1YDAA

Structural basis of inhibitor affinity to variants of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSETTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis of inhibitor affinity to variants of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
molecule tags Hydro-lyase
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1994-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ydaA00
1HCAA 4RUXA 1G45A 1HEAA 5FLTA 3C7PA 5EKMA 3SBIA 5JGSB 3MNAA 3U3AX 3MNHA 1CNBA 2CBEA 4MO8A 2GEHA 3T82A 3M2YA 1ZSBA 3M3XA 3RGEA 4PXXA 5FLQA 3D9ZA 1CINA 4Q8YA 4WUQA 1I9NA 1BNTA 1ZGEA 3S9TA 1G53A 1HUHA 1KOQA 2POWA 1RZBA 4WR7A 4Y0JA 3RYYA 3VBDA 4XZ5A 1YDDA 1G0EA 2ZNCA 4BF6A 5CA2A 3MHCA 2HKKA 1TH9A 1FSQA 1G54A 4FL7A 1MOOA 1ZGFA 3MWOA 4PYYA 5EH5A 3HLJA 1ZH9A 1KEQA 4R59A 3DD8A 1CCTA 1CNHA 4K0SA 4KUWA 1FSRA 1CVBA 1XEVA 3DVDA 1Z93A 5DSLA 1RAZA 3D93A 1H9QA 3W6HA 4YXOA 3M2ZA 5JGTB 3NI5A 3V7XA 3HKUA 1YDAA 2X7TA 4WUPA 3M1WA 4Z1EA 3V5GA 4M2UA 2HD6A 5FLSA 1UGEA 2WD2A 3P55A 4KUYA 5JQ0A 1TG9A 3RJ7A 1G46A 2AX2A 1BICA 3MNKA 4QK2A 5SZ7A 3S8XA 1CVAA 3M1KA 4Q90A 2WD3A 1LG5A 3DCWA 3T84A 3DBUA 2FOYA 5DOHA 5A6HA 2Q1QA 3KOKA 4RFDA 5E2NA 3M40A 3S72B 3M2NA 5SZ2A 1BNWA 4QJPA 5AMLA 3R16A 4PZHA 1AZMA 1IF5A 5FL5A 1UGAA 4PQ7A 4Q7PA 2Q1BA 2CBAA 1CNYA 3K2FA 1BNVA 5G0BA 5EHEA 4KP8A 4Q81A 1IF7A 4E5QA 3L14A 3CA2A 1IF8A 5FLRA 3SAPA 4WL4A 3V3GB 4CACA 5DSPA 3N0NA 1YO0A 3HFPA 3S73B 1JCZA 4RUZA 4Q8ZA 4ZAOA 1G1DA 4QIYA 1I9PA 1TEQX 5JEHB 3DC9A 4ETQC 1YDCA 4LHIA 3V3JA 4XFWA 1BNUA 3RYVB 1BN3A 1BN1A 4QEFA 3B4FA 3M98A 3P3JA 1FQLA 5E5RA 3T5UA 4YYTA 3P5AA 4HT0A 4IWZA 3RG3A 4Q9YA 3P4VA 3ML5A 1CNKA 1HUGA 1CAJA 2NWPA 3TVNX 5E2SA 3TMJA 2FOQA 3R17B 3T83A 4XE1A 1CCSA 5SZ1A 3EFTA 4IDRX 2O4ZA 1MUAA 1RZAA 4COQA 2FOUA 5DSJA 1TB0X 2NXRA 9CA2A 3DD0A 1IF6A 3DAZA 5FNLA 1LG6A 4MLTA 3FE4A 3P44A 3FW3A 5C8IA 5FNMA 3IBIA 1HCBA 3KNEA 1LGDA 1LUGA 2X7SA 5E2RA 1UGCA 2AW1A 4YGJA 3S74B 4CNVA 3BL0A 4X5SA 3M5EA 5EKHA 3MHOA 4L5UA 2GD8A 3V3HB 4R5BA 3UYNA 3P58A 1I91A 3RZ0B 3KWAA 5G0CA 3KS3A 5CACA 1V9IC 1JV0A 3KKXA 1DCAA 2H4NA 4QSBA 3S97A 3K34A 3BETA 4Q6EA 2FNMA 4BF1A 2NNVA 3OYQA 4QJ0A 5EIJA 1CAMA 3SBHA 3OIMA 1THKA 4MDGA 4HBAA 5JQTA 1BNMA 1KOPA 3QYKA 4Z1NA 2W2JA 5FNIA 3T5ZA 3RG4A 4K0TA 5JEPB 3MNJA 1CA2A 5FL6A 3IGPA 3F7UA 3IAIA 2POUA 4Q06A 1BNQA 1I9QA 3KIGA 3N4BA 4K1QA 3V2MA 1AVNA 1CVDA 3K7KA 5EHVA 1TBTX 1CAZA 1RJ6A 4HEZA 1LZVA 3NJ9A 1FR4A 4WW6A 1TEUX 5FLPA 5FNKA 4RUYA 1I9MA 3PO6A 5DVXA 4HEYA 1ZSAA 3ZNCA 4UOVA 2HFWA 3MZCA 1XQ0A 1G0FA 1HEDA 4Q07A 1XPZA 1TG3A 4K0ZA 5CLUA 3U7CA 4K13A 4KUVA 4QK3A 2NNGA 1H9NA 1CVEA 5IPZA 4ZWXA 4RH2A 2ABEA 5CJFA 1UGBA 4CNXA 4E49A 3F7BA 4FPTA 4E3DA 3IBNA 5DSOA 4QSAA 1Y7WA 3MNUA 1CAIA 1CZMA 1DCBA 1FLJA 1G4OA 3KOIA 1HVAA 3MHIA 5G01A 3MHMA 4N16A 2NXSA 1I9OA 3LXEA 4QSJA 4Q09A 1CRAA 2FMZA 1CNWA 2POVA 4Q99A 3M5TA 5JESB 5AMGA 1CAKA 3DV7A 5FLOA 5SZ4A 1CAOA 2X7UA 1G48A 1CNCA 1AM6A 5FNGA 2CBCA 1KWQA 5BNLA 3F8EA 4QK1A 3RZ8A 4Z1KA 5E2KA 1HECA 2QOAA 5DSMA 1CALA 6CA2A 1EOUA 5DSRA 2WEOA 4Q08A 3RYXB 4Q83A 3S75B 5DSNA 5SZ5A 3DA2A 3IBUA 1CIMA 1FQRA 1BN4A 5G03A 1BV3A 5FNJA 1YO2A 4QTLA 1FSNA 2NN1A 4HT2A 4KNJA 4ZWZA 3PJJA 5BYIA 2EU3A 3M04A 2CA2A 4Z0QA 5E28A 5BRWA 3Q31A 4QJXA 2OSMA 3P5LA 5E5UA 4ZWIA 2FOVA 3KLDB 4BCWA 4E4AA 3M1JA 1CVHA 4FVOA 1T9NA 3D92A 3IEOA 3JXFA 1CCUA 4JSWA 4LU3A 4M2RA 4Q8XA 4YGNA 3DCSA 1IF4A 5JDVB 2Q38A 5BRVA 1UGFA 4GL1X 1HEBA 3M2XA 1RJ5A 4Q7WA 3M96A 3RYJB 3F4XA 3S77B 4YVYA 3UYQA 4XIWA 2VVAX 3DC3A 1CAYA 4G0CA 2NXTA 3D8WA 4Q0LA 3OKUA 4FIKA 3DVCA 5SZ3A 1FQMA 4MDLA 4N0XB 4QY3A 2H15A 1CVFA 1URTA 2CABA 4KNNA 3RLDA 12CAA 2F14A 3M67A 1XEGA 5DSIA 4YHAA 4QJMA 5BRUA 4YGFA 5DSQA 1FQNA 4MDMA 1CA3A 2FNKA 2NNSA 3V3FA 2WEGA 1G6VA 4E3HA 4QIZA 1F2WA 1FR7A 4JSAA 4RFCA 1G4JA 3GZ0A 1BZMA 2IT4A 3ZP9A 4ITOA 3ML2A 1CRMA 3U45X 4CNRA 3NB5A 3OIKA 4ZX0A 1BCDA 3OILA 4Q7VA 4KV0A 3RZ1B 2ILIA 4MTYA 3OKVA 3P3HA 4HEWA 4YWPA 3RYZA 1DMXA 3MMFA 2NWZA 4R5AA 3N3JA 4RN4A 3U47A 5FNHA 1ZE8A 2FMGA 1Z97A 1I9LA 5L3OA 5FDIA 2QO8A 5AMDA 4JSSA 4Q87A 1UGGA 1V9EA 3KONA 4FVNA 4Q78A 4E3FA 3S78B 4XIXA 2EZ7A 1IF9A 4CQ0A 3N2PA 4ZWYA 1CVCA 1DMYA 5A25A 2WEHA 3MDZA 1ZSCA 5FL4A 4TWMA 4YGKA 4Q49A 1OKMA 1TE3X 4CNWA 3MYQA 3PYKA 1ZNCA 3RZ5A 5HPJA 4DZ9A 3V2JA 3DVBA 2NMXA 3OYSA 4M2VA 1KWRA 5JG5B 1A42A 1TTMA 3BL1A 1I90A 4KAPA 1H4NA 2HOCA 5LMDA 4JSZA 3CZVA 4HF3A 3CYUA 4ITPA 3M14A 1CNGA 1YO1A 4QSIA 4YGLA 4E9OX 1YDBA 4G7AA 4L5WA 3HS4A 4MLXA 4C3TA 4Q7SA 3EFIA 5DRSA 4KP5A 1RZDA 2NWOA 2EU2A 4FRCA 5EOIA 4RIUA 1CILA 2HL4A 3DCCA 5L6KA 4L5VA 2NWYA 1OKNA 4KNIA 4M2WA 1G3ZA 1ZFKA 1OKLA 5J8ZA 8CA2A 4LP6A 4JS6A 4TWLA 3HKTA 5DSKA 3M1QA 3HKNA 3SAXA 5DOGA 5E2MA 2VVBX 3S71B 2HNCA 4QJOA 5EH8A 5JEGB 1CNJA 3JXHC 4ZX1A 5EHWA 2NNOA 4RIVA 2CBBA 2FNNA 1RZEA 4PYXA 4DZ7A 3RZ7A 1JD0A 5EZTX 5EKJA 1RAYA 3M5SA 2WEJA 3HKQA 5JG3B 3MHLA 4QJWA 1UGDA 3OY0A 4HU1A 3B1BA 4ILXA 3S76A 4YX4A 3TVOX 4YXIA 3FFPX 3V3IB 5EH7A 2OSFA 3W6IA 2QP6A 4Q6DA 2FOSA 3JXGA 4KNMA 2NN7A 1ZFQA 4WW8A 5FDCA 3D0NA 1CAHA 1CANA 1CNIA 4Z1JA 3T85A 7CA2A 3CAJA 4E3GA 1J9WA 3MNIA 1RZCA 1G52A 1Z9YA 4FU5A 2FW4A 1OQ5A 4CA2A 3IBLA 1CNXA 1I8ZA 2CBDA 4YXUA 5SZ0A 5SZ6A 1BNNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HCA A;  4RUX A;  1G45 A;  1HEA A;  5FLT A;  3C7P A;  5EKM A;  3SBI A;  5JGS B;  3MNA A;  3U3A X;  3MNH A;  1CNB A;  2CBE A;  4MO8 A;  2GEH A;  3T82 A;  3M2Y A;  1ZSB A;  3M3X A;  3RGE A;  4PXX A;  5FLQ A;  3D9Z A;  1CIN A;  4Q8Y A;  4WUQ A;  1I9N A;  1BNT A;  1ZGE A;  3S9T A;  1G53 A;  1HUH A;  1KOQ A;  2POW A;  1RZB A;  4WR7 A;  4Y0J A;  3RYY A;  3VBD A;  4XZ5 A;  1YDD A;  1G0E A;  2ZNC A;  4BF6 A;  5CA2 A;  3MHC A;  2HKK A;  1TH9 A;  1FSQ A;  1G54 A;  4FL7 A;  1MOO A;  1ZGF A;  3MWO A;  4PYY A;  5EH5 A;  3HLJ A;  1ZH9 A;  1KEQ A;  4R59 A;  3DD8 A;  1CCT A;  1CNH A;  4K0S A;  4KUW A;  1FSR A;  1CVB A;  1XEV A;  3DVD A;  1Z93 A;  5DSL A;  1RAZ A;  3D93 A;  1H9Q A;  3W6H A;  4YXO A;  3M2Z A;  5JGT B;  3NI5 A;  3V7X A;  3HKU A;  1YDA A;  2X7T A;  4WUP A;  3M1W A;  4Z1E A;  3V5G A;  4M2U A;  2HD6 A;  5FLS A;  1UGE A;  2WD2 A;  3P55 A;  4KUY A;  5JQ0 A;  1TG9 A;  3RJ7 A;  1G46 A;  2AX2 A;  1BIC A;  3MNK A;  4QK2 A;  5SZ7 A;  3S8X A;  1CVA A;  3M1K A;  4Q90 A;  2WD3 A;  1LG5 A;  3DCW A;  3T84 A; 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