2IT4A

X ray structure of the complex between carbonic anhydrase i and the phosphonate antiviral drug foscarnet
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Phosph(on)ate as a zinc-binding group in metalloenzyme inhibitors: X-ray crystal structure of the antiviral drug foscarnet complexed to human carbonic anhydrase I.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 1
total genus 71
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2it4A00
4WUPA 3V7XA 5IPZA 4QIYA 5DSKA 4ITOA 3OIKA 1CNBA 4YYTA 4Q6DA 4DZ9A 2W2JA 4QY3A 4ZAOA 1I90A 1I9OA 1CCTA 3V3FA 4HT2A 2FNKA 3RYXB 3M96A 3PO6A 4XIXA 3S9TA 5FNMA 1UGAA 1BN1A 4KNMA 4PQ7A 4QSJA 4ZWXA 5E2RA 5FLOA 3DVDA 3P44A 3SBHA 1CCUA 1URTA 1LUGA 2GD8A 2NXRA 5JEPB 4MLXA 4Q90A 5DSIA 3S8XA 3PJJA 4N0XB 4QJ0A 3S75B 3N4BA 4M2VA 4YX4A 3T5ZA 4CNRA 4YXIA 1XEGA 3F7UA 3OKVA 4JSAA 4Q8XA 5E5RA 3D92A 4M2WA 4TWLA 3S76A 3N0NA 4FRCA 2GEHA 5DOGA 4E5QA 5DVXA 3RZ0B 3T84A 3JXHC 1ZH9A 1CNJA 3W6IA 2X7UA 4KNJA 1H9NA 2AW1A 2FOSA 3SAPA 4Q9YA 3ZP9A 4YGNA 4Q7PA 3MNUA 1IF4A 3KWAA 4RUYA 1CNYA 1CIMA 4ILXA 4HF3A 5G0BA 1BV3A 3D9ZA 4Q8YA 4XFWA 4Q83A 5EKHA 4G7AA 4L5VA 3NJ9A 1BICA 5DOHA 3UYNA 3M98A 3MNAA 3M5SA 2NN7A 3R17B 1A42A 4HEYA 1I9PA 3FW3A 3M2YA 5E28A 3M04A 3M5EA 3V5GA 4QSIA 2NWZA 3BL0A 4YGFA 4Q7WA 2NWPA 4ZX1A 2NN1A 1G54A 4Q99A 3HS4A 2EZ7A 5FLTA 3LXEA 2CBAA 4FIKA 2WEOA 5SZ6A 2WEGA 4M2UA 1CA3A 4KUVA 4QSBA 4JSWA 1YO1A 1BNVA 1KOPA 4ZX0A 2OSFA 1CAMA 3M1JA 4PZHA 3V2MA 5E5UA 1ZGEA 1Z97A 4E3FA 1J9WA 1FQRA 1BCDA 4RUXA 5EOIA 3DA2A 5FNHA 3P58A 3M3XA 1LZVA 4M2RA 2CBEA 5FNGA 3KIGA 1G4OA 4FU5A 3S73B 1CNGA 1FR4A 3KOIA 3IAIA 4RN4A 5SZ2A 4C3TA 2EU3A 4K0TA 2FOUA 5FLRA 3MWOA 4LHIA 1T9NA 1Z93A 1IF9A 5EH5A 4Q0LA 5DSQA 1G48A 4FVNA 4Q06A 4Q7VA 1BNNA 5BRUA 4MDMA 2OSMA 3OY0A 1FR7A 4CQ0A 1BN3A 4DZ7A 4QJOA 2ILIA 3RYZA 1CNKA 3OKUA 1BNTA 5FLPA 3RYYA 1CAKA 2WD2A 1EOUA 5JEHB 4RUZA 5EZTX 1JV0A 2CABA 4YHAA 3MNKA 3HKTA 3N3JA 1TE3X 4K13A 3V3JA 4MO8A 5DSLA 2F14A 3IBIA 4K1QA 4Q7SA 1KWQA 3CA2A 4BCWA 1CAHA 1JCZA 5AMLA 1ZSCA 4PXXA 1I8ZA 3M67A 5DRSA 4ZWYA 3NI5A 2H15A 1G52A 5EHVA 4QEFA 2NNSA 4Z0QA 1G45A 1LG6A 5E2KA 3OYSA 3S78B 4MLTA 1RZCA 1I9LA 7CA2A 1IF8A 3IEOA 3CYUA 2Q1QA 3HKQA 4QJMA 4XE1A 4G0CA 4BF1A 1TEUX 1KEQA 3DCSA 3U3AX 1FSRA 2NNGA 4Q6EA 1UGDA 4KUYA 3TVNX 3MHCA 4CNWA 1H9QA 1HUGA 4Y0JA 3DD0A 4XIWA 4IDRX 1CANA 2O4ZA 4HT0A 4LP6A 3V3IB 5J8ZA 2POVA 4YGKA 2WD3A 4KV0A 1HCAA 4RFDA 5AMDA 1HEBA 5JQ0A 1CRMA 3KKXA 5JESB 1IF7A 1G0FA 1XQ0A 5FLSA 4E9OX 5A6HA 5L6KA 5EKMA 3EFTA 1YDAA 4WR7A 2HNCA 5JGTB 1TG3A 1YDCA 3F8EA 1OKMA 2CBBA 1LGDA 2HKKA 3MDZA 3ML2A 3T85A 3B4FA 1KOQA 3GZ0A 5HPJA 4MTYA 1CNCA 3PYKA 4COQA 5EH7A 3DAZA 3M2XA 3IGPA 3RZ5A 3RYVB 1UGEA 2HOCA 2FMGA 4QK3A 3RJ7A 5EH8A 3P3HA 1CINA 1MOOA 5EHEA 4HBAA 5L3OA 4E3DA 3M2NA 1LG5A 2QO8A 1THKA 3MHLA 4KNNA 3T5UA 1V9IC 1CNIA 1ZFQA 1I9MA 1BNMA 1IF5A 3P5LA 1TTMA 2Q38A 4PYXA 3KOKA 3MZCA 4QK2A 1BNUA 4XZ5A 3DD8A 5G01A 5JG5B 4K0SA 1AZMA 3KLDB 4RH2A 4HU1A 1CNWA 5EKJA 3MMFA 4Z1NA 3DCCA 3FE4A 4HEWA 1H4NA 5E2NA 1OQ5A 1CVEA 2ABEA 3RG4A 2FOVA 3MHOA 5FDIA 1UGGA 3BETA 3RLDA 1IF6A 4KNIA 1DMXA 1YDDA 1BNQA 3DV7A 5EIJA 4Q87A 5EHWA 4R59A 2VVAX 2WEHA 3HKNA 1YDBA 1G46A 4CA2A 1RAYA 3M1KA 1FQNA 1AVNA 1ZSAA 2POUA 5FNKA 3TVOX 3S77B 1G3ZA 3P3JA 3N2PA 3IBUA 3B1BA 3M1QA 2HD6A 2NNVA 2AX2A 3V2JA 3M1WA 5DSJA 5BNLA 3DCWA 3NB5A 4IWZA 1CRAA 4L5UA 3P5AA 5JEGB 1XPZA 1ZE8A 4R5BA 4QTLA 5DSRA 1Y7WA 1AM6A 5BRWA 3K2FA 1CVDA 1CVHA 4FPTA 1CILA 5JQTA 1G1DA 3M5TA 1JD0A 8CA2A 2H4NA 2POWA 1CAYA 3KNEA 4RIUA 3S72B 3ZNCA 5DSOA 4HEZA 9CA2A 1OKNA 3DC3A 1ZSBA 3DBUA 2X7SA 2ZNCA 4LU3A 5DSNA 1BNWA 4CACA 4JSSA 1YO2A 4K0ZA 3D8WA 2HFWA 4R5AA 1RZBA 3DVCA 1FLJA 4WW6A 4RFCA 4KUWA 5AMGA 3CZVA 1CVAA 1ZGFA 2IT4A 3UYQA 5FL4A 1ZFKA 5BYIA 4QK1A 5DSMA 5FLQA 1TBTX 3K7KA 3OILA 4ZWZA 1CALA 1HEDA 3MNJA 3M2ZA 3SBIA 3S71B 1FQMA 5JDVB 5FL6A 1RZAA 3EFIA 1CNXA 5BRVA 4N16A 1CAOA 4MDLA 4KP5A 3BL1A 1HUHA 1HECA 3DVBA 4Q09A 2FNMA 4E4AA 5SZ7A 1HEAA 3HKUA 1FQLA 5G0CA 4JSZA 1G4JA 3JXGA 4MDGA 2VVBX 1FSNA 5E2MA 1TEQX 3M14A 2CA2A 1TB0X 3D93A 3F7BA 3ML5A 3IBNA 2NXSA 5C8IA 3RYJB 5JGSB 1CAJA 4ITPA 5A25A 3HFPA 4E3HA 1DCBA 3D0NA 4TWMA 5SZ4A 1RJ6A 3MHIA 1I9NA 1MUAA 4YWPA 1HVAA 5CJFA 3C7PA 1YO0A 3IBLA 3T82A 3V3HB 3R16A 5FDCA 5FNIA 4L5WA 1RAZA 3V3GB 4ETQC 4Z1KA 5DSPA 4BF6A 4WW8A 3L14A 4YGLA 5FL5A 1UGBA 3OIMA 2NMXA 3P55A 2NWOA 4CNXA 1UGFA 3MNHA 1RZDA 2HL4A 3M40A 3U45X 1RJ5A 5SZ5A 5G03A 5SZ3A 3TMJA 3RZ1B 4QJXA 3P4VA 1BN4A 2NNOA 3W6HA 1BZMA 4WUQA 3RGEA 4QIZA 4E3GA 1Z9YA 1CA2A 2WEJA 4ZWIA 5CA2A 12CAA 2FOQA 4X5SA 2NWYA 5SZ1A 1CVCA 2FMZA 4QSAA 1ZNCA 5SZ0A 2CBCA 3DC9A 4PYYA 1CCSA 4Q49A 1V9EA 3VBDA 4Z1JA 4E49A 4FVOA 1CVBA 4Z1EA 1TH9A 3S97A 2FOYA 5CACA 3T83A 4YXUA 1TG9A 3KS3A 1CAIA 4KP8A 4WL4A 1FSQA 2QOAA 5JG3B 6CA2A 4QJPA 2FW4A 3FFPX 1CZMA 4Q78A 3SAXA 4Q07A 1OKLA 3Q31A 2Q1BA 4YGJA 1RZEA 5LMDA 4QJWA 1DCAA 4Q08A 5FNLA 2FNNA 1CVFA 4Q81A 5FNJA 3OYQA 2NXTA 4JS6A 3CAJA 1CNHA 3HLJA 4RIVA 3U47A 3U7CA 4YVYA 1KWRA 3RZ7A 4KAPA 1F2WA 3QYKA 4CNVA 1I9QA 2CBDA 4UOVA 3RG3A 4YXOA 1UGCA 4FL7A 5E2SA 1G0EA 1G6VA 3MNIA 3JXFA 4GL1X 3RZ8A 2QP6A 1CAZA 1XEVA 2X7TA 1DMYA 5CLUA 3K34A 4Q8ZA 1HCBA 3S74B 2EU2A 3F4XA 1G53A 1I91A 3MHMA 3KONA 3MYQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WUP A;  3V7X A;  5IPZ A;  4QIY A;  5DSK A;  4ITO A;  3OIK A;  1CNB A;  4YYT A;  4Q6D A;  4DZ9 A;  2W2J A;  4QY3 A;  4ZAO A;  1I90 A;  1I9O A;  1CCT A;  3V3F A;  4HT2 A;  2FNK A;  3RYX B;  3M96 A;  3PO6 A;  4XIX A;  3S9T A;  5FNM A;  1UGA A;  1BN1 A;  4KNM A;  4PQ7 A;  4QSJ A;  4ZWX A;  5E2R A;  5FLO A;  3DVD A;  3P44 A;  3SBH A;  1CCU A;  1URT A;  1LUG A;  2GD8 A;  2NXR A;  5JEP B;  4MLX A;  4Q90 A;  5DSI A;  3S8X A;  3PJJ A;  4N0X B;  4QJ0 A;  3S75 B;  3N4B A;  4M2V A;  4YX4 A;  3T5Z A;  4CNR A;  4YXI A;  1XEG A;  3F7U A;  3OKV A;  4JSA A;  4Q8X A;  5E5R A;  3D92 A;  4M2W A;  4TWL A;  3S76 A;  3N0N A;  4FRC A;  2GEH A;  5DOG A;  4E5Q A;  5DVX A;  3RZ0 B;  3T84 A;  3JXH C;  1ZH9 A;  1CNJ A;  3W6I A;  2X7U A;  4KNJ A;  1H9N A;  2AW1 A;  2FOS A;  3SAP A;  4Q9Y A;  3ZP9 A;  4YGN A;  4Q7P A;  3MNU A;  1IF4 A;  3KWA A;  4RUY A;  1CNY A;  1CIM A;  4ILX A;  4HF3 A;  5G0B A;  1BV3 A;  3D9Z A;  4Q8Y A;  4XFW A;  4Q83 A;  5EKH A;  4G7A A;  4L5V A;  3NJ9 A;  1BIC A;  5DOH A;  3UYN A;  3M98 A;  3MNA A; 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