2HOC | Genus

Total Genus 74

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	74
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__9229473439927847__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__9229473439927847__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2hoc/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__9229473439927847__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"9229473439927847","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2hoc/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__9229473439927847__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Carbonic anhydrase inhibitors: X-ray crystallographic studies for the binding of 5-amino-1,3,4-thiadiazole-2-sulfonamide and 5-(4-amino-3-chloro-5-fluorophenylsulfonamido)-1,3,4-thiadiazole-2-sulfonamide to human isoform II. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 2
molecule tags	Lyase
total genus	74
structure length	258
sequence length	258
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2006-07-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	2hocA00

4KP8A 1RAZA 4Q90A 4YX4A 2WEGA 3OIMA 4KNJA 4QJ0A 1YDBA 2WEHA 3DCSA 2CBDA 5HPJA 2FNMA 5JGTB 4M2RA 3IBUA 4ILXA 2NNVA 4TWMA 1IF5A 1JD0A 1TEUX 3M3XA 4QIZA 1RAYA 4RUXA 3SAXA 4KUVA 3HKTA 3M2ZA 2NXSA 3MNUA 3QYKA 1FLJA 3OKVA 4BF6A 1AVNA 5FLRA 1I9OA 4QSAA 4E3FA 1G45A 1ZSCA 3V2JA 3RYYA 1HCBA 2NNGA 3JXFA 4XE1A 3Q31A 3OY0A 1BNUA 4Q9YA 3DVDA 3TMJA 1CNHA 3OYSA 4Q8ZA 1DMYA 4Z0QA 5SZ5A 1CAMA 3TVNX 1BZMA 4R59A 2CBAA 4R5AA 3P4VA 4KNNA 5JESB 4K13A 4YYTA 5DSJA 1I91A 4E3DA 4MDGA 2Q38A 2F14A 4HT0A 4RFDA 4RIVA 3BETA 5FL6A 1HEBA 4JSZA 3T5ZA 1YDAA 4M2UA 1CNIA 1FR4A 1XQ0A 3R16A 4QK2A 3MWOA 1ZSAA 4Q7WA 1G4JA 1YO1A 3HKUA 3MHLA 4ZAOA 1G3ZA 2NNOA 3HKNA 1H9NA 5FNMA 3OKUA 4KNMA 2VVAX 3KOKA 4YGLA 3RZ1B 3B4FA 2HL4A 4IWZA 1BV3A 4BCWA 1MOOA 5E2NA 1CNYA 4Z1NA 4KAPA 4TWLA 1XEVA 2H4NA 1RZAA 4E5QA 3MHMA 3KOIA 1RZDA 1ZFQA 2FOVA 4E4AA 3P44A 6CA2A 5E5UA 3NB5A 4Q8XA 3R17B 1CVFA 1BNMA 1FQNA 4ZWYA 1YDCA 4QSJA 2NXTA 1TTMA 1BNQA 1I9QA 1CINA 1Z97A 1CAYA 2GEHA 2H15A 5DSMA 3U3AX 3RZ5A 3CZVA 1CRMA 4HBAA 5AMGA 4KP5A 3V3IB 4FVOA 4WUQA 5FLPA 3DC9A 4Q8YA 3CAJA 2CBCA 3T83A 4CQ0A 2NWYA 1KOPA 3RZ0B 5EH7A 1JCZA 5DSLA 1V9EA 1CVHA 2FMGA 4Q78A 5FNKA 3EFTA 2ABEA 1G0EA 3M5TA 4KV0A 2CA2A 2QOAA 4YXUA 4YWPA 4PYXA 2VVBX 2AX2A 5EZTX 1CAHA 3PYKA 5E5RA 4N0XB 3N2PA 5A6HA 1IF4A 2IT4A 3PO6A 5SZ3A 3S71B 1BN4A 3KONA 3JXHC 3IEOA 4Q0LA 1HEAA 4KUWA 5EKHA 3MDZA 3RZ8A 1UGEA 4MLXA 3V5GA 9CA2A 4Q81A 5FLQA 3S77B 3W6HA 5FNIA 1BN1A 3RJ7A 2WD2A 3F7UA 5G0CA 3V3HB 4N16A 4JSSA 4ZWZA 2HD6A 1RJ6A 1CIMA 3ML5A 3HLJA 2HOCA 3RZ7A 4MDMA 4YHAA 1RZCA 2HKKA 1CCTA 2OSFA 5FL4A 3D8WA 4Q83A 5EOIA 5DSQA 3P3HA 3RLDA 2FNNA 4RFCA 4HEWA 1T9NA 5EIJA 1UGCA 3U7CA 3S75B 5FNLA 3MNHA 4DZ7A 3B1BA 1I9LA 4YXIA 1RZEA 4RH2A 4LHIA 1G48A 3MYQA 1G0FA 4QTLA 5DOGA 3V7XA 2POUA 3D9ZA 1OKNA 3BL1A 4Q6DA 5FNHA 3V3JA 4WUPA 1AM6A 3IGPA 3CA2A 1I9PA 3DA2A 1CA3A 3S9TA 3T85A 3M1WA 3RG4A 4K0ZA 2OSMA 1CNBA 4E49A 4M2VA 1KEQA 4FU5A 1AZMA 4YGFA 3LXEA 3SBHA 1OKLA 3S97A 4QJPA 4QJXA 2EU3A 1MUAA 1KWRA 2EU2A 3DC3A 3M96A 4ZX1A 5JDVB 5AMLA 1BNNA 1LUGA 8CA2A 1UGDA 1UGBA 3M14A 5C8IA 3RYXB 4C3TA 5E28A 2WEOA 1DMXA 3K7KA 4Q07A 2EZ7A 3F4XA 3P5LA 5E2MA 4CA2A 1G52A 4QSIA 1TBTX 1THKA 1CRAA 5CLUA 5BRWA 5DSPA 1H9QA 5DSOA 4JS6A 3P3JA 4QK1A 4IDRX 5DOHA 4YVYA 4Z1EA 4FL7A 4KUYA 3P58A 4K0SA 1KWQA 4CNWA 1DCBA 4E9OX 1CAOA 1Z93A 2FW4A 5G03A 4Q7SA 3NI5A 2NWZA 3S76A 5EH5A 3SBIA 4YXOA 1YO2A 4QK3A 1FSQA 3NJ9A 5DSKA 3M1JA 3V2MA 5AMDA 1BNVA 5FLTA 1CAKA 3HS4A 3FE4A 12CAA 4QY3A 4COQA 3M1KA 3M40A 3S73B 5DSIA 1I9NA 2NWPA 1CVCA 5JEPB 4LP6A 5FNGA 1CVDA 2NWOA 3MHIA 5L6KA 3DCCA 3RGEA 3IBIA 3S72B 3RYZA 3ZNCA 4MLTA 4CNVA 1CAIA 4HU1A 4WL4A 3S74B 4YGJA 1FR7A 4ITPA 1H4NA 4MTYA 4WR7A 3M1QA 1G6VA 1RZBA 4Y0JA 1JV0A 1ZH9A 2FOYA 3OILA 5G0BA 4XIWA 5CA2A 5FL5A 4HT2A 2FOQA 1HECA 2X7SA 1A42A 5EHEA 5FDCA 3M2YA 3ZP9A 2CABA 3RYVB 3MHOA 1ZGFA 3K34A 3ML2A 5E2KA 3MNJA 1LGDA 3M98A 1I8ZA 4Q7PA 3M5EA 5E2SA 1IF6A 3T84A 4Q06A 1DCAA 2FMZA 2NMXA 1CILA 5SZ1A 5BRUA 4ZX0A 3RYJB 2HNCA 3KIGA 3TVOX 4MDLA 1ZSBA 3S78B 1IF7A 3IAIA 4FVNA 4E3GA 1CNXA 2WEJA 3RG3A 4L5VA 4Z1KA 1BN3A 1UGAA 5JQ0A 1KOQA 1I9MA 4PZHA 1IF9A 5CJFA 3L14A 1HUHA 3MMFA 1CVAA 3KKXA 1ZE8A 5E2RA 4E3HA 1XPZA 4Q08A 3F7BA 2Q1BA 5EKJA 1CNCA 4QJWA 1CVEA 5JEGB 4Q09A 3DBUA 3V3FA 1CANA 4GL1X 2HFWA 3KS3A 4RUZA 5SZ4A 4FPTA 1LZVA 2NN7A 4HF3A 3FFPX 3MHCA 1HEDA 1ZNCA 5IPZA 3T5UA 3MZCA 3W6IA 3U47A 1HCAA 4KNIA 4QSBA 3DVBA 1FSRA 4XZ5A 4Z1JA 1CAZA 1G1DA 4Q87A 1TE3X 3DAZA 5BRVA 3HFPA 4G0CA 1CZMA 3U45X 1CA2A 1ZGEA 3M04A 4YGKA 5DRSA 1LG5A 2ZNCA 1HUGA 1TB0X 5L3OA 5SZ7A 4DZ9A 3OYQA 7CA2A 4FIKA 3N0NA 3DD0A 2X7UA 3MNKA 4PXXA 4QJMA 4ZWXA 1Z9YA 1CNKA 3JXGA 3K2FA 5BNLA 3SAPA 5BYIA 5JGSB 3DV7A 3KNEA 5EKMA 4ETQC 3M2XA 5EHVA 3FW3A 4RN4A 1CNJA 4Q49A 5LMDA 3P55A 1EOUA 3MNIA 1TEQX 3MNAA 3D93A 3V3GB 5FLSA 5DSRA 3BL0A 3EFIA 1CAJA 1UGGA 4RUYA 1RJ5A 1CNGA 3D92A 1YO0A 3UYNA 4RIUA 1CCUA 4BF1A 4LU3A 5FDIA 1CNWA 1UGFA 5J8ZA 2NXRA 4CACA 1F2WA 3UYQA 2X7TA 2AW1A 4MO8A 1V9IC 2CBEA 4PQ7A 2POVA 5A25A 1G4OA 1YDDA 2GD8A 2FOSA 4K1QA 4QEFA 3IBNA 4JSAA 3DCWA 5JQTA 4FRCA 3KWAA 4Q6EA 1IF8A 3N3JA 4CNRA 5CACA 3P5AA 1BNWA 2Q1QA 2WD3A 2NN1A 1J9WA 4ZWIA 5SZ6A 4CNXA 1G54A 2O4ZA 3D0NA 2QP6A 1HVAA 4HEYA 5DSNA 4UOVA 1FSNA 1ZFKA 3F8EA 4QJOA 1TG9A 1TH9A 1FQMA 1CVBA 4PYYA 3VBDA 5SZ2A 2POWA 4QIYA 2CBBA 3DVCA 2FNKA 4G7AA 1FQLA 4HEZA 4M2WA 3PJJA 4R5BA 2ILIA 1CALA 1G53A 3HKQA 5G01A 5SZ0A 3T82A 4L5UA 5FLOA 4XIXA 3IBLA 3KLDB 3S8XA 1XEGA 1BCDA 4L5WA 1CCSA 1G46A 5FNJA 1LG6A 1BICA 1I90A 5JG5B 4JSWA 4X5SA 1FQRA 3CYUA 2FOUA 2W2JA 1URTA 3DD8A 4K0TA 5JG3B 5JEHB 4WW8A 5DVXA 4Q7VA 4ITOA 4YGNA 4XFWA 5EHWA 5EH8A 4WW6A 1Y7WA 3M5SA 1TG3A 3M2NA 3C7PA 3OIKA 1OKMA 4Q99A 2NNSA 3GZ0A 1OQ5A 3N4BA 2QO8A 3M67A 1BNTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KP8 A;  1RAZ A;  4Q90 A;  4YX4 A;  2WEG A;  3OIM A;  4KNJ A;  4QJ0 A;  1YDB A;  2WEH A;  3DCS A;  2CBD A;  5HPJ A;  2FNM A;  5JGT B;  4M2R A;  3IBU A;  4ILX A;  2NNV A;  4TWM A;  1IF5 A;  1JD0 A;  1TEU X;  3M3X A;  4QIZ A;  1RAY A;  4RUX A;  3SAX A;  4KUV A;  3HKT A;  3M2Z A;  2NXS A;  3MNU A;  3QYK A;  1FLJ A;  3OKV A;  4BF6 A;  1AVN A;  5FLR A;  1I9O A;  4QSA A;  4E3F A;  1G45 A;  1ZSC A;  3V2J A;  3RYY A;  1HCB A;  2NNG A;  3JXF A;  4XE1 A;  3Q31 A;  3OY0 A;  1BNU A;  4Q9Y A;  3DVD A;  3TMJ A;  1CNH A;  3OYS A;  4Q8Z A;  1DMY A;  4Z0Q A;  5SZ5 A;  1CAM A;  3TVN X;  1BZM A;  4R59 A;  2CBA A;  4R5A A;  3P4V A;  4KNN A;  5JES B;  4K13 A;  4YYT A;  5DSJ A;  1I91 A;  4E3D A;  4MDG A;  2Q38 A;  2F14 A;  4HT0 A;  4RFD A;  4RIV A;  3BET A;  5FL6 A;  1HEB A;  4JSZ A;  3T5Z A;  1YDA A;  4M2U A;  1CNI A;  1FR4 A;  1XQ0 A;  3R16 A;  4QK2 A;  3MWO A;  1ZSA A;  4Q7W A;  1G4J A;  1YO1 A;  3HKU A;  3MHL A;  4ZAO A;  1G3Z A;  2NNO A;  3HKN A;  1H9N A;  5FNM A;  3OKU A;  4KNM A;  2VVA X;  3KOK A;  4YGL A;  3RZ1 B;  3B4F A;  2HL4 A;  4IWZ A;  1BV3 A;  4BCW A;  1MOO A;  5E2N A;  1CNY A;  4Z1N A;  4KAP A;  4TWL A;  1XEV A;  2H4N A;  1RZA A;  4E5Q A;  3MHM A;  3KOI A;  1RZD A;  1ZFQ A;  2FOV A;  4E4A A;  3P44 A;  6CA2 A;  5E5U A;  3NB5 A;  4Q8X A;  3R17 B;  1CVF A;  1BNM A;  1FQN A;  4ZWY A;  1YDC A;  4QSJ A;  2NXT A;  1TTM A;  1BNQ A;  1I9Q A;  1CIN A;  1Z97 A;  1CAY A;  2GEH A;  2H15 A;  5DSM A;  3U3A X;  3RZ5 A;  3CZV A;  1CRM A;  4HBA A;  5AMG A;  4KP5 A;  3V3I B;  4FVO A;  4WUQ A;  5FLP A;  3DC9 A;  4Q8Y A;  3CAJ A;  2CBC A;  3T83 A;  4CQ0 A;  2NWY A;  1KOP A;  3RZ0 B;  5EH7 A;  1JCZ A;  5DSL A;  1V9E A;  1CVH A;  2FMG A;  4Q78 A;  5FNK A;  3EFT A;  2ABE A;  1G0E A;  3M5T A;  4KV0 A;  2CA2 A;  2QOA A;  4YXU A;  4YWP A;  4PYX A;  2VVB X;  2AX2 A;  5EZT X;  1CAH A;  3PYK A;  5E5R A;  4N0X B;  3N2P A;  5A6H A;  1IF4 A;  2IT4 A;  3PO6 A;  5SZ3 A;  3S71 B;  1BN4 A;  3KON A;  3JXH C;  3IEO A;  4Q0L A;  1HEA A;  4KUW A;  5EKH A;  3MDZ A;  3RZ8 A;  1UGE A;  4MLX A;  3V5G A;  9CA2 A;  4Q81 A;  5FLQ A;  3S77 B;  3W6H A;  5FNI A;  1BN1 A;  3RJ7 A;  2WD2 A;  3F7U A;  5G0C A;  3V3H B;  4N16 A;  4JSS A;  4ZWZ A;  2HD6 A;  1RJ6 A;  1CIM A;  3ML5 A;  3HLJ A;  2HOC A;  3RZ7 A;  4MDM A;  4YHA A;  1RZC A;  2HKK A;  1CCT A;  2OSF A;  5FL4 A;  3D8W A;  4Q83 A;  5EOI A;  5DSQ A;  3P3H A;  3RLD A;  2FNN A;  4RFC A;  4HEW A;  1T9N A;  5EIJ A;  1UGC A;  3U7C A;  3S75 B;  5FNL A;  3MNH A;  4DZ7 A;  3B1B A;  1I9L A;  4YXI A;  1RZE A;  4RH2 A;  4LHI A;  1G48 A;  3MYQ A;  1G0F A;  4QTL A;  5DOG A;  3V7X A;  2POU A;  3D9Z A;  1OKN A;  3BL1 A;  4Q6D A;  5FNH A;  3V3J A;  4WUP A;  1AM6 A;  3IGP A;  3CA2 A;  1I9P A;  3DA2 A;  1CA3 A;  3S9T A;  3T85 A;  3M1W A;  3RG4 A;  4K0Z A;  2OSM A;  1CNB A;  4E49 A;  4M2V A;  1KEQ A;  4FU5 A;  1AZM A;  4YGF A;  3LXE A;  3SBH A;  1OKL A;  3S97 A;  4QJP A;  4QJX A;  2EU3 A;  1MUA A;  1KWR A;  2EU2 A;  3DC3 A;  3M96 A;  4ZX1 A;  5JDV B;  5AML A;  1BNN A;  1LUG A;  8CA2 A;  1UGD A;  1UGB A;  3M14 A;  5C8I A;  3RYX B;  4C3T A;  5E28 A;  2WEO A;  1DMX A;  3K7K A;  4Q07 A;  2EZ7 A;  3F4X A;  3P5L A;  5E2M A;  4CA2 A;  1G52 A;  4QSI A;  1TBT X;  1THK A;  1CRA A;  5CLU A;  5BRW A;  5DSP A;  1H9Q A;  5DSO A;  4JS6 A;  3P3J A;  4QK1 A;  4IDR X;  5DOH A;  4YVY A;  4Z1E A;  4FL7 A;  4KUY A;  3P58 A;  4K0S A;  1KWQ A;  4CNW A;  1DCB A;  4E9O X;  1CAO A;  1Z93 A;  2FW4 A;  5G03 A;  4Q7S A;  3NI5 A;  2NWZ A;  3S76 A;  5EH5 A;  3SBI A;  4YXO A;  1YO2 A;  4QK3 A;  1FSQ A;  3NJ9 A;  5DSK A;  3M1J A;  3V2M A;  5AMD A;  1BNV A;  5FLT A;  1CAK A;  3HS4 A;  3FE4 A;  12CA A;  4QY3 A;  4COQ A;  3M1K A;  3M40 A;  3S73 B;  5DSI A;  1I9N A;  2NWP A;  1CVC A;  5JEP B;  4LP6 A;  5FNG A;  1CVD A;  2NWO A;  3MHI A;  5L6K A;  3DCC A;  3RGE A;  3IBI A;  3S72 B;  3RYZ A;  3ZNC A;  4MLT A;  4CNV A;  1CAI A;  4HU1 A;  4WL4 A;  3S74 B;  4YGJ A;  1FR7 A;  4ITP A;  1H4N A;  4MTY A;  4WR7 A;  3M1Q A;  1G6V A;  1RZB A;  4Y0J A;  1JV0 A;  1ZH9 A;  2FOY A;  3OIL A;  5G0B A;  4XIW A;  5CA2 A;  5FL5 A;  4HT2 A;  2FOQ A;  1HEC A;  2X7S A;  1A42 A;  5EHE A;  5FDC A;  3M2Y A;  3ZP9 A;  2CAB A;  3RYV B;  3MHO A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2HOCA

Total Genus

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Chain Sequence

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