1RAZA

The structure of human carbonic anhydrase ii in complex with bromide and azide
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title The structure of human carbonic anhydrase II in complex with bromide and azide.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1993-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1razA00
2NN7A 5JGTB 1CAJA 3R17B 3FE4A 2NXSA 4Z1JA 5AMLA 2FOYA 3MZCA 1FSNA 3MNUA 2AX2A 3M04A 1CAIA 1CNKA 1FQNA 3KS3A 3FW3A 3T5UA 1TTMA 2WEHA 4HEZA 4KV0A 4Q09A 5JG5B 4PZHA 3BETA 4ZWYA 5JEPB 3HKTA 2FMGA 1BNUA 1IF6A 3BL0A 3OIKA 3F7BA 5SZ1A 2NXTA 2CBBA 2FNNA 4K1QA 1RAYA 1G46A 2WEJA 4JSZA 4KUVA 2WEGA 4N16A 4QK3A 5FNJA 4RH2A 4YGFA 4E9OX 4QJ0A 3RG4A 1XPZA 1G4OA 1ZGEA 1UGGA 3M98A 3OILA 4Q8ZA 5EOIA 2QO8A 2NWZA 5SZ0A 1CAZA 2FNKA 2X7UA 1I9QA 3DCSA 4QSJA 5JQTA 3D93A 3HKUA 5AMDA 1CZMA 1HEDA 5EKHA 1I9NA 5G01A 3K7KA 1J9WA 5CACA 1ZFKA 3JXGA 4QJMA 4YHAA 1LZVA 3U3AX 2POWA 1KOQA 4HBAA 3KWAA 2FOVA 4MLTA 3OIMA 3CZVA 3DVCA 1ZSAA 4MDLA 4WL4A 3JXFA 3JXHC 4UOVA 4YXIA 5JQ0A 1HUGA 1F2WA 5FLQA 4ZX1A 1OKMA 5E2NA 5JESB 4YWPA 1THKA 2AW1A 4RUXA 3PJJA 1CCSA 1DMXA 1CVEA 3F8EA 5DSJA 4Q7WA 3IBLA 1Y7WA 4Q78A 4JSSA 3NI5A 1G48A 4L5WA 5IPZA 3RZ7A 2HKKA 3GZ0A 2H15A 1T9NA 1RZBA 1BNNA 3MHOA 3T82A 3K34A 4JSAA 1RZEA 3MNHA 3V2MA 1CRMA 5G03A 3P44A 1FQRA 2EU2A 1UGCA 1KEQA 3V2JA 1LG6A 1TG9A 3MNJA 7CA2A 4FVOA 1FQLA 3BL1A 4FU5A 4RFDA 1CILA 1OKLA 3OYSA 4R59A 5LMDA 2ZNCA 3MNKA 2HD6A 4QY3A 1JV0A 1UGEA 3SAXA 1CAKA 1CNCA 3M5SA 1IF8A 5EKMA 4Q8XA 4E3GA 4QJXA 2W2JA 2FMZA 1UGAA 3RYJB 1JCZA 4TWLA 2QOAA 5EIJA 3M1KA 1TB0X 5SZ5A 3DA2A 4M2UA 3OYQA 4QSAA 1UGFA 4Q90A 4CNRA 3MYQA 3N4BA 4R5BA 2GEHA 3S77B 4YX4A 1MOOA 1I90A 3RYXB 3P58A 4WW6A 2CBDA 4PXXA 1BNMA 4Q49A 1RZDA 3DV7A 1CNYA 2NNGA 8CA2A 3T84A 3RG3A 1AM6A 3IGPA 3KNEA 1BCDA 4MLXA 3CAJA 4YGLA 1BN1A 3F7UA 4PYXA 4MDMA 3S73B 1CA3A 4LU3A 5DSMA 3V3HB 3R16A 1G45A 1ZE8A 1ZNCA 4KP5A 5EZTX 2VVBX 4M2VA 3V7XA 3T85A 3C7PA 5BNLA 1FR7A 1XEGA 2NNOA 3MWOA 4QK2A 3V3GB 1BNWA 1CNBA 1I9LA 3P3JA 4PYYA 4Q9YA 5FL4A 3S97A 2HNCA 4KAPA 3RZ0B 3N2PA 4Q0LA 2F14A 3IBNA 5BYIA 5DSOA 4QEFA 5E2KA 4RN4A 1FLJA 1G1DA 5SZ3A 4CQ0A 4YXOA 1FSRA 2NWPA 1G3ZA 3DD0A 3RLDA 3T5ZA 1I9OA 4M2RA 4Q87A 1CCUA 1CALA 3EFIA 2HL4A 1RAZA 1TE3X 3ZP9A 1V9EA 3OY0A 4LHIA 3U7CA 4Q99A 1CNHA 4ETQC 1CAHA 1CANA 5L3OA 4GL1X 3P5AA 1H4NA 1LG5A 1LUGA 1XQ0A 3B1BA 3M2NA 3M96A 1YO0A 3MHLA 4QTLA 1RZAA 4FIKA 4LP6A 4ZWIA 2FOSA 4YGNA 1CAOA 1BN4A 1I8ZA 1Z97A 3Q31A 3W6HA 3MNIA 3MHIA 5DSNA 3D9ZA 3B4FA 2ILIA 5DSIA 3MHMA 4X5SA 1RZCA 5FDCA 3DD8A 3M1JA 1CNIA 3V5GA 2H4NA 1HEAA 2Q1BA 3F4XA 4QSBA 1CRAA 5FLRA 5FL5A 3M2XA 3M40A 5FLTA 5C8IA 4YGKA 4M2WA 1CNJA 4Z1EA 1CCTA 2HOCA 2NWYA 1CA2A 3OKUA 5SZ2A 2NNSA 5AMGA 2WD2A 5FLOA 2Q38A 9CA2A 1HEBA 5FNKA 4Q81A 1V9IC 3RZ1B 3M2YA 2OSFA 3V3IB 3OKVA 3K2FA 4MDGA 4TWMA 4E3HA 4Q7VA 5L6KA 4HEWA 5SZ7A 3V3FA 1LGDA 3VBDA 5DOHA 3KKXA 3D0NA 5CLUA 3TMJA 4RFCA 1G4JA 4HT0A 3RZ5A 3L14A 3SBIA 4E4AA 1CVDA 1RJ6A 4K0ZA 3S71B 2VVAX 5FDIA 1BICA 1CINA 4Q8YA 5FNIA 1DMYA 1H9NA 1CVBA 2ABEA 4G7AA 5HPJA 2POVA 6CA2A 4YXUA 4RIVA 2GD8A 4IDRX 3M2ZA 3PYKA 3KLDB 4Z1NA 1CAYA 3IAIA 1BNVA 5EHEA 4CNXA 4KNNA 4DZ7A 1FR4A 4JSWA 4ZAOA 3FFPX 1I91A 3RYYA 12CAA 1H9QA 4ZWZA 1MUAA 1BNTA 1YDBA 3U47A 3DVBA 1DCAA 3ML2A 5CA2A 1BZMA 4R5AA 5JGSB 1KWRA 2CBEA 4WW8A 5EH5A 1CNGA 1TG3A 5SZ6A 1CVAA 1IF7A 4K13A 4Z1KA 4Q07A 4Q6DA 4QJOA 3S8XA 1ZSBA 5E2SA 1HCAA 3HLJA 4ITPA 1YDCA 3CYUA 4HEYA 4Y0JA 4ZWXA 4COQA 3MHCA 5DSPA 1EOUA 4QIYA 5FLSA 3SAPA 3S78B 1ZGFA 1A42A 1FQMA 4Q6EA 4KP8A 3N0NA 4E49A 3PO6A 3NJ9A 5EH8A 1CAMA 4XZ5A 1URTA 1TH9A 4HU1A 4DZ9A 1YDAA 3S75B 3M67A 3ZNCA 4L5UA 2OSMA 5FNLA 1G53A 1Z9YA 3HS4A 3KOKA 3KOIA 3M3XA 3UYQA 2NWOA 5JEHB 1HCBA 1OKNA 5JDVB 1OQ5A 4RIUA 5CJFA 3RGEA 1I9MA 5SZ4A 1CIMA 3S76A 5DSQA 2WEOA 4FVNA 1G52A 4HT2A 5E5UA 2NXRA 2FNMA 3W6IA 2NN1A 3HKNA 3MDZA 5EHWA 1G6VA 3KONA 4QSIA 4QIZA 1Z93A 3D8WA 4YVYA 1IF5A 4QJPA 5EH7A 3RZ8A 3TVOX 3P55A 4KUWA 4RUYA 3MMFA 1YO1A 1DCBA 4ILXA 4KNIA 1TEUX 4K0SA 2CA2A 1HUHA 5JEGB 1YO2A 4CACA 4JS6A 4QJWA 3QYKA 3S9TA 2NMXA 5EHVA 5FNMA 4IWZA 3SBHA 2POUA 1ZH9A 5J8ZA 2HFWA 1ZSCA 4YYTA 5DSLA 2X7SA 4HF3A 4WR7A 3CA2A 1BNQA 1CNWA 5G0BA 2EZ7A 2X7TA 3DCWA 1G54A 3P5LA 1IF4A 5DVXA 1YDDA 3T83A 4CNWA 1IF9A 5G0CA 3HFPA 5FL6A 1UGDA 1HVAA 4Q7SA 4XFWA 3M1WA 5A25A 3IBIA 4MTYA 3UYNA 2Q1QA 2CBAA 3IBUA 4KUYA 1AZMA 3TVNX 3P3HA 4N0XB 2FOQA 2CABA 2FW4A 2QP6A 2IT4A 4K0TA 3RYZA 3NB5A 5E28A 1AVNA 2FOUA 4E5QA 2CBCA 5BRVA 1KOPA 3DAZA 2O4ZA 4CA2A 1TBTX 4QK1A 1CVFA 3RYVB 3P4VA 4RUZA 1I9PA 4XIXA 3DC9A 5JG3B 1FSQA 4XE1A 4E3DA 3V3JA 4L5VA 5DRSA 1CVHA 4BF6A 4Q83A 1G0EA 1BN3A 3M1QA 4E3FA 4G0CA 3HKQA 4YGJA 3KIGA 3DC3A 5FNGA 4FPTA 4ITOA 4FL7A 3RJ7A 3S74B 4KNJA 5DSRA 4ZX0A 2WD3A 4PQ7A 3DBUA 3ML5A 4Q7PA 4XIWA 4Q08A 3M5TA 4Z0QA 4CNVA 3S72B 5E2MA 3LXEA 3IEOA 5E2RA 3M5EA 3D92A 1HECA 5E5RA 3DCCA 5EKJA 4BF1A 3MNAA 4C3TA 2EU3A 4FRCA 5BRWA 1KWQA 3M14A 3EFTA 5DSKA 1G0FA 4WUPA 4WUQA 1UGBA 5DOGA 5BRUA 2NNVA 4MO8A 3N3JA 3U45X 1XEVA 5A6HA 5FNHA 1TEQX 3DVDA 1RJ5A 1CVCA 4BCWA 5FLPA 1BV3A 1JD0A 1ZFQA 4KNMA 4Q06A 1CNXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NN7 A;  5JGT B;  1CAJ A;  3R17 B;  3FE4 A;  2NXS A;  4Z1J A;  5AML A;  2FOY A;  3MZC A;  1FSN A;  3MNU A;  2AX2 A;  3M04 A;  1CAI A;  1CNK A;  1FQN A;  3KS3 A;  3FW3 A;  3T5U A;  1TTM A;  2WEH A;  4HEZ A;  4KV0 A;  4Q09 A;  5JG5 B;  4PZH A;  3BET A;  4ZWY A;  5JEP B;  3HKT A;  2FMG A;  1BNU A;  1IF6 A;  3BL0 A;  3OIK A;  3F7B A;  5SZ1 A;  2NXT A;  2CBB A;  2FNN A;  4K1Q A;  1RAY A;  1G46 A;  2WEJ A;  4JSZ A;  4KUV A;  2WEG A;  4N16 A;  4QK3 A;  5FNJ A;  4RH2 A;  4YGF A;  4E9O X;  4QJ0 A;  3RG4 A;  1XPZ A;  1G4O A;  1ZGE A;  1UGG A;  3M98 A;  3OIL A;  4Q8Z A;  5EOI A;  2QO8 A;  2NWZ A;  5SZ0 A;  1CAZ A;  2FNK A;  2X7U A;  1I9Q A;  3DCS A;  4QSJ A;  5JQT A;  3D93 A;  3HKU A;  5AMD A;  1CZM A;  1HED A;  5EKH A;  1I9N A;  5G01 A;  3K7K A;  1J9W A;  5CAC A;  1ZFK A;  3JXG A;  4QJM A;  4YHA A;  1LZV A;  3U3A X;  2POW A;  1KOQ A;  4HBA A;  3KWA A;  2FOV A;  4MLT A;  3OIM A;  3CZV A;  3DVC A;  1ZSA A;  4MDL A;  4WL4 A;  3JXF A;  3JXH C;  4UOV A;  4YXI A;  5JQ0 A;  1HUG A;  1F2W A;  5FLQ A;  4ZX1 A; 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