1YO0A

Proton transfer from his200 in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGAAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTHPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Proton transfer in a Thr200His mutant of human carbonic anhydrase II
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase II
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2005-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1yo0A00
3K7KA 4Q99A 3V7XA 3DCCA 4MLXA 3M3XA 1I9LA 1CNCA 4QSIA 3T84A 4N16A 1BNUA 3U47A 3C7PA 1CNKA 3F7UA 4YGJA 1BV3A 3S78B 3MNIA 3IAIA 4FIKA 5EKMA 2FW4A 1BNQA 5BNLA 1KWRA 4QJXA 2GD8A 5DSMA 2NXRA 5FL4A 4R59A 5SZ2A 3SAXA 1ZGFA 5JQ0A 1TE3X 2WD3A 1FQLA 1Z93A 4UOVA 4YWPA 3P55A 4HEWA 2NN7A 1CINA 4WL4A 5G0BA 3EFIA 4RUYA 3U7CA 3DBUA 4PYYA 1V9EA 3R17B 3MNAA 4JS6A 3T82A 4K0SA 4Q8ZA 3M2ZA 1BNTA 2WD2A 1RZEA 3EFTA 1FQRA 3N4BA 4KV0A 3MNUA 1KOPA 3DAZA 3V2JA 3RYXB 3W6IA 1IF4A 4Q7SA 5HPJA 1RJ6A 5FNGA 5BRVA 1UGBA 4XIWA 4CNRA 1IF7A 4Q7VA 1BCDA 5EOIA 3CZVA 2NNVA 1LUGA 4COQA 1TG9A 5FNIA 1J9WA 1CA2A 3DCSA 3PJJA 2CBBA 4ZX0A 1TH9A 3MNJA 5DSOA 1UGFA 6CA2A 3P3JA 3S73B 4QEFA 3M5EA 1G3ZA 3KKXA 4L5VA 3RZ7A 2FMGA 4YGFA 1TTMA 1ZSBA 2NXSA 3M1WA 3KNEA 2FOVA 4MTYA 1CAIA 1CAYA 3RGEA 3ML2A 1JCZA 1I9QA 2HNCA 4RUXA 4E9OX 1I9NA 3HKTA 3T5ZA 1THKA 1LG6A 1CAOA 2FOSA 2QO8A 4LP6A 3FE4A 4QSBA 3MHIA 3K2FA 5CLUA 1CNGA 1CVEA 2NMXA 3M2XA 1OKLA 4QIYA 3GZ0A 4YXIA 3S75B 4Q08A 3BL0A 3MMFA 5SZ1A 3VBDA 4Q7WA 3QYKA 1CNBA 1I9OA 4WW6A 4E3DA 5FDCA 3S74B 1XEGA 1ZNCA 1EOUA 1CNIA 3D93A 3JXHC 1CCSA 4WR7A 1BNVA 4QJOA 3TVOX 4JSSA 3RLDA 5G03A 1ZFKA 5JGTB 2F14A 3KIGA 5JEPB 1FLJA 4K0TA 2FOYA 3B1BA 1XPZA 1LGDA 3KONA 4Q06A 4HT0A 1MUAA 4LHIA 5FLOA 4CACA 4HF3A 3U3AX 2NNGA 4YGLA 1HECA 4WUPA 2GEHA 2EU3A 1CAHA 1JD0A 1CVBA 1I91A 4M2VA 4X5SA 1DCAA 4Q8YA 1ZFQA 5EKHA 3RZ8A 5JEHB 4G0CA 3RG4A 5JESB 1IF9A 1CALA 1KEQA 1CVHA 1URTA 1FQNA 4Q07A 3PO6A 5DSKA 4MDLA 3M04A 2POWA 4PXXA 3RZ0B 2ZNCA 5AMGA 3S71B 5LMDA 4PQ7A 1FSNA 1HEDA 3MDZA 3Q31A 5FLRA 5E2NA 4IWZA 3OKUA 3T83A 3HKQA 4Q7PA 4HT2A 1RZDA 4RN4A 4KP5A 5AMDA 4Q90A 2CBDA 4CNWA 4K13A 2FNMA 4QJWA 4WUQA 3V2MA 4YYTA 3N2PA 1IF5A 3MWOA 3RYVB 2Q1QA 1G52A 5CA2A 1H9QA 3S9TA 3KWAA 5DSPA 3NJ9A 1CVFA 4KAPA 4FU5A 1I90A 4R5BA 4XZ5A 3HLJA 1CVAA 3DA2A 4K1QA 3FFPX 3SAPA 4FVNA 3V5GA 4RIUA 5FLSA 5JQTA 3MNKA 3F7BA 4CA2A 4Q8XA 2FNKA 2W2JA 4RFCA 2NWPA 1HUGA 4Q0LA 3OY0A 5DSQA 5L3OA 5JG5B 1G53A 1CAZA 1ZH9A 1RZAA 1AVNA 2WEGA 1CVDA 2IT4A 2HD6A 4DZ9A 1TEUX 1BN4A 4QSAA 3OIKA 5FNHA 2EZ7A 1ZE8A 3HFPA 4QK2A 4HEYA 5E2KA 3MNHA 4HBAA 2CBEA 1KOQA 1XQ0A 2QP6A 3P5LA 3MHOA 4CNXA 4QIZA 1TEQX 4QJMA 5EH8A 5EZTX 4Z1EA 1ZSCA 5FNKA 4MO8A 3M14A 4PZHA 5E28A 5DOHA 3IGPA 5G0CA 1UGDA 3M2YA 1Y7WA 3M5SA 4ZX1A 4QK3A 1BZMA 1G0FA 1YO2A 3IBIA 3M5TA 4YGNA 9CA2A 1AZMA 1RJ5A 1HCAA 1ZGEA 3RG3A 4L5WA 4Z1KA 5EH7A 4RH2A 4KUVA 3TVNX 4GL1X 5CACA 1I9MA 3IEOA 3S77B 2H4NA 3RYYA 3KOIA 5FDIA 3RZ5A 4HEZA 4KUYA 5JEGB 5DSIA 1BN1A 3RYZA 1YDBA 2X7UA 3FW3A 5JG3B 3M98A 1HEAA 5EKJA 3P44A 4Q09A 3D92A 1HEBA 3P58A 3OILA 3D0NA 4ITPA 2FOUA 3OYQA 4JSWA 3B4FA 1FQMA 4KNJA 4BF6A 3MZCA 1HUHA 2CABA 3M1QA 2OSFA 3MYQA 1AM6A 5CJFA 1CAKA 3CA2A 1G6VA 3F4XA 3N3JA 1CILA 2NNSA 2X7TA 4YX4A 4FPTA 8CA2A 3NI5A 1YDCA 1OKNA 2Q38A 4L5UA 4Q87A 5FNLA 5SZ3A 4RFDA 5J8ZA 2WEJA 3DV7A 1UGGA 2FOQA 4Q6EA 3HS4A 5E5UA 4Z0QA 3ML5A 3CYUA 3M40A 2WEOA 5BRUA 4Q49A 4QY3A 3DC3A 3RJ7A 3IBUA 5SZ4A 3KS3A 4MDMA 4XIXA 5SZ0A 1Z9YA 5E2MA 4PYXA 4FVOA 4MLTA 1A42A 2WEHA 4LU3A 4BF1A 4QSJA 3MHMA 1FR7A 1G46A 1I9PA 2VVBX 1CNHA 1KWQA 3M1KA 1YO0A 5FLTA 3KLDB 1TBTX 4DZ7A 4ZWYA 5IPZA 2EU2A 3ZP9A 12CAA 5C8IA 1LZVA 5DOGA 4ETQC 1TB0X 3OYSA 4WW8A 2ILIA 2AX2A 4Q78A 1CA3A 1CAJA 1RAYA 2HKKA 3BL1A 1CNYA 1TG3A 1CNWA 4QK1A 5DVXA 2ABEA 5DRSA 1CANA 4KNMA 2POUA 5G01A 1LG5A 3JXGA 2AW1A 1RAZA 1UGAA 4RUZA 5SZ6A 3S72B 4CNVA 3HKUA 5EHEA 5DSJA 5DSNA 1CNJA 1IF8A 2CA2A 4TWLA 3OKVA 1CZMA 5JDVB 1H4NA 5FL6A 1YDDA 4FL7A 3DVDA 1IF6A 1Z97A 3BETA 1JV0A 2NWYA 3DD8A 1BICA 1MOOA 1CNXA 3M96A 3PYKA 1FSRA 5SZ5A 5FNJA 1I8ZA 4XFWA 5FNMA 3UYQA 1BNMA 1CIMA 1BNNA 3DVCA 4YVYA 3V3GB 2QOAA 4ITOA 5BRWA 1DCBA 3CAJA 4CQ0A 3TMJA 4Z1JA 4C3TA 3S97A 4BCWA 1OKMA 4YHAA 2Q1BA 5E2SA 5EIJA 4R5AA 5A25A 5DSRA 4E3GA 1CVCA 1G48A 1UGCA 2CBAA 5EHVA 1BNWA 1G4OA 4N0XB 5E2RA 4JSAA 4KUWA 4FRCA 1G54A 5EH5A 3V3HB 3SBHA 3OIMA 1T9NA 1DMYA 1YO1A 2NWOA 3HKNA 4ILXA 4YGKA 4Q6DA 4E3HA 5FLPA 2H15A 4QJ0A 1UGEA 4JSZA 3D8WA 3M2NA 4ZAOA 1CCUA 1DMXA 3S76A 3L14A 3DVBA 3T85A 4Z1NA 3K34A 3JXFA 2FNNA 4E49A 3IBLA 4QTLA 5FLQA 3R16A 2OSMA 2HOCA 3V3FA 4E4AA 3V3JA 2O4ZA 3P3HA 4YXUA 4M2UA 1G1DA 4Q81A 1CCTA 1CRMA 4G7AA 3UYNA 1V9IC 1ZSAA 2HFWA 4ZWXA 1FSQA 1RZCA 2X7SA 4Y0JA 4K0ZA 2FMZA 3DCWA 5SZ7A 3SBIA 1FR4A 5EHWA 3RZ1B 3DC9A 1CAMA 4MDGA 3M1JA 3NB5A 1RZBA 2VVAX 2NWZA 3IBNA 4KP8A 5AMLA 3DD0A 4M2RA 4Q83A 1HVAA 3D9ZA 5BYIA 4ZWIA 3S8XA 4YXOA 3P4VA 5JGSB 3MHLA 1XEVA 4ZWZA 3LXEA 4HU1A 2NNOA 5DSLA 2HL4A 1HCBA 5L6KA 3V3IB 3F8EA 3M67A 4KNNA 2POVA 3T5UA 3W6HA 4XE1A 5FL5A 4M2WA 2NN1A 3RYJB 4KNIA 1H9NA 3MHCA 4TWMA 1G4JA 5A6HA 1YDAA 3ZNCA 2NXTA 4RIVA 1G0EA 5E5RA 1CRAA 1F2WA 2CBCA 4Q9YA 3U45X 1BN3A 4E3FA 7CA2A 3N0NA 4QJPA 3P5AA 1OQ5A 4IDRX 4E5QA 1G45A 3KOKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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