2FMZA

Carbonic anhydrase activators. activation of isoforms i, ii, iv, va, vii and xiv with l- and d- phenylalanine, structure with d-phenylalanine.
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic Anhydrase Activators. Activation of Isoforms I, II, IV, VA, VII, and XIV with l- and d-Phenylalanine and Crystallographic Analysis of Their Adducts with Isozyme II: Stereospecific Recognition within the Active Site of an Enzyme and Its Consequences for the Drug Design.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
total genus 80
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2fmzA00
3D8WA 3DD0A 5JQTA 2NWYA 3PYKA 2AX2A 2HFWA 4Q9YA 1F2WA 3S77B 1HUHA 1CINA 4MTYA 1I9MA 3L14A 4Z1EA 4BCWA 5CJFA 2Q1BA 3RG3A 4FRCA 5BRVA 4CNXA 4FU5A 1I9PA 4QJPA 4KP5A 5SZ5A 3T83A 1YO1A 4QTLA 3TVNX 3S8XA 5G0CA 5SZ0A 1JV0A 1IF5A 3RGEA 3NB5A 1UGFA 3N0NA 3RZ7A 3EFTA 3KLDB 4QK3A 2POUA 3P3HA 3DBUA 4UOVA 1RZCA 3SAPA 1CCTA 1BN4A 4Q7WA 2FOSA 2X7SA 3JXFA 5EH5A 4QEFA 1CNHA 1TTMA 4CACA 3DC3A 4YHAA 2POWA 3S78B 4HT2A 3QYKA 3DCWA 3JXHC 4YGNA 4FPTA 4YXOA 2FNMA 3MHCA 1CANA 4MLTA 4KUYA 2H4NA 4MLXA 3N4BA 1G3ZA 4WR7A 2NWOA 5DSPA 1DMYA 4HEYA 2NXSA 4KAPA 3DA2A 3MHMA 4L5WA 5EKHA 3MNUA 1CVHA 4L5VA 1I8ZA 3ZP9A 9CA2A 4ZWXA 3P5AA 4PZHA 5DSMA 4Q0LA 2Q38A 3RYZA 5FL4A 2HD6A 1RZDA 5E2RA 1G48A 3OYSA 5AMLA 5EH7A 4GL1X 1AZMA 1HEDA 5EIJA 3M2NA 1CVDA 1ZFQA 2NNOA 1DCBA 1LUGA 5E5RA 1AM6A 4JSSA 1I90A 3P5LA 8CA2A 5EZTX 1CNYA 2FMZA 5DOGA 4RH2A 3V7XA 3HKQA 3LXEA 3CAJA 3P44A 1UGAA 3D93A 2HOCA 4QJ0A 4RIVA 5JEHB 4TWMA 3RYXB 1CCUA 2NXTA 3PO6A 1CILA 1CAYA 3W6HA 4QJMA 5E2NA 3M5TA 3HLJA 1TEQX 3KWAA 1RAZA 5FDIA 3V3JA 3IBUA 5E2SA 3V3FA 4IDRX 3M2ZA 4M2RA 4E3HA 3ML5A 2POVA 4KUVA 1UGCA 2HKKA 3SBHA 3V2JA 2QOAA 1TB0X 1BZMA 2WEJA 4Q6EA 4DZ7A 5SZ1A 3M67A 4COQA 4XE1A 3MNHA 1ZSCA 3M1JA 2FOUA 3D9ZA 5JG5B 4Q07A 4WW8A 4XZ5A 5BRUA 1CZMA 1OKMA 3KIGA 4Q8YA 1CAKA 3T84A 4KNIA 2GEHA 4QY3A 3OKUA 3F7BA 4RN4A 3V2MA 3S74B 4WL4A 3C7PA 1BNMA 3NJ9A 2CBCA 5EKMA 4XIXA 2VVBX 5SZ3A 4ETQC 4IWZA 1RAYA 1G0FA 1CVAA 5J8ZA 2IT4A 1I9NA 3D92A 4M2UA 5G03A 1YDDA 3RYVB 1FQMA 3M1WA 5JEPB 4K13A 1JD0A 3IBIA 4M2WA 3MNJA 1ZGFA 1YO0A 2NWZA 2WD2A 5AMDA 3RZ8A 1BN3A 3IGPA 3HKUA 2CBAA 2WEOA 1I9QA 4BF6A 3M04A 5FNIA 2AW1A 3ML2A 5DSLA 5E5UA 1URTA 4PQ7A 5FNHA 4Q6DA 3S97A 2CBEA 1BV3A 3HKNA 3RJ7A 1YDCA 5EHEA 5EOIA 2WEHA 1CAIA 3U47A 3RZ1B 2NWPA 1CA3A 1CA2A 2NNSA 4R59A 4RUYA 1H9NA 1CVBA 1G52A 3BL0A 4FIKA 3DVDA 4CQ0A 3GZ0A 5EHWA 2FOYA 5FL5A 4YGFA 4PYYA 3MZCA 1CRMA 4MDMA 3MNAA 1IF4A 5JESB 3UYQA 3VBDA 1H9QA 5G0BA 3M98A 1MOOA 1V9IC 3DAZA 1BN1A 4QSJA 1FR7A 3RZ0B 4KV0A 2QO8A 4L5UA 4CA2A 4E3DA 4E3GA 3S76A 5C8IA 1TG9A 3KOIA 1CNWA 1T9NA 3OIKA 4XFWA 1FQNA 4WUQA 3OY0A 1THKA 5FLPA 4Q8XA 4TWLA 4Q49A 3V3GB 3NI5A 3T82A 1JCZA 1CCSA 5FLTA 1KOPA 3OILA 1ZSBA 1CAMA 1FR4A 3U3AX 2NXRA 2H15A 2NN7A 3CYUA 2HNCA 2OSMA 3Q31A 5DOHA 3M96A 3OIMA 4CNRA 5A25A 4QJOA 4Z1JA 4DZ9A 1HCBA 4YGJA 1G0EA 3F7UA 4G0CA 5FDCA 3N3JA 4Z0QA 3RG4A 1ZFKA 3K7KA 5A6HA 5CLUA 3B4FA 4YGKA 4RUXA 5BYIA 4ZWIA 5SZ7A 3DC9A 3MHLA 3MYQA 3F4XA 5JG3B 1ZE8A 3TVOX 1TE3X 1CAOA 5FNJA 5DSIA 1LZVA 5BRWA 5EHVA 1CNCA 3IEOA 2WD3A 1TBTX 1RZEA 4Q7PA 3FE4A 4Q78A 3S75B 1OKLA 4WW6A 1CNXA 3ZNCA 4KUWA 1UGGA 4Q7VA 1BCDA 2NN1A 3T5UA 3B1BA 1Z9YA 4YXIA 2X7UA 4XIWA 5E2MA 3OYQA 1TEUX 3IBLA 5E2KA 3IBNA 5FLRA 5FLOA 4HU1A 3RLDA 3S72B 4E5QA 1DCAA 5BNLA 1HUGA 4ILXA 3V3HB 1UGBA 1G46A 4Q08A 4QK1A 1ZGEA 5JEGB 5SZ2A 2FOQA 1BNNA 4JSZA 2NNGA 3M5EA 4X5SA 1CVFA 4Q83A 5EKJA 1UGDA 2CBDA 1YDAA 1KOQA 1G4OA 1H4NA 4K1QA 2ABEA 4Q87A 1IF8A 4Q99A 5HPJA 1Z97A 4MO8A 5SZ6A 2FNNA 4QIZA 4YGLA 5DSQA 3MHIA 4R5AA 3M5SA 4FL7A 1RJ6A 4FVNA 1FQLA 3BL1A 4ZAOA 2F14A 1I91A 1XEVA 1CVEA 3MHOA 4CNWA 3PJJA 1BNQA 2EU3A 2QP6A 3U7CA 1EOUA 2HL4A 1CAJA 3MWOA 1MUAA 1HVAA 6CA2A 4Q09A 1FQRA 5DVXA 2EZ7A 1G54A 5CACA 4Z1KA 4ZWZA 5AMGA 7CA2A 1RJ5A 1OQ5A 2OSFA 4MDLA 1ZSAA 3OKVA 1YO2A 4HEWA 3DCCA 4YWPA 3DVBA 4Q7SA 3FFPX 1CNGA 1G53A 4E49A 4ZWYA 1IF6A 3M14A 1FSNA 2CA2A 4N16A 5DRSA 5E28A 5FLSA 1XQ0A 1CAHA 3V3IB 5JGSB 1CAZA 3DVCA 4G7AA 3F8EA 3CA2A 4Z1NA 1ZNCA 3FW3A 1A42A 4HT0A 4QJWA 4QIYA 1FLJA 1LG5A 4JSWA 5L6KA 4Q81A 3T85A 3M3XA 1FSRA 1LGDA 3KS3A 2CBBA 4HBAA 4K0TA 3DCSA 4Q8ZA 5LMDA 2X7TA 1UGEA 5DSJA 1Y7WA 1CNBA 4HEZA 1G45A 4JSAA 1XPZA 4QJXA 1HEBA 1OKNA 4KP8A 3W6IA 4FVOA 2VVAX 3IAIA 4M2VA 5JGTB 1RZAA 1YDBA 4QSBA 1I9OA 3MNKA 3MMFA 3RZ5A 1KWRA 3M1KA 4QSIA 1HECA 1KWQA 1CVCA 2FMGA 2NNVA 2ZNCA 3BETA 4QK2A 4ZX1A 1IF9A 2FW4A 4LP6A 4QSAA 5SZ4A 5EH8A 1CIMA 4LU3A 5FNMA 3K2FA 3MNIA 3V5GA 1AVNA 2W2JA 3S71B 1XEGA 4N0XB 1BICA 4ITPA 5FL6A 4BF1A 1J9WA 4JS6A 4KNMA 3N2PA 3M1QA 4ZX0A 2CABA 3R17B 2FNKA 1G4JA 2WEGA 3T5ZA 1RZBA 3M40A 4E4AA 1LG6A 3KKXA 3JXGA 1I9LA 3KNEA 2O4ZA 4K0SA 3KOKA 4HF3A 3M2XA 1ZH9A 1HEAA 1Z93A 4RIUA 3DV7A 5IPZA 4PYXA 1CNIA 4PXXA 1V9EA 4MDGA 4RFDA 2EU2A 4Y0JA 5JDVB 1CNKA 1BNWA 3RYYA 5DSRA 5FNLA 1TH9A 3CZVA 4YYTA 2ILIA 1G1DA 3S9TA 3HS4A 4ITOA 2NMXA 2GD8A 3D0NA 3P58A 3HFPA 3P55A 4YXUA 3RYJB 5DSNA 1TG3A 3K34A 1CNJA 5DSOA 5FNKA 4YX4A 4C3TA 3S73B 3EFIA 1G6VA 5G01A 4Q06A 5L3OA 3KONA 4E9OX 1CALA 3SAXA 2Q1QA 4E3FA 3MDZA 3HKTA 1KEQA 1BNTA 2FOVA 4RFCA 4YVYA 3P4VA 3UYNA 4RUZA 1CRAA 1FSQA 4WUPA 3M2YA 1BNVA 1HCAA 1DMXA 4R5BA 3DD8A 1IF7A 4CNVA 3U45X 3R16A 4K0ZA 5JQ0A 12CAA 5DSKA 4LHIA 5FNGA 3SBIA 5CA2A 4KNJA 4Q90A 3P3JA 1BNUA 4KNNA 5FLQA 3TMJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3D8W A;  3DD0 A;  5JQT A;  2NWY A;  3PYK A;  2AX2 A;  2HFW A;  4Q9Y A;  1F2W A;  3S77 B;  1HUH A;  1CIN A;  4MTY A;  1I9M A;  3L14 A;  4Z1E A;  4BCW A;  5CJF A;  2Q1B A;  3RG3 A;  4FRC A;  5BRV A;  4CNX A;  4FU5 A;  1I9P A;  4QJP A;  4KP5 A;  5SZ5 A;  3T83 A;  1YO1 A;  4QTL A;  3TVN X;  3S8X A;  5G0C A;  5SZ0 A;  1JV0 A;  1IF5 A;  3RGE A;  3NB5 A;  1UGF A;  3N0N A;  3RZ7 A;  3EFT A;  3KLD B;  4QK3 A;  2POU A;  3P3H A;  3DBU A;  4UOV A;  1RZC A;  3SAP A;  1CCT A;  1BN4 A;  4Q7W A;  2FOS A;  2X7S A;  3JXF A;  5EH5 A;  4QEF A;  1CNH A;  1TTM A;  4CAC A;  3DC3 A;  4YHA A;  2POW A;  3S78 B;  4HT2 A;  3QYK A;  3DCW A;  3JXH C;  4YGN A;  4FPT A;  4YXO A;  2FNM A;  3MHC A;  1CAN A;  4MLT A;  4KUY A;  2H4N A;  4MLX A;  3N4B A;  1G3Z A;  4WR7 A;  2NWO A;  5DSP A;  1DMY A;  4HEY A;  2NXS A;  4KAP A;  3DA2 A;  3MHM A;  4L5W A;  5EKH A;  3MNU A;  1CVH A;  4L5V A;  1I8Z A;  3ZP9 A;  9CA2 A;  4ZWX A;  3P5A A;  4PZH A;  5DSM A;  4Q0L A;  2Q38 A;  3RYZ A;  5FL4 A;  2HD6 A;  1RZD A;  5E2R A;  1G48 A;  3OYS A; 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