2NNSA

Structure of inhibitor binding to carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
259
structure length
258
Chain Sequence
SHHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLEVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Analysis of Charge Discrimination in the Binding of Inhibitors to Human Carbonic Anhydrases I and II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
total genus 77
structure length 258
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-10-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nnsA00
5J8ZA 4C3TA 5FL6A 4E3DA 1FQMA 4Q0LA 2X7TA 4Q7VA 4Q7PA 4R59A 5JG3B 3M2ZA 2HOCA 5SZ2A 1YDCA 5AMDA 1YDDA 2FMGA 1BNTA 3IBLA 3NJ9A 3M2NA 2FOSA 4QIZA 4E9OX 5DSKA 3JXFA 3M1KA 5DSOA 3S74B 3S97A 3KNEA 4JSAA 5E2NA 3MNJA 1BICA 4JSZA 3CA2A 1XQ0A 4Q99A 3L14A 3IBUA 3W6IA 1H9NA 5G0CA 2ZNCA 3V5GA 5EKHA 4RN4A 1CVBA 5FNKA 5E28A 2NMXA 5FNLA 4RFDA 1BN3A 1F2WA 4MTYA 1CZMA 5FLOA 4ZWXA 2H4NA 4K0ZA 5JEHB 1HEDA 3RGEA 1I9OA 3S73B 2NXSA 3RYVB 1CA2A 1CANA 3MNKA 1DCBA 3D9ZA 2NN1A 5JEPB 3F8EA 3JXHC 4FRCA 3RYXB 4Q90A 1OQ5A 3NB5A 3M1QA 2NNGA 1FR7A 4ZWIA 3HKTA 4MLTA 4MLXA 5E2SA 4WR7A 4CACA 12CAA 4YX4A 5FNIA 3MDZA 1G54A 1UGEA 4XIWA 3U7CA 2QO8A 4L5WA 3T83A 5FLQA 4Q9YA 3C7PA 5E2KA 4Q07A 1BNNA 1BZMA 4BF6A 1CNJA 3U47A 3IBNA 3D93A 3RZ5A 3DD0A 2FOYA 1HCAA 1CVCA 5FNMA 4QJ0A 1G0FA 2FNMA 4QJOA 4XE1A 2GD8A 3R16A 2Q38A 3MHCA 5JG5B 3M1WA 1CVFA 1G3ZA 1CINA 4KNJA 1DCAA 1MOOA 4MDGA 4YVYA 1KWQA 2POUA 2WEOA 4E4AA 4IWZA 5FLRA 3DCWA 3UYQA 1T9NA 4Q83A 1TG9A 5L3OA 1I91A 1G1DA 2CBCA 3IAIA 4YXUA 1J9WA 1RAZA 5JGTB 1XEVA 1BNMA 1BCDA 2CBDA 4ZX1A 5JQ0A 1URTA 4CNWA 1IF9A 5CA2A 1ZE8A 4Q49A 1FQNA 1BN4A 4CQ0A 3DCCA 2WEGA 2HD6A 2FOQA 1HUHA 3M98A 5DSLA 4XIXA 1I9PA 4YGNA 3RYJB 3KOIA 3SAXA 3V3FA 1I9LA 3IEOA 1FQLA 3M96A 3V3IB 4M2RA 1ZFKA 3DD8A 3B1BA 1CNBA 1IF5A 4JSSA 1FSRA 4KP5A 3M2XA 4KUVA 1RAYA 3MHLA 1YO1A 1HECA 1ZSAA 8CA2A 3F7UA 3KLDB 4ZX0A 1G52A 2OSMA 3MZCA 1G0EA 4Q7WA 4DZ9A 4ITPA 4Q06A 5EOIA 1I90A 4G0CA 4KUYA 3S71B 3T84A 3FW3A 3IGPA 1ZGEA 3OIMA 1RZBA 4E3GA 3KIGA 1G6VA 1AVNA 4IDRX 1JV0A 4RUXA 3DCSA 6CA2A 3OYQA 5FLTA 1CAIA 5DSPA 2QOAA 3RZ7A 1HEBA 4MO8A 4ZWZA 1RZCA 2POVA 4FIKA 5EKMA 2NXRA 1UGCA 1Z97A 2NWOA 1CVEA 1IF8A 3RLDA 3UYNA 1IF4A 3MMFA 1CAKA 5DSQA 4HU1A 3KS3A 9CA2A 4Q8ZA 4KNMA 3DVBA 1IF6A 4QIYA 1UGDA 1KOPA 5FNHA 1CNIA 1RJ5A 2NXTA 5EKJA 3P55A 4Q8XA 1CILA 4HEWA 4WW8A 4CNXA 4CNVA 1LGDA 4PZHA 5SZ5A 1HUGA 1RJ6A 3OYSA 5E5UA 2HKKA 5A25A 5DSRA 1CCUA 3W6HA 5BNLA 5CACA 3DVCA 4FU5A 1ZFQA 1CRMA 3MHOA 3OILA 1V9IC 1KOQA 1CCTA 7CA2A 2CBEA 4K0SA 2X7UA 4YGLA 5FNJA 1G53A 3P44A 4HT2A 4Z1EA 1I9QA 1RZDA 3M04A 3OY0A 5FLSA 4ITOA 3S8XA 4QJMA 2WEHA 3BETA 4L5VA 5G01A 3DBUA 4FVNA 2FNKA 1TB0X 2NNOA 3N4BA 1YO2A 5SZ7A 4FVOA 1BNVA 3PYKA 4QJXA 4KP8A 1UGGA 1ZGFA 4KNIA 4QK2A 3RJ7A 4JS6A 3M67A 5DRSA 5SZ3A 1LG5A 3P5AA 4YXIA 1EOUA 3FFPX 3Q31A 1RZEA 3M40A 5DOHA 1KEQA 4R5BA 4WUQA 1UGFA 2AX2A 5SZ0A 3S78B 1ZNCA 3M5TA 4ETQC 3KWAA 2CABA 3M5EA 3SAPA 3U45X 3P58A 5JEGB 5AMLA 4Q87A 3IBIA 4RIVA 1H9QA 3V2MA 4K13A 4TWLA 4Y0JA 3TMJA 1CVAA 3JXGA 3M3XA 1BN1A 1I9NA 5BRWA 4ILXA 4Q81A 4E3HA 1CRAA 4PYYA 1BNWA 5FNGA 4RIUA 4Z0QA 5E2MA 3P3HA 3RZ8A 1H4NA 4N16A 4CNRA 4QJPA 5A6HA 5HPJA 1CNCA 1HCBA 4MDLA 3MWOA 1BV3A 3MNHA 3HLJA 4JSWA 1TH9A 5JDVB 4KNNA 3T82A 1FQRA 3V2JA 3CAJA 5AMGA 4YHAA 3ML5A 4YYTA 4PXXA 3ZNCA 5SZ6A 3N0NA 1LZVA 1V9EA 1TTMA 3DAZA 4E49A 5CLUA 1JD0A 4QTLA 4UOVA 4M2WA 4QSIA 4RUZA 1UGAA 2NNSA 4ZAOA 2EU3A 1Y7WA 2NNVA 1Z93A 1G48A 4HF3A 5FDIA 4M2VA 4Z1KA 4LU3A 5FLPA 1CCSA 1CVHA 5E2RA 4Q6DA 5EH7A 1CAJA 5G03A 4K0TA 4COQA 1CAYA 4YGJA 3N3JA 4X5SA 2VVAX 3K7KA 4QSAA 3S77B 4Q78A 2GEHA 1CALA 2F14A 5C8IA 1CAMA 5CJFA 3P4VA 1CAZA 5EHVA 3RYYA 3EFIA 2CBAA 4MDMA 1LUGA 4YWPA 5BYIA 3HKUA 4N0XB 4XZ5A 1CNGA 1LG6A 5EIJA 4Q7SA 5DOGA 1XPZA 3S76A 2Q1BA 1DMYA 3MNUA 4YXOA 5BRUA 2O4ZA 1CVDA 4RUYA 1CNXA 3CZVA 4Q09A 3M14A 3T5UA 2QP6A 3DA2A 2HFWA 3D0NA 3MYQA 4KUWA 1G45A 4HEZA 1HVAA 2IT4A 4KV0A 3ML2A 4LP6A 1AZMA 5EZTX 5FDCA 3EFTA 5G0BA 2NN7A 1G46A 3U3AX 5EHEA 5DSJA 4WL4A 2WD3A 4XFWA 1IF7A 5DVXA 2HL4A 1YDBA 2HNCA 1G4JA 3LXEA 4KAPA 3HKNA 3DVDA 3DV7A 1XEGA 3S75B 4HEYA 3V3JA 5DSMA 3SBHA 3FE4A 5SZ1A 2FMZA 4HBAA 4Q6EA 4YGFA 2X7SA 3QYKA 2POWA 1Z9YA 1TE3X 3OIKA 4QY3A 1UGBA 1I8ZA 4HT0A 4ZWYA 4BF1A 4WUPA 1TEUX 3MNAA 3HFPA 3N2PA 1TBTX 2EZ7A 3TVNX 4RFCA 1CNWA 3MHMA 4GL1X 1OKNA 1JCZA 1A42A 4L5UA 2FOUA 5EH8A 1KWRA 3P5LA 3RG3A 4YGKA 3M2YA 4QK1A 5JQTA 5DSIA 1CIMA 1CA3A 4TWMA 3MHIA 4E5QA 1BNUA 1OKLA 3DC3A 3RG4A 4E3FA 4QK3A 5E5RA 1YO0A 4Z1JA 2WEJA 3S72B 4FPTA 3M5SA 1FLJA 3K34A 1DMXA 4LHIA 5JESB 1MUAA 4M2UA 4Q8YA 5DSNA 3ZP9A 4WW6A 3RYZA 1ZSCA 3OKVA 4Q08A 4QSBA 3K2FA 1CNHA 2EU2A 3P3JA 3VBDA 2CA2A 1CNYA 3SBIA 1OKMA 4G7AA 3RZ0B 3S9TA 1CNKA 1HEAA 4PYXA 1CAOA 2NWZA 3CYUA 4R5AA 3F4XA 5FL4A 5LMDA 4DZ7A 1RZAA 1AM6A 2H15A 3KOKA 4Z1NA 4CA2A 2FW4A 3V3GB 1TEQX 3F7BA 5IPZA 3RZ1B 2ABEA 4BCWA 1FR4A 3DC9A 3V7XA 1YDAA 3HKQA 5EHWA 3KONA 3T85A 3M1JA 3R17B 2AW1A 2VVBX 3TVOX 1CAHA 1THKA 2FOVA 4K1QA 3D92A 5EH5A 3BL1A 4RH2A 1TG3A 3GZ0A 1FSQA 1G4OA 2ILIA 3HS4A 4QEFA 3D8WA 3PO6A 1BNQA 3T5ZA 2FNNA 5SZ4A 2OSFA 3NI5A 1ZH9A 4FL7A 4PQ7A 3PJJA 4QJWA 3MNIA 5JGSB 3KKXA 2NWYA 1ZSBA 2CBBA 5BRVA 3B4FA 3V3HB 5FL5A 2W2JA 3OKUA 2NWPA 2Q1QA 5L6KA 2WD2A 1FSNA 4QSJA 3BL0A 1I9MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5J8Z A;  4C3T A;  5FL6 A;  4E3D A;  1FQM A;  4Q0L A;  2X7T A;  4Q7V A;  4Q7P A;  4R59 A;  5JG3 B;  3M2Z A;  2HOC A;  5SZ2 A;  1YDC A;  5AMD A;  1YDD A;  2FMG A;  1BNT A;  3IBL A;  3NJ9 A;  3M2N A;  2FOS A;  4QIZ A;  4E9O X;  5DSK A;  3JXF A;  3M1K A;  5DSO A;  3S74 B;  3S97 A;  3KNE A;  4JSA A;  5E2N A;  3MNJ A;  1BIC A;  4JSZ A;  3CA2 A;  1XQ0 A;  4Q99 A;  3L14 A;  3IBU A;  3W6I A;  1H9N A;  5G0C A;  2ZNC A;  3V5G A;  5EKH A;  4RN4 A;  1CVB A;  5FNK A;  5E28 A;  2NMX A;  5FNL A;  4RFD A;  1BN3 A;  1F2W A;  4MTY A;  1CZM A;  5FLO A;  4ZWX A;  2H4N A;  4K0Z A;  5JEH B;  1HED A;  3RGE A;  1I9O A;  3S73 B;  2NXS A;  3RYV B;  1CA2 A;  1CAN A;  3MNK A;  1DCB A;  3D9Z A;  2NN1 A;  5JEP B;  3F8E A;  3JXH C;  4FRC A;  3RYX B;  4Q90 A;  1OQ5 A;  3NB5 A;  3M1Q A;  2NNG A;  1FR7 A;  4ZWI A;  3HKT A;  4MLT A;  4MLX A;  5E2S A;  4WR7 A;  4CAC A;  12CA A;  4YX4 A;  5FNI A;  3MDZ A;  1G54 A;  1UGE A;  4XIW A;  3U7C A;  2QO8 A;  4L5W A;  3T83 A;  5FLQ A;  4Q9Y A;  3C7P A;  5E2K A;  4Q07 A;  1BNN A;  1BZM A; 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