2CBCA

Structure of native and apo carbonic anhydrase ii and some of its anion-ligand complexes
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure of native and apo carbonic anhydrase II and structure of some of its anion-ligand complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase(oxo-acid)
total genus 78
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2cbcA00
4E4AA 5A25A 5G01A 3M1QA 4QEFA 4ZWIA 3VBDA 5JESB 1G1DA 1CAHA 1G6VA 3DD0A 1CAKA 4JSZA 1TEQX 4Q06A 1CNCA 1RAZA 2FOQA 1RZEA 4HT2A 3V3IB 1BCDA 3K34A 1I9LA 1BZMA 3T85A 3RYXB 1Y7WA 4XIXA 1TEUX 4RFCA 3ZP9A 4KNNA 5EH5A 1BICA 1CNKA 4KP8A 1ZSAA 4FPTA 3Q31A 5DSRA 4BF1A 1ZE8A 2NNOA 3LXEA 4Y0JA 3W6IA 3HLJA 4HEWA 2NMXA 3M1WA 3M40A 3MNAA 5E5UA 5J8ZA 3DA2A 1ZGEA 3JXFA 1DCBA 3KS3A 3T5ZA 1RJ6A 2X7TA 3DAZA 4FIKA 4N16A 5E2MA 3QYKA 5FDCA 1YO1A 1ZNCA 3IBNA 4ZX1A 3U45X 2CA2A 3TMJA 3KONA 4ZWZA 1CNGA 1KWRA 3MNUA 4MTYA 4QK2A 3M04A 4RN4A 4LP6A 1HVAA 4Q78A 3RZ8A 1G54A 3D9ZA 3RYJB 4KP5A 4UOVA 2WD3A 3S76A 3KOKA 1FQRA 1T9NA 1FR7A 2H15A 2NNSA 2WD2A 4Q08A 1XQ0A 2FMGA 4WR7A 1G46A 3GZ0A 4K1QA 1JD0A 4Q7VA 2CBAA 4Z1NA 1I9OA 1OKLA 2FOVA 3M5EA 3S8XA 3M5TA 4MDMA 1LG5A 3CAJA 2NNGA 3P3HA 5EKMA 1CZMA 1THKA 2ILIA 5CLUA 4BF6A 3UYNA 2FNKA 3K2FA 2ABEA 1I8ZA 5EHWA 4RH2A 1G52A 3IAIA 4Q49A 4Q83A 2EZ7A 1FQLA 4E3FA 2W2JA 1CIMA 2WEHA 4QY3A 1TE3X 3P55A 4C3TA 3IGPA 1TTMA 5FLRA 1BNNA 5FNKA 1BNVA 1ZGFA 3MHMA 1CVHA 1MOOA 4Q6DA 2NXRA 4M2UA 5DSJA 1CAYA 1CNIA 2QOAA 3OYQA 4KAPA 1V9EA 4YGJA 5JGTB 4CACA 2QO8A 1FSNA 4R59A 5DOGA 5E2NA 4E3HA 1JV0A 1CINA 3FFPX 9CA2A 2Q1BA 1CRMA 2FNMA 1LZVA 4HU1A 3S77B 1CRAA 1FSRA 1IF8A 1LGDA 1G4JA 3U3AX 5FL6A 1A42A 1FR4A 5AMDA 5FNIA 1UGFA 1DCAA 2WEGA 4KUYA 4K0TA 2QP6A 4TWMA 1XEVA 1JCZA 1IF4A 3DCSA 4Q90A 1XEGA 1CNJA 3V3JA 4PYYA 1YDAA 4IWZA 1Z93A 5JG5B 4QJMA 1G48A 1V9IC 3DVBA 3HKUA 5BRUA 5CJFA 4COQA 2GD8A 3RJ7A 1FSQA 3DCCA 1BNTA 4QSAA 3BL1A 2HFWA 3W6HA 4QSJA 2FW4A 2HKKA 1RAYA 4XZ5A 3NJ9A 3EFTA 1AVNA 1UGEA 3DVDA 5CACA 3RZ1B 4DZ9A 3OY0A 1G4OA 3V3FA 4YXOA 4KNMA 3PO6A 5DSLA 2F14A 5DSPA 4FVNA 4FRCA 4ZAOA 4HBAA 3OKUA 4RUZA 4YGLA 2WEOA 5JEPB 3P3JA 3B4FA 2NWPA 1CAIA 5DOHA 5E2RA 4Q7PA 1Z97A 7CA2A 2NNVA 4M2WA 3S73B 3UYQA 5DSOA 1HUGA 2OSMA 5DVXA 4QSBA 5AMGA 3DC3A 1CVAA 4HF3A 4Q6EA 4Q8YA 1HEBA 5DSMA 5JEGB 5SZ6A 1TG3A 1YDDA 5DSIA 2X7SA 3RZ7A 1HCAA 4M2VA 3M1JA 2EU3A 3KWAA 1UGGA 3ML2A 3RZ0B 4Q99A 4CNWA 3R17B 4IDRX 2NXSA 4KUWA 4HEZA 3U7CA 4CNRA 3KOIA 4G0CA 4QIYA 12CAA 1CNWA 5E28A 2Q1QA 1TH9A 4YXUA 3MMFA 3DBUA 5SZ2A 3R16A 1CCTA 4Z1KA 3FW3A 3MNHA 5L3OA 3KIGA 4MDLA 4RUXA 5BRVA 1URTA 1YO2A 4RIUA 5HPJA 1H4NA 3DV7A 3IBIA 3MNIA 3MYQA 3CZVA 2CBCA 3T82A 4XFWA 2NWZA 1CVEA 1CA3A 3P58A 1CAZA 5EIJA 4KUVA 1CALA 4YHAA 1Z9YA 3MDZA 1HECA 5EHEA 3ZNCA 3F4XA 3M1KA 3RLDA 4Q0LA 4PXXA 1IF7A 5JG3B 5JQTA 3M2NA 5FNHA 3B1BA 1CAMA 4KNJA 3D0NA 4K13A 4MDGA 3N2PA 4ITPA 1UGAA 5G03A 3S74B 3S75B 5SZ1A 1I91A 3JXHC 1I90A 4K0ZA 4PZHA 1IF5A 3SBIA 5BNLA 8CA2A 3MHLA 3D8WA 1KOQA 1LUGA 5EHVA 4Q8ZA 4QSIA 3F8EA 5AMLA 5FNLA 4DZ7A 2AX2A 3NB5A 1F2WA 4ITOA 4Q9YA 3M5SA 2FOUA 1TBTX 1HCBA 3ML5A 3T83A 4G7AA 5EKJA 5IPZA 2CBBA 3IEOA 4Q8XA 3TVNX 5FDIA 4YX4A 5E2KA 2NWYA 2H4NA 4RFDA 3CYUA 4JSWA 1UGCA 3V2JA 1HEDA 5L6KA 1I9PA 3M96A 4PYXA 3U47A 5C8IA 5JEHB 4HEYA 1G45A 2HOCA 4FU5A 3HKNA 1G0EA 3RYVB 1UGDA 1CNXA 1HUHA 1KEQA 1BN1A 3OKVA 5SZ3A 3BETA 3SAPA 3OIKA 4YGNA 4FL7A 1CNYA 2POUA 2VVAX 4E9OX 5BRWA 3M98A 4JSAA 1FQNA 3KLDB 1H9QA 3M67A 1CILA 5A6HA 3FE4A 1AZMA 1CVBA 1FLJA 4MLTA 3D93A 2CBDA 3RG3A 3RYYA 6CA2A 5FL4A 3PJJA 3RG4A 4XE1A 3MHCA 5FLOA 5EZTX 4YGFA 4GL1X 4CNXA 1CAJA 2OSFA 2WEJA 1DMXA 4QJOA 3MHOA 5FNJA 3L14A 4WUPA 4CA2A 1ZSCA 4MO8A 1RZDA 3DD8A 3K7KA 1CVCA 4BCWA 1OKMA 5FNGA 1CNHA 5JGSB 2CBEA 4JSSA 3NI5A 3M2XA 4PQ7A 2NN7A 3HFPA 1YDCA 4E3DA 1EOUA 3PYKA 3V3GB 2FNNA 2AW1A 4TWLA 4RUYA 3OYSA 3C7PA 1G3ZA 2HL4A 3OILA 1CCSA 3P5AA 5CA2A 1BN3A 2NXTA 5FLPA 1BNMA 3JXGA 3MNJA 3F7UA 4Z1EA 5G0BA 1YO0A 1I9NA 1KOPA 3MNKA 4FVOA 2POVA 3T84A 4ILXA 3T5UA 3HKQA 4R5BA 1YDBA 3MHIA 4Q81A 1OQ5A 3KNEA 4E49A 1MUAA 3N4BA 4CQ0A 4QK1A 3MWOA 1KWQA 5SZ7A 5E2SA 2X7UA 3MZCA 5EH7A 1I9MA 5FL5A 5EH8A 2NWOA 3S72B 4ZWXA 3V7XA 3IBUA 1CNBA 1ZFKA 4ETQC 4X5SA 5JDVB 5DSQA 1RZAA 1G0FA 2NN1A 4QJXA 1LG6A 4XIWA 2HD6A 4LHIA 1DMYA 1G53A 4QK3A 3S78B 3N0NA 4Q07A 3DCWA 4YYTA 4LU3A 1RZCA 3V5GA 4MLXA 1ZFQA 2FOSA 5FLTA 5LMDA 4Q7WA 5BYIA 3P4VA 4E5QA 4HT0A 1AM6A 3D92A 4WW8A 4M2RA 1H9NA 4Z1JA 4Q87A 5EOIA 1CAOA 4L5UA 4QJPA 5E5RA 2O4ZA 1CANA 4WW6A 1CA2A 5DSKA 3P44A 3N3JA 3M2ZA 5SZ4A 1OKNA 4WL4A 2FOYA 2CABA 3S9TA 2POWA 5FLQA 3SAXA 2IT4A 1BNUA 4Z0QA 4R5AA 3CA2A 2VVBX 5JQ0A 1TG9A 3KKXA 3BL0A 4KNIA 4Q09A 1IF9A 3DVCA 5SZ0A 1I9QA 3M3XA 4YWPA 1CVDA 5SZ5A 3S71B 5FLSA 2GEHA 1CVFA 2ZNCA 1ZH9A 3V2MA 4L5VA 3TVOX 3IBLA 3SBHA 4E3GA 1HEAA 2Q38A 3P5LA 4K0SA 4ZX0A 2FMZA 4L5WA 4QIZA 4YXIA 1BNQA 3EFIA 1CCUA 1UGBA 3M14A 1FQMA 1RZBA 3M2YA 3F7BA 4QTLA 4WUQA 4QJ0A 4ZWYA 4JS6A 3OIMA 3RZ5A 1BN4A 4YGKA 4YVYA 1TB0X 1BV3A 4RIVA 2HNCA 5DSNA 3V3HB 4N0XB 1RJ5A 3RGEA 3S97A 2EU2A 1IF6A 3RYZA 1BNWA 5G0CA 3HS4A 4KV0A 4Q7SA 1XPZA 5DRSA 1J9WA 3HKTA 5EKHA 1ZSBA 3DC9A 5FNMA 4QJWA 4CNVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E4A A;  5A25 A;  5G01 A;  3M1Q A;  4QEF A;  4ZWI A;  3VBD A;  5JES B;  1G1D A;  1CAH A;  1G6V A;  3DD0 A;  1CAK A;  4JSZ A;  1TEQ X;  4Q06 A;  1CNC A;  1RAZ A;  2FOQ A;  1RZE A;  4HT2 A;  3V3I B;  1BCD A;  3K34 A;  1I9L A;  1BZM A;  3T85 A;  3RYX B;  1Y7W A;  4XIX A;  1TEU X;  4RFC A;  3ZP9 A;  4KNN A;  5EH5 A;  1BIC A;  1CNK A;  4KP8 A;  1ZSA A;  4FPT A;  3Q31 A;  5DSR A;  4BF1 A;  1ZE8 A;  2NNO A;  3LXE A;  4Y0J A;  3W6I A;  3HLJ A;  4HEW A;  2NMX A;  3M1W A;  3M40 A;  3MNA A;  5E5U A;  5J8Z A;  3DA2 A;  1ZGE A;  3JXF A;  1DCB A;  3KS3 A;  3T5Z A;  1RJ6 A;  2X7T A;  3DAZ A;  4FIK A;  4N16 A;  5E2M A;  3QYK A;  5FDC A;  1YO1 A;  1ZNC A;  3IBN A;  4ZX1 A;  3U45 X;  2CA2 A;  3TMJ A;  3KON A;  4ZWZ A;  1CNG A;  1KWR A;  3MNU A;  4MTY A;  4QK2 A;  3M04 A;  4RN4 A;  4LP6 A;  1HVA A;  4Q78 A;  3RZ8 A;  1G54 A;  3D9Z A;  3RYJ B;  4KP5 A;  4UOV A;  2WD3 A;  3S76 A;  3KOK A;  1FQR A;  1T9N A;  1FR7 A;  2H15 A;  2NNS A;  2WD2 A;  4Q08 A;  1XQ0 A;  2FMG A;  4WR7 A;  1G46 A;  3GZ0 A;  4K1Q A;  1JD0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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