1HEDA

Structural consequences of hydrophilic amino-acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSATTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural consequences of hydrophilic amino acid substitutions in the hydrophobic pocket of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase(oxo-acid)
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1hedA00
2OSMA 3P3JA 4KNMA 1THKA 3F7UA 4MLTA 4QIYA 4BF6A 3NB5A 4Q83A 5BYIA 4IWZA 4QJMA 4YXIA 3R16A 1I9QA 1CANA 5DSKA 1J9WA 2FOSA 4N0XB 1FLJA 4WUQA 1AM6A 1CVAA 1CVDA 5FNLA 3RYXB 1FSNA 3V5GA 1TE3X 3RZ8A 1BNWA 1BNQA 5G03A 3OILA 1BCDA 2POVA 4L5WA 2FOUA 3KS3A 4KNNA 3DVBA 4KP8A 4E3HA 3V2JA 1ZSCA 5SZ1A 5FDIA 5DSNA 3TVOX 1XPZA 5EZTX 3V2MA 3DA2A 2NWYA 3UYQA 5JDVB 2NXTA 3IBUA 3IGPA 3IBLA 4LP6A 3T5ZA 3U45X 3IBNA 3P5LA 3P5AA 3R17B 4QJ0A 4K1QA 5AMGA 1RZAA 2Q1BA 3OYQA 5EHEA 1CNCA 5SZ0A 4WL4A 1G3ZA 3F7BA 2WEJA 3MNJA 1I9OA 4ZX0A 4MDLA 4HT0A 2NNSA 5JG3B 1IF8A 4XE1A 1FSRA 1CZMA 1YDBA 3N3JA 3PYKA 2EU3A 3RLDA 3DVCA 4HEZA 3K7KA 3M2XA 3P4VA 1URTA 2W2JA 1CAMA 5G0CA 5EIJA 1MUAA 3V3JA 3M1JA 3CZVA 5FNJA 3MHLA 1OKNA 4Q06A 1JV0A 3HKTA 3N4BA 2EZ7A 3M2NA 5DOGA 4E3GA 3D92A 1CVHA 4ZWIA 1I9NA 5FNMA 2HFWA 4MO8A 1LG5A 5DSIA 1TEQX 1I9LA 3K34A 4Q0LA 4Q90A 3D0NA 3MNKA 5JGSB 4Z1KA 2EU2A 3KOIA 4JSZA 3V3FA 1XQ0A 4Q7PA 2FMZA 3MYQA 1F2WA 1BN1A 3S9TA 4MTYA 1Z93A 1G46A 5DSPA 4MLXA 3S78B 1KOPA 5AMDA 3MNHA 5G0BA 4ZX1A 3RG3A 1EOUA 2AW1A 3M98A 3MHMA 1IF6A 5JGTB 1CVEA 3M5EA 3P44A 1G4JA 5SZ2A 3FFPX 1KEQA 1RZDA 1DMXA 1CNWA 3RYJB 5DOHA 5FNHA 12CAA 3JXGA 1MOOA 4L5UA 3P3HA 1H9QA 5CA2A 3N2PA 4Q8ZA 3DVDA 1LGDA 3OKUA 5SZ6A 1UGDA 3PJJA 4Q9YA 1OKMA 5EH8A 1BNMA 2WEHA 4E5QA 1RZEA 1ZNCA 2CABA 4KP5A 3U3AX 1G52A 1UGFA 1ZGFA 4HEWA 1A42A 1FR7A 1CA2A 3FW3A 1DMYA 1AVNA 4QTLA 1ZSAA 5EKJA 3S71B 4E49A 4E3FA 4CNWA 5JQTA 1CAYA 3DCWA 1IF4A 2NNGA 4K0ZA 1I91A 4JSSA 2CA2A 4XIWA 4WW8A 3ZNCA 3U7CA 2NXRA 3S72B 1FR4A 4DZ7A 3DV7A 1V9IC 5C8IA 3V7XA 4TWMA 1CAOA 1BV3A 3EFTA 4M2VA 4HU1A 5SZ5A 1RAZA 5EH5A 1ZE8A 3BETA 3D9ZA 5E2KA 3ML5A 4KUYA 4DZ9A 4ITPA 3T84A 1H4NA 1XEGA 4HEYA 5FLTA 5FL5A 4GL1X 2FMGA 3MMFA 4KUVA 4Q49A 2QOAA 2CBEA 1HEAA 2CBAA 5JESB 1CNXA 4KNJA 5FLRA 1TB0X 5FNGA 3MZCA 1CCTA 4E9OX 3D93A 1CRAA 3M96A 4Z0QA 2CBDA 3DCCA 3OIKA 4Z1NA 4PYXA 7CA2A 4Q81A 2WEGA 4QJWA 1YDAA 5DSJA 2VVAX 5DSLA 3S77B 1OQ5A 2WD3A 4COQA 5EOIA 3KLDB 4Q8XA 4QEFA 1G0FA 3CA2A 1UGCA 5CACA 4ILXA 4Q8YA 4YXUA 3SBHA 5E2NA 4FVNA 3UYNA 1YO2A 3DD0A 3L14A 4CQ0A 2FOYA 5DSMA 3TMJA 1HEBA 3MDZA 6CA2A 1XEVA 1CNYA 3C7PA 3F4XA 4YHAA 5FL4A 2ABEA 4Y0JA 4JSWA 4YGFA 5JG5B 1RZBA 3S97A 4XZ5A 5J8ZA 5SZ7A 3N0NA 3IAIA 4QSAA 1CNKA 1IF7A 5JEPB 3SAXA 1CIMA 5FNIA 4QK3A 4WUPA 4YYTA 3BL0A 1HECA 1YO1A 5IPZA 3DAZA 5LMDA 3MHIA 2GD8A 2NWPA 4PZHA 1CNHA 1RJ5A 1G1DA 2H4NA 1ZFKA 4YVYA 1KWQA 1CILA 3B1BA 5FLPA 1JCZA 4Q87A 1T9NA 3NI5A 4L5VA 1RJ6A 4QSIA 3W6IA 1IF5A 8CA2A 3OIMA 1YDCA 4YGNA 4ZAOA 3V3IB 1G54A 1CAZA 1ZH9A 2NN1A 4Q7SA 1KOQA 3CAJA 5FLOA 1HUGA 4Q78A 4CNRA 3M67A 5HPJA 4WR7A 3ZP9A 1UGGA 1HCBA 1YO0A 2FNMA 3M14A 4ZWXA 1ZGEA 2NMXA 1G45A 4FPTA 4FVOA 3T85A 2NWOA 1TG9A 4Z1EA 5CJFA 3P58A 2Q38A 3KNEA 5EHVA 2FNKA 1CVCA 3MNAA 5FLSA 1AZMA 1CCUA 1BN4A 1UGBA 2NXSA 1LZVA 4CNVA 1Z9YA 3MHCA 1FQLA 3BL1A 1BNTA 3IEOA 4Q7WA 2NNOA 3SAPA 1G4OA 4CA2A 3CYUA 5E5UA 1KWRA 3DD8A 5BRUA 2VVBX 2HOCA 1I9PA 3TVNX 2X7UA 3M1WA 1CAIA 1CNJA 2X7TA 4RIUA 3T5UA 1CVBA 3IBIA 1CAHA 2QP6A 5FNKA 1UGAA 4QY3A 4M2RA 9CA2A 3M40A 4FU5A 1RZCA 4RN4A 4QK2A 1CA3A 1TTMA 3M3XA 2NNVA 3RGEA 3V3HB 3HS4A 1CAKA 4QSBA 1DCBA 4FIKA 3RYZA 5DVXA 3ML2A 3M2ZA 2FNNA 3DC9A 1DCAA 2CBBA 4RH2A 5E5RA 1YDDA 1FQMA 4LU3A 1TEUX 4N16A 3M5SA 2X7SA 4K13A 5SZ4A 4HF3A 4K0TA 4G0CA 4XIXA 2ILIA 3LXEA 1HUHA 4ZWYA 1TH9A 3S74B 4BCWA 4Q07A 1BICA 3S76A 1ZFQA 5FDCA 4Q7VA 2FW4A 3KKXA 4Q6EA 4QJOA 4KV0A 4G7AA 2GEHA 2H15A 5L3OA 3DC3A 1CALA 4Q6DA 3HFPA 4JSAA 4KNIA 5E2MA 4HBAA 3P55A 4RFDA 5E2RA 3RJ7A 3HKUA 1OKLA 2F14A 3RYYA 4CNXA 4E3DA 1BNUA 2NN7A 5E28A 4K0SA 1HEDA 3B4FA 1CRMA 4Q99A 1I8ZA 3KIGA 2FOQA 3RZ7A 4KUWA 4MDMA 3KONA 5EKMA 1CNBA 3HKQA 4ETQC 4ZWZA 4CACA 4LHIA 3KOKA 1CNGA 2HD6A 5BNLA 3OKVA 4QJXA 4KAPA 1LG6A 1G53A 3JXHC 4Q09A 2ZNCA 4UOVA 1BNNA 4QK1A 4FL7A 4JS6A 1H9NA 1HCAA 2WD2A 4QIZA 4YWPA 5EKHA 4IDRX 4RUZA 2AX2A 4QJPA 4XFWA 1CNIA 3W6HA 3T82A 3HKNA 1HVAA 4YX4A 3VBDA 2FOVA 1LUGA 3RG4A 4RFCA 1BNVA 5SZ3A 1TG3A 1V9EA 4YGKA 1I9MA 1FQNA 3D8WA 3Q31A 3F8EA 2WEOA 4M2UA 4FRCA 1CCSA 4Z1JA 2QO8A 1TBTX 1RAYA 2HL4A 5FLQA 5G01A 1BN3A 3GZ0A 4R5AA 1G0EA 5DSQA 3RZ0B 2Q1QA 3JXFA 4WW6A 4E4AA 5BRWA 5JEGB 5L6KA 5DRSA 2NWZA 3MNUA 4R59A 3HLJA 3OYSA 4Q08A 5BRVA 5JEHB 1JD0A 2O4ZA 4PYYA 1BZMA 5EH7A 4RIVA 4PXXA 5DSOA 3EFIA 3RZ1B 3DBUA 3QYKA 4M2WA 3M5TA 5JQ0A 4YGJA 1IF9A 3S73B 5A25A 2HNCA 3M04A 4PQ7A 5DSRA 3M1KA 3DCSA 4X5SA 3SBIA 4BF1A 2OSFA 3MHOA 1FQRA 1FSQA 1G6VA 2IT4A 4TWLA 1CINA 2POWA 2HKKA 5CLUA 4HT2A 3T83A 3U47A 3PO6A 3S75B 3RZ5A 3OY0A 4YGLA 1Y7WA 3M1QA 1CAJA 1Z97A 1UGEA 4YXOA 5FL6A 2POUA 5A6HA 4RUXA 5AMLA 4RUYA 1G48A 3KWAA 4R5BA 5EHWA 3RYVB 3V3GB 4MDGA 3MWOA 3FE4A 1I90A 3NJ9A 4ITOA 3S8XA 4QSJA 4C3TA 1CVFA 3K2FA 3MNIA 2CBCA 3M2YA 1ZSBA 5E2SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2OSM A;  3P3J A;  4KNM A;  1THK A;  3F7U A;  4MLT A;  4QIY A;  4BF6 A;  3NB5 A;  4Q83 A;  5BYI A;  4IWZ A;  4QJM A;  4YXI A;  3R16 A;  1I9Q A;  1CAN A;  5DSK A;  1J9W A;  2FOS A;  4N0X B;  1FLJ A;  4WUQ A;  1AM6 A;  1CVA A;  1CVD A;  5FNL A;  3RYX B;  1FSN A;  3V5G A;  1TE3 X;  3RZ8 A;  1BNW A;  1BNQ A;  5G03 A;  3OIL A;  1BCD A;  2POV A;  4L5W A;  2FOU A;  3KS3 A;  4KNN A;  3DVB A;  4KP8 A;  4E3H A;  3V2J A;  1ZSC A;  5SZ1 A;  5FDI A;  5DSN A;  3TVO X;  1XPZ A;  5EZT X;  3V2M A;  3DA2 A;  2NWY A;  3UYQ A;  5JDV B;  2NXT A;  3IBU A;  3IGP A;  3IBL A;  4LP6 A;  3T5Z A;  3U45 X;  3IBN A;  3P5L A;  3P5A A;  3R17 B;  4QJ0 A;  4K1Q A;  5AMG A;  1RZA A;  2Q1B A;  3OYQ A;  5EHE A;  1CNC A;  5SZ0 A;  4WL4 A;  1G3Z A;  3F7B A;  2WEJ A;  3MNJ A;  1I9O A;  4ZX0 A;  4MDL A;  4HT0 A;  2NNS A;  5JG3 B;  1IF8 A;  4XE1 A;  1FSR A;  1CZM A;  1YDB A;  3N3J A;  3PYK A;  2EU3 A;  3RLD A;  3DVC A;  4HEZ A;  3K7K A;  3M2X A;  3P4V A;  1URT A;  2W2J A;  1CAM A;  5G0C A;  5EIJ A;  1MUA A;  3V3J A;  3M1J A;  3CZV A; 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