1LG5 A; 4YGL A; 5EOI A; 4KP8 A; 4Q08 A; 4XFW A; 4YVY A; 3TVN X; 3V3I B; 1CIM A; 1H4N A; 3MNH A; 1AZM A; 1UGB A; 4MLX A; 3RZ0 B; 4QY3 A; 4Z1E A; 3U3A X; 3OIM A; 1BCD A; 1CAO A; 5DSL A; 1DCA A; 5EH5 A; 5FNJ A; 2NN7 A; 4G0C A; 2OSF A; 3MHI A; 4YWP A; 1FQR A; 2ABE A; 1CCU A; 3HKT A; 3W6I A; 4ZWX A; 5BRV A; 4M2R A; 3RG4 A; 3S8X A; 1I8Z A; 4HEY A; 5DVX A; 5FNH A; 4N16 A; 5A6H A; 2WD3 A; 4Q49 A; 1Z97 A; 3GZ0 A; 1CNB A; 3OIK A; 4Q78 A; 4Q7V A; 4Q6E A; 1G4O A; 1ZGE A; 4IDR X; 4MLT A; 3MNI A; 1I90 A; 3OYS A; 3IBI A; 3BL1 A; 5L3O A; 4Q9Y A; 4QSB A; 1CVA A; 4QJW A; 3ML2 A; 3U45 X; 1JD0 A; 2AW1 A; 5DSR A; 3D0N A; 3KLD B; 4BF1 A; 4Z1N A; 1ZFK A; 5DSN A; 1XEV A; 3W6H A; 1FSQ A; 3DA2 A; 1TE3 X; 1YO0 A; 4MDM A; 1CRM A; 5E2N A; 5SZ4 A; 4FPT A; 4ZWY A; 3P5L A; 4XIW A; 5JGT B; 3DVB A; 1MUA A; 2FOQ A; 5E2S A; 3MYQ A; 3DV7 A; 5EHE A; 3M14 A; 5EHV A; 3FW3 A; 3F7U A; 2HL4 A; 1BNT A; 3RYZ A; 2NXT A; 3M96 A; 1BNW A; 3KS3 A; 1CVE A; 4Q7W A; 5JQT A; 3RZ1 B; 5FLP A; 1A42 A; 1UGF A; 3DC3 A; 3KON A; 4DZ7 A; 5AMG A; 2HFW A; 3FE4 A; 1CCT A; 3B4F A; 3P55 A; 1OKN A; 1V9I C; 4PXX A; 3V5G A; 1CNI A; 1UGD A; 4KNJ A; 4LP6 A; 3DVC A; 2HOC A; 3KKX A; 3KNE A; 4RIV A; 4KP5 A; 5E5U A; 4ZX0 A; 4FVO A; 4K0S A; 4L5W A; 1HEB A; 2VVB X; 2OSM A; 5FLR A; 3M98 A; 5FL6 A; 3R16 A; 3RZ8 A; 1DCB A; 1TG3 A; 3S76 A; 1FQN A; 5FNL A; 1CAH A; 4QJO A; 1BNU A; 1BNN A; 2GEH A; 1KOP A; 2IT4 A; 3T82 A; 1FLJ A; 3ML5 A; 5FL5 A; 3M1K A; 2CBC A; 4RUY A; 5C8I A; 3MDZ A; 2FMZ A; 4Q8Z A; 4KNI A; 1KOQ A; 4QEF A; 1HVA A; 3IBL A; 1RZA A; 3OYQ A; 5FNK A; 1CCS A; 4XIX A; 4Q0L A; 2X7S A; 4QSI A; 4MTY A; 4Q6D A; 4FVN A; 1CAY A; 2NWP A; 1LUG A; 3R17 B; 4Q7S A; 1V9E A; 4HEW A; 1FQM A; 3MHO A; 2CA2 A; 4TWM A; 2HD6 A; 4QIZ A; 1CNK A; 4X5S A; 1CAK A; 1CRA A; 5CJF A; 5BYI A; 3HS4 A; 3T5Z A; 9CA2 A; 2POU A; 5EKM A; 4Z1K A; 3OY0 A; 4CNX A; 5IPZ A; 1YDD A; 4WUQ A; 1RZD A; 4Q87 A; 5J8Z A; 1BIC A; 4G7A A; 3D93 A; 3MNA A; 3ZP9 A; 4ITO A; 3BET A; 4Z1J A; 1I9L A; 4WL4 A; 1XPZ A; 1IF6 A; 1BN3 A; 4CNR A; 3K34 A; 1AM6 A; 1G3Z A; 1CAZ A; 5G03 A; 1MOO A; 4QIY A; 1FR4 A; 2WD2 A; 4HF3 A; 3OKV A; 4YGF A; 1J9W A; 4YGN A; 3FFP X; 3HKQ A; 3S74 B; 1CVC A; 1BNQ A; 5E2M A; 1CZM A; 4BCW A; 5DSI A; 4HEZ A; 4E3F A; 4KNM A; 1CAM A; 5BNL A; 5BRW A; 2FW4 A; 2NNV A; 3F8E A; 1Z9Y A; 2X7U A; 3IBN A; 4R5B A; 1CNW A; 4YGK A; 3M1Q A; 1T9N A; 3T83 A; 4WUP A; 1ZSB A; 1G0E A; 3M04 A; 4PYY A; 5FLO A; 1ZE8 A; 4JSW A; 2NWO A; 4HU1 A; 5EH7 A; 1RJ6 A; 3RYY A; 3V3G B; 1G52 A; 3D9Z A; 4YXU A; 4RUZ A; 3M2Z A; 5BRU A; 3UYQ A; 4K1Q A; 4Q83 A; 4ZWZ A; 3MNK A; 3JXH C; 1G4J A; 5SZ1 A; 4XE1 A; 1TH9 A; 5SZ3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RZ7 A; 2NN1 A; 1CIL A; 2ZNC A; 5JGS B; 1CVD A; 3N2P A; 3PYK A; 5EKJ A; 3UYN A; 2POW A; 4MDL A; 1KWR A; 4FIK A; 3KWA A; 1CA3 A; 4JS6 A; 5SZ2 A; 4YHA A; 5DOH A; 3LXE A; 4CA2 A; 1BNV A; 4Z0Q A; 4KUY A; 5DSP A; 5FLQ A; 3EFI A; 5EH8 A; 1JCZ A; 3SBH A; 5DSM A; 1BNM A; 1I9Q A; 2Q38 A; 4Y0J A; 4YXI A; 2CBD A; 4K0T A; 2EU3 A; 4IWZ A; 1Z93 A; 3P4V A; 4CQ0 A; 4Q06 A; 2X7T A; 5SZ6 A; 3S9T A; 8CA2 A; 3CA2 A; 3TVO X; 4BF6 A; 4QSA A; 4E3G A; 2QOA A; 4FL7 A; 4E49 A; 3S73 B; 3DVD A; 1HEA A; 5EIJ A; 1CAI A; 4YYT A; 1TG9 A; 2CAB A; 4UOV A; 4FU5 A; 5JG3 B; 1I9O A; 1IF9 A; 1CVH A; 3IBU A; 4QTL A; 3V2J A; 4YX4 A; 3IGP A; 5DSQ A; 3HKU A; 2ILI A; 5SZ7 A; 2Q1B A; 1OKL A; 4M2U A; 4E4A A; 3M2X A; 4Q8Y A; 4PQ7 A; 3OKU A; 1DMY A; 1KWQ A; 5JEH B; 3EFT A; 1G6V A; 4TWL A; 1ZSC A; 3DC9 A; 4WW8 A; 1ZGF A; 2CBE A; 4PZH A; 5E5R A; 5DSO A; 5HPJ A; 4KAP A; 3DD0 A; 1CNJ A; 2NXR A; 2F14 A; 3RGE A; 3T84 A; 5AMD A; 5DRS A; 3B1B A; 1I9N A; 3MNJ A; 4HBA A; 3SAX A; 1CNH A; 3P58 A; 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