1LUGA

Full matrix error analysis of carbonic anhydrase
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Atomic resolution studies of carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic Anhydrase II
total genus 79
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2002-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1lugA00
1G46A 4ITOA 4Q87A 3P55A 3R17B 3DVBA 3N2PA 1G6VA 1MOOA 3RYVB 1CAKA 5E2SA 3IAIA 1JD0A 2NNOA 4Q7VA 4Q7PA 3QYKA 5DSQA 3MNHA 4ZWYA 4ZWZA 4KNJA 5G01A 1ZSAA 2Q38A 4XIXA 4FRCA 4WL4A 3RLDA 5SZ1A 3V3JA 2CBBA 3PO6A 1AZMA 4LHIA 5EHWA 1KWRA 5FLPA 2FMGA 4QJXA 5FLOA 1IF7A 3FFPX 1FSQA 1I91A 4RUYA 4E5QA 3KKXA 1CCUA 3KNEA 2ZNCA 4E3FA 5E5RA 1CVFA 3M2NA 5A6HA 3M1JA 1CAZA 3SBHA 4DZ9A 2NN1A 5JGSB 3RYZA 5EH5A 5EHEA 2FNKA 2X7SA 5EKHA 1F2WA 4RFCA 3C7PA 4BF6A 2AX2A 4Z1NA 4LP6A 2CA2A 4PZHA 1IF4A 1LGDA 3DC9A 3MNAA 5DSPA 4MLXA 3M1QA 1CNIA 3GZ0A 1HCAA 4YXUA 1ZNCA 2EZ7A 3P3JA 4Q7SA 3CA2A 4C3TA 5FLRA 3RZ0B 4KV0A 1UGDA 3V7XA 3RG3A 1CVHA 3SAPA 1FQLA 3D92A 1CRAA 4E4AA 1HEBA 1FQMA 4YVYA 2FOSA 5FL6A 4CACA 4KUVA 1KEQA 4WUPA 1FR7A 3V3HB 3DV7A 3PYKA 1OQ5A 5CACA 5EH8A 4UOVA 4HBAA 3D0NA 4YGNA 5SZ4A 1OKNA 4KNIA 2Q1BA 2VVAX 1RZEA 3MHMA 1HUHA 2WEGA 2NNSA 4MDGA 4QSIA 1G48A 5CLUA 2POWA 3M98A 1CNJA 4MDLA 4Q6EA 1CAMA 1Z97A 3S8XA 3M1WA 4MLTA 1RZDA 2ABEA 2FOQA 2FOYA 1I90A 3TVOX 4YXOA 1CNKA 1TBTX 1HECA 3N3JA 4K0SA 4ILXA 4N16A 5HPJA 4YGLA 1BNNA 3KIGA 4Q99A 1HEDA 5AMLA 1CVAA 5AMDA 1RZBA 1FQRA 3IBLA 3ZP9A 4WW6A 3EFIA 3V3IB 1ZFQA 3IBUA 4CNXA 4ZAOA 1UGBA 2CBAA 3T85A 3TVNX 3T5ZA 1CAHA 5JG5B 2ILIA 4COQA 1G0EA 1BNTA 1ZSBA 1FLJA 3VBDA 4CA2A 1G52A 4M2UA 3LXEA 3P3HA 1RZCA 3DVDA 3JXGA 4QSAA 1AVNA 4TWLA 3FE4A 5E2NA 2H4NA 2NWOA 3DA2A 5EOIA 5SZ3A 1JCZA 3S72B 3MNJA 1URTA 5JESB 1CILA 1IF6A 3W6HA 1CNYA 2OSFA 3S77B 4QY3A 4L5UA 2CBEA 5L3OA 5CA2A 5EKJA 1AM6A 5DSIA 1DCBA 1CVCA 4PYXA 4M2RA 1CRMA 2POUA 1V9IC 4RIVA 2Q1QA 1FR4A 3M5SA 1J9WA 1HEAA 1G45A 1G54A 4HF3A 4N0XB 4QSBA 5BNLA 5E5UA 3RYYA 5FL5A 4G7AA 3DAZA 5SZ6A 1CNWA 1LG6A 2NXRA 5FNLA 3U3AX 5DSLA 3DC3A 4K0ZA 1G0FA 1OKLA 1BICA 3HLJA 3SBIA 4ETQC 2GD8A 1YDCA 3F7BA 3HKNA 4GL1X 4YGFA 3T84A 1CA3A 3R16A 2WEOA 5E2KA 1CAJA 1Y7WA 4QJ0A 5EH7A 3M96A 5DSKA 3DBUA 1I9MA 1I9OA 2HOCA 3D9ZA 5CJFA 1CNCA 4QEFA 5E28A 1YDBA 4Q7WA 1RJ5A 1ZSCA 1BNQA 5DSRA 1BNWA 3MWOA 3U45X 4QTLA 1CANA 4HEZA 4XE1A 4YWPA 4L5VA 3DCWA 1IF8A 1H9NA 1UGAA 1ZFKA 2H15A 4KNMA 3U47A 3D93A 3M5TA 1CVEA 1HUGA 2QP6A 2NWPA 3IBIA 5JGTB 5DRSA 5DSNA 4KUWA 4FU5A 2EU3A 5FNHA 1FSNA 3CAJA 3PJJA 4XZ5A 1JV0A 1I9LA 1XEVA 3EFTA 3HKUA 5EZTX 1DCAA 1LUGA 4Y0JA 1V9EA 3K2FA 4BF1A 5FDIA 1LZVA 3BL1A 1TB0X 4QJPA 4QIZA 4R5BA 5E2RA 2HFWA 2NXSA 4RN4A 1CNHA 3UYNA 4BCWA 4CQ0A 3JXHC 3HS4A 4QJOA 1TH9A 3NJ9A 3M04A 4FL7A 5E2MA 4L5WA 3M2YA 3MHIA 2NXTA 5JEPB 1BCDA 1ZE8A 4QIYA 5FLQA 5DSOA 4XFWA 1Z93A 3V2JA 2NNGA 4Q0LA 3S71B 4QK3A 2W2JA 4MO8A 1BN3A 4HT2A 3MNKA 8CA2A 2CBDA 2FOUA 3OILA 1TG9A 2FNMA 1BV3A 5AMGA 3KONA 3MNUA 1TEQX 1ZGFA 3L14A 3RZ7A 3OYQA 4QK2A 3NB5A 3RG4A 3B1BA 2HL4A 3CZVA 2HNCA 5JQ0A 1ZGEA 4IDRX 3P58A 1CNGA 4LU3A 3S76A 4RFDA 3P5AA 5BRVA 1TE3X 3KOIA 5DSJA 3OIMA 3RZ5A 5FNKA 4Q8ZA 3OYSA 1UGCA 4KUYA 2CBCA 5A25A 7CA2A 2WEJA 4FPTA 1YDDA 4Z0QA 4Q09A 4E49A 9CA2A 4YX4A 2X7TA 4QJWA 4JS6A 5FLSA 5G03A 3IEOA 3M3XA 1G4OA 1CAIA 4WUQA 4Q07A 1I8ZA 1CALA 5SZ7A 4XIWA 3T5UA 2FMZA 4JSWA 4YHAA 5EHVA 3W6IA 1UGGA 3B4FA 3DVCA 1IF9A 2NWYA 1CAYA 5J8ZA 4RH2A 4ZWXA 3V2MA 3V3GB 1LG5A 3U7CA 3MMFA 1DMXA 3M2ZA 3OKUA 4Q8XA 3M14A 1BN1A 4M2VA 3RYXB 3S74B 3SAXA 4JSZA 5FL4A 2WEHA 2GEHA 4Q78A 4ZX1A 4K1QA 1T9NA 5L6KA 3MHLA 4Z1KA 2F14A 2NNVA 1CVBA 3S97A 5JEHB 3M5EA 3OIKA 2WD3A 1UGEA 5LMDA 5JQTA 4E9OX 4KP8A 3KWAA 1I9PA 1DMYA 2FW4A 3P44A 5DOHA 3T83A 3RZ8A 5SZ2A 3S73B 3T82A 1A42A 4RUXA 4WW8A 5BRUA 3MDZA 1BNMA 4E3DA 2OSMA 1G3ZA 4IWZA 5EKMA 4HT0A 5SZ5A 3P5LA 1KOPA 3RYJB 4Z1EA 2X7UA 1I9NA 5IPZA 1CVDA 2NMXA 4FVOA 4PQ7A 3F7UA 4YGKA 5FNJA 1RAYA 4PXXA 2POVA 4FVNA 3JXFA 3K34A 1IF5A 3FW3A 5C8IA 3HKQA 3MHOA 4DZ7A 1RZAA 4CNVA 4RUZA 1CIMA 1RAZA 5SZ0A 4KAPA 4HU1A 4RIUA 3M2XA 4Q90A 4WR7A 1CCTA 4CNWA 3M40A 1HCBA 1H4NA 3ML5A 4CNRA 1TTMA 4QJMA 1XPZA 4R5AA 3KLDB 1MUAA 3MZCA 1XEGA 2CABA 1I9QA 2EU2A 5FNIA 4QK1A 4Q06A 2VVBX 3S75B 3S9TA 1OKMA 1YO1A 4JSAA 1CNXA 1FSRA 4Q83A 4YYTA 1G53A 4Q8YA 6CA2A 4JSSA 3HFPA 5BRWA 2O4ZA 2FNNA 1CZMA 1YDAA 1G1DA 5FNGA 3Q31A 3DCSA 2HD6A 3DD0A 4K0TA 3RZ1B 1ZH9A 5EIJA 3OKVA 1H9QA 1CNBA 3RGEA 2IT4A 4G0CA 4KP5A 4ZX0A 1BZMA 3V5GA 3CYUA 4MTYA 1BN4A 2HKKA 1TG3A 1UGFA 1Z9YA 4Z1JA 5G0BA 4FIKA 4K13A 1YO2A 5FNMA 5G0CA 3UYQA 4QSJA 4Q08A 1BNVA 1G4JA 1YO0A 4PYYA 5BYIA 4Q49A 3M1KA 4Q9YA 4Q6DA 5JDVB 5DOGA 4HEWA 1CAOA 3IBNA 4E3HA 12CAA 1FQNA 3HKTA 5DSMA 4M2WA 1XQ0A 1THKA 3KS3A 4Q81A 3RJ7A 4KNNA 4YGJA 3MNIA 3F4XA 4E3GA 3N4BA 1KOQA 3NI5A 3MHCA 3OY0A 3D8WA 1KWQA 2AW1A 4X5SA 3ML2A 5JG3B 4TWMA 3N0NA 5FDCA 5FLTA 2FOVA 1RJ6A 3DCCA 1EOUA 4YXIA 3MYQA 4R59A 1BNUA 1TEUX 1HVAA 3K7KA 4ZWIA 2NWZA 3V3FA 4ITPA 4MDMA 3BL0A 3S78B 1CINA 3DD8A 2QO8A 4HEYA 5DVXA 3IGPA 3ZNCA 3F8EA 3P4VA 3TMJA 2WD2A 1CCSA 3KOKA 2QOAA 3M67A 3BETA 2NN7A 5JEGB 1CA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G46 A;  4ITO A;  4Q87 A;  3P55 A;  3R17 B;  3DVB A;  3N2P A;  1G6V A;  1MOO A;  3RYV B;  1CAK A;  5E2S A;  3IAI A;  1JD0 A;  2NNO A;  4Q7V A;  4Q7P A;  3QYK A;  5DSQ A;  3MNH A;  4ZWY A;  4ZWZ A;  4KNJ A;  5G01 A;  1ZSA A;  2Q38 A;  4XIX A;  4FRC A;  4WL4 A;  3RLD A;  5SZ1 A;  3V3J A;  2CBB A;  3PO6 A;  1AZM A;  4LHI A;  5EHW A;  1KWR A;  5FLP A;  2FMG A;  4QJX A;  5FLO A;  1IF7 A;  3FFP X;  1FSQ A;  1I91 A;  4RUY A;  4E5Q A;  3KKX A;  1CCU A;  3KNE A;  2ZNC A;  4E3F A;  5E5R A;  1CVF A;  3M2N A;  5A6H A;  3M1J A;  1CAZ A;  3SBH A;  4DZ9 A;  2NN1 A;  5JGS B;  3RYZ A;  5EH5 A;  5EHE A;  2FNK A;  2X7S A;  5EKH A;  1F2W A;  4RFC A;  3C7P A;  4BF6 A;  2AX2 A;  4Z1N A;  4LP6 A;  2CA2 A;  4PZH A;  1IF4 A;  1LGD A;  3DC9 A;  3MNA A;  5DSP A;  4MLX A;  3M1Q A;  1CNI A;  3GZ0 A;  1HCA A;  4YXU A;  1ZNC A;  2EZ7 A;  3P3J A;  4Q7S A;  3CA2 A;  4C3T A;  5FLR A;  3RZ0 B;  4KV0 A;  1UGD A;  3V7X A;  3RG3 A;  1CVH A;  3SAP A;  1FQL A;  3D92 A;  1CRA A;  4E4A A;  1HEB A;  1FQM A;  4YVY A;  2FOS A;  5FL6 A; 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