2GEHA

N-hydroxyurea, a versatile zinc binding function in the design of metalloenzyme inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title N-Hydroxyurea-A versatile zinc binding function in the design of metalloenzyme inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-03-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2gehA00
3MHOA 1TG9A 5FNKA 5SZ0A 1FR4A 1CCTA 2GD8A 2NWOA 4G7AA 4LP6A 1YDAA 1CANA 3HFPA 1BNNA 4RN4A 2CBEA 3KS3A 1DMYA 3RYYA 3S78B 5A6HA 5FLSA 1CRMA 4FPTA 3S76A 2FOQA 3HS4A 5SZ4A 5G0BA 3C7PA 3B1BA 1H9QA 5DSLA 5E28A 3MNHA 2AX2A 1UGFA 4RIUA 4KAPA 2CA2A 2NXTA 4HBAA 2Q38A 3M2ZA 5EIJA 3BETA 4YHAA 3RZ7A 1FR7A 1HUGA 3DVDA 3M1KA 4HEYA 3T5ZA 3T85A 3Q31A 5FLTA 1CVCA 1ZFKA 3MHCA 1YDCA 3M14A 3S9TA 1XPZA 3MZCA 1KOQA 5JEPB 1CNCA 1KWQA 3R16A 12CAA 1ZGEA 4C3TA 4ETQC 1UGAA 3RYVB 8CA2A 1G46A 4E3HA 1H9NA 2HKKA 3DCCA 2AW1A 3F7BA 1CALA 1KWRA 1YO1A 3NI5A 1HUHA 2FNMA 4HF3A 4R59A 5EH5A 5G01A 1FLJA 4WR7A 3M1WA 3KKXA 5L3OA 3F4XA 1BN1A 1RJ5A 3HKTA 1CCSA 1CVFA 4KUYA 5FNGA 3OIMA 3RZ1B 4KUVA 5JQ0A 4ZWZA 1CCUA 3HKQA 3IAIA 3IBUA 5E2SA 5JG3B 1CAOA 1RAYA 4RIVA 2HD6A 3CAJA 5DOHA 2FMZA 5FNLA 1FQLA 3P58A 3JXFA 1G1DA 1G54A 3MHMA 3MMFA 1MOOA 4HU1A 3M67A 3T5UA 4ZWXA 4KNNA 4QIYA 1JCZA 1TEUX 5LMDA 5DSOA 4K13A 1UGCA 2VVBX 5EH8A 1BN3A 4FVNA 4N0XB 3SBIA 3P55A 3RLDA 1CNWA 1YDDA 3DAZA 4ITOA 1CNXA 1JV0A 4MO8A 3M1QA 1T9NA 3M2XA 4HEWA 1TG3A 5FNMA 3IEOA 4M2VA 2HOCA 3S75B 2CABA 1RZAA 3V3FA 4M2UA 3S71B 4Q09A 3GZ0A 4QK2A 4E9OX 1YDBA 1LG5A 1DMXA 1MUAA 5FDCA 3KLDB 5EOIA 2POWA 1CAJA 3QYKA 3IBNA 5FNIA 4ILXA 3OYSA 4WUQA 1TEQX 4IWZA 5AMLA 4X5SA 3DBUA 3TVOX 4L5WA 5DSIA 1BV3A 5SZ7A 3T82A 1RJ6A 4IDRX 3V3GB 3DV7A 1HVAA 3SAXA 3JXGA 1IF5A 3PO6A 1UGBA 3IGPA 1AZMA 4YXIA 1CAKA 3K2FA 1BICA 2FNNA 1BNUA 4QSBA 1EOUA 1IF7A 4JSAA 2NNVA 1ZFQA 2Q1QA 4KNMA 3K7KA 1CAMA 4QSAA 3RZ5A 4Q7PA 1V9IC 1FQMA 3BL1A 1URTA 2NNGA 3DVBA 4LHIA 4QK3A 4R5AA 3M2YA 4K0ZA 4UOVA 2F14A 4M2RA 1BCDA 4YWPA 3OYQA 1CZMA 2WD2A 3MHLA 3SBHA 4RUZA 3MHIA 5FL5A 5HPJA 3MDZA 1XEVA 1OQ5A 1FSNA 3ZP9A 1CAYA 3DA2A 4QJPA 1I9OA 4QJMA 4Q0LA 1LUGA 4JSZA 4JSWA 1H4NA 1G4JA 1FSQA 1YO2A 1JD0A 1G0FA 2X7SA 3M5SA 3U3AX 3M2NA 4QSJA 4HT0A 1I91A 4Z1NA 3RYZA 3KONA 1CNIA 5SZ3A 4RH2A 2EU2A 5DVXA 4GL1X 4CA2A 2NWYA 3M3XA 4Q87A 1TB0X 3D93A 1BNTA 4Q7VA 1CNBA 1OKNA 4QIZA 1FQNA 1CAHA 3D0NA 4KNIA 1CILA 1I9LA 3MNIA 4ZWYA 3HLJA 3UYQA 4XZ5A 4RUYA 3RYJB 3EFTA 3N3JA 5E5RA 3U7CA 1CVHA 1CIMA 4Q81A 1DCAA 4Q99A 5E2RA 3MWOA 3N4BA 4L5VA 5DRSA 4Q49A 1G0EA 3V2JA 2CBAA 4QJXA 3V3HB 3RGEA 4DZ7A 1ZSCA 5FNHA 5IPZA 3FW3A 5CLUA 4E5QA 4CQ0A 5DSRA 2WEGA 4Z1JA 1Y7WA 3NB5A 4ITPA 3CA2A 5EHVA 4CNVA 2FMGA 5FL6A 3IBIA 1OKMA 3D92A 3M5TA 5EZTX 3CYUA 4E49A 4YGJA 5EKMA 4Z1KA 1Z93A 2ILIA 2POUA 4Q90A 1IF9A 4HEZA 1RAZA 1BNQA 2ZNCA 1IF6A 4CNRA 5FDIA 5EKHA 5AMDA 2NXSA 5SZ1A 4BCWA 1G6VA 1YO0A 4XIXA 4QY3A 3MYQA 3OIKA 3KIGA 5BYIA 1G52A 3RYXB 3U47A 1HEAA 4LU3A 3ML5A 3UYNA 2NNOA 4Z1EA 5DSNA 4KP8A 5BNLA 1TTMA 4Q7WA 4KNJA 4YYTA 5AMGA 2NNSA 1BZMA 2WD3A 4PYYA 4BF1A 4MDGA 1CNKA 1UGGA 2W2JA 4QJ0A 5JEGB 1LZVA 3S8XA 2GEHA 2NWZA 5FLPA 4Q08A 2QOAA 5E2MA 3RJ7A 3KOIA 4HT2A 5SZ5A 1A42A 5CJFA 3MNKA 2FW4A 2OSMA 1G4OA 4G0CA 2QO8A 2X7TA 5EHWA 5JQTA 1UGDA 1CNGA 4QTLA 5FLOA 5JG5B 4QJOA 1ZE8A 2FOVA 2OSFA 5JDVB 3S72B 5E5UA 3V7XA 1AVNA 5BRWA 1KOPA 5BRUA 7CA2A 2IT4A 1G53A 3KOKA 4WW8A 3DC9A 5DOGA 1BN4A 1FSRA 4TWMA 3DCSA 5CACA 5SZ6A 4JS6A 5FLQA 3IBLA 4YXUA 2FNKA 4PQ7A 5E2KA 2Q1BA 3OY0A 5SZ2A 4XFWA 4Z0QA 1CVAA 3K34A 3MNJA 4M2WA 3V2MA 3DC3A 1KEQA 3M1JA 1CNHA 4E3FA 2NWPA 1V9EA 3V5GA 1AM6A 3BL0A 3DVCA 4FL7A 3VBDA 3TMJA 4YGFA 2QP6A 2FOSA 3P3JA 4QEFA 2POVA 2FOUA 5EKJA 1FQRA 3ZNCA 5DSJA 4RFCA 5L6KA 2H4NA 4FRCA 2EU3A 1TBTX 4KUWA 1CINA 4QSIA 4ZX0A 2NN1A 3KNEA 4KV0A 5EHEA 1ZH9A 4MDMA 2WEOA 4KP5A 1I9PA 4BF6A 3S77B 5JGSB 1I9NA 1RZDA 2HNCA 1ZNCA 4R5BA 3W6IA 1DCBA 3DD0A 4Q8YA 1CNJA 2VVAX 2NXRA 3JXHC 1HCAA 3OKUA 3LXEA 2ABEA 1Z97A 3B4FA 1HEDA 3MNAA 5JEHB 4CNXA 3TVNX 3HKUA 2FOYA 2EZ7A 1CVEA 1IF4A 1BNMA 5G03A 4ZAOA 4E3GA 3P5AA 2CBBA 3M96A 3P5LA 4K0SA 4YGKA 4K0TA 5E2NA 5JGTB 3D8WA 5DSMA 5JESB 4FIKA 3RG3A 1CA2A 1ZGFA 4YGLA 4YGNA 3W6HA 3RZ0B 4PZHA 4Y0JA 3S97A 4N16A 3DD8A 3P44A 3OKVA 1XEGA 3MNUA 1XQ0A 3T83A 3FFPX 4XIWA 1CVBA 1LG6A 1I9MA 4K1QA 5G0CA 5CA2A 1RZCA 4Q78A 4JSSA 4YVYA 3HKNA 4CNWA 3RG4A 5FLRA 4Q8ZA 4Q6DA 3ML2A 4XE1A 1I8ZA 2CBDA 4QK1A 3N2PA 1ZSBA 3M98A 4Q06A 2NMXA 3F7UA 4YXOA 5A25A 3P4VA 2WEHA 3D9ZA 1I9QA 3PYKA 3OILA 4ZWIA 3V3IB 6CA2A 3P3HA 3DCWA 5DSQA 4E3DA 2X7UA 3L14A 3CZVA 1CRAA 4RUXA 3M04A 1TH9A 1HCBA 4E4AA 4MLTA 3S74B 4Q7SA 2O4ZA 4L5UA 4WUPA 3PJJA 9CA2A 4PYXA 4Q07A 4DZ9A 4YX4A 2HL4A 1J9WA 3RZ8A 1RZBA 4FU5A 4Q83A 3NJ9A 1THKA 3S73B 1OKLA 4TWLA 1G48A 4Q6EA 1I90A 4MDLA 1IF8A 5C8IA 1LGDA 4PXXA 2HFWA 1BNWA 4FVOA 5BRVA 4WW6A 4Q8XA 1TE3X 3N0NA 1CVDA 3M5EA 4ZX1A 2CBCA 3F8EA 5J8ZA 3SAPA 5DSPA 3T84A 3KWAA 1RZEA 4CACA 3FE4A 4QJWA 4MTYA 5DSKA 1HEBA 4WL4A 3U45X 2NN7A 2WEJA 1CAIA 4COQA 1Z9YA 3R17B 1CAZA 1G3ZA 1UGEA 4RFDA 3M40A 1G45A 5EH7A 3V3JA 1F2WA 1HECA 3EFIA 2H15A 5FL4A 1BNVA 5FNJA 1CNYA 1ZSAA 4Q9YA 4MLXA 1CA3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MHO A;  1TG9 A;  5FNK A;  5SZ0 A;  1FR4 A;  1CCT A;  2GD8 A;  2NWO A;  4G7A A;  4LP6 A;  1YDA A;  1CAN A;  3HFP A;  1BNN A;  4RN4 A;  2CBE A;  3KS3 A;  1DMY A;  3RYY A;  3S78 B;  5A6H A;  5FLS A;  1CRM A;  4FPT A;  3S76 A;  2FOQ A;  3HS4 A;  5SZ4 A;  5G0B A;  3C7P A;  3B1B A;  1H9Q A;  5DSL A;  5E28 A;  3MNH A;  2AX2 A;  1UGF A;  4RIU A;  4KAP A;  2CA2 A;  2NXT A;  4HBA A;  2Q38 A;  3M2Z A;  5EIJ A;  3BET A;  4YHA A;  3RZ7 A;  1FR7 A;  1HUG A;  3DVD A;  3M1K A;  4HEY A;  3T5Z A;  3T85 A;  3Q31 A;  5FLT A;  1CVC A;  1ZFK A;  3MHC A;  1YDC A;  3M14 A;  3S9T A;  1XPZ A;  3MZC A;  1KOQ A;  5JEP B;  1CNC A;  1KWQ A;  3R16 A;  12CA A;  1ZGE A;  4C3T A;  4ETQ C;  1UGA A;  3RYV B;  8CA2 A;  1G46 A;  4E3H A;  1H9N A;  2HKK A;  3DCC A;  2AW1 A;  3F7B A;  1CAL A;  1KWR A;  1YO1 A;  3NI5 A;  1HUH A;  2FNM A;  4HF3 A;  4R59 A;  5EH5 A;  5G01 A;  1FLJ A;  4WR7 A;  3M1W A;  3KKX A;  5L3O A;  3F4X A;  1BN1 A;  1RJ5 A;  3HKT A;  1CCS A;  1CVF A;  4KUY A;  5FNG A;  3OIM A;  3RZ1 B;  4KUV A;  5JQ0 A;  4ZWZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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