2GEHA

N-hydroxyurea, a versatile zinc binding function in the design of metalloenzyme inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title N-Hydroxyurea-A versatile zinc binding function in the design of metalloenzyme inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-03-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2gehA00
3SBIA 1TG3A 2OSMA 3RZ0B 2NNOA 1RJ5A 4YHAA 1FSNA 3DC9A 4Q7WA 2HNCA 3N0NA 4QJMA 1JD0A 1FSRA 4WW6A 3OKVA 1YO0A 4YWPA 3M67A 5JQ0A 1V9IC 4Q90A 4ZAOA 2CABA 3P4VA 4QJWA 3MZCA 5FLQA 3M2YA 3IBUA 4K13A 3RZ8A 1CA2A 3MMFA 1CNBA 4YX4A 1Z9YA 3F7BA 4CNVA 5DRSA 1HEBA 3S78B 1FLJA 3VBDA 4R5BA 4CA2A 4E3FA 1CVHA 4L5WA 1BN1A 3V7XA 4PYXA 1XPZA 3M1WA 5BNLA 1ZGFA 2FNMA 3CZVA 3HKQA 1TE3X 5DSNA 2POVA 5DOHA 4UOVA 1THKA 5IPZA 4GL1X 4LP6A 1G53A 1ZSAA 5JEHB 5CACA 3LXEA 2GEHA 1Z93A 4QSAA 3GZ0A 3V3FA 4YXIA 3TVOX 3RYVB 1YDBA 2CBAA 2O4ZA 4MO8A 4HU1A 5SZ7A 5L6KA 3K2FA 4PYYA 3RYYA 2X7UA 1BNUA 2FMGA 3M2XA 3F8EA 1CVEA 1IF8A 1OQ5A 1RZBA 5CA2A 1G54A 5G01A 5DSLA 3K7KA 5JG3B 5DOGA 5SZ2A 3D92A 1LUGA 1RZDA 3DD0A 3M04A 5DSQA 4Q78A 5E2MA 1FR4A 3K34A 4FPTA 2W2JA 4Q6DA 1XQ0A 4RN4A 1UGEA 5SZ5A 1CAMA 4QK2A 5CJFA 1BNTA 3MHMA 4HEYA 3V2MA 2WD2A 3OILA 4Q49A 1ZFKA 2CBCA 1BV3A 5JG5B 3DVBA 4QSIA 3HKNA 1I8ZA 5FLRA 4JSAA 3BL0A 1BN4A 1UGFA 1MUAA 1LZVA 4FVOA 4Q6EA 3IBIA 5L3OA 3SBHA 3T83A 4MDMA 4M2WA 4X5SA 5EH8A 5FNMA 4BCWA 3HFPA 5EKHA 4C3TA 1CNWA 4ITPA 1CNGA 3IGPA 1CVAA 2ABEA 3EFTA 3DCCA 3KIGA 3MHCA 5SZ3A 2FNNA 2HL4A 3D93A 4M2UA 1XEGA 3IBNA 4JSZA 3MNUA 5G0BA 4HEWA 2OSFA 4WW8A 2WEHA 1FQMA 3DCWA 4RIUA 1YDDA 3JXGA 5FNIA 1DMYA 3V3GB 1TBTX 4KUVA 4QSJA 2QP6A 2CBBA 1I90A 5EKMA 3IAIA 3OYSA 3OY0A 4RUZA 5JDVB 5DVXA 4Q83A 4HBAA 3HS4A 3HLJA 4KUWA 3KLDB 4LHIA 2EZ7A 2NMXA 3F7UA 4QIZA 3RZ5A 1TEQX 4Q7PA 3M2NA 5FNJA 1G3ZA 4MTYA 3RYXB 2VVBX 4QJPA 5AMLA 5LMDA 1HVAA 2FOUA 1BN3A 4G7AA 1IF7A 3RG4A 2WEJA 9CA2A 4KV0A 1ZNCA 3P55A 5E2RA 1FSQA 1CCSA 5G0CA 3P58A 4Q99A 3R16A 4JSSA 5DSPA 7CA2A 1F2WA 4IDRX 4QJXA 1CZMA 4RUXA 3W6HA 1G48A 1AVNA 1I9OA 1CA3A 4FRCA 1CANA 1G4OA 1URTA 4Q7SA 1RZEA 4Q09A 3D9ZA 4RFCA 3B4FA 1G0FA 3ZP9A 5JESB 2QO8A 3NJ9A 1I9MA 4KUYA 1KOPA 5FLOA 3S74B 3S73B 1CVCA 1CAJA 1UGBA 1CRMA 4PQ7A 3DD8A 5E2SA 2H4NA 1TB0X 1UGDA 4L5UA 4MDGA 3M96A 4YGLA 1ZFQA 5A6HA 4YXOA 3MNIA 3BETA 1CAZA 3KOIA 4RFDA 4Q07A 4RUYA 1HCAA 1G46A 3M14A 5EH7A 1BNNA 1CNHA 5BRVA 1BICA 3RZ1B 3NI5A 5HPJA 3S97A 4Z1EA 4M2RA 1CAKA 3N4BA 5JEPB 3CYUA 3FFPX 3MNJA 5FDIA 4Z0QA 5AMGA 1KEQA 1RAZA 1A42A 3IBLA 3KWAA 3M1QA 4KNJA 5JQTA 3CA2A 4E3DA 4ETQC 4ZWYA 4CNWA 3MNKA 1FR7A 3MHLA 3N3JA 2HOCA 3S9TA 1TTMA 1ZE8A 4JSWA 1KWQA 1HEDA 1BNVA 3P5LA 4E3HA 1I9LA 3M40A 3S76A 5JGSB 5G03A 5FNHA 1FQRA 1RZCA 4PXXA 1JV0A 1OKNA 3T85A 1ZGEA 3V3IB 4KP5A 4Q8YA 4BF1A 1HUHA 5FLSA 1HUGA 1DCAA 2FOSA 2NNVA 4YYTA 3QYKA 2FW4A 4DZ9A 4WUQA 3HKUA 3P44A 1DMXA 2Q1BA 3D0NA 3ZNCA 1HECA 4ZX1A 4YGFA 4ZX0A 5FL5A 1T9NA 1UGAA 5BYIA 2FOYA 1CILA 1CIMA 1Y7WA 1CCUA 2POUA 4Q7VA 4WUPA 5J8ZA 3P3JA 1OKMA 1BNWA 4ZWZA 4QIYA 3PJJA 2POWA 4COQA 5E5UA 3DC3A 1H4NA 3P5AA 4XE1A 3KS3A 5CLUA 3M3XA 3PO6A 4YVYA 1YDAA 3RG3A 3MHOA 4E4AA 3ML2A 3TMJA 1CNCA 3U47A 1DCBA 4HT2A 2X7TA 2VVAX 1ZH9A 2WEGA 3FE4A 4CACA 2X7SA 4MLXA 1XEVA 1G1DA 4FL7A 4E49A 1Z97A 4DZ7A 3MDZA 5SZ0A 1RJ6A 4WR7A 4E3GA 4Z1JA 4XZ5A 1CNKA 1TEUX 1I9PA 1RAYA 4TWLA 2WD3A 5BRWA 3RYZA 1H9QA 3V3HB 2EU3A 4PZHA 6CA2A 1CALA 1BCDA 3T84A 5A25A 1CVBA 2NXRA 2GD8A 5EHEA 5FNGA 3RYJB 3T82A 5FL6A 1CNJA 4QEFA 4N16A 3M5EA 2FOQA 5DSIA 4QTLA 1IF9A 3KONA 1CNXA 4K1QA 5EOIA 3S71B 5DSRA 4XFWA 3JXFA 4Q81A 3M2ZA 4ITOA 2H15A 4RH2A 1EOUA 3RJ7A 2AW1A 3MHIA 5FDCA 2F14A 4WL4A 3P3HA 4HF3A 2NNSA 4CNXA 4Q9YA 4R59A 1FQNA 3L14A 3DVCA 5SZ6A 2CBEA 3Q31A 4M2VA 4XIXA 3S77B 3UYQA 1I9QA 3OIMA 3S75B 4K0ZA 4ILXA 5E28A 3U7CA 3F4XA 1G6VA 5SZ1A 2NWOA 5FNKA 4KAPA 1KOQA 4N0XB 3DAZA 3JXHC 4Q8XA 4Z1NA 3U3AX 4FU5A 3S8XA 2ZNCA 3KOKA 1AZMA 2NN7A 1CAIA 3U45X 4FIKA 1KWRA 1CNIA 5FNLA 8CA2A 3BL1A 2FNKA 4CQ0A 5EHVA 3DV7A 3T5ZA 3IEOA 3M5TA 4IWZA 5DSMA 3V2JA 5C8IA 1AM6A 5SZ4A 1LGDA 4LU3A 3FW3A 1CAYA 1TG9A 1BZMA 3EFIA 2NWYA 2HKKA 3V5GA 1CVDA 5DSOA 4E5QA 3KNEA 3ML5A 3DA2A 3NB5A 4QK3A 1CRAA 4YGJA 4YGKA 5E2KA 5AMDA 4ZWIA 3W6IA 4QJ0A 3V3JA 4KNNA 1IF4A 3UYNA 2NXSA 3OYQA 4RIVA 1HEAA 4G0CA 4ZWXA 4KP8A 3T5UA 5BRUA 4QK1A 2HFWA 4YXUA 1TH9A 3MNAA 3MWOA 1OKLA 3DVDA 4Q87A 5FL4A 1YDCA 1YO1A 2HD6A 4L5VA 1BNQA 1V9EA 5E5RA 3CAJA 4KNIA 3M1KA 3N2PA 3TVNX 5EZTX 4K0TA 2WEOA 3RZ7A 1UGCA 3RLDA 3SAXA 4MLTA 3R17B 3C7PA 4JS6A 4CNRA 4Q06A 5JEGB 2NWZA 4Z1KA 2FMZA 5DSJA 2IT4A 4TWMA 1I9NA 1CAOA 3PYKA 4MDLA 1CAHA 4KNMA 2FOVA 2ILIA 5E2NA 4BF6A 4Q0LA 1IF5A 4Q8ZA 1LG5A 1J9WA 2Q1QA 3OKUA 2AX2A 1CINA 5JGTB 4XIWA 3MYQA 4K0SA 3MNHA 4QJOA 5EKJA 5FLPA 1HCBA 1RZAA 1CVFA 1JCZA 1FQLA 2NN1A 4FVNA 2NWPA 3D8WA 4QY3A 4Y0JA 5FLTA 1ZSBA 1G45A 5EH5A 3DBUA 4HT0A 1BNMA 2EU2A 2NXTA 5EIJA 3M1JA 1CNYA 1MOOA 3RGEA 3SAPA 2QOAA 1CCTA 1LG6A 1IF6A 4R5AA 1YO2A 4QSBA 3M98A 1I91A 3B1BA 5EHWA 12CAA 1UGGA 3HKTA 2CA2A 4E9OX 1G52A 3KKXA 1G4JA 3OIKA 3DCSA 2Q38A 4HEZA 2NNGA 3M5SA 3S72B 1H9NA 1ZSCA 5DSKA 2CBDA 4Q08A 4YGNA 1G0EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3SBI A;  1TG3 A;  2OSM A;  3RZ0 B;  2NNO A;  1RJ5 A;  4YHA A;  1FSN A;  3DC9 A;  4Q7W A;  2HNC A;  3N0N A;  4QJM A;  1JD0 A;  1FSR A;  4WW6 A;  3OKV A;  1YO0 A;  4YWP A;  3M67 A;  5JQ0 A;  1V9I C;  4Q90 A;  4ZAO A;  2CAB A;  3P4V A;  4QJW A;  3MZC A;  5FLQ A;  3M2Y A;  3IBU A;  4K13 A;  3RZ8 A;  1CA2 A;  3MMF A;  1CNB A;  4YX4 A;  1Z9Y A;  3F7B A;  4CNV A;  5DRS A;  1HEB A;  3S78 B;  1FLJ A;  3VBD A;  4R5B A;  4CA2 A;  4E3F A;  1CVH A;  4L5W A;  1BN1 A;  3V7X A;  4PYX A;  1XPZ A;  3M1W A;  5BNL A;  1ZGF A;  2FNM A;  3CZV A;  3HKQ A;  1TE3 X;  5DSN A;  2POV A;  5DOH A;  4UOV A;  1THK A;  5IPZ A;  4GL1 X;  4LP6 A;  1G53 A;  1ZSA A;  5JEH B;  5CAC A;  3LXE A;  2GEH A;  1Z93 A;  4QSA A;  3GZ0 A;  3V3F A;  4YXI A;  3TVO X;  3RYV B;  1YDB A;  2CBA A;  2O4Z A;  4MO8 A;  4HU1 A;  5SZ7 A;  5L6K A;  3K2F A;  4PYY A;  3RYY A;  2X7U A;  1BNU A;  2FMG A;  3M2X A;  3F8E A;  1CVE A;  1IF8 A;  1OQ5 A;  1RZB A;  5CA2 A;  1G54 A;  5G01 A;  5DSL A;  3K7K A;  5JG3 B;  5DOG A;  5SZ2 A;  3D92 A;  1LUG A;  1RZD A; 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