2NN1 | Genus

Total Genus 73

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	73
Knots found	KnotProt 2.0: S +3₁
sequence length	258
structure length	258
Chain Sequence	PDWGYDDKNGPEQWSKLYPIANGNNQSPVDIKTSETKHDTSLKPISVSYNPATAKEIINVGHSFHVNFEDNDNRSVLKGGPFSDSYRLFQFHFHWGSTNEHGSEHTVDGVKYSAELHVAHWNSAKYSSLAEAASKADGLAVIGVLMKVGEANPKLQKVLDALQAIKTKGKRAPFTNFDPSTLLPSSLDFWTYPGSLTHPPLYESVTWIICKESISVSSEQLAQFRSLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLKGRTVRASF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

loadScript /static/js/j2s/core/package.js

loadScript /static/js/j2s/core/corejmol.z.js

loadScript /static/js/j2s/core/corescript.z.js

JSmol exec jmolApplet0 start applet null

Jmol JavaScript applet jmolApplet0__187628950183346__ initializing

Jmol getValue debug null

Jmol getValue logLevel null

Jmol getValue allowjavascript null

AppletRegistry.checkIn(jmolApplet0__187628950183346__)

vwrOptions:

{ "name":"jmolApplet0","applet":true,"documentBase":"https://genus.fuw.edu.pl/view/2nn1/A/","platform":"J.awtjs2d.Platform","fullName":"jmolApplet0__187628950183346__","codePath":"https:/static/js/j2s/","display":"jmolApplet0_canvas2d","signedApplet":"true","appletReadyCallback":"Jmol._readyCallback","statusListener":"[J.appletjs.Jmol object]","syncId":"187628950183346","bgcolor":"white" }

setting document base to "https://genus.fuw.edu.pl/view/2nn1/A/"

Jmol Version: 14.29.13 2018-04-17 17:17

java.vendor: Java2Script (HTML5)

java.version: 2018-01-28 23:38:52 (JSmol/j2s)

os.name: Mozilla/5.0 AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko; compatible; ClaudeBot/1.0; +claudebot@anthropic.com)

Access: ALL

memory: 0.0/0.0

processors available: 1

useCommandThread: false

appletId:jmolApplet0 (signed)

Jmol getValue emulate null

defaults = "Jmol"

Jmol getValue boxbgcolor null

Jmol getValue bgcolor white

backgroundColor = "white"

Jmol getValue ANIMFRAMECallback null

Jmol getValue APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback

APPLETREADYCallback = "Jmol._readyCallback"

callback set for APPLETREADYCallback Jmol._readyCallback APPLETREADY

Jmol getValue ATOMMOVEDCallback null

Jmol getValue AUDIOCallback null

Jmol getValue CLICKCallback null

Jmol getValue DRAGDROPCallback null

Jmol getValue ECHOCallback null

Jmol getValue ERRORCallback null

Jmol getValue EVALCallback null

Jmol getValue HOVERCallback null

Jmol getValue IMAGECallback null

Jmol getValue LOADSTRUCTCallback null

Jmol getValue MEASURECallback null

Jmol getValue MESSAGECallback null

Jmol getValue MINIMIZATIONCallback null

Jmol getValue SERVICECallback null

Jmol getValue PICKCallback null

Jmol getValue RESIZECallback null

Jmol getValue SCRIPTCallback null

Jmol getValue SYNCCallback null

Jmol getValue STRUCTUREMODIFIEDCallback null

Jmol getValue doTranslate null

language=en_US

Jmol getValue popupMenu null

Jmol getValue script null

Jmol getValue loadInline null

Jmol getValue load null

Jmol applet jmolApplet0__187628950183346__ ready

script 1 started

platformSpeed = 8

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Homo sapiens
publication title	Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II pubmed doi rcsb
molecule keywords	Carbonic anhydrase 1
total genus	73
structure length	258
sequence length	258
chains with identical sequence	B
other databases	KnotProt 2.0: S +3₁
ec nomenclature	ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date	2006-10-23

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00194	Carb_anhydrase	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.10.200.10	Alpha Beta	Roll	Carbonic Anhydrase II	Alpha carbonic anhydrase	2nn1A00

1YDAA 4LU3A 1FR4A 4M2UA 5E2KA 4Q6EA 4HU1A 2FOQA 3RZ1B 2WEJA 3M5SA 5SZ6A 2POWA 3OYQA 1CNYA 2EZ7A 4CNRA 4Q78A 4FIKA 1CINA 4M2WA 3NI5A 2H4NA 4MLTA 5DSPA 3RZ5A 1CALA 4C3TA 3K7KA 1Z93A 2WD2A 4YXOA 2OSFA 4K0TA 4Z1KA 4PQ7A 2HD6A 1XPZA 3KIGA 3M1QA 1BZMA 4PYXA 1CNIA 1FSNA 4HEWA 3RYXB 1FLJA 3UYQA 1G1DA 1UGCA 1IF8A 3P3HA 3DCCA 1BNQA 5JG5B 3P5LA 1CAKA 4QK2A 4HEZA 3SBIA 1CVDA 1JV0A 1OKNA 2POVA 4Q8ZA 4BF1A 1ZE8A 5DSMA 4Z1NA 1FQMA 4XE1A 1I9QA 4YXUA 5FL5A 1MOOA 4Z1EA 1HECA 3HLJA 3M5EA 4YGKA 3T5ZA 3RYVB 5DOGA 2AX2A 1TEQX 4BF6A 4GL1X 1Z97A 1I90A 2WD3A 2NWYA 4QTLA 4CQ0A 4HF3A 4XZ5A 2CABA 7CA2A 4WL4A 2ABEA 4MDLA 2ZNCA 3VBDA 1G6VA 1BNWA 4JSSA 1F2WA 4QK1A 5JEGB 2NNSA 3DVDA 4Q7VA 3DVBA 4WR7A 3OILA 4E49A 1YDCA 3QYKA 2W2JA 3TMJA 4RN4A 4ZAOA 4BCWA 2CBAA 1A42A 1BN4A 1IF7A 4KNIA 4CNVA 5FNGA 9CA2A 1CNXA 3T85A 3CA2A 1CCTA 3KKXA 3S73B 3IBNA 3ZP9A 2O4ZA 3P5AA 3IGPA 3Q31A 3R17B 1EOUA 3RYYA 4QEFA 3SAXA 4FVNA 4QSIA 3V3FA 3W6IA 5JQTA 3RZ7A 4KUVA 3DV7A 5FLRA 4CA2A 1FR7A 1ZGFA 1H9NA 3OKUA 1CAHA 1HUHA 4L5UA 4TWLA 3MMFA 1BNNA 2WEOA 4E3FA 2F14A 2NNOA 4E5QA 4QIYA 5L3OA 4WUQA 1H9QA 5EKHA 3M2ZA 5EKMA 5A25A 2NXTA 5EH8A 1IF6A 3D8WA 5EOIA 2AW1A 1OQ5A 5JEPB 1ZNCA 4KUWA 3RYZA 1Z9YA 1G52A 4G0CA 1CAYA 3PYKA 3S71B 2WEHA 4LP6A 3HKUA 4Q87A 3JXHC 1IF5A 1AM6A 5SZ5A 4ZWYA 2CA2A 3KOIA 3D0NA 3M1WA 3D9ZA 4N0XB 1HCAA 3M1JA 3S77B 4XIWA 1TG3A 1BNTA 2QO8A 3V3GB 3F8EA 2QP6A 5JQ0A 3MNKA 3RLDA 1CVBA 5HPJA 4YHAA 1G4JA 4YGJA 1LZVA 4G7AA 5DSJA 4Q08A 3IEOA 4ILXA 4Q07A 1RZAA 1I91A 4ZX0A 4PYYA 4Q8XA 5AMGA 4ITOA 4K1QA 2NNGA 3BL0A 3M14A 1UGGA 1TBTX 3P58A 1AVNA 3C7PA 1HVAA 1CVCA 4YYTA 3S72B 1BNUA 1HUGA 2H15A 5DSKA 3V3JA 3MNUA 1JD0A 5G0CA 4KUYA 4TWMA 3D93A 2CBCA 2NXRA 3M98A 5G0BA 4IWZA 4KNNA 4R5BA 5BRVA 3KLDB 2FNKA 4QJOA 1KEQA 2CBEA 2VVAX 1BN1A 8CA2A 4RFCA 1IF4A 3P55A 4FPTA 1DMYA 1HCBA 5FNIA 4MDGA 5JGSB 3OYSA 5EHWA 5E2SA 4YGNA 1UGDA 1CCSA 3HKTA 4MLXA 5L6KA 4M2RA 3V3HB 4LHIA 4RUXA 5CACA 1CILA 3ML2A 5FLSA 3U47A 1DCAA 4RIUA 3BETA 1I9MA 3B4FA 1UGEA 1ZSAA 1OKMA 3M96A 5J8ZA 3T84A 4ETQC 1CAIA 3KONA 3DVCA 5EIJA 5FLPA 3K34A 3UYNA 4YX4A 1CA2A 3DCSA 1ZSBA 1HEDA 5E5UA 3JXGA 4CNWA 1V9IC 3S8XA 5G03A 2Q1QA 3IBLA 5C8IA 1G48A 1CAZA 4RUZA 3EFTA 3P4VA 4Q09A 4YGLA 3MHOA 5G01A 4E3GA 5EHEA 1TB0X 5DOHA 2X7SA 3ML5A 3T83A 4DZ7A 5IPZA 2HNCA 1CNBA 1BN3A 2NWPA 4E3HA 5AMDA 5FDCA 4HT0A 3M67A 3R16A 4WW6A 1G45A 2HL4A 3V2JA 1RZDA 3MWOA 4FL7A 1CAMA 1THKA 3CYUA 3D92A 3SAPA 5LMDA 3IBIA 1BICA 3CAJA 1KOQA 5SZ7A 2HOCA 1YDDA 1HEAA 3B1BA 3M5TA 5AMLA 5FNLA 2QOAA 2FOYA 3MHCA 5E2MA 4Z0QA 4RFDA 5E5RA 5DRSA 1H4NA 5EHVA 3KWAA 5EKJA 3SBHA 4Q7SA 3N0NA 3TVNX 3L14A 4JS6A 1RJ5A 1UGAA 4QJPA 3S97A 4MO8A 2FOUA 1CANA 1RZCA 4QSBA 3KNEA 5FNHA 1G4OA 3MNJA 2NN1A 4QJMA 3N2PA 4CACA 2CBBA 2FNNA 1BCDA 3S76A 1XEVA 2Q38A 4ZX1A 3RGEA 1LG5A 2NXSA 4R5AA 3V2MA 3V7XA 4L5WA 5FL4A 2ILIA 4QJ0A 3DC3A 4QK3A 1FSRA 3HKNA 3M1KA 4YGFA 3MYQA 1CNKA 4L5VA 3K2FA 3M04A 4WW8A 5A6HA 3FW3A 2IT4A 1G0FA 3FFPX 4KNMA 3DBUA 1FQLA 3OIMA 1RZBA 5SZ1A 1YO2A 4E9OX 3M2YA 1CRMA 2HKKA 2NWOA 4Z1JA 1DCBA 3T82A 1CVAA 5JESB 2EU3A 4KP8A 1CNGA 3MHLA 4R59A 1CCUA 5SZ4A 5EH7A 1YO0A 3HS4A 5FLTA 3PJJA 3KOKA 2NMXA 3S78B 3LXEA 4QJXA 4JSAA 4XIXA 1BNVA 1RZEA 4K0SA 3OIKA 2FOVA 3DA2A 4PXXA 1URTA 5EH5A 1CVEA 3F7UA 4MTYA 4DZ9A 1RAYA 3DCWA 3RG4A 3RJ7A 2FMGA 3S75B 3U45X 1BV3A 3RZ8A 4MDMA 1CNWA 4Q90A 5DVXA 4Q06A 1TEUX 2FNMA 2NNVA 3CZVA 3MNAA 3HKQA 2FOSA 4RH2A 4UOVA 3RZ0B 3S9TA 2X7TA 1LG6A 1CNHA 1FQRA 1RAZA 1I9LA 2WEGA 1UGBA 3DC9A 2FMZA 5FNJA 1XQ0A 1CA3A 3P44A 4JSZA 1KOPA 5FDIA 4KP5A 3F4XA 1YO1A 4HBAA 1ZSCA 1G54A 4FVOA 3KS3A 4K0ZA 1CAJA 1TTMA 5FLOA 4Q83A 2X7UA 1IF9A 3BL1A 3NB5A 4PZHA 3M40A 5EZTX 5JEHB 1FSQA 1ZGEA 4YXIA 4X5SA 4CNXA 4Q99A 4KAPA 5DSIA 4Q9YA 5DSRA 4Q7WA 4K13A 3FE4A 1CZMA 3T5UA 1ZH9A 1CNJA 3MZCA 3OKVA 3V3IB 12CAA 3MDZA 3RG3A 4HT2A 4KV0A 4WUPA 5BYIA 1XEGA 4Q8YA 3N3JA 2CBDA 1Y7WA 4HEYA 1J9WA 4M2VA 2Q1BA 4N16A 5DSNA 5SZ2A 1CVFA 3DD8A 4E4AA 3DAZA 3EFIA 1BNMA 1I9OA 4Y0JA 3F7BA 1KWQA 1OKLA 1G3ZA 3HFPA 4FRCA 1CAOA 1TH9A 4YVYA 3N4BA 4Q7PA 1CVHA 1G53A 1I8ZA 4QSAA 4ZWIA 1I9NA 2VVBX 3RYJB 3MNIA 4KNJA 3OY0A 4ZWZA 1DMXA 3P3JA 5JDVB 5FNKA 6CA2A 1RJ6A 5BRUA 1LGDA 3V5GA 2POUA 5DSOA 1HEBA 5SZ3A 4COQA 4Q6DA 1ZFQA 2EU2A 4QSJA 1MUAA 1V9EA 3MNHA 1FQNA 5E28A 5E2RA 3U7CA 3IAIA 4E3DA 3NJ9A 4YWPA 1AZMA 4XFWA 1I9PA 5JGTB 3U3AX 4FU5A 5E2NA 3GZ0A 1YDBA 1JCZA 4IDRX 4Q81A 5BNLA 3M2XA 2GEHA 2FW4A 1LUGA 3W6HA 2NWZA 3S74B 5CA2A 3MHIA 5FL6A 5CLUA 4JSWA 5DSLA 5FNMA 3JXFA 3PO6A 1TE3X 3MHMA 1CRAA 2NN7A 5BRWA 5FLQA 3IBUA 5CJFA 1CNCA 4Q49A 1UGFA 4Q0LA 4ZWXA 4RUYA 4ITPA 1G0EA 4RIVA 1CIMA 2GD8A 1G46A 2OSMA 4QIZA 1ZFKA 1KWRA 3M2NA 3ZNCA 3M3XA 5JG3B 5DSQA 5SZ0A 1T9NA 4QY3A 1TG9A 4QJWA 3DD0A 2HFWA 3TVOX
chains in the Genus database with same CATH superfamily

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YDA A;  4LU3 A;  1FR4 A;  4M2U A;  5E2K A;  4Q6E A;  4HU1 A;  2FOQ A;  3RZ1 B;  2WEJ A;  3M5S A;  5SZ6 A;  2POW A;  3OYQ A;  1CNY A;  2EZ7 A;  4CNR A;  4Q78 A;  4FIK A;  1CIN A;  4M2W A;  3NI5 A;  2H4N A;  4MLT A;  5DSP A;  3RZ5 A;  1CAL A;  4C3T A;  3K7K A;  1Z93 A;  2WD2 A;  4YXO A;  2OSF A;  4K0T A;  4Z1K A;  4PQ7 A;  2HD6 A;  1XPZ A;  3KIG A;  3M1Q A;  1BZM A;  4PYX A;  1CNI A;  1FSN A;  4HEW A;  3RYX B;  1FLJ A;  3UYQ A;  1G1D A;  1UGC A;  1IF8 A;  3P3H A;  3DCC A;  1BNQ A;  5JG5 B;  3P5L A;  1CAK A;  4QK2 A;  4HEZ A;  3SBI A;  1CVD A;  1JV0 A;  1OKN A;  2POV A;  4Q8Z A;  4BF1 A;  1ZE8 A;  5DSM A;  4Z1N A;  1FQM A;  4XE1 A;  1I9Q A;  4YXU A;  5FL5 A;  1MOO A;  4Z1E A;  1HEC A;  3HLJ A;  3M5E A;  4YGK A;  3T5Z A;  3RYV B;  5DOG A;  2AX2 A;  1TEQ X;  4BF6 A;  4GL1 X;  1Z97 A;  1I90 A;  2WD3 A;  2NWY A;  4QTL A;  4CQ0 A;  4HF3 A;  4XZ5 A;  2CAB A;  7CA2 A;  4WL4 A;  2ABE A;  4MDL A;  2ZNC A;  3VBD A;  1G6V A;  1BNW A;  4JSS A;  1F2W A;  4QK1 A;  5JEG B;  2NNS A;  3DVD A;  4Q7V A;  3DVB A;  4WR7 A;  3OIL A;  4E49 A;  1YDC A;  3QYK A;  2W2J A;  3TMJ A;  4RN4 A;  4ZAO A;  4BCW A;  2CBA A;  1A42 A;  1BN4 A;  1IF7 A;  4KNI A;  4CNV A;  5FNG A;  9CA2 A;  1CNX A;  3T85 A;  3CA2 A;  1CCT A;  3KKX A;  3S73 B;  3IBN A;  3ZP9 A;  2O4Z A;  3P5A A;  3IGP A;  3Q31 A;  3R17 B;  1EOU A;  3RYY A;  4QEF A;  3SAX A;  4FVN A;  4QSI A;  3V3F A;  3W6I A;  5JQT A;  3RZ7 A;  4KUV A;  3DV7 A;  5FLR A;  4CA2 A;  1FR7 A;  1ZGF A;  1H9N A;  3OKU A;  1CAH A;  1HUH A;  4L5U A;  4TWL A;  3MMF A;  1BNN A;  2WEO A;  4E3F A;  2F14 A;  2NNO A;  4E5Q A;  4QIY A;  5L3O A;  4WUQ A;  1H9Q A;  5EKH A;  3M2Z A;  5EKM A;  5A25 A;  2NXT A;  5EH8 A;  1IF6 A;  3D8W A;  5EOI A;  2AW1 A;  1OQ5 A;  5JEP B;  1ZNC A;  4KUW A;  3RYZ A;  1Z9Y A;  1G52 A;  4G0C A;  1CAY A;  3PYK A;  3S71 B;  2WEH A;  4LP6 A;  3HKU A;  4Q87 A;  3JXH C;  1IF5 A;  1AM6 A;  5SZ5 A;  4ZWY A;  2CA2 A;  3KOI A;  3D0N A;  3M1W A;  3D9Z A;  4N0X B;  1HCA A;  3M1J A;  3S77 B;  4XIW A;  1TG3 A;  1BNT A;  2QO8 A;  3V3G B;  3F8E A;  2QP6 A;  5JQ0 A;  3MNK A;  3RLD A;  1CVB A;  5HPJ A;  4YHA A;  1G4J A;  4YGJ A;  1LZV A;  4G7A A;  5DSJ A;  4Q08 A;  3IEO A;  4ILX A;  4Q07 A;  1RZA A;  1I91 A;  4ZX0 A;  4PYY A;  4Q8X A;  5AMG A;  4ITO A;  4K1Q A;  2NNG A;  3BL0 A;  3M14 A;  1UGG A;  1TBT X;  3P58 A;  1AVN A;  3C7P A;  1HVA A;  1CVC A;  4YYT A;  3S72 B;  1BNU A;  1HUG A;  2H15 A;  5DSK A;  3V3J A;  3MNU A;  1JD0 A;  5G0C A;  4KUY A;  4TWM A;  3D93 A;  2CBC A;  2NXR A;  3M98 A;  5G0B A;  4IWZ A;  4KNN A;  4R5B A;  5BRV A;  3KLD B;  2FNK A;  4QJO A;  1KEQ A;  2CBE A;  2VVA X;  1BN1 A;  8CA2 A;  4RFC A;  1IF4 A;  3P55 A;  4FPT A;  1DMY A;  1HCB A;  5FNI A;  4MDG A;  5JGS B;  3OYS A;  5EHW A;  5E2S A;  4YGN A;  1UGD A;  1CCS A;  3HKT A;  4MLX A;  5L6K A;  4M2R A;  3V3H B;  4LHI A;  4RUX A;  5CAC A;  1CIL A;  3ML2 A;  5FLS A;  3U47 A;  1DCA A;  4RIU A;  3BET A;  1I9M A;  3B4F A;  1UGE A;  1ZSA A;  1OKM A;  3M96 A;  5J8Z A;  3T84 A;  4ETQ C;  1CAI A;  3KON A;  3DVC A;  5EIJ A;  5FLP A;  3K34 A;  3UYN A;  4YX4 A;  1CA2 A;  3DCS A;  1ZSB A;  1HED A;  5E5U A;  3JXG A;  4CNW A;  1V9I C;  3S8X A;  5G03 A;  2Q1Q A;  3IBL A;  5C8I A;  1G48 A;  1CAZ A;  4RUZ A;  3EFT A;  3P4V A;  4Q09 A;  4YGL A;  3MHO A;  5G01 A;  4E3G A;  5EHE A;  1TB0 X;  5DOH A;  2X7S A;  3ML5 A;  3T83 A;  4DZ7 A;  5IPZ A;  2HNC A;  1CNB A;  1BN3 A;  2NWP A;  4E3H A;  5AMD A;  5FDC A;  4HT0 A;  3M67 A;  3R16 A;  4WW6 A;  1G45 A;  2HL4 A;  3V2J A;  1RZD A;  3MWO A;  4FL7 A;  1CAM A;  1THK A;  3CYU A;  3D92 A;  3SAP A;  5LMD A;  3IBI A;  1BIC A;  3CAJ A;  1KOQ A;  5SZ7 A;  2HOC A;  1YDD A;  1HEA A;  3B1B A;  3M5T A;  5AML A;  5FNL A;  2QOA A;  2FOY A;  3MHC A;  5E2M A;  4Z0Q A;  4RFD A;  5E5R A;  5DRS A;  1H4N A;  5EHV A;  3KWA A;  5EKJ A;  3SBH A;  4Q7S A;  3N0N A;  3TVN X;  3L14 A;  4JS6 A;  1RJ5 A;  1UGA A;  4QJP A;  3S97 A;  4MO8 A;  2FOU A;  1CAN A;  1RZC A;  4QSB A;  3KNE A;  5FNH A;  1G4O A;  3MNJ A;  2NN1 A;  4QJM A;  3N2P A;  4CAC A;  2CBB A;  2FNN A;  1BCD A;  3S76 A;  1XEV A;  2Q38 A;  4ZX1 A;  3RGE A;  1LG5 A;  2NXS A;  4R5A A;  3V2M A;  3V7X A;  4L5W A;  5FL4 A;  2ILI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2NN1A

Total Genus

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sequence length

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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