1I8ZA

Carbonic anhydrase ii complexed with al-6629 2h-thieno[3,2-e]-1,2-thiazine-6-sulfonamide, 2-(3-methoxyphenyl)-3-(4-morpholinyl)-, 1,1-dioxide
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural aspects of isozyme selectivity in the binding of inhibitors to carbonic anhydrases II and IV.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2001-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1i8zA00
2FMZA 1ZNCA 4YGFA 3UYNA 1G6VA 1ZSAA 4Z0QA 4HT2A 1CVDA 3M2YA 3HS4A 1JD0A 1UGFA 4E9OX 1CA2A 1CVHA 3V7XA 4CACA 2AX2A 2FOQA 3MDZA 1CAHA 4XIXA 3M5EA 5FLOA 4IDRX 4QK1A 3K7KA 5E2MA 4QSAA 3EFIA 4Q99A 4E3HA 4Q8YA 3ML5A 4E49A 2H4NA 4E4AA 3NI5A 5SZ4A 5EOIA 2CABA 1LGDA 2Q1QA 4WR7A 4ZWXA 4FVOA 1CNYA 4R5BA 1KEQA 2CBDA 1I9QA 2FNKA 4LP6A 5DSJA 3KOIA 4LHIA 1CAZA 3IGPA 3F7BA 4N16A 1CALA 2HFWA 5DSKA 3IBNA 1BNWA 3M3XA 2NXSA 4RUXA 3KLDB 1TG9A 5AMGA 5BRWA 4MO8A 4M2VA 3OY0A 5G03A 1G48A 4QJMA 1CANA 1LZVA 5CLUA 4K0ZA 3NJ9A 2QOAA 3P44A 3F4XA 1CNIA 3FFPX 1ZE8A 1IF4A 3P5AA 3U7CA 5G0CA 3SBIA 1CRMA 4Q07A 3CA2A 4Q09A 5BRUA 1OQ5A 5JG5B 1IF6A 3CYUA 3N4BA 4TWLA 1FQRA 3MWOA 4DZ7A 4M2UA 3M40A 5SZ2A 5SZ1A 3RYJB 4IWZA 3S97A 1I9PA 1YO0A 3S77B 4Q7VA 4Y0JA 3V2JA 5SZ7A 3T83A 6CA2A 4M2WA 1TEQX 2NNOA 2VVAX 3RZ5A 3RZ1B 2HNCA 4QK2A 3M67A 2CBBA 1BNVA 2GEHA 2NWOA 3DV7A 1T9NA 3R17B 2ILIA 1ZGFA 4YHAA 3RYZA 3CAJA 3N2PA 1CNHA 1AM6A 3FE4A 1OKNA 1CIMA 1XPZA 3S76A 4K13A 3MYQA 3HFPA 1CAMA 3V3HB 1G53A 3KS3A 4MTYA 1HCBA 3V3JA 1FR4A 4KNIA 5C8IA 4YGJA 3OKUA 5FL4A 3HKNA 1CVFA 3HKTA 4Q81A 1CVAA 3K34A 3M1WA 4FU5A 4UOVA 8CA2A 1CNKA 2IT4A 5DVXA 4Q87A 5JESB 1MOOA 3RGEA 5FLSA 4PXXA 1BV3A 3F7UA 3BL0A 2WD2A 4JSWA 3B4FA 4Q08A 4QIZA 3MNUA 4BCWA 1FLJA 4YXOA 4XE1A 3UYQA 4Q06A 5FNIA 3PO6A 5DRSA 3P5LA 1G1DA 1HECA 3IBUA 4RFCA 4MDMA 2FNMA 4MDGA 4KNJA 5JGTB 3ZP9A 2WEOA 1TE3X 5E2NA 4ZWYA 3HKUA 4QJXA 4HBAA 5JEPB 3S71B 1TEUX 5FLQA 2NWYA 3MHIA 2QP6A 4Q0LA 1UGGA 1CAIA 1OKMA 4QJPA 4ITOA 4L5UA 1G4OA 5BRVA 5JEGB 2WEHA 1LG5A 1DCAA 1CAOA 4Q7WA 2FW4A 4K0TA 5BYIA 1H9QA 3D0NA 3NB5A 4RH2A 5FNHA 4MLTA 1XQ0A 2EZ7A 2O4ZA 4CNVA 5A25A 3C7PA 1BNTA 2NXRA 3GZ0A 1A42A 3S9TA 4K1QA 4KP8A 1CVBA 1FQLA 2FOYA 4HU1A 3MNJA 3QYKA 1YO2A 4L5WA 4WL4A 4Q78A 1CAJA 2FOVA 3MNAA 5FLTA 3U3AX 5FNGA 3W6HA 5DOGA 3D93A 4FIKA 5FL6A 3KIGA 3TMJA 2HOCA 4Q90A 1CNGA 1DCBA 1BN4A 1CA3A 1RZAA 1V9IC 3M5SA 3JXGA 1BNUA 4E3FA 4QEFA 5HPJA 3SAPA 4R59A 4WW8A 3RG3A 5EH5A 2HKKA 5JEHB 4KV0A 9CA2A 1FR7A 1I9LA 2VVBX 4Z1EA 1ZSBA 3P3JA 1G3ZA 2NXTA 5JQ0A 4Q49A 5EHVA 4G7AA 3Q31A 1RZDA 1H9NA 3S72B 1CNWA 3M14A 3RJ7A 4XFWA 5EH7A 3MHMA 3P4VA 4KP5A 1UGDA 4YGLA 2WEJA 1TG3A 4R5AA 5DSRA 1BNMA 4GL1X 3V5GA 5JG3B 1DMXA 3HLJA 1H4NA 4E3GA 1RAZA 4MLXA 3DVCA 4QIYA 1CZMA 1CAKA 4Q8XA 3RYVB 3DC9A 3MZCA 2FOSA 2POVA 3JXHC 1BZMA 3M04A 1TH9A 1URTA 1IF8A 3TVOX 4Z1NA 5JDVB 1HEBA 1JCZA 5FNLA 1FSNA 4ILXA 4M2RA 3ML2A 1ZGEA 3DD8A 3IBIA 1UGAA 5FDIA 3EFTA 3M98A 4YXUA 3HKQA 4RFDA 7CA2A 3ZNCA 1G45A 12CAA 3SBHA 1AZMA 3M1JA 2FMGA 1LUGA 5L6KA 4TWMA 4ZAOA 1ZSCA 5DSNA 5G01A 2CBEA 2X7TA 2Q38A 4PYYA 5G0BA 2NWZA 5FNKA 1UGEA 5DSIA 4BF1A 4LU3A 1IF9A 1I91A 4Q7SA 4RUZA 2NNGA 1JV0A 2QO8A 3OYSA 1G46A 3VBDA 2X7SA 4WUQA 4XZ5A 3PYKA 3KONA 4YGKA 3IEOA 5E5RA 3FW3A 4QJ0A 1BCDA 3OIKA 3OILA 4RUYA 2F14A 3V2MA 1CNCA 3M1QA 1RAYA 1HUGA 4Q8ZA 1RZBA 1HVAA 3CZVA 4HEWA 2NNSA 1HCAA 2POUA 2HD6A 3KOKA 5AMDA 3T5UA 1IF5A 4CNWA 1CINA 1DMYA 3M96A 3DCCA 4Z1JA 2POWA 1BN1A 1Y7WA 4Q6DA 3L14A 1CAYA 3RLDA 4Q83A 3P3HA 4PYXA 1G54A 1YDDA 2WEGA 3F8EA 4JSSA 4KNNA 1F2WA 5FNMA 3R16A 1FQNA 1ZFQA 4BF6A 1I9OA 2GD8A 5DSMA 1RJ6A 1MUAA 5FLRA 5FNJA 4ETQC 4JSZA 4CNXA 4CQ0A 3N0NA 5DSQA 4JSAA 5EHEA 2WD3A 5LMDA 3BETA 3DA2A 5DOHA 4Q9YA 5SZ5A 1YO1A 1CRAA 3RZ7A 3KKXA 4RIVA 5E28A 1YDBA 3RYYA 1CNBA 4KAPA 1KWQA 4YGNA 1ZH9A 4YYTA 3MMFA 1EOUA 3V3FA 4FPTA 4Q6EA 2W2JA 1THKA 4G0CA 3S8XA 4C3TA 1RJ5A 2NN7A 4QJWA 4ZWZA 1UGCA 1FSRA 3RG4A 4PZHA 4K0SA 3MNIA 2CA2A 5DSPA 4YWPA 2FOUA 5FLPA 2NMXA 4ZX1A 4E3DA 3S73B 4RIUA 3RYXB 4YX4A 4E5QA 4HEZA 5JQTA 4Z1KA 1J9WA 1I9MA 2CBCA 1ZFKA 4QTLA 3M2ZA 5FDCA 3DC3A 3KWAA 3B1BA 1YDCA 3MNHA 4QSIA 1CNJA 4YXIA 2EU2A 3IBLA 5DSLA 5CA2A 4KUWA 5A6HA 4KUYA 1BN3A 3KNEA 3V3GB 1HEAA 3DCWA 4QSJA 3U47A 1I90A 5IPZA 5E2RA 1XEGA 1YDAA 3U45X 4Q7PA 3K2FA 3DD0A 4PQ7A 2X7UA 1CVEA 3LXEA 5SZ3A 4KNMA 1CILA 5EZTX 1UGBA 1LG6A 4FRCA 3T85A 3D9ZA 2CBAA 5EH8A 5CJFA 4RN4A 4ZWIA 3TVNX 3OKVA 2ZNCA 2OSFA 3W6IA 3S78B 3PJJA 1CNXA 4FVNA 5FL5A 1CCTA 1BNQA 1Z9YA 3DBUA 2OSMA 1V9EA 3T82A 2ABEA 1Z97A 4MDLA 2EU3A 4HF3A 5L3OA 4CNRA 4ITPA 1TBTX 1Z93A 5EKJA 1KOQA 1FSQA 1G52A 5EIJA 1HUHA 3T5ZA 3OIMA 5E2SA 3BL1A 5SZ6A 1TTMA 1I8ZA 4COQA 3SAXA 1BNNA 1G4JA 5E2KA 4KUVA 4ZX0A 4WW6A 5E5UA 2NN1A 5BNLA 3MHCA 3JXFA 1CCUA 1FQMA 1CVCA 3N3JA 1AVNA 4L5VA 4N0XB 1I9NA 3DVDA 2FNNA 3P55A 4JS6A 4QSBA 1RZCA 5J8ZA 3IAIA 3DAZA 2NWPA 3MHLA 5AMLA 2H15A 4XIWA 4CA2A 3D8WA 5DSOA 3V3IB 3DVBA 2AW1A 1KWRA 3T84A 4HEYA 2NNVA 3P58A 5JGSB 1IF7A 4QK3A 1TB0X 3MNKA 2HL4A 1XEVA 1OKLA 5EHWA 5CACA 4QY3A 4X5SA 3M1KA 4DZ9A 1G0EA 3M2XA 3MHOA 1HEDA 3RZ0B 5SZ0A 4YVYA 5EKHA 1CCSA 4QJOA 1G0FA 3S74B 3M2NA 3M5TA 1KOPA 5EKMA 3OYQA 3S75B 3D92A 2Q1BA 1BICA 4FL7A 4HT0A 4WUPA 1RZEA 3DCSA 3RZ8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FMZ A;  1ZNC A;  4YGF A;  3UYN A;  1G6V A;  1ZSA A;  4Z0Q A;  4HT2 A;  1CVD A;  3M2Y A;  3HS4 A;  1JD0 A;  1UGF A;  4E9O X;  1CA2 A;  1CVH A;  3V7X A;  4CAC A;  2AX2 A;  2FOQ A;  3MDZ A;  1CAH A;  4XIX A;  3M5E A;  5FLO A;  4IDR X;  4QK1 A;  3K7K A;  5E2M A;  4QSA A;  3EFI A;  4Q99 A;  4E3H A;  4Q8Y A;  3ML5 A;  4E49 A;  2H4N A;  4E4A A;  3NI5 A;  5SZ4 A;  5EOI A;  2CAB A;  1LGD A;  2Q1Q A;  4WR7 A;  4ZWX A;  4FVO A;  1CNY A;  4R5B A;  1KEQ A;  2CBD A;  1I9Q A;  2FNK A;  4LP6 A;  5DSJ A;  3KOI A;  4LHI A;  1CAZ A;  3IGP A;  3F7B A;  4N16 A;  1CAL A;  2HFW A;  5DSK A;  3IBN A;  1BNW A;  3M3X A;  2NXS A;  4RUX A;  3KLD B;  1TG9 A;  5AMG A;  5BRW A;  4MO8 A;  4M2V A;  3OY0 A;  5G03 A;  1G48 A;  4QJM A;  1CAN A;  1LZV A;  5CLU A;  4K0Z A;  3NJ9 A;  2QOA A;  3P44 A;  3F4X A;  1CNI A;  3FFP X;  1ZE8 A;  1IF4 A;  3P5A A;  3U7C A;  5G0C A;  3SBI A;  1CRM A;  4Q07 A;  3CA2 A;  4Q09 A;  5BRU A;  1OQ5 A;  5JG5 B;  1IF6 A;  3CYU A;  3N4B A;  4TWL A;  1FQR A;  3MWO A;  4DZ7 A;  4M2U A;  3M40 A;  5SZ2 A; 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