2IT4A

X ray structure of the complex between carbonic anhydrase i and the phosphonate antiviral drug foscarnet
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Phosph(on)ate as a zinc-binding group in metalloenzyme inhibitors: X-ray crystal structure of the antiviral drug foscarnet complexed to human carbonic anhydrase I.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
molecule tags Lyase
total genus 71
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2it4A00
3KWAA 1I9MA 3M1WA 4QJXA 5DSPA 2EU2A 2QP6A 4YXUA 12CAA 1BNQA 2ILIA 4Q08A 4E5QA 5JEGB 3S9TA 1LG5A 3MNJA 1DMXA 3KOKA 2EZ7A 3V5GA 5BRWA 3M3XA 2VVBX 4L5WA 4YHAA 2Q1BA 2NNVA 2FNKA 3KKXA 1BNTA 5E5UA 3DV7A 2WEOA 1V9EA 3HKQA 3MHLA 4RUYA 4ETQC 1JCZA 4MDMA 4ITPA 1Z93A 1CAYA 1CNCA 1BNVA 3U7CA 2NWZA 4QSJA 3RZ0B 5FL4A 3FW3A 1CRMA 7CA2A 5BRVA 1RJ6A 1G0FA 2W2JA 3OIKA 2POVA 3UYQA 2FOUA 4E3HA 1CVEA 5SZ7A 5SZ0A 4K1QA 2AX2A 1JD0A 3F8EA 3PYKA 3U3AX 3CA2A 4Q8YA 2F14A 4KUVA 1AZMA 1CCTA 4E4AA 1YDBA 1XQ0A 1CAMA 1YO2A 3IBLA 2NWYA 3R16A 3T82A 3M96A 1G48A 3N0NA 4Q8ZA 5FLPA 3D8WA 3OKVA 5IPZA 4Q7VA 4ZWXA 1TEQX 4BCWA 4ZX1A 3MHIA 1G45A 1ZFQA 1RZCA 5C8IA 1G52A 3OILA 3OIMA 1HEDA 4WW6A 4MTYA 2Q38A 1RZBA 3MNHA 1CA3A 1I9NA 4XIWA 3DBUA 5A25A 4QK1A 3T5ZA 4CA2A 1G1DA 3RZ8A 1OKMA 1EOUA 4X5SA 4Y0JA 2POWA 5SZ2A 4IDRX 4HEYA 1BNWA 4RH2A 1RAZA 1CVBA 3C7PA 5FDIA 1HEAA 4Q06A 3RG3A 2NXTA 4HBAA 4HEWA 3S71B 4YGNA 1CNXA 3M5EA 4MDGA 1BN3A 3V2JA 3W6IA 1BN4A 1CCSA 1UGFA 3JXFA 1BNMA 3MHOA 2POUA 1URTA 3D0NA 3TVNX 1CVFA 1A42A 2HL4A 5EHEA 3FE4A 2FW4A 1CILA 1UGAA 4JSAA 3EFIA 5JDVB 1CRAA 5DSIA 1UGBA 4QIZA 4JSSA 2FNMA 3V3FA 3F4XA 1G4JA 1CNKA 3DCSA 5SZ6A 2CBCA 4MLXA 3S8XA 1Z9YA 4G0CA 4PXXA 4ZX0A 1FSRA 3BETA 3W6HA 2OSMA 2WEHA 5FNIA 1LZVA 3DC3A 3ZNCA 4R59A 2NN7A 3MWOA 1BN1A 4G7AA 3DVBA 4WL4A 4YVYA 5DOHA 3PJJA 5CA2A 5SZ4A 1YO0A 1ZGFA 4CNRA 1CNHA 4KUWA 5DVXA 1CNJA 3CYUA 2NWPA 1KEQA 1JV0A 2NN1A 4JS6A 3HFPA 1HCAA 1DMYA 5FNHA 1CALA 4Z0QA 4E3GA 1CVCA 4Z1JA 2NNGA 4CQ0A 1CVAA 3ML5A 1I8ZA 4BF6A 1FQMA 5E28A 1CNWA 3RGEA 3RZ5A 3T5UA 5JG3B 4HT0A 1FQRA 3SAPA 3M2ZA 4MDLA 1CA2A 4LHIA 3T83A 2GEHA 1IF8A 3P3HA 5EH8A 5JQTA 1CNYA 3M1JA 5E2NA 1G0EA 3MYQA 4Q6EA 3V3JA 1HUHA 1ZE8A 3MHMA 3PO6A 4HT2A 1FQLA 4RFDA 4QJMA 5FNGA 1IF6A 4XIXA 4KNMA 1KWRA 4WUQA 4QSIA 4YGKA 1TBTX 2NWOA 3IEOA 4R5AA 2NXRA 5JGTB 1H9QA 1BICA 3KS3A 3U45X 3F7UA 1YO1A 2IT4A 5SZ3A 1ZNCA 4R5BA 3RYJB 3VBDA 2VVAX 2FOSA 1CAJA 3S73B 3SBIA 5DRSA 3T84A 3RYVB 3TMJA 4PQ7A 3M1KA 4WW8A 3P4VA 2HKKA 5FLTA 3BL0A 1ZSAA 4TWLA 4Q78A 4RUZA 3JXHC 2HOCA 5CJFA 1FSNA 4N16A 4E49A 3MNUA 5DSKA 3M67A 4Q90A 3IBIA 2FOYA 3KOIA 3Q31A 9CA2A 5JGSB 4KNIA 4N0XB 5EHVA 4KP8A 4COQA 2H15A 5FDCA 4QSBA 1RZDA 1H9NA 1CAIA 3UYNA 3S74B 1DCBA 2NNSA 1UGGA 4QJWA 3SAXA 1I9PA 3S76A 1H4NA 5EOIA 5L3OA 4QJPA 3JXGA 3D92A 4YYTA 4BF1A 1FLJA 2CBEA 4ZWYA 3RLDA 1YDAA 3DD0A 4QSAA 5DSRA 4QIYA 4RFCA 3OYQA 5EKJA 5G0CA 3IGPA 4YX4A 1HCBA 5E2RA 1LGDA 2GD8A 2WEGA 4QTLA 3MNAA 3TVOX 4XE1A 1HVAA 1J9WA 3M5TA 4FPTA 1AVNA 4Q07A 1Y7WA 3KNEA 5FLSA 5DSOA 1G3ZA 1ZSCA 3B1BA 3HKNA 4IWZA 4QK2A 1FR4A 3DAZA 5DSJA 3KIGA 5AMLA 3QYKA 1DCAA 1THKA 1XEGA 4Q81A 4E9OX 5SZ1A 1UGEA 3IBNA 4FU5A 1YDDA 1RJ5A 2EU3A 1KWQA 5BNLA 5EIJA 5J8ZA 3IBUA 2FMZA 4CNXA 5DSQA 4RUXA 2AW1A 4WUPA 6CA2A 5G03A 4QY3A 5DOGA 3S75B 4Z1EA 4M2WA 3V3HB 3HLJA 4KV0A 5DSMA 5FLOA 1TG9A 2QO8A 3M98A 2OSFA 2NMXA 3BL1A 3P44A 2NXSA 3K2FA 4RIUA 4YXOA 1CIMA 1IF5A 3M5SA 5G0BA 2HD6A 4ZWZA 1YDCA 8CA2A 5CACA 1MUAA 4KNJA 1LUGA 5FLRA 1G53A 4FRCA 3KONA 4WR7A 1FQNA 1TB0X 3DCCA 3NJ9A 2X7SA 2CBAA 3IAIA 4M2RA 4ILXA 5L6KA 2CABA 1BZMA 4RIVA 2ZNCA 4YGLA 4ITOA 5FL6A 1CANA 1CNIA 4Q6DA 1BV3A 1ZH9A 5EH7A 1IF9A 4FIKA 1CAZA 1G46A 3MMFA 4Q7SA 1G54A 3EFTA 3MDZA 1LG6A 3D9ZA 3SBHA 3M14A 5FLQA 3M2NA 4M2UA 4QJOA 1I9LA 4Q99A 3DCWA 1Z97A 4KP5A 1XPZA 4XZ5A 1OQ5A 4K0ZA 5JEHB 5EZTX 4K0SA 2QOAA 4YGFA 5E5RA 1ZGEA 4K0TA 1HUGA 4PZHA 5FNKA 3RG4A 1HEBA 1IF7A 3KLDB 4ZWIA 5EKMA 4DZ7A 5BYIA 3MHCA 1RZAA 5HPJA 4Q0LA 3CZVA 4ZAOA 4L5VA 1F2WA 5AMGA 4HF3A 4GL1X 4LP6A 4L5UA 2H4NA 3M40A 3P55A 1KOPA 4FVNA 4Q09A 3OKUA 3P5LA 1CNBA 5E2MA 1CVDA 5EH5A 3OY0A 3K7KA 2WEJA 4Q8XA 4RN4A 3K34A 3P3JA 4QJ0A 5JQ0A 5FNMA 3RYXB 1CZMA 3DA2A 3V3IB 3FFPX 4PYXA 3P5AA 5EHWA 4UOVA 5E2KA 5BRUA 1UGDA 4YWPA 5AMDA 4FL7A 1OKLA 4QK3A 4MLTA 1FSQA 1BCDA 1OKNA 4JSZA 3HKUA 4TWMA 3N4BA 2WD3A 5E2SA 2FOQA 1ZSBA 4CNWA 1UGCA 4CNVA 3N2PA 4Q7PA 3DVCA 4JSWA 3CAJA 5SZ5A 3L14A 4Q7WA 4K13A 5FNJA 4Z1NA 1I9QA 4LU3A 3M04A 1AM6A 3S77B 3V2MA 3B4FA 3S72B 3RJ7A 5JEPB 1FR7A 3M2YA 4KNNA 3R17B 4C3TA 2O4ZA 2WD2A 5CLUA 4Q87A 3LXEA 5DSLA 2X7UA 1ZFKA 3RZ7A 3U47A 5FL5A 3RYZA 3F7BA 4Q49A 4E3FA 5JG5B 4Z1KA 1I9OA 3S78B 4QEFA 3HS4A 3V3GB 4FVOA 2CBBA 4MO8A 4DZ9A 4HU1A 1T9NA 3OYSA 1I91A 1BNNA 1RZEA 5JESB 3HKTA 3N3JA 3MZCA 1TH9A 3RYYA 3ZP9A 1TE3X 3DVDA 1V9IC 2FOVA 3T85A 4M2VA 2HNCA 1TEUX 3DD8A 1BNUA 1CNGA 2FMGA 2X7TA 1CAKA 1I90A 3RZ1B 3DC9A 3MNKA 4YXIA 4PYYA 1CAHA 4Q83A 5A6HA 1CINA 1CCUA 4CACA 2NNOA 3NI5A 3M1QA 1MOOA 3S97A 5EKHA 4KAPA 1IF4A 1RAYA 4YGJA 5DSNA 3GZ0A 3P58A 1G6VA 1XEVA 4XFWA 1G4OA 1TG3A 1CVHA 2FNNA 4Q9YA 4E3DA 2CA2A 1TTMA 1KOQA 1CAOA 4KUYA 1HECA 2ABEA 3D93A 3ML2A 5G01A 5LMDA 3V7XA 5FNLA 3NB5A 2HFWA 3M2XA 2CBDA 3MNIA 4HEZA 2Q1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3KWA A;  1I9M A;  3M1W A;  4QJX A;  5DSP A;  2EU2 A;  2QP6 A;  4YXU A;  12CA A;  1BNQ A;  2ILI A;  4Q08 A;  4E5Q A;  5JEG B;  3S9T A;  1LG5 A;  3MNJ A;  1DMX A;  3KOK A;  2EZ7 A;  3V5G A;  5BRW A;  3M3X A;  2VVB X;  4L5W A;  4YHA A;  2Q1B A;  2NNV A;  2FNK A;  3KKX A;  1BNT A;  5E5U A;  3DV7 A;  2WEO A;  1V9E A;  3HKQ A;  3MHL A;  4RUY A;  4ETQ C;  1JCZ A;  4MDM A;  4ITP A;  1Z93 A;  1CAY A;  1CNC A;  1BNV A;  3U7C A;  2NWZ A;  4QSJ A;  3RZ0 B;  5FL4 A;  3FW3 A;  1CRM A;  7CA2 A;  5BRV A;  1RJ6 A;  1G0F A;  2W2J A;  3OIK A;  2POV A;  3UYQ A;  2FOU A;  4E3H A;  1CVE A;  5SZ7 A;  5SZ0 A;  4K1Q A;  2AX2 A;  1JD0 A;  3F8E A;  3PYK A;  3U3A X;  3CA2 A;  4Q8Y A;  2F14 A;  4KUV A;  1AZM A;  1CCT A;  4E4A A;  1YDB A;  1XQ0 A;  1CAM A;  1YO2 A;  3IBL A;  2NWY A;  3R16 A;  3T82 A;  3M96 A;  1G48 A;  3N0N A;  4Q8Z A;  5FLP A;  3D8W A;  3OKV A;  5IPZ A;  4Q7V A;  4ZWX A;  1TEQ X;  4BCW A;  4ZX1 A;  3MHI A;  1G45 A;  1ZFQ A;  1RZC A;  5C8I A;  1G52 A;  3OIL A;  3OIM A;  1HED A;  4WW6 A;  4MTY A;  2Q38 A; 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