1JV0A

The crystal structure of the zinc(ii) adduct of the cai michigan 1 variant
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
DWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFRVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a zinc-activated variant of human carbonic anhydrase I, CA I Michigan 1: evidence for a second zinc binding site involving arginine coordination
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE I
total genus 68
structure length 257
sequence length 257
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2001-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1jv0A00
2WEOA 1CNHA 1FSQA 1RAYA 2ABEA 4RH2A 1I91A 4XZ5A 2NWYA 4M2UA 1ZGEA 4QJOA 2AX2A 5EHWA 4Q8YA 5CA2A 2CA2A 2WEJA 1Z9YA 1ZSAA 5JQ0A 3CYUA 5SZ3A 2POUA 1CNBA 1G48A 3CZVA 4BF1A 4YGKA 3UYNA 5BRVA 4JSZA 2F14A 3JXFA 1CNIA 2FMZA 4ILXA 1I9MA 2CBDA 2OSFA 4XE1A 4MTYA 1G1DA 1JCZA 5BNLA 1CAIA 1HVAA 4HEYA 2FOUA 1CAKA 4RUXA 2CBBA 1Y7WA 4WUPA 4PYYA 5EHEA 4FU5A 4MDGA 4Y0JA 2QOAA 5DSQA 3RLDA 3FFPX 1G46A 4Q06A 2HKKA 2H15A 3T5UA 2CBAA 2NXTA 1BNTA 3S78B 3MHMA 3U45X 4CNXA 1XQ0A 1BNVA 5DOHA 4Q8ZA 4PXXA 4Q9YA 2WEHA 3TMJA 4LP6A 5SZ4A 3RJ7A 3P58A 3RYYA 5DSOA 3U7CA 5EHVA 4KUWA 3IBIA 5CACA 4ITPA 4Q83A 1RZCA 4R59A 2X7SA 1YDAA 5FLPA 1ZGFA 1ZH9A 5JG5B 2NXRA 4HT0A 3RYJB 3DV7A 3D92A 4YXOA 1G45A 1LG5A 1UGAA 3ML2A 5DSKA 4FPTA 1LGDA 1XEVA 2FNNA 1KOPA 2HNCA 3M1WA 4CA2A 2QO8A 3PO6A 4L5VA 5J8ZA 3MNHA 1CALA 4TWMA 5EH7A 1H9QA 2CBEA 3RZ0B 1V9IC 1ZSBA 3DVDA 1RZDA 1LG6A 4E3DA 4QJPA 5L6KA 2Q1QA 3PYKA 4ZX1A 3P55A 3P3JA 4CQ0A 3DC9A 1G4JA 4HBAA 5EKMA 4Q7WA 4ZWIA 1FQNA 2FW4A 1I9PA 1CNKA 2X7TA 5SZ7A 1FQLA 3MNJA 4Q08A 5SZ0A 1LUGA 1FSNA 1OKNA 4DZ7A 3SBIA 6CA2A 1CINA 4G7AA 3KKXA 5LMDA 1IF8A 1CAMA 3IBNA 4Q7VA 1Z93A 3F8EA 3IGPA 3EFTA 1RAZA 4HU1A 4FVOA 3OKUA 4KP5A 2FNKA 4YYTA 4FVNA 3S72B 3B1BA 5DSPA 3RZ1B 3S9TA 1URTA 4YVYA 5FNLA 2AW1A 1I8ZA 1ZE8A 1AVNA 4QK2A 5DSNA 4WW8A 4PYXA 4N16A 4ITOA 4QJ0A 3DCWA 4QK3A 3HKNA 4Z1NA 3P5LA 1BNNA 1BNQA 2HOCA 1TG9A 5HPJA 5JQTA 2NNVA 5E5RA 1THKA 4KAPA 5E2RA 1G0FA 1ZFQA 2HD6A 3MNKA 3M14A 3QYKA 4JS6A 1CVDA 1RJ6A 4WR7A 2ZNCA 1CRMA 3IBUA 1TB0X 4KUYA 5EOIA 1KWQA 3CAJA 5FL4A 1FSRA 4YGJA 1DMYA 2NWOA 3M98A 1CRAA 5FNIA 1TH9A 2HL4A 3T83A 2GD8A 5FLOA 5L3OA 1CNGA 1F2WA 5SZ2A 3R16A 1BNUA 2HFWA 4Q78A 5G0CA 4E3FA 3KS3A 2Q1BA 3V3GB 3IAIA 2EU3A 5A6HA 1YO0A 3T5ZA 4ZAOA 5E2NA 5FNKA 4KNJA 3HLJA 3OKVA 1BN1A 1UGFA 1RZBA 4HEZA 4JSSA 4Q87A 3KOKA 5CLUA 3DD0A 3N4BA 4MDMA 1YO2A 5G0BA 3M1KA 4ZWXA 3HS4A 4M2RA 5FL6A 4K13A 3RG3A 4MLXA 5EIJA 4Q7PA 1IF5A 3BETA 3S75B 2NXSA 4Q09A 5DSIA 3V2MA 4K1QA 1MUAA 5JEHB 4XIWA 3D8WA 1J9WA 3OIKA 3KNEA 3M2YA 1CAYA 5DSMA 5SZ6A 4Q81A 3L14A 4R5AA 4BF6A 1I9LA 3K2FA 1G4OA 3MHIA 3MHCA 4Z1EA 4RUYA 1AM6A 12CAA 3T84A 4XIXA 3MNUA 4E5QA 1CCUA 1UGCA 3HKQA 1ZNCA 3F7UA 3W6HA 4E9OX 5BRUA 4KP8A 5IPZA 3Q31A 3P44A 3OYQA 3V2JA 1BICA 3MDZA 3MMFA 3EFIA 2NN7A 1CVAA 2ILIA 5FLQA 4ZX0A 4YXUA 4YGLA 3VBDA 3S76A 5EKJA 1CNXA 3M5SA 5EKHA 4HF3A 3C7PA 4X5SA 1OQ5A 3OILA 4G0CA 8CA2A 3JXHC 1CNYA 3MNIA 5G03A 3DC3A 2GEHA 1I9NA 5G01A 1BNWA 3MHOA 2FOSA 1CVBA 1CVFA 2Q38A 5FNGA 4Q8XA 1KWRA 5BRWA 3RZ8A 5FNMA 1HEDA 3DA2A 4UOVA 4FL7A 1CNCA 3K34A 4RIVA 4Z1JA 4JSWA 3IBLA 4Z0QA 2NMXA 3DBUA 3S97A 4Q0LA 1CAJA 1Z97A 4HT2A 4MLTA 1G0EA 3CA2A 1UGDA 1DCAA 1CAOA 1G6VA 1XPZA 3F7BA 3U3AX 1HUHA 4KUVA 4CACA 2WEGA 3SAXA 2FOVA 1CA3A 1BV3A 4E4AA 4M2WA 2NWZA 3N0NA 3NJ9A 1MOOA 4Q90A 3SBHA 4BCWA 5AMGA 3NB5A 4YGNA 1FQRA 1V9EA 9CA2A 1CVEA 1UGEA 4E49A 2FOQA 4K0SA 3HKTA 1RZAA 1CIMA 1OKLA 4TWLA 1HCBA 2WD3A 3M96A 5E28A 5JGSB 1TBTX 5EH8A 1IF7A 5JEGB 2QP6A 1YO1A 4YGFA 2EZ7A 3V3JA 5FDIA 3OY0A 4K0ZA 3ZP9A 3DVCA 4QTLA 3M2XA 1EOUA 3TVNX 2NNGA 4LU3A 5FNJA 4CNRA 3SAPA 1BN4A 1I9OA 1CVCA 4QIYA 4YX4A 4MDLA 1BN3A 3RYXB 3V3IB 4PZHA 3P4VA 3MYQA 1YDDA 1HUGA 4KNNA 1HEBA 4E3GA 5FDCA 3MZCA 4QJXA 2NN1A 3M2ZA 5DSRA 3HKUA 1CAHA 3D9ZA 4QSBA 4COQA 3KONA 2CABA 3K7KA 1UGBA 4CNVA 3BL1A 3KIGA 5SZ5A 1RZEA 2NWPA 4Q7SA 4QK1A 2VVBX 4YHAA 1I90A 5FLSA 3B4FA 1IF6A 4QIZA 4ETQC 2EU2A 4KNMA 1H9NA 5BYIA 4XFWA 1XEGA 3W6IA 4QJWA 1TTMA 2H4NA 3RGEA 1FLJA 2CBCA 4QY3A 3S71B 1DCBA 3T82A 3V7XA 4E3HA 5JGTB 2O4ZA 5E2SA 4Q07A 3P3HA 1YDCA 4PQ7A 4WUQA 3FW3A 1TG3A 1H4NA 1ZFKA 1FQMA 1HCAA 1HECA 4FIKA 3MWOA 4QSJA 3P5AA 1TE3X 3RYVB 3ZNCA 1CILA 1YDBA 3S74B 4WW6A 3M67A 7CA2A 4RUZA 1G52A 3MNAA 1CANA 3M04A 1KEQA 3T85A 3N2PA 3M1JA 3BL0A 1BZMA 5DRSA 4IWZA 4FRCA 5SZ1A 5CJFA 3D0NA 1G54A 3F4XA 1A42A 2VVAX 5FLRA 5FNHA 4JSAA 5E2KA 3S8XA 3N3JA 4M2VA 1DMXA 3S73B 5AMLA 1CAZA 3ML5A 3OIMA 4HEWA 4LHIA 3KOIA 4KNIA 4WL4A 4Q49A 2NNOA 4KV0A 4RIUA 3U47A 3D93A 5FL5A 3M40A 1IF9A 3DCSA 4ZWZA 1I9QA 4QSIA 4C3TA 4Z1KA 3RZ5A 4RN4A 1BCDA 1RJ5A 2WD2A 5DOGA 1G3ZA 2FOYA 4YWPA 1CCSA 3M3XA 3RZ7A 1CVHA 3KLDB 5FLTA 3TVOX 1UGGA 3V3HB 4N0XB 4L5UA 1OKMA 5JDVB 4Q6EA 3OYSA 3M5TA 4DZ9A 3R17B 2X7UA 4MO8A 1FR7A 4Q99A 4K0TA 3M1QA 4IDRX 1CNWA 3MHLA 1TEUX 3UYQA 4YXIA 5E5UA 5E2MA 4RFDA 3PJJA 3M2NA 4QJMA 5DVXA 3DVBA 1BNMA 5JESB 5AMDA 3FE4A 3LXEA 5EZTX 1CNJA 3S77B 4CNWA 1HEAA 4L5WA 4RFCA 3V3FA 5JG3B 1T9NA 3GZ0A 4ZWYA 3DCCA 4GL1X 5C8IA 1JD0A 1ZSCA 2NNSA 2OSMA 3IEOA 1IF4A 2IT4A 3KWAA 2POWA 1CZMA 1FR4A 2FNMA 5DSJA 1CA2A 4R5BA 5EH5A 4QEFA 1JV0A 3RG4A 5DSLA 1LZVA 4Q6DA 3JXGA 3M5EA 5A25A 3NI5A 1CCTA 1TEQX 1G53A 3DD8A 4QSAA 3RYZA 2FMGA 5JEPB 2W2JA 1AZMA 2POVA 3V5GA 1KOQA 3DAZA 3HFPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2WEO A;  1CNH A;  1FSQ A;  1RAY A;  2ABE A;  4RH2 A;  1I91 A;  4XZ5 A;  2NWY A;  4M2U A;  1ZGE A;  4QJO A;  2AX2 A;  5EHW A;  4Q8Y A;  5CA2 A;  2CA2 A;  2WEJ A;  1Z9Y A;  1ZSA A;  5JQ0 A;  3CYU A;  5SZ3 A;  2POU A;  1CNB A;  1G48 A;  3CZV A;  4BF1 A;  4YGK A;  3UYN A;  5BRV A;  4JSZ A;  2F14 A;  3JXF A;  1CNI A;  2FMZ A;  4ILX A;  1I9M A;  2CBD A;  2OSF A;  4XE1 A;  4MTY A;  1G1D A;  1JCZ A;  5BNL A;  1CAI A;  1HVA A;  4HEY A;  2FOU A;  1CAK A;  4RUX A;  2CBB A;  1Y7W A;  4WUP A;  4PYY A;  5EHE A;  4FU5 A;  4MDG A;  4Y0J A;  2QOA A;  5DSQ A;  3RLD A;  3FFP X;  1G46 A;  4Q06 A;  2HKK A;  2H15 A;  3T5U A;  2CBA A;  2NXT A;  1BNT A;  3S78 B;  3MHM A;  3U45 X;  4CNX A;  1XQ0 A;  1BNV A;  5DOH A;  4Q8Z A;  4PXX A;  4Q9Y A;  2WEH A;  3TMJ A;  4LP6 A;  5SZ4 A;  3RJ7 A;  3P58 A;  3RYY A;  5DSO A;  3U7C A;  5EHV A;  4KUW A;  3IBI A;  5CAC A;  4ITP A;  4Q83 A;  1RZC A;  4R59 A;  2X7S A;  1YDA A;  5FLP A;  1ZGF A;  1ZH9 A;  5JG5 B;  2NXR A;  4HT0 A;  3RYJ B;  3DV7 A;  3D92 A;  4YXO A;  1G45 A;  1LG5 A; 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