2FMGA

Carbonic anhydrase activators. activation of isoforms i, ii, iv, va, vii and xiv with l- and d- phenylalanine and crystallographic analysis of their adducts with isozyme ii: sterospecific recognition within the active site of an enzyme and its consequences for the drug design, structure with l-phenylalanine
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic Anhydrase Activators. Activation of Isoforms I, II, IV, VA, VII, and XIV with l- and d-Phenylalanine and Crystallographic Analysis of Their Adducts with Isozyme II: Stereospecific Recognition within the Active Site of an Enzyme and Its Consequences for the Drug Design.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2fmgA00
1HCAA 5EHWA 1YO0A 1BICA 5DSOA 4K0SA 5JEHB 3F4XA 3N0NA 1TBTX 5DSJA 4JSAA 4QJXA 2Q38A 4C3TA 1CANA 3MHLA 4WUQA 5BNLA 3JXHC 4IWZA 5CACA 2CBCA 4KP8A 1BN3A 3DVCA 3IGPA 4MO8A 1AVNA 2X7UA 5E2NA 1DMYA 3RZ5A 1KEQA 4ITPA 1CVHA 5SZ0A 1KWRA 3K34A 2HKKA 4Q8ZA 1H4NA 4FRCA 3DD8A 2OSFA 1G6VA 2WD2A 1I91A 3BL0A 5FNGA 3D93A 1BN1A 2NNVA 1XPZA 4E3HA 2HOCA 3V3GB 4K1QA 3M5EA 3M5TA 2POVA 3DD0A 3IBNA 5EH5A 3OY0A 4KNMA 1G48A 1TH9A 1TB0X 2FMZA 4KUWA 4QEFA 4QJOA 4K0TA 2WEJA 4PXXA 4Q7PA 3S75B 2O4ZA 1XEGA 4PQ7A 3D0NA 1CCSA 3P3HA 3L14A 1CCTA 4Q99A 5CJFA 7CA2A 3CAJA 3HLJA 3DC3A 3P58A 2NNOA 1FSRA 4KP5A 3MNAA 1FR4A 3KONA 1BZMA 1UGFA 4PYYA 4HBAA 5E2MA 1G54A 2H15A 3SAPA 1YDAA 3PJJA 1I8ZA 5SZ2A 3HS4A 4JSSA 4Q6DA 5AMDA 3DA2A 1TEUX 3MHMA 4M2RA 1DMXA 5L3OA 3SBHA 3V7XA 1DCAA 3U45X 4Q9YA 1RJ6A 3RZ1B 1UGDA 1T9NA 3N2PA 4YGJA 2W2JA 5FNHA 1HVAA 2ZNCA 4Q78A 1CA3A 5FLSA 5BRVA 5E2KA 4Z1NA 4LP6A 4K13A 1G4OA 5C8IA 3IAIA 5E28A 1LZVA 3M1KA 3MHCA 4QK1A 4YXIA 1CAIA 1YO1A 3IBIA 1H9QA 3DVBA 3JXFA 4RFDA 4Q0LA 1MOOA 4CNVA 5DSLA 4DZ7A 3OILA 2CBAA 4FVNA 4BCWA 5FDCA 2WD3A 4E3DA 3NB5A 3S97A 3UYQA 5EOIA 2F14A 2HFWA 1HUHA 1RJ5A 1XQ0A 3MDZA 5DOGA 2HL4A 1CVEA 1ZSCA 4ZWZA 1FSNA 1I9QA 3PO6A 1CNWA 4JSZA 5EH7A 3RG3A 1CAYA 3N3JA 3W6HA 5DVXA 1FSQA 4LU3A 3CA2A 3IEOA 4WUPA 5FL6A 5E2SA 3ML2A 1UGGA 1CALA 3FW3A 1CVCA 1MUAA 1YO2A 1CILA 2NWZA 4MLTA 3DCSA 5FLTA 4RUZA 4QTLA 3IBUA 1CAZA 4Q07A 1DCBA 1JCZA 4FU5A 4ETQC 12CAA 3UYNA 1FQRA 5DSIA 1G0EA 5E5UA 1OKNA 3OIKA 2CBEA 3V5GA 2FOSA 1JV0A 2HD6A 5DSRA 3DAZA 3KLDB 2AW1A 4MDGA 5G01A 1CNGA 3DVDA 1J9WA 4HU1A 4QIZA 4Q49A 5FL4A 1CNBA 3HKTA 2FOYA 2NMXA 4Q8XA 4Q83A 3V2JA 2VVBX 1ZGFA 5E5RA 1UGCA 1TG3A 1JD0A 5JG3B 1LG6A 4E3GA 4R5AA 3S9TA 5J8ZA 4BF1A 2EU2A 1RZCA 4HF3A 5JEPB 1CNIA 3B1BA 3CZVA 2Q1BA 3K2FA 2WEGA 3KNEA 4M2VA 4MTYA 4XFWA 5FDIA 4BF6A 1Z9YA 5DSKA 3SBIA 5FNLA 4CQ0A 5JEGB 3MWOA 1CVFA 4ZWYA 5DSPA 5EKMA 1YDDA 1CAKA 1Z97A 3KOKA 2NN1A 4Q7WA 1A42A 3M5SA 1FR7A 3S72B 3RZ8A 3DV7A 1RZBA 5FNIA 3F8EA 1G53A 1RZDA 3OKUA 1G45A 2NWOA 5JGTB 2IT4A 1Y7WA 3D8WA 1I9LA 4FIKA 1G4JA 4HEZA 1UGAA 3OIMA 3MNJA 2NWPA 4FPTA 5JG5B 4DZ9A 5JQTA 1BNWA 3OKVA 3JXGA 3M96A 4WR7A 3FE4A 5SZ6A 1YDCA 1KOQA 3KKXA 4QJMA 1G52A 4ZX1A 3S78B 3BL1A 1ZH9A 4Z0QA 1CA2A 3M04A 3M98A 4QJWA 9CA2A 4XZ5A 2FNNA 2NN7A 1BNMA 3MHOA 4Q7SA 3V3FA 1HCBA 4Z1EA 5FLOA 2FOQA 3RG4A 6CA2A 2FOVA 1CIMA 4FVOA 1IF9A 3M2YA 4K0ZA 3U47A 4QSIA 4LHIA 1RZEA 4M2UA 1CVDA 4X5SA 5G03A 3P5LA 3R16A 3NI5A 4G0CA 3U7CA 4JS6A 1BNNA 4KAPA 4IDRX 3RYYA 4G7AA 1AM6A 1CRMA 4YWPA 3M1WA 4N0XB 3QYKA 3M14A 4E5QA 2CABA 3K7KA 3S8XA 4RH2A 3U3AX 1RAZA 3CYUA 1CVBA 5EKJA 4QK2A 4HT2A 4Q7VA 4TWMA 3HFPA 4YXUA 5SZ3A 5FNKA 4HEWA 1ZFQA 4Q6EA 5EH8A 3T5UA 2NWYA 3MNIA 4Q8YA 3W6IA 2NXSA 3VBDA 1I9NA 3FFPX 1CNYA 1IF7A 1TEQX 3HKUA 4RIVA 1FQLA 1CRAA 1YDBA 1ZE8A 3KS3A 2NNSA 1UGBA 3Q31A 3V3HB 3M1QA 1V9EA 4CACA 4Q06A 1BNQA 3DC9A 3MYQA 1BNVA 4YVYA 1CNKA 3M2XA 4QJPA 3C7PA 3EFTA 2H4NA 4M2WA 1G46A 1I9MA 2OSMA 4CNXA 5EZTX 5LMDA 4ZWIA 3T83A 4YGLA 3RLDA 5EHVA 4QY3A 4KUYA 4YX4A 3TMJA 4QJ0A 2WEHA 3HKQA 3N4BA 3P44A 4R59A 4CNRA 1IF6A 3KWAA 3NJ9A 2ABEA 2FNMA 8CA2A 1UGEA 2Q1QA 3P3JA 3IBLA 4RUYA 3RZ0B 1H9NA 5FNMA 4Z1JA 1I9PA 1KWQA 1URTA 2EU3A 1CAMA 3S74B 5JESB 3BETA 3DCWA 4E4AA 3V3JA 1ZSBA 2EZ7A 1CNJA 3M2ZA 5E2RA 2GEHA 2FW4A 3RGEA 1Z93A 1TE3X 5AMGA 5SZ5A 3HKNA 1ZFKA 4YGKA 4WW6A 3MHIA 4QK3A 4UOVA 2ILIA 5SZ1A 4GL1X 1ZGEA 3MNKA 5A6HA 2CA2A 3P4VA 3P55A 1AZMA 4MDMA 5FLPA 2POWA 4KV0A 4YXOA 3S71B 2CBBA 3V3IB 4PYXA 4CA2A 1HEAA 3RJ7A 1LUGA 4ILXA 5CA2A 1CNCA 1CAJA 3ML5A 5EHEA 1XEVA 3F7UA 3MNHA 5BRWA 3RYXB 3RZ7A 1EOUA 2NNGA 1BN4A 1KOPA 1V9IC 4Q09A 4Q81A 4ZX0A 4E3FA 1OKLA 4WL4A 2AX2A 2FOUA 4KNNA 1IF5A 5DRSA 2X7SA 1FQNA 3DCCA 4FL7A 3T85A 5FNJA 1IF4A 5CLUA 4Q90A 3F7BA 4QSBA 2VVAX 4KUVA 4COQA 5SZ4A 5A25A 3S73B 1FQMA 4ITOA 4QIYA 5DSMA 1CAOA 5G0CA 4ZWXA 3RYJB 3SAXA 1IF8A 5L6KA 5DOHA 1LGDA 4KNJA 4RN4A 4Z1KA 5DSNA 1CAHA 3RYVB 3T84A 5DSQA 4MLXA 1CZMA 1F2WA 1G0FA 1HEBA 4L5WA 1OQ5A 4E49A 4RFCA 5EIJA 3OYSA 4Y0JA 3MMFA 4CNWA 4Q87A 3P5AA 1HECA 5FLQA 3M2NA 4KNIA 1THKA 4TWLA 4YGFA 1BNTA 3M40A 4XE1A 1HUGA 3D9ZA 1FLJA 1TTMA 3T5ZA 2FMGA 4QSAA 4HT0A 2QP6A 4WW8A 2X7TA 3GZ0A 1BNUA 4MDLA 1RAYA 4RIUA 3RYZA 3M3XA 3KOIA 3B4FA 1G1DA 1BCDA 5JDVB 2QOAA 4HEYA 3V2MA 3TVNX 3DBUA 2HNCA 5EKHA 2POUA 3D92A 1BV3A 4JSWA 2GD8A 1CINA 3OYQA 5JQ0A 1OKMA 3ZNCA 5BRUA 4N16A 4L5VA 1I90A 1CCUA 2CBDA 4XIXA 5BYIA 3S76A 5FL5A 4L5UA 3S77B 1G3ZA 4YGNA 4YYTA 1ZSAA 1CNHA 2WEOA 1I9OA 3R17B 1LG5A 5JGSB 4Q08A 4R5BA 5AMLA 2FNKA 3TVOX 3M1JA 5FLRA 4XIWA 4YHAA 3T82A 3M67A 5IPZA 1HEDA 3MNUA 2NXRA 3EFIA 4QSJA 4RUXA 1CVAA 3ZP9A 5HPJA 3PYKA 2NXTA 3LXEA 3KIGA 2QO8A 5SZ7A 5G0BA 4E9OX 1CNXA 4ZAOA 1TG9A 1ZNCA 4PZHA 3MZCA 1RZAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HCA A;  5EHW A;  1YO0 A;  1BIC A;  5DSO A;  4K0S A;  5JEH B;  3F4X A;  3N0N A;  1TBT X;  5DSJ A;  4JSA A;  4QJX A;  2Q38 A;  4C3T A;  1CAN A;  3MHL A;  4WUQ A;  5BNL A;  3JXH C;  4IWZ A;  5CAC A;  2CBC A;  4KP8 A;  1BN3 A;  3DVC A;  3IGP A;  4MO8 A;  1AVN A;  2X7U A;  5E2N A;  1DMY A;  3RZ5 A;  1KEQ A;  4ITP A;  1CVH A;  5SZ0 A;  1KWR A;  3K34 A;  2HKK A;  4Q8Z A;  1H4N A;  4FRC A;  3DD8 A;  2OSF A;  1G6V A;  2WD2 A;  1I91 A;  3BL0 A;  5FNG A;  3D93 A;  1BN1 A;  2NNV A;  1XPZ A;  4E3H A;  2HOC A;  3V3G B;  4K1Q A;  3M5E A;  3M5T A;  2POV A;  3DD0 A;  3IBN A;  5EH5 A;  3OY0 A;  4KNM A;  1G48 A;  1TH9 A;  1TB0 X;  2FMZ A;  4KUW A;  4QEF A;  4QJO A;  4K0T A;  2WEJ A;  4PXX A;  4Q7P A;  3S75 B;  2O4Z A;  1XEG A;  4PQ7 A;  3D0N A;  1CCS A;  3P3H A;  3L14 A;  1CCT A;  4Q99 A;  5CJF A;  7CA2 A;  3CAJ A;  3HLJ A;  3DC3 A;  3P58 A;  2NNO A;  1FSR A;  4KP5 A;  3MNA A;  1FR4 A;  3KON A;  1BZM A;  1UGF A;  4PYY A;  4HBA A;  5E2M A;  1G54 A;  2H15 A;  3SAP A;  1YDA A;  3PJJ A;  1I8Z A;  5SZ2 A;  3HS4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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