1HEDA

Structural consequences of hydrophilic amino-acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSATTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural consequences of hydrophilic amino acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1hedA00
3ZP9A 1KOPA 5EH8A 1CZMA 5EHVA 3W6HA 1UGAA 5SZ7A 3MNKA 1BN1A 2IT4A 1I9QA 1BNUA 1I9NA 1F2WA 1ZGEA 1FR7A 4QJMA 3S75B 2HD6A 3M67A 4LU3A 5AMLA 5E5UA 4R59A 1IF5A 1IF7A 3N2PA 4JSZA 3V5GA 4QSJA 3B1BA 2W2JA 4ETQC 1YDBA 2NXRA 5FNGA 5FDIA 5BYIA 4CNRA 4CNVA 1CVFA 5CA2A 2FW4A 4HBAA 3DAZA 1CNXA 1UGEA 3IGPA 1CNGA 2X7UA 1LGDA 4YGKA 3RGEA 4Z0QA 2NN1A 5A6HA 3DCCA 3RYYA 3OKUA 2ABEA 3S9TA 3IBUA 4CNWA 1CNBA 3RZ7A 1OKNA 4KV0A 1G52A 4QJPA 1BNMA 4ITPA 3KNEA 4ZAOA 3PJJA 4HU1A 1G4JA 3P5LA 4YHAA 1G45A 1YDAA 1CA2A 1IF8A 2NNGA 3D9ZA 4JSAA 3M3XA 5AMDA 1G1DA 3V3JA 5SZ5A 1I91A 3OILA 3P3HA 1AM6A 4MLXA 3TVNX 5HPJA 5JQTA 3K2FA 4GL1X 1FR4A 5A25A 1RZCA 3F8EA 3MNIA 5SZ0A 2NWPA 1CNHA 3M40A 4ZWZA 4M2RA 1BN4A 3KIGA 3P5AA 1G48A 3RYVB 3R16A 1CVAA 4CNXA 4RUZA 5DSRA 4XFWA 6CA2A 4ILXA 5L6KA 5SZ6A 3U7CA 1RAYA 4Q78A 3CZVA 3IEOA 3JXFA 4G7AA 3S74B 5DSIA 4L5VA 4QSBA 1CANA 3MNJA 4YXUA 1ZFQA 5JGSB 3CA2A 4PYYA 4WL4A 3M96A 3UYQA 1V9EA 3HKTA 3KLDB 4KNIA 4TWMA 4Q90A 4YWPA 3JXHC 3M04A 3V2JA 3P58A 3V3HB 1G46A 4PXXA 1TH9A 4Q99A 3HLJA 5EH7A 5EKMA 1HEDA 1YO1A 3U3AX 3BETA 3M5EA 1H4NA 4DZ9A 3DD8A 4QJWA 3M2XA 3IBNA 5FLSA 1I9OA 1UGBA 1BNTA 1CVBA 4XIXA 3V3IB 4CACA 1I8ZA 4QJXA 9CA2A 1Z9YA 1I9LA 1CAZA 1DMXA 3RG3A 3RLDA 3ML2A 1CNJA 3S97A 3MHCA 4E3GA 3K7KA 5FNJA 1Z97A 4FPTA 5G0CA 1H9NA 5JEGB 1I9PA 4Q7PA 1TE3X 2AX2A 1THKA 3MYQA 1BN3A 1CNYA 3F7UA 4IDRX 4E9OX 4G0CA 1CAYA 5JDVB 3F4XA 1UGCA 3V3GB 4KAPA 5DSQA 5FNHA 3RG4A 3S76A 5EHEA 5E2RA 2NNVA 5DSOA 3RZ1B 3VBDA 1KEQA 4YGNA 1CINA 4R5AA 1CAMA 4YGLA 3KKXA 3MHMA 1G53A 3KS3A 1KWQA 5EKHA 5SZ4A 1RJ6A 3R17B 4FU5A 4QIYA 3SBHA 3D8WA 3N0NA 3M14A 3OYSA 5EHWA 2X7SA 1CCTA 2CBEA 4WUQA 1HVAA 4KUWA 2CABA 1LZVA 4KNNA 4FL7A 1YO0A 2FMZA 1G3ZA 4RUYA 1URTA 1T9NA 5DVXA 4KNMA 4UOVA 4QY3A 5BRWA 3HFPA 2VVBX 1RZDA 1Z93A 3IAIA 3RZ8A 1J9WA 1Y7WA 4QEFA 3N3JA 2FOUA 4KUYA 4Q87A 3U45X 4KNJA 4RH2A 2FOSA 3RYJB 5DSJA 2GEHA 4KP5A 1DCBA 3OKVA 2EU2A 4QSAA 4E5QA 3DC9A 3DV7A 5DRSA 4LHIA 1G4OA 5FLPA 4Z1JA 3D92A 4COQA 4Q7SA 4Q9YA 4ZX0A 1BNNA 4ITOA 4E4AA 4MLTA 2OSMA 4HF3A 3KWAA 1G54A 4RFCA 3B4FA 3T85A 3OY0A 4RFDA 2NXTA 2FNNA 1RZBA 2ILIA 3V7XA 4QK1A 5JG5B 4C3TA 1A42A 4ZX1A 2FNMA 1OQ5A 4YVYA 1OKLA 3C7PA 3TVOX 2CBCA 4YGFA 5BRUA 1HUGA 4WW8A 4K0SA 1RZEA 1ZFKA 4HT0A 2FMGA 2O4ZA 4WR7A 1CAIA 5DOHA 3RYXB 5IPZA 1G0FA 1KWRA 1CILA 4Q81A 3S77B 2Q1BA 5FLOA 3P4VA 3CYUA 5FNIA 4YXOA 3HKQA 5JQ0A 4Q8YA 2AW1A 3FE4A 4FVOA 4K13A 3M1WA 5DSKA 5J8ZA 3HS4A 1XQ0A 1BZMA 5EZTX 1AZMA 3M2YA 3KOIA 4L5WA 3JXGA 5FL5A 3M2NA 4QK3A 1EOUA 3MNHA 1G6VA 1FLJA 2QO8A 1XEVA 4XIWA 3TMJA 1CAOA 5BRVA 1CVHA 5EH5A 1HEBA 1I9MA 5JEHB 1ZSBA 2NNSA 4FIKA 3PO6A 5FLQA 3K34A 1CRMA 3P3JA 8CA2A 3NI5A 1HUHA 4Y0JA 1ZH9A 3T84A 5FLRA 1IF9A 4Q7WA 3S72B 4CA2A 4R5BA 4RIUA 1BCDA 1V9IC 2POVA 1CNCA 2HOCA 1ZSAA 5E2MA 4QJ0A 4Z1EA 1RZAA 2H15A 1ZNCA 2POUA 3DVCA 5SZ2A 1LUGA 5EOIA 1LG6A 2HKKA 5FL4A 4LP6A 1XEGA 2EU3A 3P44A 3SBIA 1CNKA 3LXEA 4Q7VA 4XE1A 1LG5A 2WEOA 3RYZA 3SAPA 5E5RA 2WD3A 4Q08A 5JGTB 1FQMA 5SZ3A 3ZNCA 3T82A 3IBIA 1HCAA 3RJ7A 1JD0A 4CQ0A 2NMXA 3HKUA 3NB5A 4KUVA 5AMGA 3SAXA 3ML5A 1DMYA 5DSMA 1XPZA 3M2ZA 4N16A 5LMDA 1TB0X 5E2KA 3FW3A 3MHOA 3P55A 5G0BA 5DSLA 3W6IA 4XZ5A 4FVNA 4K0ZA 3QYKA 1CNWA 3DVDA 2HNCA 3S8XA 4FRCA 4M2WA 4MDLA 3T5UA 1IF6A 12CAA 3MZCA 1CVDA 1JCZA 4HEYA 3FFPX 5E2NA 3IBLA 3M1JA 4QK2A 1CRAA 3DC3A 3DVBA 3MNAA 4PQ7A 3U47A 1JV0A 5FLTA 3UYNA 1FSQA 3BL0A 4Q6DA 3MHLA 1UGGA 5G03A 5L3OA 3S71B 2CBAA 3N4BA 4Q8XA 1ZSCA 4HEWA 3M1QA 2QOAA 1CVCA 3OIKA 1YDCA 1H9QA 4RIVA 3GZ0A 2FOQA 5E2SA 4TWLA 1HEAA 3KOKA 1BV3A 1HCBA 4MO8A 2FOVA 4Q09A 2WEGA 2NWYA 5FNMA 3MMFA 1KOQA 3MHIA 4E3HA 4E3DA 1IF4A 1TEUX 1CNIA 1ZGFA 5FDCA 3DCWA 4Q07A 4K0TA 5JEPB 4DZ7A 4N0XB 2NN7A 5DOGA 3T5ZA 1TTMA 1I90A 2NWOA 4RN4A 2WD2A 1CAKA 3T83A 3M1KA 5CLUA 3DD0A 1RAZA 3RZ5A 4YXIA 4Z1NA 2GD8A 4Q06A 1CCSA 2POWA 1CCUA 4PZHA 2NNOA 4ZWIA 5SZ1A 4E49A 2CBDA 1G0EA 4IWZA 4KP8A 5EKJA 3S78B 4Z1KA 5FNLA 2OSFA 5FNKA 3D93A 7CA2A 2H4NA 4HEZA 4QSIA 1BICA 2VVAX 5FL6A 2HFWA 4PYXA 1UGDA 2NWZA 3S73B 2F14A 2X7TA 1TEQX 5EIJA 2CA2A 3L14A 4YX4A 4Q83A 1FQRA 1RJ5A 4E3FA 2Q1QA 2FNKA 3EFTA 4M2VA 3NJ9A 4Q49A 5JESB 1FSRA 4JSWA 3MNUA 1FQLA 2HL4A 5DSPA 4BCWA 5JG3B 4QTLA 3RZ0B 4Q0LA 4M2UA 1HECA 4BF1A 5C8IA 3MDZA 1CAJA 3F7BA 4JS6A 3M98A 1TBTX 3HKNA 5G01A 5BNLA 3D0NA 4K1QA 3M5SA 4QIZA 3DA2A 4Q8ZA 4WUPA 1DCAA 3Q31A 1ZE8A 1CIMA 4L5UA 3V3FA 4QJOA 4YGJA 2CBBA 4MTYA 3DBUA 1YDDA 1BNWA 4JSSA 2FOYA 3KONA 2QP6A 3BL1A 5E28A 3M5TA 2WEJA 1FQNA 3OIMA 1YO2A 1MOOA 4X5SA 2Q38A 2WEHA 1CA3A 1CALA 5DSNA 3OYQA 4WW6A 1TG9A 2EZ7A 3EFIA 1FSNA 1BNQA 4ZWYA 4MDMA 3CAJA 4BF6A 2NXSA 4ZWXA 5CACA 1MUAA 1CAHA 3DCSA 1AVNA 4RUXA 1UGFA 1CVEA 4HT2A 4MDGA 1TG3A 3MWOA 5CJFA 3V2MA 1OKMA 2ZNCA 3PYKA 1BNVA 4YYTA 4Q6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ZP9 A;  1KOP A;  5EH8 A;  1CZM A;  5EHV A;  3W6H A;  1UGA A;  5SZ7 A;  3MNK A;  1BN1 A;  2IT4 A;  1I9Q A;  1BNU A;  1I9N A;  1F2W A;  1ZGE A;  1FR7 A;  4QJM A;  3S75 B;  2HD6 A;  3M67 A;  4LU3 A;  5AML A;  5E5U A;  4R59 A;  1IF5 A;  1IF7 A;  3N2P A;  4JSZ A;  3V5G A;  4QSJ A;  3B1B A;  2W2J A;  4ETQ C;  1YDB A;  2NXR A;  5FNG A;  5FDI A;  5BYI A;  4CNR A;  4CNV A;  1CVF A;  5CA2 A;  2FW4 A;  4HBA A;  3DAZ A;  1CNX A;  1UGE A;  3IGP A;  1CNG A;  2X7U A;  1LGD A;  4YGK A;  3RGE A;  4Z0Q A;  2NN1 A;  5A6H A;  3DCC A;  3RYY A;  3OKU A;  2ABE A;  3S9T A;  3IBU A;  4CNW A;  1CNB A;  3RZ7 A;  1OKN A;  4KV0 A;  1G52 A;  4QJP A;  1BNM A;  4ITP A;  3KNE A;  4ZAO A;  3PJJ A;  4HU1 A;  1G4J A;  3P5L A;  4YHA A;  1G45 A;  1YDA A;  1CA2 A;  1IF8 A;  2NNG A;  3D9Z A;  4JSA A;  3M3X A;  5AMD A;  1G1D A;  3V3J A;  5SZ5 A;  1I91 A;  3OIL A;  3P3H A;  1AM6 A;  4MLX A;  3TVN X;  5HPJ A;  5JQT A;  3K2F A;  4GL1 X;  1FR4 A;  5A25 A;  1RZC A;  3F8E A;  3MNI A;  5SZ0 A;  2NWP A;  1CNH A;  3M40 A;  4ZWZ A;  4M2R A; 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