1TG3A

Effect of shuttle location and ph environment on h+ transfer in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNHGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural and Kinetic Characterization of Active-Site Histidine as a Proton Shuttle in Catalysis by Human Carbonic Anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase II
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2004-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1tg3A00
3NB5A 4K0SA 5DSRA 4XZ5A 6CA2A 3RG4A 5FNHA 1CINA 1DCBA 2NNGA 4LU3A 3HFPA 1CNYA 4RIUA 4Q7WA 4WW6A 4LHIA 4YGLA 2NN1A 1G4OA 2FOUA 1YO0A 4FL7A 3OILA 5EHWA 4QIZA 3FE4A 3S77B 3R17B 4Z1NA 7CA2A 4GL1X 5L3OA 4Q49A 4Z1KA 4FRCA 4CNXA 2FNMA 3B1BA 1IF4A 1HCBA 3T84A 5DSJA 5JGTB 5E2NA 1KWRA 1XQ0A 1V9EA 3IBIA 3V3FA 3DVDA 5DSOA 1Y7WA 4G0CA 3KWAA 4KNNA 1G48A 4CNRA 4Q7PA 4RIVA 2WEGA 5DSIA 1CAJA 2OSFA 3JXGA 3PJJA 3M1WA 3RZ1B 5E5RA 3OY0A 1TH9A 4YGFA 3M98A 4Q09A 3W6IA 1ZH9A 2HFWA 5CJFA 4YX4A 5JG3B 5FNGA 3EFTA 5E2RA 4KNMA 3MHIA 1CZMA 2NWYA 3S97A 4HEWA 3V3IB 3TVNX 4CA2A 5L6KA 4K13A 5DSKA 1G0EA 4YGNA 4PZHA 3DC3A 4QTLA 1I9PA 1CVFA 5FLSA 3P44A 2CBDA 4YHAA 4WL4A 4ZWYA 3K2FA 3UYQA 4HT2A 5E28A 2CBCA 4KNJA 4XIWA 4JSSA 4KUYA 1LG5A 3U45X 5E2SA 5BRVA 5FNKA 4WUPA 3RZ0B 3D0NA 1KOPA 2NN7A 1CNWA 4N16A 1I91A 2ILIA 1RZAA 4ZAOA 3DCSA 1UGBA 4FPTA 1TG9A 4HBAA 3PYKA 2QOAA 4Q8YA 1CCSA 3P5AA 3N4BA 4FVOA 1FLJA 2FOSA 4E3DA 3M2NA 4L5VA 1I9MA 3DAZA 4COQA 3RJ7A 3PO6A 1FSQA 1Z93A 1ZE8A 3M2XA 4X5SA 4QSJA 5FNMA 1ZSAA 3M1JA 1H9QA 3D8WA 2H15A 3M3XA 1FQRA 1BZMA 2FNNA 1BNWA 5DOHA 5EKJA 3V3JA 1G45A 1Z97A 3DVCA 3MWOA 1I90A 1HUHA 2POVA 4HEYA 4L5WA 3V5GA 4RUYA 1RZCA 4E49A 1DMYA 1CNGA 3ML5A 3M1KA 3P58A 5E2KA 3T5UA 3V3GB 2O4ZA 3M04A 4Q90A 3MNKA 5EHVA 3KIGA 5IPZA 1TBTX 1ZFQA 4MDLA 5HPJA 2NXTA 1HVAA 3OKUA 5FLQA 5FL6A 5SZ1A 4E3FA 1ZSCA 5JQTA 5G0CA 4QJOA 3IEOA 1CNCA 1CNBA 1CANA 3ZP9A 1JD0A 4HT0A 4BF6A 3RZ5A 2POUA 5JDVB 3BL0A 4YWPA 4ZX1A 5FNLA 3MZCA 1LG6A 3M5EA 1I9QA 1CNJA 5FNJA 3SBIA 1I9OA 2WEOA 3BL1A 3T82A 3W6HA 2Q1QA 2WEJA 5FLPA 1OKNA 5EH5A 5A6HA 5DSNA 1CVDA 1MUAA 4QSBA 1TG3A 4KV0A 3KOIA 3JXHC 1IF5A 4RUXA 3DBUA 4QSIA 4QSAA 4KP5A 2HNCA 3IAIA 4Y0JA 4CNVA 4QIYA 1ZSBA 1HEAA 1I8ZA 1BNVA 1HEBA 4M2RA 2OSMA 4Q9YA 5SZ7A 5FL5A 1YDCA 1DCAA 1CNIA 3MHCA 1G4JA 1I9LA 5DOGA 3KS3A 4QJPA 4KP8A 1AVNA 1CRMA 5E5UA 4JSAA 1CAZA 1URTA 1IF9A 1HCAA 1CVCA 3MDZA 3ML2A 2IT4A 3CAJA 4MLTA 5EOIA 1FSRA 1XEGA 4YGKA 3ZNCA 1G46A 4KUVA 4RN4A 3HKNA 4QK3A 2CBEA 4TWLA 5A25A 3KNEA 3RYXB 4Q8XA 4HEZA 4K1QA 3N2PA 4JS6A 2FOYA 4Q8ZA 4E3GA 4WW8A 1UGCA 4YXIA 1BN1A 1CNHA 1RZEA 1BICA 1T9NA 3UYNA 1CVHA 3T83A 4QJMA 5FLOA 4M2VA 4CQ0A 5FDIA 1HEDA 1BN4A 2FNKA 4ITPA 4PQ7A 3HKQA 4Z0QA 4QJWA 5FLTA 3S76A 3S8XA 1TEQX 4RH2A 3P3JA 1LGDA 3P55A 4JSWA 4K0TA 3MYQA 4N0XB 2X7SA 1XPZA 1AZMA 5LMDA 1CAHA 1V9IC 4MDGA 1H9NA 3MNIA 5JEPB 1J9WA 5DVXA 4QK1A 1BNNA 1CILA 5DRSA 4FU5A 4Z1JA 3DA2A 5EHEA 3P4VA 4E9OX 1G6VA 3TVOX 3N3JA 5AMDA 5JESB 4HF3A 1ZGFA 3MHMA 5SZ6A 4KNIA 3VBDA 1CCTA 2WD3A 2QP6A 1TE3X 3C7PA 3F4XA 4JSZA 5FLRA 3HKUA 3DV7A 5JEHB 4RFDA 5EH7A 4Q7SA 4E3HA 2NWOA 5DSMA 3M67A 4QJXA 1H4NA 4M2UA 1BN3A 2CABA 4Q08A 4M2WA 3IBNA 3V2JA 3IBUA 5AMGA 2VVBX 1BNTA 3V3HB 3DCWA 1LZVA 4YXOA 3KOKA 1AM6A 1BCDA 3P5LA 3S71B 3OYSA 1IF7A 5C8IA 3M40A 4YXUA 4PYYA 1CAMA 4RFCA 1ZNCA 2QO8A 2X7UA 4XFWA 4ILXA 1BNUA 4MDMA 4QEFA 1BV3A 2X7TA 3T85A 3D93A 1FSNA 1TEUX 1CRAA 5SZ2A 1KWQA 3QYKA 3MNHA 3K7KA 2HL4A 2FW4A 1CVBA 3JXFA 1RAZA 1CA3A 4YYTA 1DMXA 2ABEA 3DC9A 1G3ZA 3KONA 1JCZA 3MMFA 5EKMA 2HD6A 3SAPA 1YO1A 4TWMA 2FOVA 1UGFA 3V2MA 5BRWA 2HKKA 3RYJB 4QK2A 4G7AA 3RYVB 3HLJA 4Q06A 1CAKA 1FQNA 2FOQA 3OIKA 1TTMA 3M96A 3D92A 2NNVA 2H4NA 2W2JA 1A42A 1LUGA 4WUQA 3RG3A 2WD2A 4MO8A 2CBBA 4Q0LA 4QY3A 4IDRX 3RZ8A 3MHLA 1FR4A 1UGAA 12CAA 3OIMA 4YGJA 3S9TA 2F14A 5SZ3A 5DSQA 1YDAA 1HUGA 4FVNA 3IGPA 5SZ4A 4KAPA 3F7UA 3D9ZA 4DZ9A 3OKVA 3DD0A 4CNWA 3N0NA 4E4AA 3B4FA 5J8ZA 5SZ0A 3V7XA 1RAYA 2AW1A 1CAYA 5BNLA 4YVYA 5CACA 4Q6EA 4MLXA 4RUZA 2ZNCA 3SBHA 4DZ7A 1FR7A 1BNQA 1UGDA 4LP6A 3Q31A 4E5QA 3DCCA 4KUWA 4ZWIA 3RLDA 2WEHA 5G0BA 4MTYA 1XEVA 1OQ5A 3DD8A 3DVBA 4PXXA 4FIKA 2NXRA 1YDBA 2NMXA 4Z1EA 3IBLA 3L14A 2EU3A 1RJ6A 5EKHA 5G01A 1RJ5A 5JG5B 3CZVA 4BF1A 5EH8A 3OYQA 3SAXA 1ZGEA 2FMGA 1KOQA 1G1DA 5CLUA 3KKXA 3U7CA 4Q7VA 4BCWA 4QJ0A 1CVEA 1RZBA 1CNXA 5DSLA 3TMJA 5DSPA 5JEGB 1OKLA 4L5UA 4R59A 3M5SA 2HOCA 5EIJA 5EZTX 5JQ0A 4Q81A 3MHOA 9CA2A 1YO2A 2CA2A 3RYZA 2VVAX 3F8EA 5CA2A 3CYUA 1CAIA 3S73B 4ZWZA 3K34A 3F7BA 2NNSA 1UGGA 3NI5A 2Q1BA 1ZFKA 3RZ7A 3KLDB 4C3TA 5G03A 3S78B 2NWPA 3RYYA 4ZX0A 3EFIA 3MNUA 4Q87A 3S75B 4R5BA 1THKA 3M5TA 5FNIA 5FDCA 1G52A 1JV0A 3HS4A 3U47A 1CNKA 4IWZA 4XIXA 3FW3A 1KEQA 1G53A 1FQLA 3S74B 2NXSA 4R5AA 2EZ7A 1CIMA 3HKTA 4K0ZA 1CCUA 4CACA 5E2MA 1RZDA 2AX2A 1F2WA 4ETQC 1TB0X 2NWZA 2CBAA 8CA2A 3P3HA 4XE1A 5JGSB 3CA2A 1IF8A 1EOUA 2FMZA 4WR7A 5BYIA 1OKMA 3MNJA 1YDDA 1Z9YA 4Q99A 3FFPX 3T5ZA 3M14A 3U3AX 3BETA 4ZWXA 3M2ZA 1G54A 5FL4A 3NJ9A 2GEHA 4ITOA 5BRUA 4Q07A 4PYXA 4Q78A 4Q83A 1HECA 3RGEA 2Q38A 1CA2A 1CVAA 1MOOA 1I9NA 3M2YA 3M1QA 2EU2A 1BNMA 3S72B 3MNAA 4Q6DA 1IF6A 1CAOA 5SZ5A 2POWA 1UGEA 4HU1A 3GZ0A 3R16A 5AMLA 2GD8A 1FQMA 2NNOA 4UOVA 1CALA 3LXEA 1G0FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NB5 A;  4K0S A;  5DSR A;  4XZ5 A;  6CA2 A;  3RG4 A;  5FNH A;  1CIN A;  1DCB A;  2NNG A;  4LU3 A;  3HFP A;  1CNY A;  4RIU A;  4Q7W A;  4WW6 A;  4LHI A;  4YGL A;  2NN1 A;  1G4O A;  2FOU A;  1YO0 A;  4FL7 A;  3OIL A;  5EHW A;  4QIZ A;  3FE4 A;  3S77 B;  3R17 B;  4Z1N A;  7CA2 A;  4GL1 X;  5L3O A;  4Q49 A;  4Z1K A;  4FRC A;  4CNX A;  2FNM A;  3B1B A;  1IF4 A;  1HCB A;  3T84 A;  5DSJ A;  5JGT B;  5E2N A;  1KWR A;  1XQ0 A;  1V9E A;  3IBI A;  3V3F A;  3DVD A;  5DSO A;  1Y7W A;  4G0C A;  3KWA A;  4KNN A;  1G48 A;  4CNR A;  4Q7P A;  4RIV A;  2WEG A;  5DSI A;  1CAJ A;  2OSF A;  3JXG A;  3PJJ A;  3M1W A;  3RZ1 B;  5E5R A;  3OY0 A;  1TH9 A;  4YGF A;  3M98 A;  4Q09 A;  3W6I A;  1ZH9 A;  2HFW A;  5CJF A;  4YX4 A;  5JG3 B;  5FNG A;  3EFT A;  5E2R A;  4KNM A;  3MHI A;  1CZM A;  2NWY A;  3S97 A;  4HEW A;  3V3I B;  3TVN X;  4CA2 A;  5L6K A;  4K13 A;  5DSK A;  1G0E A;  4YGN A;  4PZH A;  3DC3 A;  4QTL A;  1I9P A;  1CVF A;  5FLS A;  3P44 A;  2CBD A;  4YHA A;  4WL4 A;  4ZWY A;  3K2F A;  3UYQ A;  4HT2 A;  5E28 A; 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