2H15A

Carbonic anhydrase inhibitors: clashing with ala65 as a means of designing isozyme-selective inhibitors that show low affinity for the ubiquitous isozyme ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Carbonic anhydrase inhibitors: clash with Ala65 as a means for designing inhibitors with low affinity for the ubiquitous isozyme II, exemplified by the crystal structure of the topiramate sulfamide analogue.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
total genus 77
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2h15A00
2FMGA 4CQ0A 1TB0X 1ZH9A 12CAA 3HS4A 4QJ0A 1CNBA 3HKNA 3DAZA 3JXHC 4Q7PA 3M1QA 5JESB 4FVNA 2NNSA 2FMZA 1CRMA 4K0TA 4QSAA 1UGAA 5E2KA 1CVCA 4PZHA 1LG6A 3K34A 3W6IA 1KWRA 3L14A 4ZX0A 4YGNA 4JS6A 2HL4A 3M2YA 2NXSA 3DCSA 3DV7A 1CNHA 5DOHA 5EH5A 2FNKA 4QJMA 3RYJB 1OKLA 5SZ3A 3Q31A 3DCCA 2EZ7A 1I9QA 3M5TA 4M2WA 3C7PA 4PXXA 3S9TA 4YGJA 5G03A 4ZWZA 1CVHA 4QIYA 5SZ0A 4JSAA 1UGGA 2CA2A 3P4VA 3MNIA 5SZ4A 1IF9A 1FQLA 7CA2A 1RZCA 1CNIA 3IBUA 1UGDA 3HLJA 4ZX1A 4HEWA 4FVOA 4QJPA 5JG5B 1DMYA 1LGDA 5CACA 3S76A 2FOUA 5BRWA 3DVDA 3KS3A 5JDVB 4Q06A 1XEVA 3N3JA 4HBAA 3OKUA 4Q6DA 5IPZA 3F7UA 4YVYA 4KP8A 3VBDA 3U3AX 4Q7WA 3DVCA 5EKHA 1FQNA 4FIKA 4ZWYA 3KOKA 1CA3A 1EOUA 4E4AA 4MTYA 3RZ0B 2HNCA 2CBEA 3D9ZA 3S71B 3IGPA 4Q8ZA 1BN4A 5A25A 1TE3X 3S78B 1I9PA 3LXEA 3V7XA 1URTA 1KOQA 1G4OA 4MLXA 5EZTX 5G0BA 3P3JA 1G45A 1YDDA 5A6HA 4FL7A 5G0CA 4QSIA 2NNOA 4N0XB 4RUYA 5AMDA 2HD6A 3RYZA 3RYVB 1KWQA 3GZ0A 2OSMA 1ZSAA 4R5AA 1IF4A 5BRVA 3RYYA 3PJJA 2VVAX 3TMJA 4ZWXA 3RZ5A 1I9MA 5BRUA 3DBUA 2NWPA 3JXFA 4BF6A 1DCAA 2F14A 3PYKA 2NNGA 3S8XA 3S73B 2VVBX 3K7KA 5DSQA 1RJ6A 4DZ7A 5DSKA 2FW4A 5L6KA 2FNNA 5DSRA 3S77B 1TEUX 3BL1A 3CA2A 3SBHA 2NN1A 5EOIA 4KNNA 3MYQA 3KOIA 5DSJA 1CCUA 1UGCA 4RFCA 2NXTA 2ABEA 1YDBA 4LHIA 4QSBA 4YYTA 4UOVA 4CACA 2Q38A 2HOCA 1CNKA 1LZVA 3RLDA 1FSNA 3MNJA 3S74B 4Q7SA 4PYYA 4HF3A 2WEHA 5EH7A 4YGFA 5EHVA 3P3HA 5DVXA 5FNMA 2FOSA 2AW1A 1HCBA 3P5AA 4KP5A 5FDCA 4ZWIA 4HT0A 3DA2A 1BNNA 3CYUA 2CBDA 1CNYA 4N16A 1CAOA 1KEQA 1Z9YA 3KWAA 3HFPA 4KUYA 1CNCA 4CNVA 1BNMA 1UGFA 1BNTA 1Y7WA 1AVNA 5E2NA 5L3OA 1CVFA 3HKQA 3OIMA 4ILXA 4X5SA 4CA2A 2NXRA 3FW3A 5FNIA 5BYIA 1DCBA 3IBNA 3RYXB 2ILIA 3R17B 1BZMA 5SZ7A 3B4FA 5JQTA 1HUGA 3D93A 3IBLA 5G01A 4KUWA 3JXGA 3D0NA 3RZ8A 5EKMA 1CAHA 4MDGA 3N4BA 1RZDA 3MNHA 1DMXA 2WEJA 3BL0A 3B1BA 4YX4A 5DRSA 6CA2A 3KNEA 5SZ5A 4RFDA 4ZAOA 1ZFQA 3DCWA 4WL4A 5JEPB 1I9OA 1ZFKA 3M04A 4E3DA 1CRAA 1OKMA 4L5VA 5HPJA 3M5EA 3MWOA 1BNQA 3BETA 3P55A 2QP6A 2O4ZA 3M1JA 3UYNA 1RAZA 2POVA 5FNLA 3HKTA 4Q7VA 4E49A 1HECA 4PQ7A 4R59A 5DSMA 4FPTA 2ZNCA 5DSPA 3KLDB 5SZ2A 3T84A 2FOYA 3MHMA 1AM6A 2NWOA 4E3HA 4RIUA 3NB5A 1CAIA 3EFIA 4ETQC 1TBTX 4IWZA 3KIGA 5FL6A 3M1WA 4WR7A 1JD0A 1CCTA 4HT2A 3S72B 1CA2A 4YWPA 5E5RA 4QJOA 1V9EA 2X7TA 5JGSB 1XPZA 3IEOA 1ZNCA 4KV0A 5JQ0A 5J8ZA 3K2FA 4L5WA 3V5GA 1CNJA 5FLRA 5AMGA 3V3IB 2NWYA 4Q81A 4Z1NA 3D8WA 1MUAA 3RJ7A 3MNAA 5FDIA 3OKVA 3V2JA 2HFWA 3DD8A 4QTLA 4QJXA 5FLOA 1UGEA 1YDCA 4C3TA 3V3FA 1IF7A 3V3HB 5DOGA 3M2XA 4IDRX 4CNRA 3F8EA 4Q0LA 1CAMA 4WUQA 1HEAA 1YO1A 1BV3A 5CLUA 4GL1X 1I90A 3T85A 5E28A 5EKJA 1I91A 2Q1BA 5AMLA 2WD2A 1MOOA 3R16A 3IAIA 3M3XA 4Q78A 5EIJA 1H4NA 2FNMA 4Z1JA 4Q99A 4BF1A 1G0EA 4K0SA 3U47A 4Z0QA 1CZMA 5SZ1A 1FLJA 4JSWA 4XE1A 1THKA 1CINA 1RAYA 3T5ZA 4PYXA 4QK3A 4LP6A 3DVBA 1UGBA 3ZP9A 1KOPA 2FOVA 1G6VA 1TEQX 4K0ZA 1XEGA 2CBAA 3IBIA 3M14A 1CAJA 2Q1QA 2QO8A 4KUVA 1ZGEA 4G0CA 4K1QA 4QEFA 1CAKA 1FSRA 5FLPA 4ITOA 2WD3A 4E3GA 1CNWA 2CBBA 4Q08A 4RN4A 1YO0A 2H15A 4XZ5A 4Q8XA 3N2PA 3U45X 1CAYA 4FU5A 1Z97A 4TWMA 5FL5A 1BN1A 1JV0A 1H9NA 3OIKA 3RG4A 1BICA 4L5UA 5EHEA 1CAZA 1CNGA 2WEOA 5FNJA 5JEGB 1IF8A 1HVAA 3MZCA 1J9WA 1YO2A 3MNKA 1HCAA 2NN7A 4WW6A 4YXOA 3MDZA 4HEYA 3ML2A 5FLSA 4QK1A 1G3ZA 3KONA 1CVDA 1YDAA 1TG3A 3CZVA 4Q90A 4QIZA 1H9QA 5E5UA 4Z1EA 4BCWA 3RGEA 1OQ5A 3DC9A 4FRCA 4KNJA 1CVAA 4HEZA 4XIXA 1CVEA 4JSZA 4Q09A 4QJWA 3FFPX 4ITPA 4M2RA 4WUPA 4MDMA 4E9OX 3HKUA 3T5UA 2AX2A 1CIMA 1ZGFA 1LUGA 3TVNX 3RZ7A 1TG9A 1CVBA 4YXUA 4Q6EA 4RUXA 4Q83A 1TH9A 2OSFA 5DSOA 4KNMA 3M40A 1HUHA 2NMXA 1Z93A 4MDLA 3ML5A 1T9NA 4CNWA 3S75B 5DSIA 2EU2A 2FOQA 4Q9YA 4Z1KA 3QYKA 1CALA 5JG3B 2WEGA 2CABA 5JEHB 3OYQA 1FR4A 1G52A 4YXIA 1FR7A 2GEHA 5E2MA 3V3GB 4XFWA 3PO6A 4Q87A 3SBIA 3F7BA 4RUZA 5DSNA 4YGLA 3TVOX 4M2UA 1G4JA 3UYQA 1BNVA 2POWA 3M1KA 3OILA 1I9NA 1I8ZA 1BNWA 4YGKA 4LU3A 1G1DA 1G53A 2NNVA 3D92A 3MHLA 3T82A 4RIVA 4Q49A 1OKNA 1ZSBA 3NJ9A 1I9LA 4MO8A 4E3FA 1V9IC 1G0FA 4XIWA 4KNIA 3RG3A 4G7AA 5E2SA 2EU3A 4Q8YA 1G46A 5FNKA 4CNXA 3SAXA 3M67A 1RJ5A 5FNHA 1IF5A 1F2WA 3DC3A 4K13A 2GD8A 3OY0A 1TTMA 3NI5A 2IT4A 1HEBA 3M2ZA 4R5BA 5LMDA 2H4NA 4M2VA 5FNGA 1RZAA 2X7UA 2X7SA 2CBCA 3DD0A 5BNLA 4JSSA 4WW8A 4QSJA 4MLTA 3CAJA 3S97A 3U7CA 1CCSA 3F4XA 4Q07A 4E5QA 1G54A 1XQ0A 1JCZA 1RZEA 4HU1A 3V2MA 3W6HA 3P58A 9CA2A 4DZ9A 1ZSCA 4Y0JA 2HKKA 1AZMA 2POUA 3FE4A 4YHAA 3M5SA 3MHIA 3N0NA 3M96A 1CILA 5E2RA 5SZ6A 2W2JA 1BCDA 2NWZA 3RZ1B 4QY3A 1FQRA 1IF6A 5EHWA 3MNUA 1RZBA 3T83A 1BNUA 3M2NA 3ZNCA 1CNXA 5FL4A 5DSLA 5FLQA 5CA2A 3EFTA 1CANA 1A42A 4TWLA 2QOAA 4COQA 1BN3A 3MHOA 1FSQA 1ZE8A 5C8IA 4KAPA 3P5LA 5EH8A 5JGTB 5CJFA 3KKXA 4QK2A 3M98A 3MMFA 3OYSA 8CA2A 4RH2A 3V3JA 1G48A 3MHCA 1HEDA 3SAPA 1FQMA 3P44A 5FLTA 1LG5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2FMG A;  4CQ0 A;  1TB0 X;  1ZH9 A;  12CA A;  3HS4 A;  4QJ0 A;  1CNB A;  3HKN A;  3DAZ A;  3JXH C;  4Q7P A;  3M1Q A;  5JES B;  4FVN A;  2NNS A;  2FMZ A;  1CRM A;  4K0T A;  4QSA A;  1UGA A;  5E2K A;  1CVC A;  4PZH A;  1LG6 A;  3K34 A;  3W6I A;  1KWR A;  3L14 A;  4ZX0 A;  4YGN A;  4JS6 A;  2HL4 A;  3M2Y A;  2NXS A;  3DCS A;  3DV7 A;  1CNH A;  5DOH A;  5EH5 A;  2FNK A;  4QJM A;  3RYJ B;  1OKL A;  5SZ3 A;  3Q31 A;  3DCC A;  2EZ7 A;  1I9Q A;  3M5T A;  4M2W A;  3C7P A;  4PXX A;  3S9T A;  4YGJ A;  5G03 A;  4ZWZ A;  1CVH A;  4QIY A;  5SZ0 A;  4JSA A;  1UGG A;  2CA2 A;  3P4V A;  3MNI A;  5SZ4 A;  1IF9 A;  1FQL A;  7CA2 A;  1RZC A;  1CNI A;  3IBU A;  1UGD A;  3HLJ A;  4ZX1 A;  4HEW A;  4FVO A;  4QJP A;  5JG5 B;  1DMY A;  1LGD A;  5CAC A;  3S76 A;  2FOU A;  5BRW A;  3DVD A;  3KS3 A;  5JDV B;  4Q06 A;  1XEV A;  3N3J A;  4HBA A;  3OKU A;  4Q6D A;  5IPZ A;  3F7U A;  4YVY A;  4KP8 A;  3VBD A;  3U3A X;  4Q7W A;  3DVC A;  5EKH A;  1FQN A;  4FIK A;  4ZWY A;  3KOK A;  1CA3 A;  1EOU A;  4E4A A;  4MTY A;  3RZ0 B; 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