2NXSA

Structural and kinetic effects of hydrophobic mutations in the active site of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGFGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Speeding Up Proton Transfer in a Fast Enzyme: Kinetic and Crystallographic Studies on the Effect of Hydrophobic Amino Acid Substitutions in the Active Site of Human Carbonic Anhydrase II.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
molecule keywords carbonic anhydrase 2
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2006-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 2nxsA00
1JV0A 3JXFA 3T83A 2Q1BA 3PJJA 1G4OA 1I8ZA 1UGEA 2FOYA 2FOUA 4Q90A 4QSJA 4MDLA 1TB0X 1Z9YA 4QK2A 3ZNCA 4Q7WA 2NWZA 5FLPA 1AVNA 2OSFA 1I91A 4C3TA 1BNQA 1HUHA 3SAXA 3DCSA 1HEBA 3HS4A 3U47A 3RYZA 1RJ6A 2CBAA 4L5VA 1HECA 4PYXA 5IPZA 4LU3A 4CACA 3KONA 1CVEA 4MDGA 4Q83A 1AZMA 3RZ5A 4YGNA 3W6HA 4TWLA 5DOGA 1JCZA 1TH9A 2HL4A 2WD2A 4Q8YA 1HEAA 5DRSA 3SBHA 4BCWA 2HD6A 4YVYA 1BNMA 4QIYA 3D93A 4X5SA 1A42A 1BICA 1FSQA 1G46A 3MZCA 6CA2A 2IT4A 5FNGA 5C8IA 3M14A 2WEOA 3NI5A 4FIKA 3HKUA 4Q0LA 1UGAA 4K1QA 2EU3A 2WD3A 9CA2A 3S77B 3KWAA 3M40A 1BN3A 1H9QA 1HVAA 1XEGA 3MHOA 5FLOA 4K0TA 5AMLA 5G0BA 3KOIA 1I9NA 5E2MA 5BRVA 5FLRA 5FNIA 3S73B 4L5WA 4N16A 4DZ7A 3JXGA 7CA2A 3M04A 3T5UA 5DSQA 5DSRA 1LGDA 5FDCA 3P55A 2FMZA 4Z1EA 3M2XA 1RZEA 2ZNCA 3TVOX 3MYQA 4KUVA 1CINA 4LP6A 4E3GA 4BF6A 1DCAA 1CAHA 1UGGA 3FE4A 4PYYA 1KEQA 4Q49A 5G0CA 1XPZA 4PZHA 3RZ7A 4Q8XA 1ZNCA 4Q07A 3MMFA 5G03A 5JEPB 1FLJA 1YDCA 3V5GA 1KWRA 3V3FA 5BRUA 2EZ7A 3F7BA 2NNVA 1OQ5A 4N0XB 3IBUA 1DCBA 1ZSCA 4R59A 3ML2A 4Q7VA 5HPJA 4XIWA 3SBIA 2NWPA 3HFPA 2QO8A 4Q7PA 1IF9A 3EFTA 4XIXA 2GEHA 4KUWA 4JSAA 4HEWA 3M3XA 4QJ0A 1CNJA 4E49A 4FPTA 2HKKA 1CCUA 3DC9A 3KOKA 4ZX0A 3V3HB 4YGLA 5SZ1A 4FVNA 4JSWA 1CALA 5SZ4A 1Z97A 5JG5B 3P58A 3GZ0A 5BRWA 1HEDA 3V7XA 4FRCA 1CVFA 5CACA 3FW3A 3M5TA 4CNRA 4ITOA 4KAPA 1URTA 3RZ0B 3DV7A 2NXTA 3RG3A 3M1WA 5SZ3A 4BF1A 1BNVA 3B4FA 5L6KA 4QSBA 1CRMA 3K2FA 3OKUA 4QSAA 3V2MA 3UYQA 1RZAA 3EFIA 4XE1A 5DSNA 3M1QA 3UYNA 2CBDA 3S71B 3D8WA 4HF3A 1CAZA 2FNKA 1RJ5A 4Q8ZA 2NNSA 3KLDB 5EKMA 3M1JA 4ITPA 1G54A 2POUA 3M2YA 3OILA 5EIJA 3DD8A 1ZGEA 1AM6A 1J9WA 2FOVA 1CVAA 1G52A 4Q99A 3TMJA 3P5LA 1BN1A 2NXRA 3OIKA 3RG4A 3M2NA 4ILXA 4MDMA 5FNHA 1CAJA 3RZ1B 1FQRA 1G0EA 1CVHA 1CNKA 3DC3A 1BCDA 1YO1A 3MNKA 4GL1X 2NNGA 5EOIA 5A6HA 2Q38A 4RH2A 2W2JA 4G0CA 1IF4A 1IF7A 3DD0A 3N2PA 5EH5A 3R16A 2NN1A 5EZTX 4CNVA 3RZ8A 3OY0A 3K7KA 3S74B 4M2WA 5CJFA 3P5AA 3MHCA 1BN4A 4QJXA 5DSPA 4RUYA 4JS6A 3HKNA 5J8ZA 4Q81A 4QY3A 1THKA 2X7TA 3MNHA 8CA2A 3M67A 5SZ7A 1UGDA 1RAZA 3N4BA 3OIMA 4QTLA 1BNNA 5SZ0A 4KV0A 2ILIA 3DAZA 5JEGB 1OKMA 3VBDA 1IF6A 4PQ7A 4QJMA 1CVBA 2VVAX 3MHIA 5DVXA 3S97A 5EH8A 3OKVA 5DSLA 4YYTA 3M5EA 3RGEA 4ZWYA 1G0FA 3PYKA 3V3JA 2Q1QA 1ZH9A 3U45X 1BZMA 1IF8A 1FQMA 3MDZA 1BNWA 3S8XA 4Q7SA 3N3JA 3P44A 3HKTA 4COQA 1RZBA 1CNYA 4CQ0A 4CNXA 1LZVA 4Q06A 1CNBA 4KP8A 2NN7A 5JDVB 3S78B 4QJOA 4QJPA 2POWA 4KNNA 3D9ZA 3IAIA 3IBIA 3ZP9A 2X7SA 3V3IB 1G3ZA 2CBCA 4G7AA 1LUGA 1FSNA 4Q08A 4Q87A 1CIMA 5EHVA 4ZWXA 1ZFQA 2WEJA 3U7CA 1CAYA 3M5SA 1UGBA 1YDDA 1FR4A 3BL0A 4KP5A 3DCCA 1CAIA 3Q31A 1RZDA 4JSZA 5L3OA 4RIVA 5FL6A 4R5BA 1CZMA 1TBTX 1CILA 2WEHA 5EKJA 3L14A 4RIUA 1G4JA 4Q09A 2NXSA 3MNIA 2POVA 3F8EA 1I9PA 3RYVB 1FQNA 4PXXA 3IGPA 3TVNX 3CA2A 2NMXA 5DOHA 2AX2A 2FMGA 5FLTA 3SAPA 1T9NA 4YXIA 3DCWA 1CAOA 2H15A 5FL5A 2EU2A 1CNGA 4YGFA 3S75B 1I90A 1LG5A 4E3HA 1ZFKA 3N0NA 5FL4A 1HUGA 3CZVA 3V3GB 3CYUA 3DA2A 3M2ZA 3HLJA 4WL4A 4Q9YA 4QIZA 1CCSA 2FNNA 3DVDA 3PO6A 1IF5A 4WW8A 4YGJA 1H4NA 2FW4A 1BNUA 3IBLA 5JQTA 4ZWZA 5EHWA 1G1DA 5DSMA 1G48A 5E2KA 4KNMA 4Q6DA 5JQ0A 3RLDA 4K13A 4R5AA 3OYSA 4HEYA 1YO0A 4ZAOA 4RFDA 5CLUA 5SZ2A 1Z93A 2CBBA 1HCBA 3ML5A 1JD0A 2H4NA 3C7PA 2F14A 3M1KA 1FR7A 3F7UA 4M2RA 3MNUA 1KWQA 4M2VA 4WUQA 4ZWIA 2WEGA 3S9TA 4XZ5A 4YXOA 4HBAA 3NJ9A 2NWOA 4DZ9A 1TE3X 4MLXA 4FL7A 1CVCA 1TG9A 3CAJA 1TG3A 4KNIA 1CANA 3RYYA 5EKHA 1CNXA 4ETQC 1CCTA 4E3DA 4Z1JA 1KOQA 1DMYA 3KNEA 5EH7A 2NWYA 4XFWA 5SZ5A 1TTMA 3T84A 1CA3A 4TWMA 3RYJB 3P3JA 1V9IC 3HKQA 4YHAA 2X7UA 5JESB 4WW6A 4RFCA 4QK3A 2CA2A 1I9LA 1MOOA 2FNMA 5JG3B 3T82A 1I9MA 2OSMA 1YO2A 3F4XA 4FVOA 3RJ7A 4HT0A 3M98A 5FDIA 5G01A 1FQLA 4E4AA 1CNIA 4K0SA 3DVCA 5FNLA 4WUPA 1CAKA 2FOQA 4JSSA 5E5UA 3D0NA 3MHMA 1XQ0A 5JGTB 4QEFA 3DVBA 1OKLA 3BETA 4E5QA 5DSIA 1EOUA 5E2NA 5E2SA 3KKXA 1I9QA 1CNWA 3M96A 4KNJA 2GD8A 5DSKA 5A25A 4K0ZA 1ZE8A 1F2WA 3P3HA 3MNAA 5SZ6A 4UOVA 1UGCA 1MUAA 1CRAA 2QOAA 1RZCA 1LG6A 1H9NA 2AW1A 3MWOA 1TEQX 1KOPA 1OKNA 3IEOA 3W6IA 1RAYA 3BL1A 4E3FA 2CBEA 3U3AX 4LHIA 3B1BA 5JGSB 1YDAA 4M2UA 3RYXB 1FSRA 2CABA 1CAMA 2HOCA 1DMXA 3R17B 3NB5A 1BNTA 4CNWA 3IBNA 12CAA 1YDBA 4IWZA 5AMDA 4QK1A 3KS3A 3D92A 5LMDA 3MNJA 1XEVA 3P4VA 1I9OA 4YXUA 4KUYA 3FFPX 4MLTA 4RN4A 3T5ZA 4E9OX 4Q6EA 5E2RA 5AMGA 3KIGA 1BV3A 1HCAA 4YGKA 4HEZA 5JEHB 4Z0QA 4MTYA 4FU5A 5E5RA 4ZX1A 4Q78A 3S76A 3MHLA 4WR7A 3S72B 3LXEA 4IDRX 1ZGFA 2QP6A 3DBUA 3QYKA 4YX4A 2O4ZA 1CA2A 5DSOA 2ABEA 5FNJA 1CNCA 1CNHA 4Z1KA 1G53A 3V2JA 1CVDA 5DSJA 4Z1NA 2VVBX 2FOSA 5BNLA 3K34A 5E28A 4HT2A 1G45A 4RUZA 5FNMA 4CA2A 5BYIA 4L5UA 5CA2A 1ZSBA 2NNOA 2HFWA 1UGFA 5EHEA 3T85A 5FNKA 5FLSA 1ZSAA 1G6VA 3OYQA 4MO8A 4YWPA 4RUXA 5FLQA 1TEUX 4QJWA 4QSIA 1V9EA 2HNCA 4HU1A 3JXHC 1Y7WA 4Y0JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JV0 A;  3JXF A;  3T83 A;  2Q1B A;  3PJJ A;  1G4O A;  1I8Z A;  1UGE A;  2FOY A;  2FOU A;  4Q90 A;  4QSJ A;  4MDL A;  1TB0 X;  1Z9Y A;  4QK2 A;  3ZNC A;  4Q7W A;  2NWZ A;  5FLP A;  1AVN A;  2OSF A;  1I91 A;  4C3T A;  1BNQ A;  1HUH A;  3SAX A;  3DCS A;  1HEB A;  3HS4 A;  3U47 A;  3RYZ A;  1RJ6 A;  2CBA A;  4L5V A;  1HEC A;  4PYX A;  5IPZ A;  4LU3 A;  4CAC A;  3KON A;  1CVE A;  4MDG A;  4Q83 A;  1AZM A;  3RZ5 A;  4YGN A;  3W6H A;  4TWL A;  5DOG A;  1JCZ A;  1TH9 A;  2HL4 A;  2WD2 A;  4Q8Y A;  1HEA A;  5DRS A;  3SBH A;  4BCW A;  2HD6 A;  4YVY A;  1BNM A;  4QIY A;  3D93 A;  4X5S A;  1A42 A;  1BIC A;  1FSQ A;  1G46 A;  3MZC A;  6CA2 A;  2IT4 A;  5FNG A;  5C8I A;  3M14 A;  2WEO A;  3NI5 A;  4FIK A;  3HKU A;  4Q0L A;  1UGA A;  4K1Q A;  2EU3 A;  2WD3 A;  9CA2 A;  3S77 B;  3KWA A;  3M40 A;  1BN3 A;  1H9Q A;  1HVA A;  1XEG A;  3MHO A;  5FLO A;  4K0T A;  5AML A;  5G0B A;  3KOI A;  1I9N A;  5E2M A;  5BRV A;  5FLR A;  5FNI A;  3S73 B;  4L5W A;  4N16 A;  4DZ7 A;  3JXG A;  7CA2 A;  3M04 A;  3T5U A;  5DSQ A; 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