2NWPA

Structural and kinetic effects of hydrophobic mutations in the active site of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNLGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Speeding Up Proton Transfer in a Fast Enzyme: Kinetic and Crystallographic Studies on the Effect of Hydrophobic Amino Acid Substitutions in the Active Site of Human Carbonic Anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords carbonic anhydrase 2
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nwpA00
3MZCA 3RZ1B 1G45A 4ITPA 5BRUA 5FLOA 3UYNA 1XEVA 3D93A 1HEDA 3M5EA 2NWZA 3M96A 4CNVA 2CABA 3MHOA 1T9NA 3M3XA 4QK1A 1G4OA 4Q6EA 3SAPA 5JG3B 5JDVB 3DD8A 3KKXA 5DSNA 3RG4A 3DV7A 3V3HB 1ZSAA 3M2ZA 4KUYA 3V7XA 3ML2A 2POWA 3S78B 3MHIA 3W6IA 1IF6A 1FQRA 1CAOA 5CJFA 1TE3X 3HLJA 3HKUA 4M2UA 4Y0JA 3JXGA 3DBUA 1RZAA 1CAIA 5JG5B 4E3HA 2NXTA 4Q08A 4FL7A 1KWRA 3U3AX 3MNKA 1G1DA 4KNNA 5LMDA 3KOIA 5IPZA 2NXSA 5FLRA 3RYZA 4QEFA 1BCDA 4BCWA 3RLDA 4L5VA 3P3JA 4Z1NA 3D8WA 4QJWA 1ZSBA 4JSSA 3ZNCA 3LXEA 5EH8A 1HECA 5CLUA 4BF6A 4N0XB 5BYIA 4TWMA 5FL5A 4PXXA 4QJPA 1BNWA 1TH9A 2EU2A 1CNKA 1CZMA 4RFCA 1IF5A 5FNKA 3M40A 1CRAA 4XE1A 1H9QA 4L5WA 2X7SA 2HKKA 3FFPX 1CVCA 1Z9YA 4RH2A 3F8EA 3T85A 3V3IB 3BETA 2X7UA 4M2RA 5CACA 3MWOA 2FMGA 4PYXA 4XZ5A 5E5UA 3RZ5A 1IF4A 1IF8A 3RJ7A 4E9OX 1CAMA 4JSAA 1HEAA 3DCWA 3OILA 1G52A 2ZNCA 5HPJA 2POVA 4Z1KA 4KNMA 1TG9A 1CAYA 2NN7A 1YO0A 1LG6A 4QSJA 1I8ZA 4YGFA 4MO8A 4KP8A 1OQ5A 1CVDA 1BNNA 1RZDA 4WL4A 4JSZA 3OKUA 1I9MA 4Q7PA 3S97A 5E2KA 5JESB 5E5RA 3SAXA 5EH7A 1CNXA 3HS4A 3M5SA 2NNGA 5J8ZA 1DCAA 4L5UA 3RZ0B 2WEHA 3IBUA 3OIMA 4Z1JA 1HCAA 2WD2A 1FQMA 1OKNA 2QOAA 2FOQA 1I9NA 4QK3A 4QJOA 1JD0A 1BN3A 1UGDA 4MLXA 4Q07A 1IF9A 5SZ6A 4QSIA 3MNIA 4IDRX 3MDZA 1CNBA 5FLSA 4JS6A 3KOKA 3S73B 5FLTA 5G0CA 4YYTA 4ILXA 2EU3A 5L6KA 1BNUA 1CVBA 1H9NA 1FR7A 1G48A 1AZMA 1DMXA 1KWQA 3DC3A 3MYQA 5EZTX 5A6HA 1BN4A 4Q49A 5FNHA 5FLPA 1JV0A 3IGPA 1CAZA 3RYJB 5EHWA 1IF7A 3IEOA 1ZSCA 3UYQA 3R16A 3M14A 3OYQA 4FPTA 4QIZA 1TG3A 3MNHA 3GZ0A 5G03A 5JQTA 4HT2A 1HUGA 4Q78A 4Q99A 3M1JA 1RJ6A 5E2RA 4CA2A 1G54A 1ZNCA 3F7UA 5FDIA 4ZAOA 4HBAA 1LG5A 1HEBA 3TVOX 1J9WA 3MHLA 4RUXA 3JXHC 1CINA 5AMDA 3NI5A 4ITOA 3QYKA 6CA2A 1UGBA 3T83A 4R5BA 1CIMA 4E5QA 3N2PA 1G0EA 1CNJA 4TWLA 5BNLA 4ETQC 4E3DA 5SZ5A 1UGCA 4QJXA 3DCCA 1I91A 1CILA 1YDCA 2VVBX 2X7TA 3MMFA 1MOOA 2FOVA 3U7CA 3K2FA 3CA2A 4M2VA 1AM6A 1MUAA 3TVNX 4ZX0A 4QY3A 4YGJA 4COQA 2HL4A 2NWYA 4PYYA 1ZH9A 2IT4A 2NNVA 4KV0A 4MDLA 4XIWA 5DVXA 3P5AA 1V9IC 1G3ZA 3CAJA 5G0BA 1F2WA 3C7PA 3MNAA 3T5UA 3M1KA 2AW1A 3D9ZA 5AMGA 3RZ8A 1XPZA 3L14A 5E2SA 2O4ZA 3P44A 4ZWIA 3P55A 3KNEA 3ZP9A 1CA2A 3CZVA 1CVFA 4ZWYA 4KNJA 2OSMA 1BV3A 1FSNA 4GL1X 1ZFQA 1CCTA 1G46A 5DSIA 1HCBA 3R17B 4LP6A 5DSOA 5DSPA 3T84A 3V2JA 3SBIA 2WD3A 4Q81A 4QSBA 3KWAA 4ZX1A 2Q38A 3F4XA 3SBHA 3V2MA 4E3GA 1I9QA 5JGTB 4HU1A 5DSMA 4HT0A 4QJ0A 1BNTA 5G01A 5DSQA 1ZE8A 4E49A 3OIKA 5E2NA 3IBNA 5SZ4A 2H4NA 4XIXA 3S76A 2FOUA 5FL4A 2FNKA 4R5AA 3OKVA 3S9TA 3PO6A 2CBBA 1ZFKA 3DC9A 1FSRA 1A42A 2FMZA 3MHMA 4RN4A 1XQ0A 1BZMA 4QTLA 1EOUA 1JCZA 3S8XA 1RJ5A 3DVCA 1BN1A 4HEYA 3U45X 1I90A 4Q90A 3CYUA 3RYYA 1YDBA 1CNIA 3P5LA 2QO8A 5CA2A 3KS3A 4ZWZA 4Q8YA 5DSLA 3N3JA 4QIYA 5EKHA 3ML5A 1LGDA 3HFPA 5AMLA 2NNSA 4YVYA 5C8IA 3FE4A 1KOQA 1TB0X 3DCSA 3S72B 5JEHB 1H4NA 1YDDA 4MLTA 5DRSA 5EIJA 2NMXA 3DAZA 3M04A 4N16A 4LHIA 4Q87A 4Q0LA 3Q31A 1ZGFA 2FOSA 3V5GA 1OKMA 1Z97A 2NWOA 3B1BA 3S74B 3M67A 4Z1EA 3JXFA 4YGNA 4CNWA 1CCUA 3M2XA 3K34A 3NB5A 4X5SA 1TTMA 4UOVA 1AVNA 2ILIA 3EFIA 5EOIA 1CAKA 1UGGA 3RZ7A 1LZVA 1G6VA 2HNCA 4IWZA 1CNHA 2NNOA 5FNIA 4WUPA 2NWPA 4Z0QA 5EHVA 5L3OA 1LUGA 2FW4A 4PZHA 2EZ7A 5FLQA 4MDGA 4DZ7A 2VVAX 4KP5A 4M2WA 1I9PA 4YHAA 4K0TA 4Q8XA 2FNNA 3RG3A 3BL1A 1TEQX 4MDMA 1FQNA 4Q7SA 4FIKA 4Q83A 2CBCA 4KUWA 1ZGEA 4WUQA 4WW8A 2QP6A 1UGEA 3T82A 1DMYA 1CNCA 5DOHA 1CVAA 1BNMA 3PJJA 5FDCA 2FOYA 4MTYA 4YGLA 3DD0A 4CNXA 5FL6A 5EKMA 3M2YA 1KOPA 1CAJA 1RZBA 2CBEA 7CA2A 3P4VA 3K7KA 3M5TA 1CANA 1KEQA 5SZ0A 3V3JA 4YX4A 2WEOA 1BNQA 2GD8A 1CNYA 1UGAA 3EFTA 2WEJA 5SZ7A 3S75B 4FVOA 1TEUX 2Q1QA 5A25A 4JSWA 4K13A 3PYKA 3D92A 3VBDA 4PQ7A 1RAYA 3TMJA 4Q09A 3S71B 4LU3A 5DSJA 4R59A 1BICA 2HOCA 3N4BA 4HF3A 2WEGA 4K1QA 1FR4A 5FNJA 2GEHA 2CA2A 2Q1BA 3HKQA 3P58A 2W2JA 2NN1A 1G0FA 1RZCA 1URTA 4FU5A 4Q9YA 5EHEA 3M1QA 4E4AA 2CBDA 1CNWA 3V3FA 3KLDB 1UGFA 5JQ0A 5DOGA 4KAPA 5FNLA 3IBLA 5BRWA 1FQLA 3T5ZA 8CA2A 3IBIA 3M98A 2H15A 4RUZA 4KNIA 5JEPB 1Z93A 4K0SA 3U47A 5DSKA 4K0ZA 3BL0A 4C3TA 1YO1A 2ABEA 1CALA 3HKTA 4RIUA 5E28A 3RGEA 1HVAA 5FNGA 3S77B 4WR7A 3N0NA 1DCBA 4BF1A 2HD6A 4KUVA 1CRMA 1BNVA 3MNJA 4YXIA 4Q8ZA 3F7BA 1RAZA 5BRVA 3IAIA 1CA3A 3P3HA 5DSRA 4YWPA 4XFWA 1I9OA 9CA2A 3DVBA 4ZWXA 1I9LA 4Q06A 2F14A 4QSAA 1Y7WA 5JGSB 3HKNA 1HUHA 4QK2A 1YO2A 1G53A 1THKA 4QJMA 3RYXB 4Q6DA 5FNMA 1CVEA 5SZ2A 1RZEA 4DZ9A 1CVHA 3DVDA 3M2NA 3FW3A 1CAHA 3OY0A 3KONA 3OYSA 2HFWA 4Q7VA 5E2MA 4CACA 2NXRA 4CQ0A 4CNRA 4RIVA 4RUYA 4HEWA 1TBTX 3DA2A 4Q7WA 4FVNA 5EKJA 1G4JA 1V9EA 5SZ3A 4YGKA 2POUA 4E3FA 1FSQA 2AX2A 3B4FA 1XEGA 4HEZA 4WW6A 3V3GB 1FLJA 3MNUA 4YXUA 3NJ9A 2OSFA 1CNGA 5JEGB 3RYVB 1OKLA 5EH5A 4YXOA 3KIGA 4G7AA 5SZ1A 1CCSA 4RFDA 2CBAA 3M1WA 1YDAA 3W6HA 3MHCA 4FRCA 2FNMA 3D0NA 12CAA 4G0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MZC A;  3RZ1 B;  1G45 A;  4ITP A;  5BRU A;  5FLO A;  3UYN A;  1XEV A;  3D93 A;  1HED A;  3M5E A;  2NWZ A;  3M96 A;  4CNV A;  2CAB A;  3MHO A;  1T9N A;  3M3X A;  4QK1 A;  1G4O A;  4Q6E A;  3SAP A;  5JG3 B;  5JDV B;  3DD8 A;  3KKX A;  5DSN A;  3RG4 A;  3DV7 A;  3V3H B;  1ZSA A;  3M2Z A;  4KUY A;  3V7X A;  3ML2 A;  2POW A;  3S78 B;  3MHI A;  3W6I A;  1IF6 A;  1FQR A;  1CAO A;  5CJF A;  1TE3 X;  3HLJ A;  3HKU A;  4M2U A;  4Y0J A;  3JXG A;  3DBU A;  1RZA A;  1CAI A;  5JG5 B;  4E3H A;  2NXT A;  4Q08 A;  4FL7 A;  1KWR A;  3U3A X;  3MNK A;  1G1D A;  4KNN A;  5LMD A;  3KOI A;  5IPZ A;  2NXS A;  5FLR A;  3RYZ A;  4QEF A;  1BCD A;  4BCW A;  3RLD A;  4L5V A;  3P3J A;  4Z1N A;  3D8W A;  4QJW A;  1ZSB A;  4JSS A;  3ZNC A;  3LXE A;  5EH8 A;  1HEC A;  5CLU A;  4BF6 A;  4N0X B;  5BYI A;  4TWM A;  5FL5 A;  4PXX A;  4QJP A;  1BNW A;  1TH9 A;  2EU2 A;  1CNK A;  1CZM A;  4RFC A;  1IF5 A;  5FNK A;  3M40 A;  1CRA A;  4XE1 A;  1H9Q A;  4L5W A;  2X7S A;  2HKK A;  3FFP X;  1CVC A;  1Z9Y A;  4RH2 A;  3F8E A;  3T85 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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