1RZC | Genus

Total Genus 80

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	80
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__884584983813797__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__884584983813797__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/1rzc/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__884584983813797__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"884584983813797","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/1rzc/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__884584983813797__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase(oxo-acid)
source organism	Homo sapiens
publication title	X-ray analysis of metal-substituted human carbonic anhydrase II derivatives. pubmed doi rcsb
molecule keywords	CARBONIC ANHYDRASE II
total genus	80
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	1993-05-25

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	1rzcA00

3SAXA 1F2WA 3KIGA 2NXRA 4KP5A 3M67A 1TEUX 3RZ5A 5DVXA 4KNNA 2FNMA 1FSRA 1BZMA 3MHOA 4RN4A 4FRCA 4E9OX 5EH7A 4FPTA 3JXGA 3V3HB 2CBDA 5EHEA 1CA3A 2NWOA 4HEZA 4MDLA 4Q7VA 1J9WA 4BCWA 4HT2A 2EZ7A 3KOIA 3DAZA 3RJ7A 5FNIA 4YXOA 1EOUA 1CCSA 3F8EA 5CA2A 2WD3A 3OIMA 3W6IA 1FSNA 4R5AA 3S76A 4QK3A 5EKHA 3MNHA 3IBLA 3RZ1B 1G1DA 1ZSCA 1V9IC 3KLDB 1FLJA 4CQ0A 3M5EA 2NXSA 2IT4A 3N0NA 2O4ZA 4K0TA 1DMYA 5FLRA 3DBUA 2WEJA 4CNVA 4RUXA 4ZX0A 2POWA 3M1JA 5FNMA 3MZCA 4LU3A 4MLTA 4ZWYA 2Q1BA 4ZWXA 1CA2A 2FOQA 3CYUA 4Q6DA 1KEQA 1IF5A 3M1WA 3RG4A 3DD0A 5G0BA 5FNGA 4YYTA 4Q81A 3SAPA 1FQRA 1CNBA 5FLPA 3DV7A 3F7BA 1BCDA 1IF6A 3M5SA 5BRWA 3HFPA 2WEGA 3KOKA 2WEOA 1CNJA 3OKVA 4GL1X 4TWMA 3PJJA 3DCWA 3R16A 4QSAA 4XIXA 1ZE8A 4E4AA 4WUQA 1CNXA 5JGSB 1TB0X 5CACA 4IWZA 3T84A 3RGEA 3TVNX 1CZMA 1HCAA 3HKUA 4K0ZA 2Q1QA 3RYXB 5JG5B 3BL0A 4HEWA 4Q08A 2NNGA 1CRMA 1ZSAA 5DOGA 3GZ0A 1ZGFA 1CNCA 3IBNA 5L6KA 1CAYA 1ZFQA 1G6VA 4Q06A 4Q8YA 4FU5A 5SZ4A 5EHWA 5BRVA 3W6HA 5DSJA 4Q90A 1FR7A 3M96A 4KNIA 1CNIA 3MHMA 5FL4A 1A42A 5DOHA 4KV0A 3N3JA 4Q8XA 4Z0QA 1I9QA 3HLJA 2FNKA 1CAMA 1DCAA 4G7AA 1YDBA 1G52A 5E5UA 5E5RA 3V2JA 8CA2A 5A6HA 4RFDA 3KKXA 3PYKA 1RZAA 1OKLA 1G46A 4L5UA 4Z1KA 4QIZA 4RUZA 3S74B 4XIWA 4JSZA 3CAJA 2NXTA 4ILXA 4ZX1A 1OKNA 5FLSA 2NNSA 4IDRX 1HCBA 3DVBA 1CVDA 3KONA 4UOVA 4WR7A 4JSAA 1BNNA 3DC3A 1I9OA 1BNTA 1DCBA 1CNHA 4MO8A 4M2WA 4R59A 3P5LA 4QSIA 1HUGA 4MTYA 1BNMA 3N4BA 1MUAA 3P55A 3V3FA 5EKMA 2W2JA 3V3JA 1CANA 1UGCA 3NI5A 3R17B 2ABEA 1OQ5A 1TH9A 4QJMA 5LMDA 4ZWZA 6CA2A 4MDMA 1XPZA 3U7CA 4JS6A 12CAA 4WW8A 3NB5A 3UYNA 4QK1A 3OIKA 5FL6A 3V3GB 5J8ZA 3HKNA 1FR4A 4RIUA 1HUHA 3L14A 3CZVA 4RH2A 1AZMA 5JDVB 1KOQA 3P58A 3MNJA 2ILIA 4PXXA 4YVYA 1UGDA 1UGGA 1YO0A 3IEOA 1Z97A 4QJXA 3T82A 5FNLA 1AVNA 5SZ2A 1TEQX 5EH5A 3M2NA 1TG3A 3TMJA 4FL7A 4E3FA 4QJPA 5SZ6A 5DSLA 4KUWA 5EH8A 3S75B 1H4NA 4XZ5A 3M98A 5JGTB 3MHIA 5BYIA 1CVEA 1KOPA 5G01A 3S78B 3EFTA 5FNKA 3OYSA 3UYQA 3HKQA 2VVBX 3ZNCA 1RJ5A 1CNWA 3DCSA 1YDDA 3P3JA 2WEHA 1UGEA 3M40A 2NMXA 3C7PA 5DSNA 1OKMA 1BNVA 3FFPX 4Q49A 2POUA 1JCZA 3S8XA 1CNYA 4QK2A 1HEAA 4YHAA 1LG5A 3MNIA 3RLDA 4RIVA 3MDZA 5E2MA 1CCTA 3PO6A 4QSJA 1CCUA 5SZ0A 1CAZA 5JEHB 1CILA 4K1QA 4LHIA 4Q7PA 5DSKA 4YX4A 1G4OA 4WUPA 2FOUA 2EU2A 1XQ0A 5IPZA 3P44A 9CA2A 4JSSA 1CVCA 5CLUA 4YGLA 4K0SA 1CNGA 5DSMA 1BNUA 2VVAX 2WD2A 4PZHA 3K2FA 3RYZA 4E3DA 3M1QA 1Y7WA 1JD0A 2X7UA 1FQNA 4FVOA 5E2SA 3HKTA 2CBCA 3DC9A 3JXFA 1FSQA 3V2MA 5EZTX 5EOIA 4Q8ZA 5E2NA 1ZH9A 5EHVA 2X7TA 3MNKA 1UGFA 1G0EA 1ZFKA 4JSWA 2NWZA 4E5QA 4C3TA 4Q07A 4Z1NA 2CBAA 2FW4A 4R5BA 4L5VA 4ITPA 4ZAOA 1CNKA 4YXIA 1CALA 2GD8A 5JESB 3M5TA 1RZDA 2POVA 3KNEA 3T5UA 5AMGA 1TG9A 3LXEA 1ZNCA 1Z9YA 4QSBA 3S71B 3MHCA 1G53A 3KWAA 2AX2A 1RZEA 3MMFA 3IGPA 2QO8A 4Z1EA 4RUYA 5FLTA 3K7KA 1RJ6A 2AW1A 4M2UA 5EIJA 2FOSA 1CVHA 2FMZA 3M2ZA 5EKJA 1FQLA 3D0NA 4DZ9A 4LP6A 2F14A 1IF7A 1I9MA 2QP6A 4Q6EA 1BN3A 4BF6A 5DSPA 5HPJA 2HD6A 1JV0A 1HVAA 3EFIA 2NNVA 3MHLA 3M1KA 3RYYA 2NWYA 1YDAA 1BNWA 1I90A 1RZCA 2CABA 2FMGA 1LGDA 4MDGA 2NWPA 1I9LA 1IF4A 3B1BA 5FLQA 3V7XA 2OSFA 3OKUA 5FNHA 1TE3X 3ML2A 3SBIA 5FDIA 4HU1A 5SZ7A 4KUYA 1RAYA 4MLXA 3N2PA 4YGNA 3OILA 3RZ7A 1G4JA 4KAPA 2NN1A 1IF9A 3RYJB 5JEGB 3FW3A 3TVOX 2QOAA 4X5SA 3V3IB 2GEHA 5SZ3A 4FIKA 3T5ZA 5JEPB 3M2YA 4Q87A 4E3HA 4ITOA 1URTA 5JG3B 4YGJA 5JQ0A 1TTMA 4Q9YA 3K34A 2HFWA 1ZSBA 1KWRA 1T9NA 1YDCA 1BICA 3DVCA 3V5GA 4KNJA 4PQ7A 3HS4A 5CJFA 4HEYA 5FNJA 5G03A 3IAIA 1I9NA 5C8IA 3S97A 3P5AA 1BV3A 1RZBA 4QTLA 5AMDA 5E2RA 3JXHC 3ML5A 1LG6A 3VBDA 4YGFA 1CVBA 3RZ8A 1Z93A 1BN4A 1UGBA 3P4VA 4Z1JA 1BN1A 5DSRA 1UGAA 1AM6A 3KS3A 4KNMA 3RYVB 4Q09A 4ZWIA 5DRSA 1G45A 3M3XA 4Q0LA 4XE1A 4Q7SA 5SZ1A 1CIMA 1IF8A 4WL4A 4CNRA 3CA2A 1FQMA 2HOCA 4QJWA 2FNNA 5E28A 4TWLA 4PYYA 2H4NA 3RZ0B 2NNOA 3U47A 4YWPA 4CNXA 4QJOA 3OY0A 1MOOA 3ZP9A 3D9ZA 3D8WA 2ZNCA 4Q78A 4PYXA 4N16A 3B4FA 2NN7A 1CVAA 3DCCA 3M14A 1BNQA 3IBUA 4QJ0A 3P3HA 3U3AX 2FOVA 4KUVA 1CRAA 1CAIA 4BF1A 4QEFA 4Y0JA 5FLOA 1HEBA 3S77B 3MYQA 2Q38A 4HF3A 5G0CA 3T83A 4COQA 3S72B 5DSIA 1G3ZA 2OSMA 4K13A 2HL4A 4FVNA 3QYKA 3OYQA 1HECA 4Q83A 5SZ5A 1CAOA 3BETA 1H9NA 2FOYA 5FL5A 4Q99A 1ZGEA 5E2KA 4CACA 3F4XA 1CINA 3SBHA 2CBEA 3MWOA 4ETQC 4E49A 1I91A 4HBAA 5DSOA 3M2XA 4DZ7A 2H15A 3S73B 3F7UA 5BNLA 5JQTA 4RFCA 2CA2A 4HT0A 1HEDA 1YO2A 3DD8A 4QIYA 1RAZA 5FDCA 1CAKA 3T85A 1V9EA 3S9TA 4E3GA 2EU3A 3BL1A 5BRUA 1G48A 2HNCA 4QY3A 3NJ9A 4M2RA 3FE4A 3IBIA 4G0CA 1I9PA 1G54A 4L5WA 3Q31A 1DMXA 1LZVA 4KP8A 1YO1A 1TBTX 3M04A 4CA2A 3MNAA 7CA2A 1I8ZA 1XEGA 1CAHA 3D92A 3MNUA 1LUGA 5L3OA 4WW6A 4CNWA 2CBBA 3U45X 1CAJA 2X7SA 4M2VA 1XEVA 5AMLA 3RG3A 1CVFA 4YXUA 4YGKA 3DVDA 4Q7WA 3D93A 5A25A 1G0FA 1KWQA 1THKA 1H9QA 2HKKA 5DSQA 4XFWA 4N0XB 3DA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SAX A;  1F2W A;  3KIG A;  2NXR A;  4KP5 A;  3M67 A;  1TEU X;  3RZ5 A;  5DVX A;  4KNN A;  2FNM A;  1FSR A;  1BZM A;  3MHO A;  4RN4 A;  4FRC A;  4E9O X;  5EH7 A;  4FPT A;  3JXG A;  3V3H B;  2CBD A;  5EHE A;  1CA3 A;  2NWO A;  4HEZ A;  4MDL A;  4Q7V A;  1J9W A;  4BCW A;  4HT2 A;  2EZ7 A;  3KOI A;  3DAZ A;  3RJ7 A;  5FNI A;  4YXO A;  1EOU A;  1CCS A;  3F8E A;  5CA2 A;  2WD3 A;  3OIM A;  3W6I A;  1FSN A;  4R5A A;  3S76 A;  4QK3 A;  5EKH A;  3MNH A;  3IBL A;  3RZ1 B;  1G1D A;  1ZSC A;  1V9I C;  3KLD B;  1FLJ A;  4CQ0 A;  3M5E A;  2NXS A;  2IT4 A;  3N0N A;  2O4Z A;  4K0T A;  1DMY A;  5FLR A;  3DBU A;  2WEJ A;  4CNV A;  4RUX A;  4ZX0 A;  2POW A;  3M1J A;  5FNM A;  3MZC A;  4LU3 A;  4MLT A;  4ZWY A;  2Q1B A;  4ZWX A;  1CA2 A;  2FOQ A;  3CYU A;  4Q6D A;  1KEQ A;  1IF5 A;  3M1W A;  3RG4 A;  3DD0 A;  5G0B A;  5FNG A;  4YYT A;  4Q81 A;  3SAP A;  1FQR A;  1CNB A;  5FLP A;  3DV7 A;  3F7B A;  1BCD A;  1IF6 A;  3M5S A;  5BRW A;  3HFP A;  2WEG A;  3KOK A;  2WEO A;  1CNJ A;  3OKV A;  4GL1 X;  4TWM A;  3PJJ A;  3DCW A;  3R16 A;  4QSA A;  4XIX A;  1ZE8 A;  4E4A A;  4WUQ A;  1CNX A;  5JGS B;  1TB0 X;  5CAC A;  4IWZ A;  3T84 A;  3RGE A;  3TVN X;  1CZM A;  1HCA A;  3HKU A;  4K0Z A;  2Q1Q A;  3RYX B;  5JG5 B;  3BL0 A;  4HEW A;  4Q08 A;  2NNG A;  1CRM A;  1ZSA A;  5DOG A;  3GZ0 A;  1ZGF A;  1CNC A;  3IBN A;  5L6K A;  1CAY A;  1ZFQ A;  1G6V A;  4Q06 A;  4Q8Y A;  4FU5 A;  5SZ4 A;  5EHW A;  5BRV A;  3W6H A;  5DSJ A;  4Q90 A;  1FR7 A;  3M96 A;  4KNI A;  1CNI A;  3MHM A;  5FL4 A;  1A42 A;  5DOH A;  4KV0 A;  3N3J A;  4Q8X A;  4Z0Q A;  1I9Q A;  3HLJ A;  2FNK A;  1CAM A;  1DCA A;  4G7A A;  1YDB A;  1G52 A;  5E5U A;  5E5R A;  3V2J A;  8CA2 A;  5A6H A;  4RFD A;  3KKX A;  3PYK A;  1RZA A;  1OKL A;  1G46 A;  4L5U A;  4Z1K A;  4QIZ A;  4RUZ A;  3S74 B;  4XIW A;  4JSZ A;  3CAJ A;  2NXT A;  4ILX A;  4ZX1 A;  1OKN A;  5FLS A;  2NNS A;  4IDR X;  1HCB A;  3DVB A;  1CVD A;  3KON A;  4UOV A;  4WR7 A;  4JSA A;  1BNN A;  3DC3 A;  1I9O A;  1BNT A;  1DCB A;  1CNH A;  4MO8 A;  4M2W A;  4R59 A;  3P5L A;  4QSI A;  1HUG A;  4MTY A;  1BNM A;  3N4B A;  1MUA A;  3P55 A;  3V3F A;  5EKM A;  2W2J A;  3V3J A;  1CAN A;  1UGC A;  3NI5 A;  3R17 B;  2ABE A;  1OQ5 A;  1TH9 A;  4QJM A;  5LMD A;  4ZWZ A;  6CA2 A;  4MDM A;  1XPZ A;  3U7C A;  4JS6 A;  12CA A;  4WW8 A;  3NB5 A;  3UYN A;  4QK1 A;  3OIK A;  5FL6 A;  3V3G B;  5J8Z A;  3HKN A;  1FR4 A;  4RIU A;  1HUH A;  3L14 A;  3CZV A;  4RH2 A;  1AZM A;  5JDV B;  1KOQ A;  3P58 A;  3MNJ A;  2ILI A;  4PXX A;  4YVY A;  1UGD A;  1UGG A;  1YO0 A;  3IEO A;  1Z97 A;  4QJX A;  3T82 A;  5FNL A;  1AVN A;  5SZ2 A;  1TEQ X;  5EH5 A;  3M2N A;  1TG3 A;  3TMJ A;  4FL7 A;  4E3F A;  4QJP A;  5SZ6 A;  5DSL A;  4KUW A;  5EH8 A;  3S75 B;  1H4N A;  4XZ5 A;  3M98 A;  5JGT B;  3MHI A;  5BYI A;  1CVE A;  1KOP A;  5G01 A;  3S78 B;  3EFT A;  5FNK A;  3OYS A;  3UYQ A;  3HKQ A;  2VVB X;  3ZNC A;  1RJ5 A;  1CNW A;  3DCS A;  1YDD A;  3P3J A;  2WEH A;  1UGE A;  3M40 A;  2NMX A;  3C7P A;  5DSN A;  1OKM A;  1BNV A;  3FFP X;  4Q49 A;  2POU A;  1JCZ A;  3S8X A;  1CNY A;  4QK2 A;  1HEA A;  4YHA A;  1LG5 A;  3MNI A;  3RLD A;  4RIV A;  3MDZ A;  5E2M A;  1CCT A;  3PO6 A;  4QSJ A;  1CCU A;  5SZ0 A;  1CAZ A;  5JEH B;  1CIL A;  4K1Q A;  4LHI A;  4Q7P A;  5DSK A;  4YX4 A;  1G4O A;  4WUP A;  2FOU A;  2EU2 A;  1XQ0 A;  5IPZ A;  3P44 A;  9CA2 A;  4JSS A;  1CVC A;  5CLU A;  4YGL A;  4K0S A;  1CNG A;  5DSM A;  1BNU A;  2VVA X;  2WD2 A;  4PZH A;  3K2F A;  3RYZ A;  4E3D A;  3M1Q A;  1Y7W A;  1JD0 A;  2X7U A;  1FQN A;  4FVO A;  5E2S A;  3HKT A;  2CBC A;  3DC9 A;  3JXF A;  1FSQ A;  3V2M A;  5EZT X;  5EOI A;  4Q8Z A;  5E2N A;  1ZH9 A;  5EHV A;  2X7T A;  3MNK A;  1UGF A;  1G0E A;  1ZFK A;  4JSW A;  2NWZ A;  4E5Q A;  4C3T A;  4Q07 A;  4Z1N A;  2CBA A;  2FW4 A;  4R5B A;  4L5V A;  4ITP A;  4ZAO A;  1CNK A;  4YXI A;  1CAL A;  2GD8 A;  5JES B;  3M5T A;  1RZD A;  2POV A;  3KNE A;  3T5U A;  5AMG A;  1TG9 A;  3LXE A;  1ZNC A;  1Z9Y A;  4QSB A;  3S71 B;  3MHC A;  1G53 A;  3KWA A;  2AX2 A;  1RZE A;  3MMF A;  3IGP A;  2QO8 A;  4Z1E A;  4RUY A;  5FLT A;  3K7K A;  1RJ6 A;  2AW1 A;  4M2U A;  5EIJ A;  2FOS A;  1CVH A;  2FMZ A;  3M2Z A;  5EKJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1RZCA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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