1Z97 | Genus

Total Genus 73

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	73
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	263
structure length	263
Chain Sequence	EWGYASHNGPDHWHELFPNAKGENQSPIELHTKDIRHDPSLQPWSVSYDGGSAKTILNNGKTCRVVFDDTYDRSMLRGGPLPGPYRLRQFHLHWGSSDDHGSEHTVDGVKYAAELHLVHWNPKYNTFKEALKQRDGIAVIGIFLKIGHENGEFQIFLDALDKIKTKGKEAPFTKFDPSSLFPASRDYWTYQGSLTTPPCEECIVWLLLKEPMTVSSDQMAKLRSLLSSAENEPPVPLVSNWRPPQPINNRVVRASFKHHHHHH

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__542737603517843__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__542737603517843__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/1z97/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__542737603517843__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"542737603517843","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/1z97/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__542737603517843__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Human Carbonic Anhydrase III: Structural and Kinetic Study of Catalysis and Proton Transfer pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase III
total genus	73
structure length	263
sequence length	263
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2005-03-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	1z97A00

1G1DA 3P44A 1LZVA 5FDIA 4QK1A 5JEHB 3MMFA 4LP6A 3S9TA 1CRAA 5JG5B 1ZSBA 5FNKA 2QO8A 2NWZA 4KNNA 2OSFA 3W6HA 3M1JA 1JCZA 5SZ1A 3MHCA 5DOGA 3S76A 2CBDA 2FNMA 1HUHA 3CAJA 4CNRA 1CAZA 3RJ7A 5DRSA 1CNYA 1KOPA 1ZSCA 3SAXA 1I8ZA 2WEJA 5AMLA 4KNMA 3ML2A 4YWPA 3KS3A 4ETQC 3R17B 4YGKA 4E5QA 1FSNA 1V9IC 3BETA 3D92A 2FNKA 1URTA 4E3FA 2NXTA 1CAHA 4IWZA 1CANA 1CVEA 3L14A 5G0BA 3OIKA 1BNMA 3VBDA 4Q83A 3RZ0B 1IF7A 3LXEA 1I91A 4E9OX 4YXOA 3P5AA 1CNJA 1YDDA 4K13A 5FNHA 3M2ZA 1DMXA 5L3OA 4YXUA 4Q6EA 5FLTA 2NWOA 2FOVA 1XQ0A 1G4OA 4QIYA 1HUGA 1BNVA 1V9EA 12CAA 2HL4A 2WD3A 1UGBA 2O4ZA 3MHLA 1RZDA 5DOHA 2WD2A 3OKVA 1OQ5A 1YDCA 1F2WA 3S71B 3DA2A 4HEYA 1UGDA 1YO0A 4L5UA 1ZGFA 2H15A 4G0CA 5EH8A 4MLXA 4MLTA 5EZTX 5DSKA 3HKNA 2CBEA 5FLQA 3SBIA 3DVDA 3W6IA 4BCWA 3M2YA 2FOQA 4WW6A 4G7AA 1TG3A 4Z1EA 1CAYA 2ABEA 3V3HB 3PO6A 1CINA 3KNEA 1KOQA 3IBNA 3KLDB 3MNAA 4HF3A 3HKQA 4WR7A 1BN1A 1TH9A 3EFIA 3SBHA 1BNTA 3M96A 4K1QA 1DCAA 4Q8XA 3MZCA 3FFPX 3M3XA 3P55A 3DCSA 3NI5A 1CA3A 3KKXA 1RZBA 4FU5A 4HU1A 1RZAA 5EHEA 1TB0X 4M2WA 4QJMA 3P4VA 3MWOA 2HKKA 3S75B 5DSLA 4MDMA 1G0EA 2CBCA 3SAPA 5SZ6A 1JD0A 4ZWYA 2VVBX 1G4JA 4ZX1A 3MNIA 3RG3A 2GD8A 1CCUA 5FNIA 3T85A 1UGEA 1IF4A 3JXHC 3U3AX 3S77B 4CACA 5FLPA 4BF1A 2NNOA 1CA2A 4N0XB 4Z0QA 1FSQA 3RZ1B 1AVNA 1G46A 4E4AA 2Q38A 4Q9YA 5CLUA 5JEPB 2CBBA 3M2XA 4WW8A 5EHWA 4FL7A 3OILA 2WEGA 3P3JA 4RFCA 1CCTA 4QJOA 3T83A 3DBUA 3KOKA 3S97A 1G48A 3KWAA 4TWMA 4E3GA 1T9NA 2NXRA 4XIXA 3RZ7A 1RZCA 3RYZA 1BV3A 1ZE8A 5EOIA 5FDCA 5E2SA 3RG4A 2Q1BA 3V2JA 2CABA 2POVA 4Q7PA 4Z1JA 3V2MA 1CALA 3IEOA 4PYYA 5EKJA 1ZSAA 3U7CA 3V5GA 1H9NA 3GZ0A 1CNXA 1BNUA 4E3DA 1CAMA 3M04A 2FMZA 5DVXA 4L5WA 1TG9A 3DC3A 1I9QA 3M98A 5EIJA 3UYQA 3MNUA 4RUYA 1Z93A 1YO1A 4KUVA 1AM6A 4YX4A 3HS4A 1CNBA 3DAZA 1BCDA 3DV7A 4ITPA 3S73B 5C8IA 2HD6A 3IAIA 4QSBA 3F7BA 3ML5A 4RH2A 5EKMA 5SZ4A 4KUYA 2WEOA 5AMDA 3M5TA 5EKHA 1KWRA 5DSQA 3IGPA 4QJWA 1UGGA 4L5VA 4QIZA 1AZMA 1TBTX 5JEGB 4Q90A 5BRWA 4Q7WA 3RYJB 3D0NA 4KP8A 1G0FA 1Y7WA 4ZWIA 2FOSA 4HT0A 7CA2A 1ZGEA 1CCSA 4Q08A 3M14A 3U45X 1CNGA 4QY3A 3NB5A 4BF6A 4PXXA 1G6VA 1TTMA 1DMYA 1YDBA 2OSMA 1RAYA 1CAOA 1YO2A 1I9PA 5J8ZA 5BRUA 4Z1NA 3HFPA 3DD8A 1RZEA 2NN1A 4ZAOA 1KEQA 3MYQA 4Q8ZA 1CNHA 1CVHA 4QEFA 2IT4A 1Z9YA 4QSAA 3MNJA 4RIUA 3D9ZA 4MTYA 2EU2A 3KOIA 4KP5A 1ZNCA 5E2NA 3Q31A 3OKUA 4PYXA 3IBLA 1HEAA 2H4NA 2NN7A 3OIMA 5FNJA 4Q81A 5CJFA 5DSRA 4FVOA 4QTLA 1I90A 1TEQX 3BL0A 4LHIA 4PZHA 4RIVA 5A25A 4RUZA 1UGFA 2AX2A 1HVAA 3V3JA 1ZFKA 4C3TA 5FLOA 1CZMA 1RJ6A 1LG5A 2WEHA 3DVBA 9CA2A 5FNMA 1I9OA 3T82A 4RUXA 4FIKA 4YHAA 1RAZA 1CAJA 1XEVA 4Q0LA 4Q7VA 3DCWA 1H9QA 5JG3B 4K0TA 3TMJA 4CNWA 3V3GB 2ZNCA 1H4NA 3IBIA 4YVYA 1BNWA 1TE3X 3P3HA 6CA2A 1G52A 3MHMA 3JXGA 5EH5A 2FW4A 1HCBA 4Q49A 3RYYA 3HKUA 4DZ9A 1OKNA 4QK2A 4QK3A 5FL6A 1I9LA 4HBAA 4QSJA 3QYKA 4K0ZA 5L6KA 4ZWZA 1G45A 3M1KA 4IDRX 1CAKA 1ZH9A 3R16A 3IBUA 2POUA 4HEZA 1CVAA 3N3JA 2NXSA 5FLSA 4XFWA 2POWA 2VVAX 3RLDA 3DVCA 2EZ7A 4WL4A 1IF9A 4R5AA 1CVFA 4CNVA 4QJ0A 5BNLA 1J9WA 5AMGA 5SZ7A 4Z1KA 3HKTA 4JSWA 5E5RA 4LU3A 1IF8A 3UYNA 5JQ0A 3M2NA 4JSSA 3OY0A 4Q07A 5G0CA 5CACA 3F7UA 5DSNA 1IF6A 4Q99A 2HNCA 4HT2A 1IF5A 5FLRA 3RZ8A 3MNKA 1HEDA 4ITOA 5E5UA 5EH7A 2X7SA 1CILA 1FQNA 2W2JA 3V3FA 1CNCA 1FQRA 1JV0A 5JQTA 4RN4A 1EOUA 2NNVA 1CAIA 5FL4A 4YXIA 3M40A 3MNHA 4Q8YA 3FE4A 3NJ9A 4MDLA 5SZ2A 3RYVB 2FNNA 3TVOX 3TVNX 5BYIA 1LUGA 3OYSA 4E49A 1CVBA 4TWLA 4YGLA 3MHOA 5BRVA 1CVCA 4Q78A 2NNSA 5E28A 3B4FA 3CA2A 3MHIA 5DSPA 4CA2A 1I9MA 1OKMA 4YYTA 4ILXA 5A6HA 4XIWA 4ZWXA 2FMGA 4KNIA 5EHVA 4JSAA 4WUPA 3N2PA 3RZ5A 4E3HA 1FR4A 3N0NA 1I9NA 1HEBA 3S78B 3V3IB 1G53A 3DC9A 3K7KA 1CNWA 1G54A 1A42A 4Q7SA 4PQ7A 3P5LA 1UGCA 1TEUX 1BNNA 3M67A 3K34A 1LG6A 4ZX0A 5JGSB 3KONA 5G01A 3S8XA 4JSZA 4X5SA 1HCAA 3P58A 3JXFA 4N16A 4YGNA 8CA2A 3T5UA 1OKLA 1G3ZA 2NWYA 3M1WA 3S74B 5SZ3A 1FQMA 3K2FA 3RYXB 4FRCA 4DZ7A 5E2MA 4KV0A 4XE1A 2NMXA 2QOAA 3M5SA 3V7XA 5CA2A 4K0SA 1RJ5A 2HFWA 2FOYA 5E2KA 1CNIA 1CNKA 1MOOA 3F4XA 3DCCA 2HOCA 3KIGA 4M2UA 5DSOA 3RGEA 2FOUA 3B1BA 3M1QA 3MDZA 2CA2A 3ZP9A 3D93A 4M2VA 3HLJA 1LGDA 4YGFA 2NNGA 4QJPA 2QP6A 1THKA 1FLJA 2CBAA 4YGJA 3D8WA 3EFTA 4Q87A 5DSMA 1CVDA 3CZVA 4JS6A 4KAPA 4HEWA 1BICA 2F14A 2X7TA 5JGTB 2X7UA 4QJXA 1CRMA 5JDVB 5LMDA 5SZ5A 4Y0JA 4FPTA 4KUWA 4XZ5A 4GL1X 3T5ZA 3PYKA 1UGAA 2Q1QA 4R59A 2AW1A 4CQ0A 1BN3A 2ILIA 3C7PA 4KNJA 4CNXA 4RFDA 3S72B 5FL5A 5DSIA 5SZ0A 4FVNA 5IPZA 5FNGA 3BL1A 1HECA 1BZMA 3OYQA 3T84A 5JESB 3FW3A 1YDAA 2NWPA 5DSJA 3CYUA 4M2RA 5E2RA 5FNLA 4MO8A 4Q06A 1BNQA 4UOVA 4R5BA 1DCBA 2GEHA 1MUAA 1FQLA 1CIMA 1FR7A 1ZFQA 1BN4A 4Q09A 1XEGA 3M5EA 5HPJA 3ZNCA 3DD0A 1XPZA 1FSRA 4QSIA 1KWQA 3F8EA 4Q6DA 4WUQA 2EU3A 3N4BA 4COQA 3U47A 1Z97A 4MDGA 5G03A 3PJJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G1D A;  3P44 A;  1LZV A;  5FDI A;  4QK1 A;  5JEH B;  3MMF A;  4LP6 A;  3S9T A;  1CRA A;  5JG5 B;  1ZSB A;  5FNK A;  2QO8 A;  2NWZ A;  4KNN A;  2OSF A;  3W6H A;  3M1J A;  1JCZ A;  5SZ1 A;  3MHC A;  5DOG A;  3S76 A;  2CBD A;  2FNM A;  1HUH A;  3CAJ A;  4CNR A;  1CAZ A;  3RJ7 A;  5DRS A;  1CNY A;  1KOP A;  1ZSC A;  3SAX A;  1I8Z A;  2WEJ A;  5AML A;  4KNM A;  3ML2 A;  4YWP A;  3KS3 A;  4ETQ C;  3R17 B;  4YGK A;  4E5Q A;  1FSN A;  1V9I C;  3BET A;  3D92 A;  2FNK A;  1URT A;  4E3F A;  2NXT A;  1CAH A;  4IWZ A;  1CAN A;  1CVE A;  3L14 A;  5G0B A;  3OIK A;  1BNM A;  3VBD A;  4Q83 A;  3RZ0 B;  1IF7 A;  3LXE A;  1I91 A;  4E9O X;  4YXO A;  3P5A A;  1CNJ A;  1YDD A;  4K13 A;  5FNH A;  3M2Z A;  1DMX A;  5L3O A;  4YXU A;  4Q6E A;  5FLT A;  2NWO A;  2FOV A;  1XQ0 A;  1G4O A;  4QIY A;  1HUG A;  1BNV A;  1V9E A;  12CA A;  2HL4 A;  2WD3 A;  1UGB A;  2O4Z A;  3MHL A;  1RZD A;  5DOH A;  2WD2 A;  3OKV A;  1OQ5 A;  1YDC A;  1F2W A;  3S71 B;  3DA2 A;  4HEY A;  1UGD A;  1YO0 A;  4L5U A;  1ZGF A;  2H15 A;  4G0C A;  5EH8 A;  4MLX A;  4MLT A;  5EZT X;  5DSK A;  3HKN A;  2CBE A;  5FLQ A;  3SBI A;  3DVD A;  3W6I A;  4BCW A;  3M2Y A;  2FOQ A;  4WW6 A;  4G7A A;  1TG3 A;  4Z1E A;  1CAY A;  2ABE A;  3V3H B;  3PO6 A;  1CIN A;  3KNE A;  1KOQ A;  3IBN A;  3KLD B;  3MNA A;  4HF3 A;  3HKQ A;  4WR7 A;  1BN1 A;  1TH9 A;  3EFI A;  3SBH A;  1BNT A;  3M96 A;  4K1Q A;  1DCA A;  4Q8X A;  3MZC A;  3FFP X;  3M3X A;  3P55 A;  3DCS A;  3NI5 A;  1CA3 A;  3KKX A;  1RZB A;  4FU5 A;  4HU1 A;  1RZA A;  5EHE A;  1TB0 X;  4M2W A;  4QJM A;  3P4V A;  3MWO A;  2HKK A;  3S75 B;  5DSL A;  4MDM A;  1G0E A;  2CBC A;  3SAP A;  5SZ6 A;  1JD0 A;  4ZWY A;  2VVB X;  1G4J A;  4ZX1 A;  3MNI A;  3RG3 A;  2GD8 A;  1CCU A;  5FNI A;  3T85 A;  1UGE A;  1IF4 A;  3JXH C;  3U3A X;  3S77 B;  4CAC A;  5FLP A;  4BF1 A;  2NNO A;  1CA2 A;  4N0X B;  4Z0Q A;  1FSQ A;  3RZ1 B;  1AVN A;  1G46 A;  4E4A A;  2Q38 A;  4Q9Y A;  5CLU A;  5JEP B;  2CBB A;  3M2X A;  4WW8 A;  5EHW A;  4FL7 A;  3OIL A;  2WEG A;  3P3J A;  4RFC A;  1CCT A;  4QJO A;  3T83 A;  3DBU A;  3KOK A;  3S97 A;  1G48 A;  3KWA A;  4TWM A;  4E3G A;  1T9N A;  2NXR A;  4XIX A;  3RZ7 A;  1RZC A;  3RYZ A;  1BV3 A;  1ZE8 A;  5EOI A;  5FDC A;  5E2S A;  3RG4 A;  2Q1B A;  3V2J A;  2CAB A;  2POV A;  4Q7P A;  4Z1J A;  3V2M A;  1CAL A;  3IEO A;  4PYY A;  5EKJ A;  1ZSA A;  3U7C A;  3V5G A;  1H9N A;  3GZ0 A;  1CNX A;  1BNU A;  4E3D A;  1CAM A;  3M04 A;  2FMZ A;  5DVX A;  4L5W A;  1TG9 A;  3DC3 A;  1I9Q A;  3M98 A;  5EIJ A;  3UYQ A;  3MNU A;  4RUY A;  1Z93 A;  1YO1 A;  4KUV A;  1AM6 A;  4YX4 A;  3HS4 A;  1CNB A;  3DAZ A;  1BCD A;  3DV7 A;  4ITP A;  3S73 B;  5C8I A;  2HD6 A;  3IAI A;  4QSB A;  3F7B A;  3ML5 A;  4RH2 A;  5EKM A;  5SZ4 A;  4KUY A;  2WEO A;  5AMD A;  3M5T A;  5EKH A;  1KWR A;  5DSQ A;  3IGP A;  4QJW A;  1UGG A;  4L5V A;  4QIZ A;  1AZM A;  1TBT X;  5JEG B;  4Q90 A;  5BRW A;  4Q7W A;  3RYJ B;  3D0N A;  4KP8 A;  1G0F A;  1Y7W A;  4ZWI A;  2FOS A;  4HT0 A;  7CA2 A;  1ZGE A;  1CCS A;  4Q08 A;  3M14 A;  3U45 X;  1CNG A;  4QY3 A;  3NB5 A;  4BF6 A;  4PXX A;  1G6V A;  1TTM A;  1DMY A;  1YDB A;  2OSM A;  1RAY A;  1CAO A;  1YO2 A;  1I9P A;  5J8Z A;  5BRU A;  4Z1N A;  3HFP A;  3DD8 A;  1RZE A;  2NN1 A;  4ZAO A;  1KEQ A;  3MYQ A;  4Q8Z A;  1CNH A;  1CVH A;  4QEF A;  2IT4 A;  1Z9Y A;  4QSA A;  3MNJ A;  4RIU A;  3D9Z A;  4MTY A;  2EU2 A;  3KOI A;  4KP5 A;  1ZNC A;  5E2N A;  3Q31 A;  3OKU A;  4PYX A;  3IBL A;  1HEA A;  2H4N A;  2NN7 A;  3OIM A;  5FNJ A;  4Q81 A;  5CJF A;  5DSR A;  4FVO A;  4QTL A;  1I90 A;  1TEQ X;  3BL0 A;  4LHI A;  4PZH A;  4RIV A;  5A25 A;  4RUZ A;  1UGF A;  2AX2 A;  1HVA A;  3V3J A;  1ZFK A;  4C3T A;  5FLO A;  1CZM A;  1RJ6 A;  1LG5 A;  2WEH A;  3DVB A;  9CA2 A;  5FNM A;  1I9O A;  3T82 A;  4RUX A;  4FIK A;  4YHA A;  1RAZ A;  1CAJ A;  1XEV A;  4Q0L A;  4Q7V A;  3DCW A;  1H9Q A;  5JG3 B;  4K0T A;  3TMJ A;  4CNW A;  3V3G B;  2ZNC A;  1H4N A;  3IBI A;  4YVY A;  1BNW A;  1TE3 X;  3P3H A;  6CA2 A;  1G52 A;  3MHM A;  3JXG A;  5EH5 A;  2FW4 A;  1HCB A;  4Q49 A;  3RYY A;  3HKU A;  4DZ9 A;  1OKN A;  4QK2 A;  4QK3 A;  5FL6 A;  1I9L A;  4HBA A;  4QSJ A;  3QYK A;  4K0Z A;  5L6K A;  4ZWZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1Z97A

Total Genus

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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