2FOS | Genus

Total Genus 74

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	74
Knots found	KnotProt 2.0: K +3₁
sequence length	259
structure length	258
Chain Sequence	SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLEVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__213876982498459__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__213876982498459__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2fos/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__213876982498459__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"213876982498459","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2fos/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__213876982498459__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Ultrahigh resolution crystal structures of human carbonic anhydrases I and II complexed with two-prong inhibitors reveal the molecular basis of high affinity. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic Anhydrase II
total genus	74
structure length	258
sequence length	259
other databases	KnotProt 2.0: K +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2006-01-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	2fosA00

1FSQA 1KOQA 5FLOA 3LXEA 5SZ7A 3DAZA 5FLPA 4E4AA 1XPZA 1OKNA 2POWA 3BL1A 2ABEA 3CZVA 3V5GA 1DMYA 1I9MA 1TE3X 5EIJA 3P55A 4G7AA 3MHCA 1BICA 2FOSA 3P5LA 3DA2A 3S74B 1CNCA 1ZSCA 4RUZA 1CCSA 3W6HA 3M98A 2EU2A 1MUAA 4WUPA 2FMGA 1BNTA 4Q7VA 2GEHA 3NI5A 4KNJA 5EHVA 4KP5A 5LMDA 2CBAA 3S73B 3W6IA 3MNHA 5JEGB 3HKNA 2QP6A 3RZ8A 2FNMA 3V3FA 5FNHA 2NWPA 3RYJB 4Q8YA 4QK2A 1AVNA 3KS3A 1CRMA 4KP8A 1CINA 4R59A 4CNVA 3U7CA 2ILIA 2WEGA 4WW6A 1CRAA 3HKQA 4JS6A 5FNKA 5SZ3A 5EHWA 3MHMA 4UOVA 4ILXA 1BN3A 2FMZA 2EZ7A 5FLTA 1IF5A 4Q9YA 3F7BA 1ZFQA 5FNIA 5JGSB 3DC9A 1FQNA 5SZ5A 4YGJA 4YX4A 1LG6A 1RJ6A 5DSQA 3MYQA 3M2XA 4Q7PA 5E2SA 2X7UA 1ZSAA 2NXRA 3SAXA 1IF4A 1IF8A 4QSBA 3BL0A 4RIUA 5G0BA 3B1BA 4E3FA 1TH9A 1BCDA 1RZEA 3MHIA 2WEJA 3M5EA 2HNCA 3KIGA 2O4ZA 1UGGA 4TWLA 4YGNA 3S71B 3N3JA 3M1KA 3S8XA 3MNJA 5FLRA 5BRWA 5EOIA 3IBIA 1UGFA 3D9ZA 3IGPA 1G1DA 5DSJA 4X5SA 4CACA 1G6VA 3KNEA 1Y7WA 4Q8ZA 4DZ9A 3S9TA 1ZFKA 3JXGA 3M2ZA 1G52A 3NJ9A 1RJ5A 2CABA 5DSRA 1JV0A 4ZAOA 4L5UA 3RYZA 4PXXA 4QIYA 5FL4A 1CAIA 4HT0A 1CVHA 3Q31A 1CCTA 4Q08A 3IEOA 4E9OX 1CVAA 2CA2A 1H4NA 1IF6A 1TG9A 3ML5A 5JQ0A 3N2PA 5FNMA 1XEGA 5E2NA 5SZ4A 1CVEA 4ZX1A 4MO8A 4Z1KA 1CVCA 3N4BA 2NNVA 4KV0A 4WW8A 5EHEA 5DSLA 4Q8XA 4E49A 5C8IA 4CA2A 3DVBA 4KUWA 3UYNA 1CAKA 3FFPX 3MMFA 4KNMA 4Q6DA 1LUGA 4QJWA 1FSNA 1KWRA 1OKMA 2POUA 2FOUA 2HOCA 1CAOA 3DD0A 5FNGA 2WEOA 3KWAA 1AM6A 2NNGA 1BNMA 1YDCA 4PQ7A 3T85A 3L14A 9CA2A 3IBLA 3TMJA 1CA3A 1CA2A 4DZ7A 4WUQA 4LHIA 4C3TA 2AW1A 1I9OA 3BETA 3JXHC 4K1QA 4KNNA 1DMXA 2NXTA 3QYKA 4Z1NA 3RGEA 5BNLA 5E5UA 3P4VA 1V9IC 1HUGA 3EFIA 3MDZA 2OSFA 4ZWXA 1Z93A 3RJ7A 1G53A 4HU1A 3B4FA 3IBNA 4HEZA 4PYYA 5EKMA 1CNIA 4Z1JA 4XZ5A 4KUVA 3RZ5A 3V2MA 2FNKA 4MDMA 4E5QA 2F14A 4YGLA 5DSMA 1HCBA 3FW3A 5AMGA 1HCAA 4E3DA 3KOKA 3RYYA 4JSZA 1XEVA 3MNKA 3D93A 3OYQA 3PYKA 4FVOA 4ITPA 3UYQA 3MWOA 1RAYA 1ZH9A 1ZGFA 3OKVA 4Z1EA 3S78B 4L5WA 3S77B 3K34A 5L6KA 3HFPA 2H15A 3M3XA 5E2MA 2CBEA 1HEAA 3MNIA 1CNGA 3KOIA 5IPZA 2H4NA 3HS4A 1I9NA 3DC3A 1CNHA 4MDLA 4Q07A 4QK3A 4RFCA 5JDVB 5DVXA 4Q78A 3F4XA 4IDRX 1FQMA 1HECA 3M04A 4YGFA 5SZ6A 4M2UA 4RH2A 3V7XA 4BCWA 5DSKA 4N16A 5JQTA 3P44A 3S72B 3S75B 4CNRA 4Q87A 3TVNX 2WD3A 1G48A 3KLDB 2OSMA 4MLXA 4QY3A 3U45X 2HL4A 3CA2A 3V3HB 1XQ0A 4QIZA 3ZNCA 4HEYA 1OQ5A 3GZ0A 1Z9YA 1CNBA 3DVCA 1DCAA 1I9QA 4JSAA 1HEDA 3KKXA 1YO2A 4QSAA 2POVA 1CALA 4XE1A 3RZ7A 3MZCA 3V3IB 4KNIA 4YYTA 4YHAA 1TB0X 5E28A 4XFWA 2HFWA 4R5AA 5E2RA 2GD8A 4K0ZA 1UGAA 3U3AX 1CAZA 2NNOA 5AMLA 3M1JA 3SAPA 4FIKA 2X7TA 1G0EA 4K13A 1KOPA 2QO8A 4E3HA 5EZTX 1CNWA 1OKLA 2ZNCA 5DSIA 3M1QA 4Q7WA 1G54A 4TWMA 3FE4A 4RUXA 3HLJA 3OY0A 4ETQC 3D8WA 2HD6A 1ZGEA 1RZBA 5FL6A 3DCSA 1TEQX 3DD8A 1Z97A 5CA2A 4QTLA 3C7PA 1G46A 4WR7A 3U47A 1BNWA 1FQLA 1UGEA 5DRSA 1BV3A 4RN4A 4YXUA 2NXSA 2FNNA 2VVBX 4FL7A 5BRUA 5A6HA 3D0NA 1RZDA 5EKHA 4FU5A 1CAJA 5JG5B 4M2VA 2NN7A 5CJFA 5JESB 2FOQA 2NNSA 1CZMA 5EH8A 1BNUA 3P3HA 1G4OA 1CVFA 1CVBA 3OIKA 4HT2A 4ZX0A 1ZSBA 5JEHB 3SBIA 2Q1QA 4Q90A 2EU3A 5FLQA 4E3GA 3OILA 4HEWA 4YGKA 4QJOA 4QJXA 3S76A 5E5RA 4MTYA 4MDGA 5FNLA 1HUHA 3PO6A 4XIWA 2FOVA 3D92A 1HVAA 4WL4A 3M67A 4COQA 1TG3A 5HPJA 3DBUA 1CNXA 12CAA 4Q7SA 1CANA 2NWYA 3MHLA 5FL5A 1FLJA 1CNJA 1TBTX 3P5AA 4ITOA 4M2WA 3T5UA 3RYVB 3RZ0B 4Z0QA 1RZAA 1CNKA 4M2RA 3P3JA 5EH5A 5G0CA 5SZ1A 3CYUA 3ML2A 3RG3A 2CBBA 4QSIA 1JD0A 1G0FA 5DSPA 5BRVA 4Q81A 3K7KA 4HF3A 1BNQA 1ZE8A 1IF7A 1MOOA 4QSJA 2Q38A 3F7UA 5JEPB 2CBCA 3M5TA 3S97A 3M5SA 1CNYA 1H9QA 4K0TA 1UGDA 1KEQA 1IF9A 1CAMA 3T5ZA 5AMDA 5E2KA 5DOGA 5EKJA 4YWPA 5BYIA 4MLTA 4PZHA 3DV7A 3OIMA 1CILA 4Q99A 1FR4A 1BNVA 5J8ZA 5L3OA 3R16A 5SZ2A 4QJ0A 2QOAA 2WD2A 4IWZA 3CAJA 4L5VA 1LZVA 5JG3B 4Q6EA 1ZNCA 1H9NA 3OYSA 3M2NA 4K0SA 5FDCA 1LG5A 5SZ0A 2NWZA 4KAPA 1I9PA 1EOUA 1BZMA 1FR7A 3DVDA 4KUYA 5G03A 4BF6A 3HKUA 2X7SA 1LGDA 3SBHA 1DCBA 1JCZA 4QK1A 1G3ZA 2IT4A 3T84A 1FSRA 4JSWA 1CIMA 3M40A 1FQRA 1G45A 3NB5A 2NWOA 1A42A 4RFDA 3MHOA 1THKA 3KONA 3RG4A 4Q83A 3R17B 8CA2A 4JSSA 1I90A 4GL1X 5JGTB 3VBDA 3K2FA 4N0XB 1YDAA 4YXOA 5A25A 1G4JA 3IBUA 7CA2A 4RUYA 4PYXA 1UGBA 4QEFA 2FOYA 3TVOX 4LU3A 4CNWA 4QJMA 1J9WA 3RZ1B 2VVAX 2WEHA 1BN1A 5DOHA 3DCWA 3V2JA 4CNXA 1RZCA 4QJPA 4BF1A 1YO0A 1I8ZA 1RAZA 2FW4A 3F8EA 3OKUA 1CVDA 4R5BA 4ZWYA 1BN4A 4G0CA 3M14A 3T82A 1KWQA 4FRCA 3DCCA 1TTMA 4Q0LA 4RIVA 3ZP9A 3IAIA 4Q49A 4Q06A 1URTA 3M2YA 3RYXB 6CA2A 4ZWZA 1YDBA 4CQ0A 2HKKA 1YDDA 3HKTA 2AX2A 4FPTA 1CAYA 1TEUX 4FVNA 3JXFA 3T83A 5FLSA 1I91A 1T9NA 5G01A 5CACA 1YO1A 3MNUA 4Y0JA 3M96A 2NN1A 2Q1BA 1AZMA 3M1WA 5FNJA 1I9LA 1HEBA 1BNNA 3N0NA 1F2WA 2CBDA 5EH7A 2W2JA 5DSOA 3EFTA 4HBAA 4LP6A 3V3JA 4XIXA 1UGCA 4Q09A 4YVYA 2NMXA 1CCUA 5DSNA 3P58A 4YXIA 1CAHA 3MNAA 3PJJA 4ZWIA 5CLUA 1V9EA 3V3GB 5FDIA 3RLDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FSQ A;  1KOQ A;  5FLO A;  3LXE A;  5SZ7 A;  3DAZ A;  5FLP A;  4E4A A;  1XPZ A;  1OKN A;  2POW A;  3BL1 A;  2ABE A;  3CZV A;  3V5G A;  1DMY A;  1I9M A;  1TE3 X;  5EIJ A;  3P55 A;  4G7A A;  3MHC A;  1BIC A;  2FOS A;  3P5L A;  3DA2 A;  3S74 B;  1CNC A;  1ZSC A;  4RUZ A;  1CCS A;  3W6H A;  3M98 A;  2EU2 A;  1MUA A;  4WUP A;  2FMG A;  1BNT A;  4Q7V A;  2GEH A;  3NI5 A;  4KNJ A;  5EHV A;  4KP5 A;  5LMD A;  2CBA A;  3S73 B;  3W6I A;  3MNH A;  5JEG B;  3HKN A;  2QP6 A;  3RZ8 A;  2FNM A;  3V3F A;  5FNH A;  2NWP A;  3RYJ B;  4Q8Y A;  4QK2 A;  1AVN A;  3KS3 A;  1CRM A;  4KP8 A;  1CIN A;  4R59 A;  4CNV A;  3U7C A;  2ILI A;  2WEG A;  4WW6 A;  1CRA A;  3HKQ A;  4JS6 A;  5FNK A;  5SZ3 A;  5EHW A;  3MHM A;  4UOV A;  4ILX A;  1BN3 A;  2FMZ A;  2EZ7 A;  5FLT A;  1IF5 A;  4Q9Y A;  3F7B A;  1ZFQ A;  5FNI A;  5JGS B;  3DC9 A;  1FQN A;  5SZ5 A;  4YGJ A;  4YX4 A;  1LG6 A;  1RJ6 A;  5DSQ A;  3MYQ A;  3M2X A;  4Q7P A;  5E2S A;  2X7U A;  1ZSA A;  2NXR A;  3SAX A;  1IF4 A;  1IF8 A;  4QSB A;  3BL0 A;  4RIU A;  5G0B A;  3B1B A;  4E3F A;  1TH9 A;  1BCD A;  1RZE A;  3MHI A;  2WEJ A;  3M5E A;  2HNC A;  3KIG A;  2O4Z A;  1UGG A;  4TWL A;  4YGN A;  3S71 B;  3N3J A;  3M1K A;  3S8X A;  3MNJ A;  5FLR A;  5BRW A;  5EOI A;  3IBI A;  1UGF A;  3D9Z A;  3IGP A;  1G1D A;  5DSJ A;  4X5S A;  4CAC A;  1G6V A;  3KNE A;  1Y7W A;  4Q8Z A;  4DZ9 A;  3S9T A;  1ZFK A;  3JXG A;  3M2Z A;  1G52 A;  3NJ9 A;  1RJ5 A;  2CAB A;  5DSR A;  1JV0 A;  4ZAO A;  4L5U A;  3RYZ A;  4PXX A;  4QIY A;  5FL4 A;  1CAI A;  4HT0 A;  1CVH A;  3Q31 A;  1CCT A;  4Q08 A;  3IEO A;  4E9O X;  1CVA A;  2CA2 A;  1H4N A;  1IF6 A;  1TG9 A;  3ML5 A;  5JQ0 A;  3N2P A;  5FNM A;  1XEG A;  5E2N A;  5SZ4 A;  1CVE A;  4ZX1 A;  4MO8 A;  4Z1K A;  1CVC A;  3N4B A;  2NNV A;  4KV0 A;  4WW8 A;  5EHE A;  5DSL A;  4Q8X A;  4E49 A;  5C8I A;  4CA2 A;  3DVB A;  4KUW A;  3UYN A;  1CAK A;  3FFP X;  3MMF A;  4KNM A;  4Q6D A;  1LUG A;  4QJW A;  1FSN A;  1KWR A;  1OKM A;  2POU A;  2FOU A;  2HOC A;  1CAO A;  3DD0 A;  5FNG A;  2WEO A;  3KWA A;  1AM6 A;  2NNG A;  1BNM A;  1YDC A;  4PQ7 A;  3T85 A;  3L14 A;  9CA2 A;  3IBL A;  3TMJ A;  1CA3 A;  1CA2 A;  4DZ7 A;  4WUQ A;  4LHI A;  4C3T A;  2AW1 A;  1I9O A;  3BET A;  3JXH C;  4K1Q A;  4KNN A;  1DMX A;  2NXT A;  3QYK A;  4Z1N A;  3RGE A;  5BNL A;  5E5U A;  3P4V A;  1V9I C;  1HUG A;  3EFI A;  3MDZ A;  2OSF A;  4ZWX A;  1Z93 A;  3RJ7 A;  1G53 A;  4HU1 A;  3B4F A;  3IBN A;  4HEZ A;  4PYY A;  5EKM A;  1CNI A;  4Z1J A;  4XZ5 A;  4KUV A;  3RZ5 A;  3V2M A;  2FNK A;  4MDM A;  4E5Q A;  2F14 A;  4YGL A;  5DSM A;  1HCB A;  3FW3 A;  5AMG A;  1HCA A;  4E3D A;  3KOK A;  3RYY A;  4JSZ A;  1XEV A;  3MNK A;  3D93 A;  3OYQ A;  3PYK A;  4FVO A;  4ITP A;  3UYQ A;  3MWO A;  1RAY A;  1ZH9 A;  1ZGF A;  3OKV A;  4Z1E A;  3S78 B;  4L5W A;  3S77 B;  3K34 A;  5L6K A;  3HFP A;  2H15 A;  3M3X A;  5E2M A;  2CBE A;  1HEA A;  3MNI A;  1CNG A;  3KOI A;  5IPZ A;  2H4N A;  3HS4 A;  1I9N A;  3DC3 A;  1CNH A;  4MDL A;  4Q07 A;  4QK3 A;  4RFC A;  5JDV B;  5DVX A;  4Q78 A;  3F4X A;  4IDR X;  1FQM A;  1HEC A;  3M04 A;  4YGF A;  5SZ6 A;  4M2U A;  4RH2 A;  3V7X A;  4BCW A;  5DSK A;  4N16 A;  5JQT A;  3P44 A;  3S72 B;  3S75 B;  4CNR A;  4Q87 A;  3TVN X;  2WD3 A;  1G48 A;  3KLD B;  2OSM A;  4MLX A;  4QY3 A;  3U45 X;  2HL4 A;  3CA2 A;  3V3H B;  1XQ0 A;  4QIZ A;  3ZNC A;  4HEY A;  1OQ5 A;  3GZ0 A;  1Z9Y A;  1CNB A;  3DVC A;  1DCA A;  1I9Q A;  4JSA A;  1HED A;  3KKX A;  1YO2 A;  4QSA A;  2POV A;  1CAL A;  4XE1 A;  3RZ7 A;  3MZC A;  3V3I B;  4KNI A;  4YYT A;  4YHA A;  1TB0 X;  5E28 A;  4XFW A;  2HFW A;  4R5A A;  5E2R A;  2GD8 A;  4K0Z A;  1UGA A;  3U3A X;  1CAZ A;  2NNO A;  5AML A;  3M1J A;  3SAP A;  4FIK A;  2X7T A;  1G0E A;  4K13 A;  1KOP A;  2QO8 A;  4E3H A;  5EZT X;  1CNW A;  1OKL A;  2ZNC A;  5DSI A;  3M1Q A;  4Q7W A;  1G54 A;  4TWM A;  3FE4 A;  4RUX A;  3HLJ A;  3OY0 A;  4ETQ C;  3D8W A;  2HD6 A;  1ZGE A;  1RZB A;  5FL6 A;  3DCS A;  1TEQ X;  3DD8 A;  1Z97 A;  5CA2 A;  4QTL A;  3C7P A;  1G46 A;  4WR7 A;  3U47 A;  1BNW A;  1FQL A;  1UGE A;  5DRS A;  1BV3 A;  4RN4 A;  4YXU A;  2NXS A;  2FNN A;  2VVB X;  4FL7 A;  5BRU A;  5A6H A;  3D0N A;  1RZD A;  5EKH A;  4FU5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2FOSA

Total Genus

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Chain Sequence

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