2HL4 | Genus

Total Genus 76

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	76
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	257
structure length	257
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__262157251815038__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__262157251815038__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2hl4/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__262157251815038__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"262157251815038","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2hl4/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__262157251815038__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
publication title	Carbonic anhydrase inhibitors: binding of an antiglaucoma glycosyl-sulfanilamide derivative to human isoform II and its consequences for the drug design of enzyme inhibitors incorporating sugar moieties pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
total genus	76
structure length	257
sequence length	257
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2006-07-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	2hl4A00

1CVFA 2NWPA 5CA2A 5JDVB 3RZ5A 4JSSA 1BNTA 1ZGEA 3V3IB 4TWMA 4WUQA 5FDIA 4XIXA 1I9LA 3NJ9A 5FLPA 2CBDA 5A25A 2NNGA 1CNKA 3U47A 2F14A 3QYKA 3F8EA 4LP6A 5FL4A 5HPJA 3SAXA 1XPZA 1H9QA 4BCWA 3RYYA 4BF1A 1IF6A 3MYQA 3DC9A 3M5TA 1CA2A 3MNUA 2POUA 3W6HA 1CNIA 2WD3A 4Z1EA 1IF7A 2CBCA 3M1WA 4Q8XA 1ZSCA 1G46A 1I9OA 3V3JA 4DZ9A 4QJPA 5E2NA 2X7TA 1IF4A 4Q08A 1FQMA 1UGAA 2NXTA 4FIKA 4RN4A 3SAPA 3SBIA 4PXXA 5FLTA 1ZSAA 3M04A 3ZNCA 3S75B 5BRVA 4HF3A 5SZ3A 1JD0A 1LZVA 3RYVB 5FNHA 4E5QA 1UGGA 4FVNA 4E3FA 3D8WA 1CVHA 1RJ5A 5DOHA 4MLXA 3L14A 4QTLA 3F4XA 3JXFA 4Q8YA 4QSAA 4YX4A 4QK3A 4E9OX 4E49A 3RYJB 2FNNA 1I9MA 2X7SA 1RZEA 4LHIA 4N16A 3U45X 5DSPA 4PYYA 1TE3X 1AZMA 5EKJA 1CNJA 1UGDA 1OKNA 4FU5A 5JEPB 3MHIA 3PJJA 1I9NA 3BL1A 5EOIA 1OKMA 3M5EA 3D93A 3KOIA 1TEUX 1G0FA 4XE1A 3FW3A 5FNLA 1RZDA 3D9ZA 3M67A 4QK1A 2ZNCA 4ILXA 2HFWA 1BN1A 1CNCA 3M2ZA 4RH2A 1G4OA 1V9IC 1CVBA 1THKA 1HECA 4HEWA 2WEGA 3Q31A 1BNNA 5FNGA 3S74B 3RZ7A 3M3XA 1CVEA 5FNIA 1TG9A 3M98A 5DSOA 4ZWXA 1TH9A 1BZMA 3K34A 3DD8A 1CAOA 5DSKA 4WL4A 4K0TA 4Q07A 1BICA 3R16A 5FLSA 3CYUA 5DRSA 1CNYA 4ZWIA 3OIKA 4L5VA 4QK2A 4Q0LA 4QIZA 3VBDA 1DMXA 1YDBA 1J9WA 1G1DA 1G54A 4YGNA 3S9TA 4KNIA 3MNJA 2WD2A 5JEGB 3DBUA 1FSRA 3M1KA 4Q81A 5EHVA 2AW1A 1G6VA 4HEZA 3KWAA 4MO8A 3P5LA 3N3JA 4XZ5A 4QSIA 1UGEA 5AMDA 2VVBX 1UGCA 4KP8A 3HLJA 1FQNA 3OILA 5SZ2A 1H9NA 3U3AX 3V7XA 5EH7A 3M96A 4ZX1A 4BF6A 1CAYA 1KEQA 5A6HA 4R5AA 3S73B 3HFPA 1Z97A 2GEHA 4MLTA 3S97A 1CNXA 3DVDA 5E2RA 2FW4A 3N0NA 4HT2A 3V2JA 3MNKA 2OSFA 1CNGA 1CAIA 3N4BA 3V3GB 1MOOA 4IWZA 5SZ1A 3M5SA 2WEHA 5DSIA 1OQ5A 3TVNX 5DSJA 1BN3A 3IBNA 4K13A 5DSMA 3P3JA 4K0SA 3UYQA 1DCBA 5AMLA 4KUWA 4WUPA 4R5BA 3S77B 2NWZA 1CRAA 3N2PA 4Q99A 5G0BA 3F7UA 3FE4A 3IGPA 4ETQC 4HEYA 4FRCA 2FNMA 4QEFA 4Q09A 1BNUA 2OSMA 4M2VA 3HKNA 3S72B 4KNMA 3OYSA 4R59A 4X5SA 4Q8ZA 4QJ0A 3EFTA 4Q9YA 3S76A 4MDGA 3RZ0B 2GD8A 1G4JA 4RIVA 4XFWA 5E2KA 5JGSB 2HKKA 3B1BA 5CLUA 2IT4A 3HKTA 4YGLA 1BNMA 3M2NA 2CBBA 3M2YA 4KP5A 9CA2A 2FOVA 4DZ7A 3MHLA 4Y0JA 3CZVA 3NI5A 2FOQA 4RFDA 3HS4A 4E3GA 1HCAA 5FLOA 1RJ6A 1KOPA 1BNWA 2FOYA 4ITPA 3U7CA 5SZ4A 3KOKA 1I91A 4RFCA 5DOGA 3DV7A 1LUGA 3OY0A 1ZFQA 3RGEA 4Q7VA 5FNJA 3RLDA 3F7BA 2EU3A 3T5ZA 3TMJA 5JG3B 4QJWA 1CVDA 3V5GA 3T5UA 4CACA 3T85A 1CAZA 1HEDA 4KUYA 4UOVA 1HCBA 1Z93A 5EH5A 1G53A 4L5UA 4YVYA 4Q83A 3T82A 3P3HA 1V9EA 3M1JA 2EU2A 2HD6A 3RZ8A 1F2WA 3DAZA 4COQA 1Z9YA 1G0EA 1YDCA 1KWQA 2H4NA 2NNVA 1CZMA 1TBTX 1LGDA 3GZ0A 1HVAA 6CA2A 3OKVA 1FSQA 3P44A 3R17B 1TEQX 5EHEA 3RJ7A 5DSLA 5J8ZA 4QJMA 3ZP9A 3MMFA 1BCDA 3P5AA 3EFIA 3KONA 3RG4A 1FQLA 4RUZA 3OYQA 4FVOA 1CAMA 5E5UA 2FOSA 2ILIA 3MHOA 4YYTA 1RZBA 3ML2A 5JG5B 4JSAA 1CA3A 2NWOA 1RAZA 4Q90A 1YO1A 3M40A 4Z0QA 3KS3A 4QSBA 4CNWA 1CNWA 1G3ZA 3K2FA 1CILA 4MDMA 3IBIA 2NMXA 4CQ0A 1DMYA 4YWPA 1HEAA 1LG5A 5G01A 3IAIA 4CNVA 4ZAOA 3M1QA 1ZH9A 1I90A 4Q7SA 2CA2A 2POVA 3CAJA 3S71B 1CNHA 5DSNA 4YXIA 5EZTX 1CANA 4RUXA 8CA2A 3IEOA 3DVCA 1ZSBA 4HT0A 4ITOA 5BYIA 4LU3A 5CJFA 1CNBA 5DSQA 5JEHB 2QO8A 3IBUA 5E2MA 3NB5A 1TTMA 2EZ7A 2NXRA 2CBEA 1URTA 4KAPA 3M14A 5IPZA 1I9PA 1YDDA 3V3FA 3UYNA 1KWRA 4CNXA 3RYZA 4Q6DA 2Q38A 2NN7A 3MHMA 5C8IA 1OKLA 1CAKA 5DVXA 3SBHA 5EIJA 4Q7PA 3TVOX 4G0CA 4Q49A 4KNJA 5SZ5A 1H4NA 4KNNA 5SZ7A 2FMZA 5AMGA 2HNCA 3JXGA 1CVAA 4TWLA 1ZGFA 1RZAA 4MDLA 2NXSA 3M2XA 4KV0A 4QJXA 3JXHC 4FL7A 3ML5A 3IBLA 2FOUA 3KLDB 2WEJA 4ZX0A 1XEGA 2Q1BA 5JGTB 1CAHA 2W2JA 3D92A 4M2RA 4C3TA 1UGFA 4QSJA 3KKXA 1BV3A 2NN1A 1CCUA 1HEBA 1BNVA 1DCAA 2FNKA 3P55A 4WW6A 4M2UA 1CRMA 3MWOA 2X7UA 5EKHA 1ZFKA 3T83A 5BRUA 4Z1JA 1CALA 2CBAA 2QOAA 1Y7WA 5SZ0A 1FSNA 1AVNA 2ABEA 1BNQA 2AX2A 3HKQA 1CVCA 3KNEA 4XIWA 4Q06A 4E4AA 3DC3A 4HU1A 1IF8A 1CCSA 2H15A 5EKMA 1ZNCA 5EHWA 1YO0A 5E2SA 2O4ZA 4YXUA 4PZHA 4JS6A 4L5WA 5G0CA 4YGKA 5E5RA 5FL6A 1CAJA 5FNMA 4K0ZA 4KUVA 3BL0A 1YO2A 5LMDA 3W6IA 1A42A 1IF9A 1AM6A 1UGBA 2VVAX 1RAYA 2HOCA 4GL1X 5DSRA 1JCZA 5FDCA 1G45A 2QP6A 3P4VA 1FR7A 4FPTA 4ZWZA 4PYXA 4CA2A 4JSWA 3MHCA 2FMGA 3MNHA 4M2WA 4PQ7A 3KIGA 4Z1KA 5BNLA 3MNAA 2NNOA 5FNKA 1XQ0A 3RYXB 4QJOA 3V2MA 4K1QA 3S8XA 4JSZA 1IF5A 4G7AA 1YDAA 1I9QA 3DCSA 3OKUA 3MZCA 2WEOA 12CAA 2POWA 3DCCA 5SZ6A 1MUAA 1T9NA 4RIUA 5L3OA 4Z1NA 4Q6EA 1FQRA 5JESB 5FL5A 2HL4A 4MTYA 3CA2A 3BETA 4E3DA 1G48A 3FFPX 5BRWA 1TG3A 5EH8A 5JQTA 2NNSA 3DCWA 1FR4A 1CCTA 3B4FA 4IDRX 4Q87A 4E3HA 1XEVA 3C7PA 4QY3A 3PYKA 2Q1QA 3DA2A 5E28A 3P58A 4N0XB 4YHAA 4RUYA 3D0NA 5FLQA 1CIMA 4YGJA 1G52A 1ZE8A 4Q7WA 7CA2A 5G03A 1BN4A 5JQ0A 3PO6A 1KOQA 3LXEA 3V3HB 5CACA 3DD0A 5FLRA 3DVBA 4ZWYA 5L6KA 1EOUA 3MNIA 4QIYA 4HBAA 4YXOA 1RZCA 3T84A 1FLJA 2CABA 3HKUA 4YGFA 1TB0X 2NWYA 4Q78A 4WR7A 1HUHA 3MDZA 3OIMA 1I8ZA 1CINA 1HUGA 3RG3A 3S78B 4WW8A 1JV0A 1LG6A 4CNRA 3RZ1B 3K7KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CVF A;  2NWP A;  5CA2 A;  5JDV B;  3RZ5 A;  4JSS A;  1BNT A;  1ZGE A;  3V3I B;  4TWM A;  4WUQ A;  5FDI A;  4XIX A;  1I9L A;  3NJ9 A;  5FLP A;  2CBD A;  5A25 A;  2NNG A;  1CNK A;  3U47 A;  2F14 A;  3QYK A;  3F8E A;  4LP6 A;  5FL4 A;  5HPJ A;  3SAX A;  1XPZ A;  1H9Q A;  4BCW A;  3RYY A;  4BF1 A;  1IF6 A;  3MYQ A;  3DC9 A;  3M5T A;  1CA2 A;  3MNU A;  2POU A;  3W6H A;  1CNI A;  2WD3 A;  4Z1E A;  1IF7 A;  2CBC A;  3M1W A;  4Q8X A;  1ZSC A;  1G46 A;  1I9O A;  3V3J A;  4DZ9 A;  4QJP A;  5E2N A;  2X7T A;  1IF4 A;  4Q08 A;  1FQM A;  1UGA A;  2NXT A;  4FIK A;  4RN4 A;  3SAP A;  3SBI A;  4PXX A;  5FLT A;  1ZSA A;  3M04 A;  3ZNC A;  3S75 B;  5BRV A;  4HF3 A;  5SZ3 A;  1JD0 A;  1LZV A;  3RYV B;  5FNH A;  4E5Q A;  1UGG A;  4FVN A;  4E3F A;  3D8W A;  1CVH A;  1RJ5 A;  5DOH A;  4MLX A;  3L14 A;  4QTL A;  3F4X A;  3JXF A;  4Q8Y A;  4QSA A;  4YX4 A;  4QK3 A;  4E9O X;  4E49 A;  3RYJ B;  2FNN A;  1I9M A;  2X7S A;  1RZE A;  4LHI A;  4N16 A;  3U45 X;  5DSP A;  4PYY A;  1TE3 X;  1AZM A;  5EKJ A;  1CNJ A;  1UGD A;  1OKN A;  4FU5 A;  5JEP B;  3MHI A;  3PJJ A;  1I9N A;  3BL1 A;  5EOI A;  1OKM A;  3M5E A;  3D93 A;  3KOI A;  1TEU X;  1G0F A;  4XE1 A;  3FW3 A;  5FNL A;  1RZD A;  3D9Z A;  3M67 A;  4QK1 A;  2ZNC A;  4ILX A;  2HFW A;  1BN1 A;  1CNC A;  3M2Z A;  4RH2 A;  1G4O A;  1V9I C;  1CVB A;  1THK A;  1HEC A;  4HEW A;  2WEG A;  3Q31 A;  1BNN A;  5FNG A;  3S74 B;  3RZ7 A;  3M3X A;  1CVE A;  5FNI A;  1TG9 A;  3M98 A;  5DSO A;  4ZWX A;  1TH9 A;  1BZM A;  3K34 A;  3DD8 A;  1CAO A;  5DSK A;  4WL4 A;  4K0T A;  4Q07 A;  1BIC A;  3R16 A;  5FLS A;  3CYU A;  5DRS A;  1CNY A;  4ZWI A;  3OIK A;  4L5V A;  4QK2 A;  4Q0L A;  4QIZ A;  3VBD A;  1DMX A;  1YDB A;  1J9W A;  1G1D A;  1G54 A;  4YGN A;  3S9T A;  4KNI A;  3MNJ A;  2WD2 A;  5JEG B;  3DBU A;  1FSR A;  3M1K A;  4Q81 A;  5EHV A;  2AW1 A;  1G6V A;  4HEZ A;  3KWA A;  4MO8 A;  3P5L A;  3N3J A;  4XZ5 A;  4QSI A;  1UGE A;  5AMD A;  2VVB X;  1UGC A;  4KP8 A;  3HLJ A;  1FQN A;  3OIL A;  5SZ2 A;  1H9N A;  3U3A X;  3V7X A;  5EH7 A;  3M96 A;  4ZX1 A;  4BF6 A;  1CAY A;  1KEQ A;  5A6H A;  4R5A A;  3S73 B;  3HFP A;  1Z97 A;  2GEH A;  4MLT A;  3S97 A;  1CNX A;  3DVD A;  5E2R A;  2FW4 A;  3N0N A;  4HT2 A;  3V2J A;  3MNK A;  2OSF A;  1CNG A;  1CAI A;  3N4B A;  3V3G B;  1MOO A;  4IWZ A;  5SZ1 A;  3M5S A;  2WEH A;  5DSI A;  1OQ5 A;  3TVN X;  5DSJ A;  1BN3 A;  3IBN A;  4K13 A;  5DSM A;  3P3J A;  4K0S A;  3UYQ A;  1DCB A;  5AML A;  4KUW A;  4WUP A;  4R5B A;  3S77 B;  2NWZ A;  1CRA A;  3N2P A;  4Q99 A;  5G0B A;  3F7U A;  3FE4 A;  3IGP A;  4ETQ C;  4HEY A;  4FRC A;  2FNM A;  4QEF A;  4Q09 A;  1BNU A;  2OSM A;  4M2V A;  3HKN A;  3S72 B;  4KNM A;  3OYS A;  4R59 A;  4X5S A;  4Q8Z A;  4QJ0 A;  3EFT A;  4Q9Y A;  3S76 A;  4MDG A;  3RZ0 B;  2GD8 A;  1G4J A;  4RIV A;  4XFW A;  5E2K A;  5JGS B;  2HKK A;  3B1B A;  5CLU A;  2IT4 A;  3HKT A;  4YGL A;  1BNM A;  3M2N A;  2CBB A;  3M2Y A;  4KP5 A;  9CA2 A;  2FOV A;  4DZ7 A;  3MHL A;  4Y0J A;  3CZV A;  3NI5 A;  2FOQ A;  4RFD A;  3HS4 A;  4E3G A;  1HCA A;  5FLO A;  1RJ6 A;  1KOP A;  1BNW A;  2FOY A;  4ITP A;  3U7C A;  5SZ4 A;  3KOK A;  1I91 A;  4RFC A;  5DOG A;  3DV7 A;  1LUG A;  3OY0 A;  1ZFQ A;  3RGE A;  4Q7V A;  5FNJ A;  3RLD A;  3F7B A;  2EU3 A;  3T5Z A;  3TMJ A;  5JG3 B;  4QJW A;  1CVD A;  3V5G A;  3T5U A;  4CAC A;  3T85 A;  1CAZ A;  1HED A;  4KUY A;  4UOV A;  1HCB A;  1Z93 A;  5EH5 A;  1G53 A;  4L5U A;  4YVY A;  4Q83 A;  3T82 A;  3P3H A;  1V9E A;  3M1J A;  2EU2 A;  2HD6 A;  3RZ8 A;  1F2W A;  3DAZ A;  4COQ A;  1Z9Y A;  1G0E A;  1YDC A;  1KWQ A;  2H4N A;  2NNV A;  1CZM A;  1TBT X;  1LGD A;  3GZ0 A;  1HVA A;  6CA2 A;  3OKV A;  1FSQ A;  3P44 A;  3R17 B;  1TEQ X;  5EHE A;  3RJ7 A;  5DSL A;  5J8Z A;  4QJM A;  3ZP9 A;  3MMF A;  1BCD A;  3P5A A;  3EFI A;  3KON A;  3RG4 A;  1FQL A;  4RUZ A;  3OYQ A;  4FVO A;  1CAM A;  5E5U A;  2FOS A;  2ILI A;  3MHO A;  4YYT A;  1RZB A;  3ML2 A;  5JG5 B;  4JSA A;  1CA3 A;  2NWO A;  1RAZ A;  4Q90 A;  1YO1 A;  3M40 A;  4Z0Q A;  3KS3 A;  4QSB A;  4CNW A;  1CNW A;  1G3Z A;  3K2F A;  1CIL A;  4MDM A;  3IBI A;  2NMX A;  4CQ0 A;  1DMY A;  4YWP A;  1HEA A;  1LG5 A;  5G01 A;  3IAI A;  4CNV A;  4ZAO A;  3M1Q A; 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2HL4A

Total Genus

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Chain Sequence

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